Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400038064
CDS Infomation

pacid=37440842 polypeptide=PGSC0003DMP400025857 locus=PGSC0003DMG400014676 ID=PGSC0003DMT400038064.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCGTGTCCGTTGGAACTCTAACTGGTGTAGTAGGTTAAGAGAATTACTATGTCATGGC
AAATCTCAAGACGTTCTTCTCCACTACCGTGAATTGAACAAGACCGGGGTTGAGTTGCCG
GACCATTCCGTTTTCCCTATCCTTTTCAAAGCATGTTTAAATCTCTCCGCTACACACGGC
CACAGCGGCAACTCTATCCACGCCTCTCTGGTTAAGCAGGGATTCTTAGCTTTCACCTCC
GTCGGTAATTCTATGATGGACTTCTATGCTAAATCTGGAGACTTGGGTTCTGCGCTTGTT
GTTTTTAACTGCATGGACAACAAAGATTCAGTTTCCTGGAATGTAATCATTCATGGCCAC
TTATTAGAGCGAGATGCTTCTCCCCAAGGATTATGCTTCTTCACTCAGGCTTGGGCTGCA
GGTTTTGAACCCAACATCTCCACTTTTGTACTTGTCATTCAGGCTTGTCGCAATCTTACA
GCTTTTGAGGCTGGCCGGACGATCCATGCTTCTACTCTTCGTGCTGGGTATTCAAGTATT
ACTTCCATCCACAACTCGCTCCTCAGTTTCTATGCTCAATTCGGAATGCACCTTGCGCAC
AACCTTTTTGATGAAATGACTGAAAGAGACGTTATTTCTTGGAGTGTCATGATTGCTGCC
TATGCCCAAAGTGCGGACGAAACAGTGCTTTCCCTGGAGTTTTTTCAACGGATGATTGAC
TTTGGGAAACCACCAGACGGACAATCTGTGGTAAGTGTACTCAAAGCCTGCACCAAATTG
AAGGCCATTAGAATGGGAGAGTCAATTCACGGATTAGTTATCTCTAGAGGTCTGGGTTAT
GATTTGTTCGTATACAACTCTCTGATCGACTTGTATTCTAAATGCAATGACATTGATTCT
TCATTGAGAGTTTTCCGGGGAATTCCTGAGAAGAATGTCGTGTCCTGGAACTCTTTGTTG
TCTGGACTTGTGCAGAATGAGATGCATTCTGAGGCCCTTACTTTATTTGATTCGATGCGC
AAGGCTGGAGTTGAATCTGATGAGGTGACTCTGGTCAATCTGCTGCAGTTATGTAAGTTC
TTCCTTGACCCTTGCCAGTGCAAGTTGATACATTCCAGAATACTTCGACAAGGTTTTGAG
TTGAATGAGTTGGTTACAAACTCTTTGATCGATGCATATGCAAGTTGCAATCTCATAACT
TATGCATGGAGTCAATTTAATAATATGACAACACGAGATGCAGTAACTTGGAGCACCATG
ATTGCTGGCTTCACCCACTGTGGCATGCCTGACGAAGCAATTGCTGTTTTCCGAGAGATG
AGCCACACCTCTGAACGGCCCAATGCTGTTACCATGTTAAATCTTCTTGAAGCTTGCGCT
CTTTCTGCAGATATGAAAAGATCAAGGTGGGCTCATGGCATTGCTATTCGAGGAGGGTTG
GCATCTAATGTGGTAGTGGGAACTGCGATCTTAGATATGTACTCAAAATGTGGTTCTATT
GGATCTTCAAGAAAAGTGTTTGACCGGATTCCATACAAGAATGTTGTGACCTGGAGTGCC
ATTATTGCAGCATATGGTATGATTGGCCTCCCAAATGAAGCTCTATCCCTACTTGCTGAG
ATGAAAGTTTGTGGTCTGAGGCCAAACCAAGTTACTGCATTATCTCTTTTATCGGCTTGT
