Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400037751
CDS Infomation

pacid=37444327 polypeptide=PGSC0003DMP400025658 locus=PGSC0003DMG400014564 ID=PGSC0003DMT400037751.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAATTCAAGAAAATTTCTTATGCACACCAAGTGTTTGATCAAATTCCTGACTTACAA
GATGCTTCTCCTTGGAACATAATGTTTAAAGGGTATATTCAGAATGATATGTACAGGGAT
GTTGTTGTGTCGTTTCGTCGTATGATGAACGAAGATGTTAGTTTGAATTGTTTTTCATTT
CCTATGGTTTTGAAGTCTTGTGTAAAGTTATTGGCTTTAGTAGAAGGTGAAGAAGTGCAT
GGTGTGGTGGTAAAGGTTGGGTTTTTGACCAATACTTTTGTGGGTAGCACTTTGATTGAT
ATGTATTCAAGTGTTGGGCGAGTGAAATGCGCTTATAGGGTGTTTAATGAGATGGTTTTA
CGGAATGTTTTTACGTGGACTTCTATGATCAATGGATATGTTGCAAATGGTGATTTGGTA
TCTGCAAGAATGCTTTTTGACTTGGCGCCTGAGCGAGATGTTGTGTTATGGAATAGGATG
GTTACAGGGTATATTGAATGTCGGGATATGGAAGAGGCTCGAAAGCTTTTTGATGTGATG
CCAAACAAAGATATAATGTCATGGAATACTATGTTGAATGGTTATGCCAATAATGGGGAT
GTTGAGGGGTGTGAGAATCTTTTCGAAGAGATGAAAGAGAGAAATATTTTTTCATGGAAT
GGTCTGATTGGAGGGTACGCTCACAATGGGCGTTTCACCGAGGTTATTAATGCTTTTAAG
AGGATGTTAAATGAGTCTGATGTGAAGCCTAACGATGCCACCCTTGTGAATGTTTTGTCT
GCTTGCACGAGATTAGGTGCTCTTGATTTGGGTAAGTGGGTGCACGTATATGCTGAGAGC
AATGGGTATAAGCACAATGTATATGTTGCCAATGGGTTGATCGATATGTATGCAAAATGT
GGGGTGGTTGGTAATGCTGTTGATGTGTTTAGGAGTATGGATAAAAGAGATTTGATTTCT
TGGAACACCATCATTAATGGCTTAGCGGTGCATGGTCGGGGTAGTGATGCCTTGAGTTTG
TTTGTTGAGATGAAGAATTCTGGAGTAGAACCGGATGGAATTACTTTTATTGGAGTGTTA
TGTGCATGTTCTCACATGGGTTTAGTTGCGGAAGGATTCACCTATTTTAACACAATGGCG
AATGCTTATTCCATTACGCCTAAAATTGAGCATTATGGTTGCATGGTTGATCTATTGGGC
AGAGCTGGTCTTTTGGAGCAGGCTGTGAAATTTGTGGAGAAGATGCCTGTACAAGCTGAT
GCTATCATTTGGACAGCATTACTTGGCGCGTGTAGAGTATACAAAAACATTGACTTTGCA
AGACTGGTTCTTCAGAAACTTATTGAGCTTGACCCGAAAAACCCTGCAAATTACGTTATG
CTAGCAAATATCTGTGGTGATGCTCGGAGGTGGAAAGACGTGGCAGAGCTAAAAGTGGCG
ATGAGGGACACTGGATCCCGTAAGGTTCCGGGATGCAGCTTGATTGAGGTTGCTGATGAA
GTGGCTGAGTTCTATTGCTTCGACGAGAGGCATTCCAAGTCAAAAGAGATATATGGTGCC
TTGAGAAGCTTGATGAAGGCATCAAAATCATCTGGTCCAGAAAGTCCATTATTTTTAATG
GATTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400025658
PEP Infomation

