Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400039659
CDS Infomation

pacid=37447867 polypeptide=PGSC0003DMP400026894 locus=PGSC0003DMG400015338 ID=PGSC0003DMT400039659.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGAAAGTGAAAAAGGTATCATCTTTCAGTCTCTCCTCTCTGCTTCGCCAGCAAAAA
GATGCTAAAATCGCCCTTCAGCTCTTCCTTAATCCTAATCCCAGCCATGGAAGCAACAAA
ACTACTAAACCCTTTCGTTATTCTCCACTCTGCTATGATCTCATCATCTGCAAGCTCGGC
AGAGCCAAACTCTTTCAAGAAATGGAAAAAATCATCGATAAATTAAGACACGACACTCGA
GTTTCTCTCAACGAAGTTGTTTTCTGCAATGTTATCTCTTTCTATGGAAGAGCACATTTA
CCTGAAAAGGCTCTTCATATGTATAATGAAATACCCTCTTTTCGCTGCTATAGAAGTATA
AAGTCTGTCAATAGCTTGTTGAATGCACTTTTAGCTTGTAAAGAATACAGCAAGATTCGT
GAAATGTTAAACAACTTTGAAAATTACGCAACCCCAGATGTTTGTACGTTTAATATACTG
ATGAATGTAAGTTGTTTGTGTGGTGATTTGGATAGTGCACGGGAGGTGTTTGATGAAATG
CGTAAGAGAGGAATTCAGCCAAATGTGGTGACTTTCGGGACGTTGATTAATGGGCTTTGC
ATGAATCGAGAGTTAGACGAGGCGTTTAGGATGAAAAAGATTATGGAGAGAGATTTTAAG
TTGAAGCCTAATGCTTTCGTGTATGTTGCGTTGATTAAAGGACTTTGTAAGGTTGATGAT
TTGGATGCGGCAGTTAAGATGAAGGAGGAGATGTTGAGAAAGAAAGTGGAATTGGATTCA
GCTGTGTATTCTACTTTGATTAGTGCATATTTTAGGATTGGTCGAAGGGATGAAGTTTAT
GGTTTGTTGACGGAGATGGAAAAGAATGGATGCAAATGTGATACAGTTACTTTCAATGCA
TTAATGCATGGTTATTGTCAGGAGAAAGACTTTGATTCTGCATTTAAGGTTCTGGATGAG
ATGGAAGGGAAGGGGTGTAAACCTGATGTAATTAGTTGCAATGTGATAATTCGGGGCCTT
TGTGATGACGGGAAATTAAGAGAAGCTAGTGAACTCTTGGATGATATGCCAAGACGAAGG
TGTAAACCCGATGTGGTTAGTTATAGGATATATCTTGACGGGCTCTGTAAAGCGAAGCAG
TTTAAGGAAGCTGCAGTTATTTTACATGAGATGGTTTTCAAAGGATATATTCCTCGTGAT
ACAAGTTTGTGTAAGTTATTTGACGGGCTAATTCAAGAAGGAGATAGAGAATCATTACTG
AGAGCTCTGGATAACATGGCCTCTGTAAATTGTATTAGTAAAGAAGTGTGGGAAATGGTC
ATTTCCATGATGTGCCAACAAGATAACTTGTCTAGCGCATCTGCTCTTGTAGGAATGCTA
ACGAAGGACGGAGTAAACAAATTCTCCTTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400026894
PEP Infomation

