Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400038420
CDS Infomation

pacid=37463692 polypeptide=PGSC0003DMP400026100 locus=PGSC0003DMG402014825 ID=PGSC0003DMT400038420.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACCAAGCATAGACTTGGACTGCACACTCGCTCGTGCTTCCATCTCTCAAGAACAAAG
AGACCTTTAACTACTTCCCCTTTACCTTCGGAAGCAATATCATGTGTTCACACTTCCCCA
GTTAATCACAAGACCTTGTGTTTTTCACTTGCAGACAATTTAATAGTTCGTGGGTTGTTC
GATTCAGCTGAGAAAGTAATTCGGAGAATCATCAAGCATTCCTCATCAGTTTCTGAAGCT
ATCTCTGCTGTTGAATTTTCTATTTCTCGTGGAGTTGAGCCTGATGCAACTAGCTATGCT
TTTCTCTTTCGGCAACTTGTGACATCTAGAGAAACCCTGAAGGCTGAGGCTCTCTATGTA
GATTGCATTTTGAACAGAGGTATTGAGCCGAATCATTCTGTATTGAATTCCATGGCGATT
TGTTATTGTAATTTGGGTAAATTGGAGGAAGCTAAGTTGCTTTTTGATAAACTTGTGGAT
AAGAAGTTGTTGCCTTGTAGTAGCACGTGTAATGAGCTTATTAAGGGATTTTGTGGCCAA
GATAGAATCTTGGATGGATTTGATGTTTTTGTTGAAGCTATTAATTCAGAGGTATTACTG
GCTTTCAGTTGTTACAATAAGTTAGTGGATGGTTTGTGCTTCCGTGGGTACTTAGATGAA
GCACTCTATGTGTTTGACGAAATGTGTGATAGAGGGGTACCACCCACAGTTCATTTGTTT
AAAACATTGATTCTTTCGTTGTCTAAGAGAGGCAGAGTTGAGGAAGCGCAATTGTTGAGC
ATGGATATGGAATCTTATGGTTTTGTTTTGGATAAAGTAATGTACACGACTCTCATCAAC
GGTTATTCCAAGATCCAGAAAATGAAAACGGCTATGATGTTATTTCTCAGAATGCGTAAG
TTAGGCTGTGAACCGGATAAGTATACTTACAACACGCTGATCAATGGGTTTATAAACTTG
GGCATGTTCGACAAGGGTTGGATGCTGAATCAGCAGATGGTTGAATTTGGATTAGAACCT
GATGCGGTAAGTTACCAAATCATGATTGCCAAGTATTGCAAGGACCATAAAGTTGATTGC
GCATTGACGCTATTGAATGACATTAATCAGTGCAACGTTCCTCCCAGTGTTCACTCTTAT
ACTGCTTTGATCTCTGCACTTTATAAAGAGAATCGGTTAGCTGAAGTAGATGACTTATAC
AGGAAGATGTTGTACACTGGATTGGTTCCTGACCATGTTCTGTTTTTTACCTTGATCAGC
AATCATCCAAGAGGGTCAGAGATTAGTCTAGCATGCACATTTTTGCGGGCTATTGCCAAG
AACGGTTGTGGTATTGACCTCTCTTACATCCCTAGCCCTACCAGTCGTAAAGTTACTACA
GATATCATGCTTGATATTGATCGTCTCTTGGGAGAAATTGTGGCAAGAAACTTACCTCTG
GCTAGTGTTGCTTTCAATATATATATGATTGCTTTGTGTCTAGGAGGAGAACTTGATTCT
GCTCAGCTTTGCATGGATAAGATGTCAAGCCTTTCTCTTCAGCCTTCACTGTCAGCTTAT
AATTCCATGATCAAGTGCCTTTACCAAAAGGGACTACATGAGGATGCCAAGTTCCTTGTT
GAAGTTATGCAAGATCAAGGTCAAGTTCCAAATCAAGCAACATTCTTGATTATGGTAAAT