pacid=37444327 transcript=PGSC0003DMT400037751 locus=PGSC0003DMG400014564 ID=PGSC0003DMT400037751.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEFKKISYAHQVFDQIPDLQDASPWNIMFKGYIQNDMYRDVVVSFRRMMNEDVSLNCFSF
PMVLKSCVKLLALVEGEEVHGVVVKVGFLTNTFVGSTLIDMYSSVGRVKCAYRVFNEMVL
RNVFTWTSMINGYVANGDLVSARMLFDLAPERDVVLWNRMVTGYIECRDMEEARKLFDVM
PNKDIMSWNTMLNGYANNGDVEGCENLFEEMKERNIFSWNGLIGGYAHNGRFTEVINAFK
RMLNESDVKPNDATLVNVLSACTRLGALDLGKWVHVYAESNGYKHNVYVANGLIDMYAKC
GVVGNAVDVFRSMDKRDLISWNTIINGLAVHGRGSDALSLFVEMKNSGVEPDGITFIGVL
CACSHMGLVAEGFTYFNTMANAYSITPKIEHYGCMVDLLGRAGLLEQAVKFVEKMPVQAD
AIIWTALLGACRVYKNIDFARLVLQKLIELDPKNPANYVMLANICGDARRWKDVAELKVA
MRDTGSRKVPGCSLIEVADEVAEFYCFDERHSKSKEIYGALRSLMKASKSSGPESPLFLM
D*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400037751
Transcript Infomation

pacid=37444327 locus=PGSC0003DMG400014564 ID=PGSC0003DMT400037751.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAATTCAAGAAAATTTCTTATGCACACCAAGTGTTTGATCAAATTCCTGACTTACAA
GATGCTTCTCCTTGGAACATAATGTTTAAAGGGTATATTCAGAATGATATGTACAGGGAT
GTTGTTGTGTCGTTTCGTCGTATGATGAACGAAGATGTTAGTTTGAATTGTTTTTCATTT
CCTATGGTTTTGAAGTCTTGTGTAAAGTTATTGGCTTTAGTAGAAGGTGAAGAAGTGCAT
GGTGTGGTGGTAAAGGTTGGGTTTTTGACCAATACTTTTGTGGGTAGCACTTTGATTGAT
ATGTATTCAAGTGTTGGGCGAGTGAAATGCGCTTATAGGGTGTTTAATGAGATGGTTTTA
CGGAATGTTTTTACGTGGACTTCTATGATCAATGGATATGTTGCAAATGGTGATTTGGTA
TCTGCAAGAATGCTTTTTGACTTGGCGCCTGAGCGAGATGTTGTGTTATGGAATAGGATG
GTTACAGGGTATATTGAATGTCGGGATATGGAAGAGGCTCGAAAGCTTTTTGATGTGATG
CCAAACAAAGATATAATGTCATGGAATACTATGTTGAATGGTTATGCCAATAATGGGGAT
GTTGAGGGGTGTGAGAATCTTTTCGAAGAGATGAAAGAGAGAAATATTTTTTCATGGAAT
GGTCTGATTGGAGGGTACGCTCACAATGGGCGTTTCACCGAGGTTATTAATGCTTTTAAG
AGGATGTTAAATGAGTCTGATGTGAAGCCTAACGATGCCACCCTTGTGAATGTTTTGTCT
GCTTGCACGAGATTAGGTGCTCTTGATTTGGGTAAGTGGGTGCACGTATATGCTGAGAGC
AATGGGTATAAGCACAATGTATATGTTGCCAATGGGTTGATCGATATGTATGCAAAATGT
GGGGTGGTTGGTAATGCTGTTGATGTGTTTAGGAGTATGGATAAAAGAGATTTGATTTCT
TGGAACACCATCATTAATGGCTTAGCGGTGCATGGTCGGGGTAGTGATGCCTTGAGTTTG
TTTGTTGAGATGAAGAATTCTGGAGTAGAACCGGATGGAATTACTTTTATTGGAGTGTTA
TGTGCATGTTCTCACATGGGTTTAGTTGCGGAAGGATTCACCTATTTTAACACAATGGCG
AATGCTTATTCCATTACGCCTAAAATTGAGCATTATGGTTGCATGGTTGATCTATTGGGC
AGAGCTGGTCTTTTGGAGCAGGCTGTGAAATTTGTGGAGAAGATGCCTGTACAAGCTGAT
GCTATCATTTGGACAGCATTACTTGGCGCGTGTAGAGTATACAAAAACATTGACTTTGCA
AGACTGGTTCTTCAGAAACTTATTGAGCTTGACCCGAAAAACCCTGCAAATTACGTTATG
CTAGCAAATATCTGTGGTGATGCTCGGAGGTGGAAAGACGTGGCAGAGCTAAAAGTGGCG
ATGAGGGACACTGGATCCCGTAAGGTTCCGGGATGCAGCTTGATTGAGGTTGCTGATGAA
GTGGCTGAGTTCTATTGCTTCGACGAGAGGCATTCCAAGTCAAAAGAGATATATGGTGCC
TTGAGAAGCTTGATGAAGGCATCAAAATCATCTGGTCCAGAAAGTCCATTATTTTTAATG
GATTAG