Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400038216
CDS Infomation

pacid=37435374 polypeptide=PGSC0003DMP400025964 locus=PGSC0003DMG400014740 ID=PGSC0003DMT400038216.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAAGTGTTAGCAATAACACTATGGGTTCTCTTGTTTTTTATTTTGACAAATACCAAG
TTTGTTGTTTGTGTAGGGATTTGCAGAGACAATGAGCAACAAGCGTTGGAGACCTTGAAG
AAAGAAGTATATGATCCCTCGAATCGTCTCGCTTCTTGGGTAGTCGGAAAAGATTGTTGT
GAATGGGAAGGGGTCGTGTGCAACAATCTCACTCGTCATGTGATTGAGCTAAGCATTTAT
AGTGATCAGATCGAGTCGAGATATCTAAGGATCAATAGCCTAGAGTGGTTGACAAGTCTT
TCGAGTCTTGAGAACCTAGAAATGTATAATGTGGATCTTAGCAAAGCTAATGAATGGCTA
CAAGTTATTAACATGCTTCCTTCTCTTGTTTATCTTCGTCTATACAAATGTAGTCTTTCA
AGTCTTGAGCTCCGTTATGGTGGCATTGAAGGTGCGATACAGAGTAAGAGTGGAAACATA
ACAAAACTTAAACATCTTGATCTTTCTAGCAATAACCTTAACTCCACTATACCAAATTGG
CTCTATCAATGTAAAGATCTAGAATCACTTTTCCTTGGATCAAATCGTCTTGAGGGAACA
GTTTCAAGTCTGATTTCAAATTTGAGCTCAATAATTAGTATTGACCTTTTTGATAATATG
CTTTCCGGAAAGTTACCAAATGTAATTGGAAAGTTAGGGAAATTAGGATCGCTTGAACTC
TCAGTAAATCAATTTGAGGGAGATATATCTGAATTATTCAATTTTATGAGTAATTTCCTT
TCCATAGAATTTGGAAATAGTTCTTCTTTAACTGTGTTGAGTCTAGACAATAATAAACTC
ACAGGAGCTGTTCCGGAAAGTGTTGGCCATCTTTCAATGCTACAAGGCCCTTTGTTTCCC
ACGTGGCTCAGAACTCAAAAAAAGATATTGAATGTCGACATATCAGATGGTGGAATACAA
GGTGAGGTTCCAACTTGGTTTTGGAAATTGTCTCCTCAAATTCGATTACTCAATCTTTCT
CACAACCAATTTGTTGGTGAGGTTCCAATCATCTCGACAGATGAGCAAAGTGATTCTTGG
CTATTAATGTACTTGGGTTCCAACAATTTTAGTGGACCAATACCATTGATTTCAACAAAT
GTAAGAGAGCTAGATCTCTCAAACAATTCTTTTTCCAAAGGTTTATCTAACTTTTTGTGT
GAAGCAAAGAATGGATCTTACAAATTGAGAATCTTAAACCTCGGGGGAAATGATTTATCA
GAAGAAATTCCTGATTGTTGGATGAATTGGCCGGAGTTGAAAGTTTTAATCTTGAGGGAC
AATAATTTGATTGGAAGCTTACCAAGATCTATGGAGGTTTTGAGTAATTTGCGATCATTA
GACTTACGAAGAAATAGACTTAACGGTCCGTTTCCTTCATCCTTGGAAAACTTCACAAAA
CTGCATAAAATAGATTTAGCTGAGAATGACTTTTTTGGAAAATTACCATCTTGGTTGGGA
ATGAGGTTTCCAACCTTAATAGTTCTTATCCTTCGGTCCAATAAATTTGATGGTGAATTG
CCTAAAGAACTATGTCACCTCAAAGATCTTCAGATCTTAGACCTTGCAAACAATACATTT
GTTGGAATCATACCAAGGTGTATTGGCAATTTGAGTGCGATGGTCAAAGTAAAAAAGAAA
GTACTGGAAGATGATTTCGAGTTAAATTATTCCTCTCGTTATGGAACTTTGATAGAGAGT
GCAATGGTGATGACTAAAGGCAACATGTACCAGTATGATACAATTTTGGTGTTGTTTACA