GAATACTGTAAACAGGGTGACATACAATCAGCATTAGAAGTTTTGGACCAAATGGAAGAG
AGTGGATTGAAGCCTAGTGTTGCTATATATGACTCCGTCATTGGGTGTTTGGGTAGAGAA
AAGAGAATAGACGAGGCCCTTGGAGTTTTCCGGAGAATGCTCGAGGCTGGAATTTATCCT
GATAAAATTTTGTTTGTGACAATGATTAATGCTCTATCAAGAAATGGGCAAGCTATTCAG
GCCCATGAGCTCTTCATTACAATGTTGGAAGATGGAGTTCAACCAAGCCACTATGCTTAT
ACTGCTCTTATAAATGGGTTGGTTAAGAAAAACATGATAGAAAAGGGCTGTGTATACCTC
AAGCAAATGATAGAAGAGGGTTTCATGCCAAATACTGTTCTTTATACTTCTCTTATAAAA
CAATTCTTAAGGAAGAGACAGTTTGAATTCGCACTTAAGTTGGTTGATTTGATGGAAAGA
AGTGAGATTGAGCGAGACTTGGTAACTTATATTACTTTGGTCAGTGGCGTTTCTAGAAAT
ATTAGGTCAGTCGATGGGAAAGGGCTTGTTCCACAGAGACGGTATGAAGAATCTAAGGAA
ATGTTGTTCCGCCTACTTCATCAGAGTGCTATGTTGCCTAAGGAAAAATGTTTGAAAATC
TCAGTTAGCTCTCAGGAACAAATAAAATTTCTTGCACTTCGGCTGATAAATAAAGTGAAG
GCCACTCCCCTAATGCCAAATTTGTACTTATATAATGGCATAATTTCTGGGTTTTGTTGG
GCAGAGAGTATGGAAGATGCATACAAGCACCTTCATACGATGCAAAATGAAGGCATCCAA
CCAAATCAAGTTACTTTTACTATTCTAATTGATGGGCATTTCCGAAGTGGTGAAATTAAT
TGTGCTGTTAGTCTTTTCAACAGAATGAATGCACAGGGTTGTCCTCCAGATAACATCGTC
TACAACACTTTAATTAGAGGTCTATGCAGGCACGGAAGGCTCGTGGATGCTCTATCACTC
TCATACACTATGCTCAAAAAAGGATTGGCCCCTTCTAAGGCATCATATGAAAGTCTTCTC
AGTTCTCTTTGTGCTAGTAATTGGAGAGTTCATGCACTGAAGATATGTCACGATATGCTT
GCCAATAAATATGTCCCTTGTGGCCATAATCTTAAATTGTTGATTTGTATACTGGGTGAA
GAAAATAAGTGGCACGAAGCTCGTTTTATGTATGATTTGCTTCTTAAGAAAGAAAATTTA
TGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400026100
PEP Infomation

pacid=37463692 transcript=PGSC0003DMT400038420 locus=PGSC0003DMG402014825 ID=PGSC0003DMT400038420.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MTKHRLGLHTRSCFHLSRTKRPLTTSPLPSEAISCVHTSPVNHKTLCFSLADNLIVRGLF
DSAEKVIRRIIKHSSSVSEAISAVEFSISRGVEPDATSYAFLFRQLVTSRETLKAEALYV
DCILNRGIEPNHSVLNSMAICYCNLGKLEEAKLLFDKLVDKKLLPCSSTCNELIKGFCGQ
DRILDGFDVFVEAINSEVLLAFSCYNKLVDGLCFRGYLDEALYVFDEMCDRGVPPTVHLF
KTLILSLSKRGRVEEAQLLSMDMESYGFVLDKVMYTTLINGYSKIQKMKTAMMLFLRMRK
LGCEPDKYTYNTLINGFINLGMFDKGWMLNQQMVEFGLEPDAVSYQIMIAKYCKDHKVDC