AGTCATGGGGGATTGGTAGAAGAAGGGCTCTCTCTTTTTGAGGAGTTGATTTGGGATCAT
GAGGTTGAACCTGGCATAGAACATTACTCTTGCCTTGTAGATTTGTTAGCTCGGGCTGGA
AAGGTTGATAGTGCAATGAATTTGATAGGAAAGCTAGGTGTTGGACTAAAGCCTGGTGCA
AGTGCATGGGGGGCACTCTTGAGTGCTTGTAGGAACTATGAAAACTATGAGTTTGGTGCC
ATTGCCCTCCCTCAAGTAGTTGAACTTGAGCCGTCAAGTTCAGCTGGCTATCTGCTTGCA
TCAAACATGTATGCATCAGGTCGTTCATGGGTTGATGCCACTAAAATGAGAATGCTGGCT
AAGGAAGGAGGGGTCAAAGTTACAGCTGGCTATAGCTTAGTGTATGTAAATGGTAAGGCT
TGCAGGTTTCTTGCGGGAGAAAACCACCATTGTTTGTCTGATGAATTGCAGTTTGCTATT
CAGCAACTGCACTCGAGCATGAAAATGGACATTACCTGCGGATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400025857
PEP Infomation

pacid=37440842 transcript=PGSC0003DMT400038064 locus=PGSC0003DMG400014676 ID=PGSC0003DMT400038064.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MRVRWNSNWCSRLRELLCHGKSQDVLLHYRELNKTGVELPDHSVFPILFKACLNLSATHG
HSGNSIHASLVKQGFLAFTSVGNSMMDFYAKSGDLGSALVVFNCMDNKDSVSWNVIIHGH
LLERDASPQGLCFFTQAWAAGFEPNISTFVLVIQACRNLTAFEAGRTIHASTLRAGYSSI
TSIHNSLLSFYAQFGMHLAHNLFDEMTERDVISWSVMIAAYAQSADETVLSLEFFQRMID
FGKPPDGQSVVSVLKACTKLKAIRMGESIHGLVISRGLGYDLFVYNSLIDLYSKCNDIDS
SLRVFRGIPEKNVVSWNSLLSGLVQNEMHSEALTLFDSMRKAGVESDEVTLVNLLQLCKF
FLDPCQCKLIHSRILRQGFELNELVTNSLIDAYASCNLITYAWSQFNNMTTRDAVTWSTM
IAGFTHCGMPDEAIAVFREMSHTSERPNAVTMLNLLEACALSADMKRSRWAHGIAIRGGL
ASNVVVGTAILDMYSKCGSIGSSRKVFDRIPYKNVVTWSAIIAAYGMIGLPNEALSLLAE
MKVCGLRPNQVTALSLLSACSHGGLVEEGLSLFEELIWDHEVEPGIEHYSCLVDLLARAG
KVDSAMNLIGKLGVGLKPGASAWGALLSACRNYENYEFGAIALPQVVELEPSSSAGYLLA
SNMYASGRSWVDATKMRMLAKEGGVKVTAGYSLVYVNGKACRFLAGENHHCLSDELQFAI
QQLHSSMKMDITCG*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400038064
Transcript Infomation

pacid=37440842 locus=PGSC0003DMG400014676 ID=PGSC0003DMT400038064.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCGTGTCCGTTGGAACTCTAACTGGTGTAGTAGGTTAAGAGAATTACTATGTCATGGC
AAATCTCAAGACGTTCTTCTCCACTACCGTGAATTGAACAAGACCGGGGTTGAGTTGCCG
GACCATTCCGTTTTCCCTATCCTTTTCAAAGCATGTTTAAATCTCTCCGCTACACACGGC
CACAGCGGCAACTCTATCCACGCCTCTCTGGTTAAGCAGGGATTCTTAGCTTTCACCTCC
GTCGGTAATTCTATGATGGACTTCTATGCTAAATCTGGAGACTTGGGTTCTGCGCTTGTT