AGTTTGGATATGTCTAGCAATAATCTTTCTGGAGATATTCCTATAAGTGTAACACGTCTT
GCAGGATTAAGATCATTTAATCTTTCAAAAAATAATCTGATTGGTAGGATTCCAAATGAC
ATTGGTGATATGAAAGTCTTGGAATCTGTTGATCTTTCAGAAAATCAACTTTATGGTCAA
ATCCCACAAAGCTTTTCAAGTTTGACCACTTTGGACTGCTTGAATCTATCTGATAACAAT
TTGTCAGGTATGATACCATTGAGCACTCAACTTCAAAGCTTTGATCCCACGAGTTTTCAA
GGAAGTAAACTTTGCGGGCTCCCACTCTTGGTGAACTGCAGTTCGAATGGTAATGTTCCA
AATCACGAATATGAAGATGAGGAGAGTGACAAAGATGAAGTGGATTGGTTTTACATTTCA
ATGGCTATAGGATTTGCACTAAGCTTTTGGGGTGTTTGTGGTTCATTGCTTTTCAAGAGA
TCATGGAGATATGCTTATTTTCGTTTTCTAGACCATGGCTGGGAAATGTTGCTTGCAAAG
TTACCAGTATGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400025964
PEP Infomation

pacid=37435374 transcript=PGSC0003DMT400038216 locus=PGSC0003DMG400014740 ID=PGSC0003DMT400038216.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MKVLAITLWVLLFFILTNTKFVVCVGICRDNEQQALETLKKEVYDPSNRLASWVVGKDCC
EWEGVVCNNLTRHVIELSIYSDQIESRYLRINSLEWLTSLSSLENLEMYNVDLSKANEWL
QVINMLPSLVYLRLYKCSLSSLELRYGGIEGAIQSKSGNITKLKHLDLSSNNLNSTIPNW
LYQCKDLESLFLGSNRLEGTVSSLISNLSSIISIDLFDNMLSGKLPNVIGKLGKLGSLEL
SVNQFEGDISELFNFMSNFLSIEFGNSSSLTVLSLDNNKLTGAVPESVGHLSMLQGPLFP
TWLRTQKKILNVDISDGGIQGEVPTWFWKLSPQIRLLNLSHNQFVGEVPIISTDEQSDSW
LLMYLGSNNFSGPIPLISTNVRELDLSNNSFSKGLSNFLCEAKNGSYKLRILNLGGNDLS
EEIPDCWMNWPELKVLILRDNNLIGSLPRSMEVLSNLRSLDLRRNRLNGPFPSSLENFTK
LHKIDLAENDFFGKLPSWLGMRFPTLIVLILRSNKFDGELPKELCHLKDLQILDLANNTF
VGIIPRCIGNLSAMVKVKKKVLEDDFELNYSSRYGTLIESAMVMTKGNMYQYDTILVLFT
SLDMSSNNLSGDIPISVTRLAGLRSFNLSKNNLIGRIPNDIGDMKVLESVDLSENQLYGQ
IPQSFSSLTTLDCLNLSDNNLSGMIPLSTQLQSFDPTSFQGSKLCGLPLLVNCSSNGNVP
NHEYEDEESDKDEVDWFYISMAIGFALSFWGVCGSLLFKRSWRYAYFRFLDHGWEMLLAK
LPVC*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400038216
Transcript Infomation

pacid=37435374 locus=PGSC0003DMG400014740 ID=PGSC0003DMT400038216.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAAGTGTTAGCAATAACACTATGGGTTCTCTTGTTTTTTATTTTGACAAATACCAAG
TTTGTTGTTTGTGTAGGGATTTGCAGAGACAATGAGCAACAAGCGTTGGAGACCTTGAAG
AAAGAAGTATATGATCCCTCGAATCGTCTCGCTTCTTGGGTAGTCGGAAAAGATTGTTGT
GAATGGGAAGGGGTCGTGTGCAACAATCTCACTCGTCATGTGATTGAGCTAAGCATTTAT
AGTGATCAGATCGAGTCGAGATATCTAAGGATCAATAGCCTAGAGTGGTTGACAAGTCTT