ALTLLNDINQCNVPPSVHSYTALISALYKENRLAEVDDLYRKMLYTGLVPDHVLFFTLIS
NHPRGSEISLACTFLRAIAKNGCGIDLSYIPSPTSRKVTTDIMLDIDRLLGEIVARNLPL
ASVAFNIYMIALCLGGELDSAQLCMDKMSSLSLQPSLSAYNSMIKCLYQKGLHEDAKFLV
EVMQDQGQVPNQATFLIMVNEYCKQGDIQSALEVLDQMEESGLKPSVAIYDSVIGCLGRE
KRIDEALGVFRRMLEAGIYPDKILFVTMINALSRNGQAIQAHELFITMLEDGVQPSHYAY
TALINGLVKKNMIEKGCVYLKQMIEEGFMPNTVLYTSLIKQFLRKRQFEFALKLVDLMER
SEIERDLVTYITLVSGVSRNIRSVDGKGLVPQRRYEESKEMLFRLLHQSAMLPKEKCLKI
SVSSQEQIKFLALRLINKVKATPLMPNLYLYNGIISGFCWAESMEDAYKHLHTMQNEGIQ
PNQVTFTILIDGHFRSGEINCAVSLFNRMNAQGCPPDNIVYNTLIRGLCRHGRLVDALSL
SYTMLKKGLAPSKASYESLLSSLCASNWRVHALKICHDMLANKYVPCGHNLKLLICILGE
ENKWHEARFMYDLLLKKENL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400038420
Transcript Infomation

pacid=37463692 locus=PGSC0003DMG402014825 ID=PGSC0003DMT400038420.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACCAAGCATAGACTTGGACTGCACACTCGCTCGTGCTTCCATCTCTCAAGAACAAAG
AGACCTTTAACTACTTCCCCTTTACCTTCGGAAGCAATATCATGTGTTCACACTTCCCCA
GTTAATCACAAGACCTTGTGTTTTTCACTTGCAGACAATTTAATAGTTCGTGGGTTGTTC
GATTCAGCTGAGAAAGTAATTCGGAGAATCATCAAGCATTCCTCATCAGTTTCTGAAGCT
ATCTCTGCTGTTGAATTTTCTATTTCTCGTGGAGTTGAGCCTGATGCAACTAGCTATGCT
TTTCTCTTTCGGCAACTTGTGACATCTAGAGAAACCCTGAAGGCTGAGGCTCTCTATGTA
GATTGCATTTTGAACAGAGGTATTGAGCCGAATCATTCTGTATTGAATTCCATGGCGATT
TGTTATTGTAATTTGGGTAAATTGGAGGAAGCTAAGTTGCTTTTTGATAAACTTGTGGAT
AAGAAGTTGTTGCCTTGTAGTAGCACGTGTAATGAGCTTATTAAGGGATTTTGTGGCCAA
GATAGAATCTTGGATGGATTTGATGTTTTTGTTGAAGCTATTAATTCAGAGGTATTACTG
GCTTTCAGTTGTTACAATAAGTTAGTGGATGGTTTGTGCTTCCGTGGGTACTTAGATGAA
GCACTCTATGTGTTTGACGAAATGTGTGATAGAGGGGTACCACCCACAGTTCATTTGTTT
AAAACATTGATTCTTTCGTTGTCTAAGAGAGGCAGAGTTGAGGAAGCGCAATTGTTGAGC
ATGGATATGGAATCTTATGGTTTTGTTTTGGATAAAGTAATGTACACGACTCTCATCAAC
GGTTATTCCAAGATCCAGAAAATGAAAACGGCTATGATGTTATTTCTCAGAATGCGTAAG
TTAGGCTGTGAACCGGATAAGTATACTTACAACACGCTGATCAATGGGTTTATAAACTTG
GGCATGTTCGACAAGGGTTGGATGCTGAATCAGCAGATGGTTGAATTTGGATTAGAACCT
GATGCGGTAAGTTACCAAATCATGATTGCCAAGTATTGCAAGGACCATAAAGTTGATTGC