GTTTTTAACTGCATGGACAACAAAGATTCAGTTTCCTGGAATGTAATCATTCATGGCCAC
TTATTAGAGCGAGATGCTTCTCCCCAAGGATTATGCTTCTTCACTCAGGCTTGGGCTGCA
GGTTTTGAACCCAACATCTCCACTTTTGTACTTGTCATTCAGGCTTGTCGCAATCTTACA
GCTTTTGAGGCTGGCCGGACGATCCATGCTTCTACTCTTCGTGCTGGGTATTCAAGTATT
ACTTCCATCCACAACTCGCTCCTCAGTTTCTATGCTCAATTCGGAATGCACCTTGCGCAC
AACCTTTTTGATGAAATGACTGAAAGAGACGTTATTTCTTGGAGTGTCATGATTGCTGCC
TATGCCCAAAGTGCGGACGAAACAGTGCTTTCCCTGGAGTTTTTTCAACGGATGATTGAC
TTTGGGAAACCACCAGACGGACAATCTGTGGTAAGTGTACTCAAAGCCTGCACCAAATTG
AAGGCCATTAGAATGGGAGAGTCAATTCACGGATTAGTTATCTCTAGAGGTCTGGGTTAT
GATTTGTTCGTATACAACTCTCTGATCGACTTGTATTCTAAATGCAATGACATTGATTCT
TCATTGAGAGTTTTCCGGGGAATTCCTGAGAAGAATGTCGTGTCCTGGAACTCTTTGTTG
TCTGGACTTGTGCAGAATGAGATGCATTCTGAGGCCCTTACTTTATTTGATTCGATGCGC
AAGGCTGGAGTTGAATCTGATGAGGTGACTCTGGTCAATCTGCTGCAGTTATGTAAGTTC
TTCCTTGACCCTTGCCAGTGCAAGTTGATACATTCCAGAATACTTCGACAAGGTTTTGAG
TTGAATGAGTTGGTTACAAACTCTTTGATCGATGCATATGCAAGTTGCAATCTCATAACT
TATGCATGGAGTCAATTTAATAATATGACAACACGAGATGCAGTAACTTGGAGCACCATG
ATTGCTGGCTTCACCCACTGTGGCATGCCTGACGAAGCAATTGCTGTTTTCCGAGAGATG
AGCCACACCTCTGAACGGCCCAATGCTGTTACCATGTTAAATCTTCTTGAAGCTTGCGCT
CTTTCTGCAGATATGAAAAGATCAAGGTGGGCTCATGGCATTGCTATTCGAGGAGGGTTG
GCATCTAATGTGGTAGTGGGAACTGCGATCTTAGATATGTACTCAAAATGTGGTTCTATT
GGATCTTCAAGAAAAGTGTTTGACCGGATTCCATACAAGAATGTTGTGACCTGGAGTGCC
ATTATTGCAGCATATGGTATGATTGGCCTCCCAAATGAAGCTCTATCCCTACTTGCTGAG
ATGAAAGTTTGTGGTCTGAGGCCAAACCAAGTTACTGCATTATCTCTTTTATCGGCTTGT
AGTCATGGGGGATTGGTAGAAGAAGGGCTCTCTCTTTTTGAGGAGTTGATTTGGGATCAT
GAGGTTGAACCTGGCATAGAACATTACTCTTGCCTTGTAGATTTGTTAGCTCGGGCTGGA
AAGGTTGATAGTGCAATGAATTTGATAGGAAAGCTAGGTGTTGGACTAAAGCCTGGTGCA
AGTGCATGGGGGGCACTCTTGAGTGCTTGTAGGAACTATGAAAACTATGAGTTTGGTGCC
ATTGCCCTCCCTCAAGTAGTTGAACTTGAGCCGTCAAGTTCAGCTGGCTATCTGCTTGCA
TCAAACATGTATGCATCAGGTCGTTCATGGGTTGATGCCACTAAAATGAGAATGCTGGCT
AAGGAAGGAGGGGTCAAAGTTACAGCTGGCTATAGCTTAGTGTATGTAAATGGTAAGGCT
TGCAGGTTTCTTGCGGGAGAAAACCACCATTGTTTGTCTGATGAATTGCAGTTTGCTATT
CAGCAACTGCACTCGAGCATGAAAATGGACATTACCTGCGGATAG