TCGAGTCTTGAGAACCTAGAAATGTATAATGTGGATCTTAGCAAAGCTAATGAATGGCTA
CAAGTTATTAACATGCTTCCTTCTCTTGTTTATCTTCGTCTATACAAATGTAGTCTTTCA
AGTCTTGAGCTCCGTTATGGTGGCATTGAAGGTGCGATACAGAGTAAGAGTGGAAACATA
ACAAAACTTAAACATCTTGATCTTTCTAGCAATAACCTTAACTCCACTATACCAAATTGG
CTCTATCAATGTAAAGATCTAGAATCACTTTTCCTTGGATCAAATCGTCTTGAGGGAACA
GTTTCAAGTCTGATTTCAAATTTGAGCTCAATAATTAGTATTGACCTTTTTGATAATATG
CTTTCCGGAAAGTTACCAAATGTAATTGGAAAGTTAGGGAAATTAGGATCGCTTGAACTC
TCAGTAAATCAATTTGAGGGAGATATATCTGAATTATTCAATTTTATGAGTAATTTCCTT
TCCATAGAATTTGGAAATAGTTCTTCTTTAACTGTGTTGAGTCTAGACAATAATAAACTC
ACAGGAGCTGTTCCGGAAAGTGTTGGCCATCTTTCAATGCTACAAGGCCCTTTGTTTCCC
ACGTGGCTCAGAACTCAAAAAAAGATATTGAATGTCGACATATCAGATGGTGGAATACAA
GGTGAGGTTCCAACTTGGTTTTGGAAATTGTCTCCTCAAATTCGATTACTCAATCTTTCT
CACAACCAATTTGTTGGTGAGGTTCCAATCATCTCGACAGATGAGCAAAGTGATTCTTGG
CTATTAATGTACTTGGGTTCCAACAATTTTAGTGGACCAATACCATTGATTTCAACAAAT
GTAAGAGAGCTAGATCTCTCAAACAATTCTTTTTCCAAAGGTTTATCTAACTTTTTGTGT
GAAGCAAAGAATGGATCTTACAAATTGAGAATCTTAAACCTCGGGGGAAATGATTTATCA
GAAGAAATTCCTGATTGTTGGATGAATTGGCCGGAGTTGAAAGTTTTAATCTTGAGGGAC
AATAATTTGATTGGAAGCTTACCAAGATCTATGGAGGTTTTGAGTAATTTGCGATCATTA
GACTTACGAAGAAATAGACTTAACGGTCCGTTTCCTTCATCCTTGGAAAACTTCACAAAA
CTGCATAAAATAGATTTAGCTGAGAATGACTTTTTTGGAAAATTACCATCTTGGTTGGGA
ATGAGGTTTCCAACCTTAATAGTTCTTATCCTTCGGTCCAATAAATTTGATGGTGAATTG
CCTAAAGAACTATGTCACCTCAAAGATCTTCAGATCTTAGACCTTGCAAACAATACATTT
GTTGGAATCATACCAAGGTGTATTGGCAATTTGAGTGCGATGGTCAAAGTAAAAAAGAAA
GTACTGGAAGATGATTTCGAGTTAAATTATTCCTCTCGTTATGGAACTTTGATAGAGAGT
GCAATGGTGATGACTAAAGGCAACATGTACCAGTATGATACAATTTTGGTGTTGTTTACA
AGTTTGGATATGTCTAGCAATAATCTTTCTGGAGATATTCCTATAAGTGTAACACGTCTT
GCAGGATTAAGATCATTTAATCTTTCAAAAAATAATCTGATTGGTAGGATTCCAAATGAC
ATTGGTGATATGAAAGTCTTGGAATCTGTTGATCTTTCAGAAAATCAACTTTATGGTCAA
ATCCCACAAAGCTTTTCAAGTTTGACCACTTTGGACTGCTTGAATCTATCTGATAACAAT
TTGTCAGGTATGATACCATTGAGCACTCAACTTCAAAGCTTTGATCCCACGAGTTTTCAA
GGAAGTAAACTTTGCGGGCTCCCACTCTTGGTGAACTGCAGTTCGAATGGTAATGTTCCA
AATCACGAATATGAAGATGAGGAGAGTGACAAAGATGAAGTGGATTGGTTTTACATTTCA
ATGGCTATAGGATTTGCACTAAGCTTTTGGGGTGTTTGTGGTTCATTGCTTTTCAAGAGA
TCATGGAGATATGCTTATTTTCGTTTTCTAGACCATGGCTGGGAAATGTTGCTTGCAAAG
TTACCAGTATGTTGA