GCATTGACGCTATTGAATGACATTAATCAGTGCAACGTTCCTCCCAGTGTTCACTCTTAT
ACTGCTTTGATCTCTGCACTTTATAAAGAGAATCGGTTAGCTGAAGTAGATGACTTATAC
AGGAAGATGTTGTACACTGGATTGGTTCCTGACCATGTTCTGTTTTTTACCTTGATCAGC
AATCATCCAAGAGGGTCAGAGATTAGTCTAGCATGCACATTTTTGCGGGCTATTGCCAAG
AACGGTTGTGGTATTGACCTCTCTTACATCCCTAGCCCTACCAGTCGTAAAGTTACTACA
GATATCATGCTTGATATTGATCGTCTCTTGGGAGAAATTGTGGCAAGAAACTTACCTCTG
GCTAGTGTTGCTTTCAATATATATATGATTGCTTTGTGTCTAGGAGGAGAACTTGATTCT
GCTCAGCTTTGCATGGATAAGATGTCAAGCCTTTCTCTTCAGCCTTCACTGTCAGCTTAT
AATTCCATGATCAAGTGCCTTTACCAAAAGGGACTACATGAGGATGCCAAGTTCCTTGTT
GAAGTTATGCAAGATCAAGGTCAAGTTCCAAATCAAGCAACATTCTTGATTATGGTAAAT
GAATACTGTAAACAGGGTGACATACAATCAGCATTAGAAGTTTTGGACCAAATGGAAGAG
AGTGGATTGAAGCCTAGTGTTGCTATATATGACTCCGTCATTGGGTGTTTGGGTAGAGAA
AAGAGAATAGACGAGGCCCTTGGAGTTTTCCGGAGAATGCTCGAGGCTGGAATTTATCCT
GATAAAATTTTGTTTGTGACAATGATTAATGCTCTATCAAGAAATGGGCAAGCTATTCAG
GCCCATGAGCTCTTCATTACAATGTTGGAAGATGGAGTTCAACCAAGCCACTATGCTTAT
ACTGCTCTTATAAATGGGTTGGTTAAGAAAAACATGATAGAAAAGGGCTGTGTATACCTC
AAGCAAATGATAGAAGAGGGTTTCATGCCAAATACTGTTCTTTATACTTCTCTTATAAAA
CAATTCTTAAGGAAGAGACAGTTTGAATTCGCACTTAAGTTGGTTGATTTGATGGAAAGA
AGTGAGATTGAGCGAGACTTGGTAACTTATATTACTTTGGTCAGTGGCGTTTCTAGAAAT
ATTAGGTCAGTCGATGGGAAAGGGCTTGTTCCACAGAGACGGTATGAAGAATCTAAGGAA
ATGTTGTTCCGCCTACTTCATCAGAGTGCTATGTTGCCTAAGGAAAAATGTTTGAAAATC
TCAGTTAGCTCTCAGGAACAAATAAAATTTCTTGCACTTCGGCTGATAAATAAAGTGAAG
GCCACTCCCCTAATGCCAAATTTGTACTTATATAATGGCATAATTTCTGGGTTTTGTTGG
GCAGAGAGTATGGAAGATGCATACAAGCACCTTCATACGATGCAAAATGAAGGCATCCAA
CCAAATCAAGTTACTTTTACTATTCTAATTGATGGGCATTTCCGAAGTGGTGAAATTAAT
TGTGCTGTTAGTCTTTTCAACAGAATGAATGCACAGGGTTGTCCTCCAGATAACATCGTC
TACAACACTTTAATTAGAGGTCTATGCAGGCACGGAAGGCTCGTGGATGCTCTATCACTC
TCATACACTATGCTCAAAAAAGGATTGGCCCCTTCTAAGGCATCATATGAAAGTCTTCTC
AGTTCTCTTTGTGCTAGTAATTGGAGAGTTCATGCACTGAAGATATGTCACGATATGCTT
GCCAATAAATATGTCCCTTGTGGCCATAATCTTAAATTGTTGATTTGTATACTGGGTGAA
GAAAATAAGTGGCACGAAGCTCGTTTTATGTATGATTTGCTTCTTAAGAAAGAAAATTTA
TGA