pacid=37447867 transcript=PGSC0003DMT400039659 locus=PGSC0003DMG400015338 ID=PGSC0003DMT400039659.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEKVKKVSSFSLSSLLRQQKDAKIALQLFLNPNPSHGSNKTTKPFRYSPLCYDLIICKLG
RAKLFQEMEKIIDKLRHDTRVSLNEVVFCNVISFYGRAHLPEKALHMYNEIPSFRCYRSI
KSVNSLLNALLACKEYSKIREMLNNFENYATPDVCTFNILMNVSCLCGDLDSAREVFDEM
RKRGIQPNVVTFGTLINGLCMNRELDEAFRMKKIMERDFKLKPNAFVYVALIKGLCKVDD
LDAAVKMKEEMLRKKVELDSAVYSTLISAYFRIGRRDEVYGLLTEMEKNGCKCDTVTFNA
LMHGYCQEKDFDSAFKVLDEMEGKGCKPDVISCNVIIRGLCDDGKLREASELLDDMPRRR
CKPDVVSYRIYLDGLCKAKQFKEAAVILHEMVFKGYIPRDTSLCKLFDGLIQEGDRESLL
RALDNMASVNCISKEVWEMVISMMCQQDNLSSASALVGMLTKDGVNKFSL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400039659
Transcript Infomation

pacid=37447867 locus=PGSC0003DMG400015338 ID=PGSC0003DMT400039659.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGAAAGTGAAAAAGGTATCATCTTTCAGTCTCTCCTCTCTGCTTCGCCAGCAAAAA
GATGCTAAAATCGCCCTTCAGCTCTTCCTTAATCCTAATCCCAGCCATGGAAGCAACAAA
ACTACTAAACCCTTTCGTTATTCTCCACTCTGCTATGATCTCATCATCTGCAAGCTCGGC
AGAGCCAAACTCTTTCAAGAAATGGAAAAAATCATCGATAAATTAAGACACGACACTCGA
GTTTCTCTCAACGAAGTTGTTTTCTGCAATGTTATCTCTTTCTATGGAAGAGCACATTTA
CCTGAAAAGGCTCTTCATATGTATAATGAAATACCCTCTTTTCGCTGCTATAGAAGTATA
AAGTCTGTCAATAGCTTGTTGAATGCACTTTTAGCTTGTAAAGAATACAGCAAGATTCGT
GAAATGTTAAACAACTTTGAAAATTACGCAACCCCAGATGTTTGTACGTTTAATATACTG
ATGAATGTAAGTTGTTTGTGTGGTGATTTGGATAGTGCACGGGAGGTGTTTGATGAAATG
CGTAAGAGAGGAATTCAGCCAAATGTGGTGACTTTCGGGACGTTGATTAATGGGCTTTGC
ATGAATCGAGAGTTAGACGAGGCGTTTAGGATGAAAAAGATTATGGAGAGAGATTTTAAG
TTGAAGCCTAATGCTTTCGTGTATGTTGCGTTGATTAAAGGACTTTGTAAGGTTGATGAT
TTGGATGCGGCAGTTAAGATGAAGGAGGAGATGTTGAGAAAGAAAGTGGAATTGGATTCA
GCTGTGTATTCTACTTTGATTAGTGCATATTTTAGGATTGGTCGAAGGGATGAAGTTTAT
GGTTTGTTGACGGAGATGGAAAAGAATGGATGCAAATGTGATACAGTTACTTTCAATGCA
TTAATGCATGGTTATTGTCAGGAGAAAGACTTTGATTCTGCATTTAAGGTTCTGGATGAG
ATGGAAGGGAAGGGGTGTAAACCTGATGTAATTAGTTGCAATGTGATAATTCGGGGCCTT
TGTGATGACGGGAAATTAAGAGAAGCTAGTGAACTCTTGGATGATATGCCAAGACGAAGG
TGTAAACCCGATGTGGTTAGTTATAGGATATATCTTGACGGGCTCTGTAAAGCGAAGCAG
TTTAAGGAAGCTGCAGTTATTTTACATGAGATGGTTTTCAAAGGATATATTCCTCGTGAT
ACAAGTTTGTGTAAGTTATTTGACGGGCTAATTCAAGAAGGAGATAGAGAATCATTACTG
AGAGCTCTGGATAACATGGCCTCTGTAAATTGTATTAGTAAAGAAGTGTGGGAAATGGTC
ATTTCCATGATGTGCCAACAAGATAACTTGTCTAGCGCATCTGCTCTTGTAGGAATGCTA
ACGAAGGACGGAGTAAACAAATTCTCCTTGTAA