Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400039209
CDS Infomation	pacid=37460148 polypeptide=PGSC0003DMP400026597 locus=PGSC0003DMG402015159 ID=PGSC0003DMT400039209.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGACTCTGAGAGCAAACAATGCTGAGGCAGAAAATAAAACGTTGGTTGACCGATGGATG CTGCAGAAGATGCAGGATGCTGAGCGCCTTAACGAGGCAAATGCTCTCTATGGAGATATG CTTGATAAGGTCAAGGCCGCCAGTATAGAGAAACTTGCTCGTCAACAAGTGGACGGTGTG GTCCGCCAAAGTGAAGATGGTGCAGAATTTTACGTAGAATCTTCCATCCCTAGTACATGC AAGCAAAGGATCCCCGCCCATGATGGTGGATGTGCCTCGATTCTTTTTGAGTATAACTCA AGTAAATTGATAAGTGGAGGGCAGGATCGGGCAATTAAAATGTGGGATACCACAAGTGGA TCATTAACCAACAGTTTTTATGGTTGTCTGGGTTCTGTTCTTGATCTTTCCATCACACAT GATAACAAATTCATCATAGCAGCAAGTAGTTCAAATAATTTGTATGTGTGGGATGCAAAT TCAGGCAGGATACGGCATACTCTTACTGGGCACATTGACAAGGTTTGTGCAGTTGATGTG AGCAAATTTTCAAGTCGCTATGTGGTGAGTGCTGCATATGATCGCACAATAAAAGTTTGG GATCTGCAGAAGGGTTACTGTAACAACACTATCATATTTCACAGCAACTGTAACAGCCTT GCGTTTAGCATGGATGCGCTGACCATCTGTTCCGGTCATGTTGATGGTAATCTTAGATTA TGGGATGTTCAAACAGGCAAGCTTCTGAGTGAAGTTGCTGCACATTCACAGGCTGTTACA TCAGTTTCACTCTCTCGGAATGGAAACATGATATTAACCAGTGGGAGAGACAACTTGCAC AATCTATTCGATATACGCACCCTTGAAATTTGTGGCACTTTCAGATCAAATGCAAATCGA GTTGCATCTAATTGGAGCCGATCCTGTATTAGTGCCGATGACGGTTATGTTACTGCAGGT TCTGTTGATGGATCTGTTCATATTTGGTCAGTATTAAACGGTAAAATGGTAAGCACATTG AAAGAACATACATCCTCTGTACTTTGTTGTTCATGGAGTGGTCTTGGTAATCCTTTGGCC ACCTCAGATAAGAGTGGAACCATATGTATTTGGTCATGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400026597
PEP Infomation	pacid=37460148 transcript=PGSC0003DMT400039209 locus=PGSC0003DMG402015159 ID=PGSC0003DMT400039209.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MTLRANNAEAENKTLVDRWMLQKMQDAERLNEANALYGDMLDKVKAASIEKLARQQVDGV VRQSEDGAEFYVESSIPSTCKQRIPAHDGGCASILFEYNSSKLISGGQDRAIKMWDTTSG SLTNSFYGCLGSVLDLSITHDNKFIIAASSSNNLYVWDANSGRIRHTLTGHIDKVCAVDV SKFSSRYVVSAAYDRTIKVWDLQKGYCNNTIIFHSNCNSLAFSMDALTICSGHVDGNLRL WDVQTGKLLSEVAAHSQAVTSVSLSRNGNMILTSGRDNLHNLFDIRTLEICGTFRSNANR VASNWSRSCISADDGYVTAGSVDGSVHIWSVLNGKMVSTLKEHTSSVLCCSWSGLGNPLA TSDKSGTICIWS*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400039209
Transcript Infomation	pacid=37460148 locus=PGSC0003DMG402015159 ID=PGSC0003DMT400039209.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGACTCTGAGAGCAAACAATGCTGAGGCAGAAAATAAAACGTTGGTTGACCGATGGATG CTGCAGAAGATGCAGGATGCTGAGCGCCTTAACGAGGCAAATGCTCTCTATGGAGATATG CTTGATAAGGTCAAGGCCGCCAGTATAGAGAAACTTGCTCGTCAACAAGTGGACGGTGTG GTCCGCCAAAGTGAAGATGGTGCAGAATTTTACGTAGAATCTTCCATCCCTAGTACATGC AAGCAAAGGATCCCCGCCCATGATGGTGGATGTGCCTCGATTCTTTTTGAGTATAACTCA AGTAAATTGATAAGTGGAGGGCAGGATCGGGCAATTAAAATGTGGGATACCACAAGTGGA TCATTAACCAACAGTTTTTATGGTTGTCTGGGTTCTGTTCTTGATCTTTCCATCACACAT GATAACAAATTCATCATAGCAGCAAGTAGTTCAAATAATTTGTATGTGTGGGATGCAAAT TCAGGCAGGATACGGCATACTCTTACTGGGCACATTGACAAGGTTTGTGCAGTTGATGTG AGCAAATTTTCAAGTCGCTATGTGGTGAGTGCTGCATATGATCGCACAATAAAAGTTTGG GATCTGCAGAAGGGTTACTGTAACAACACTATCATATTTCACAGCAACTGTAACAGCCTT GCGTTTAGCATGGATGCGCTGACCATCTGTTCCGGTCATGTTGATGGTAATCTTAGATTA TGGGATGTTCAAACAGGCAAGCTTCTGAGTGAAGTTGCTGCACATTCACAGGCTGTTACA TCAGTTTCACTCTCTCGGAATGGAAACATGATATTAACCAGTGGGAGAGACAACTTGCAC AATCTATTCGATATACGCACCCTTGAAATTTGTGGCACTTTCAGATCAAATGCAAATCGA GTTGCATCTAATTGGAGCCGATCCTGTATTAGTGCCGATGACGGTTATGTTACTGCAGGT TCTGTTGATGGATCTGTTCATATTTGGTCAGTATTAAACGGTAAAATGGTAAGCACATTG AAAGAACATACATCCTCTGTACTTTGTTGTTCATGGAGTGGTCTTGGTAATCCTTTGGCC ACCTCAGATAAGAGTGGAACCATATGTATTTGGTCATGA