Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400037696
CDS Infomation

pacid=37443500 polypeptide=PGSC0003DMP400025612 locus=PGSC0003DMG400014540 ID=PGSC0003DMT400037696.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAATTTTTCTTTTCTTCCTCATTCTTACTAGTCTTTACAATATGCATAATAGGTTGT
GTGAATTTGGTCTACACAGCTCCAACCAAGATTGGCAATGGCTATAGTTTGATAGCCATT
GAAGAGTCACCAGATGGTGGCCTCATAGGTTACCTTAAAGTTAAGAAGAAAAACAACATT
TATGGCCCTGATATTCCTAACTTGCAGCTCTATGTCAAGCATGAGACAGATAATCGTTTG
AGGATTCACATAACAGATGCAGATAAGCAAAGATGGGAAGTTCCTTACAACTTATTACCA
AGAGAAACACCTCCATCACTTAAACAAACAATTGGCAAATCAAGAAAAGGCCAATTTTCA
CTTTTGTCCAATCAAGAATACTCAGGAAATGAGTTAATGTTCAGTTACACAAGTGACCCT
TTTAGTTTTTCTGTTAAAAGAAAATCAAATGGACAAACCCTTTTCAATTCAAGTAGTGAA
GATTCTGATCCATATAGTAATTTGGTATTTAAAGATCAGTATCTTGAAATATCAACAAAA
TTGCCTAAAGATGCTTCATTATATGGTCTTGGTGAAAATACACAACCTCATGGTATTAAA
ATTTACCCAAATGACCCTTACACTTTGTACACAACAGATCAATCATCAATCAATTTGAAT
ATGGATTTATATGGATCACATCCAATGTATATGGATTTGAGAAATGTGAATGGTGAAGCT
TATGCTCATGCAGTTTTGTTGATGAATAGTAATGGTATGGATGTGTTCTATAGAGGGGAT
TCATTGACATACAAAGTGATTGGGGGTGTTTTGGACTTTTACTTCTTCTCTGGGCCCACA
CCTCTTGCTGTTGTTGATCAATATACTCAATTTATAGGAAGGCCTGCTCCTATGCCCTAT
TGGTCCTTTGGTTTCCATCAATGTAGATGGGGTTACCACAATTTATCTGTGATTGAAGAT
GTTATTGCCAATTACAAGAAAGCAAAAATCCCTCTTGATGTTATATGGAATGATGATGAT
CATATGGATGGGAAAAAGGACTTCACCCTCCATCCTGTTAACTACCCTGGCCCAAAGTTG
AGAGCTTTCTTAGAGAAAATTCATGCTGAAGGAATGCATTACATTGTGATCAATGATCCT
GGAATTGGAGTTAACAAAAGTTATGGTACTTACCAAAGAGGTTTAGCCAATGATGTTTTC
ATCAAATACGAAGGGAAACCGTTTCTAGCACAAGTCTGGCCTGGTGCTGTTCATTTCCCT
GACTTCCTCAACCCGAAAACAGTTGAGTGGTGGGGTGATGAGATTCGACGTTTCCATGAA
CTTGCTCCTATTGATGGACTATGGATTGACATGAATGAAGTTTCCAACTTTTGTAATGGT
TTGTGCACGATCCCCAAGGGTAGGATATGTCCTAATGGGACAGGTCCTGGTTGGATATGT
TGCTTGGATTGCAAGAATGTAACGAAAACAAAGTGGGATGATCCGCCTTACAAGATAAAT
GCTTCTGGTATTCAAGCTCCAATAGGTTACAAAACGATTGCTACGAGTGCAACACATTAT
AATGGTGTTAGGGAATATGATGCTCATAGTCTTTATGGTTTCTCTGAGACTATTGCAACT
CACAAGGGTCTACAAGCTATAGAGGGAAAACGTCCGTTCATATTGACTCGTGCCACGTTT
GTTGGTTCAGGACATTATGCTGCACATTGGACAGGGGATAACAAAGGTACTTGGAAGGAT
TTGAAGTATTCAATCTCTACTGTCTTGAACTTTGGTATATTTGGTGTTCCTATGGTTGGT
TCAGACATATGTGGATTTTACCCCGCGGCTCCTCCTTTGGAGGAGCTATGCAACCGTTGG
ATTCAAGTAGGCGCGTTCTATCCCTTCTCAAGGGATCACGCGAACTATTACTCACCAAGA
CAAGAGCTTTACCAATGGAAAAGTGTGACTAAATCTTCGCGTAATGCTTTAGGAATGAGA
TACAAATTGTTGCCTTATCTCTACACATTGAGCTACGAGGCACACAAAACCGGAGCACCA
ATTGTAAGGCCACTCTTCTTCACTTTCCCAAACATTCCAGAGCTTTACGAGTTAAGCACT
CAATTCTTGGTAGGAAGCAATGTCATGGTCTCTCCAGTGCTAGAAAAGGCTAAAACTAAG
GTAAGCGCGCTCTTTCCTCCAGGTACTTGGTACAGTTTATTCGATATGACACAAGTCATT
GTCACAAAAGAGCCACATTACCGCTCACTTGATGCACCATTGCACGTAGTCAACGTGCAT
TTGTACCAAAACACCATACTACCAATGCAACGCGGAGGGATGTTAACAAAAGAAGCAAGA
ATGACACCTTTCACAATCGTTGTAGCCTTCCCACTCGGGGCATCAGAAGGGGTAGCTAAA
GGAAATCTTTTCCTCGACGATGATGAGCTTCCTGAGATGAAACTAGGAAATGGGAAGTCA
ACATACATGGATTTCCACGCGACAACTAGCAATGGTACAGTGAAGATTTGGTCTGAAGTT
CAAGAAAGTAAATACGCGTTGGATAAAGGTTGGTACATCGAAAAGGTTACCGTGTTAGGA
TTGAATGGAATTGGAGGTGCATTTGACATTCTTGTTGATGGAAGTAAAGTTGAAGATACT
TCAAAGTTGGAATTTGAAACAGAAGAGCACAAGTTTATAGACAAATTGGAAGAGGGAGGT
CACAAGAAGAGTATGATGCTAGATATTAAAGGATTAGAATTACCAATTGGTAAAAACTTT
GCTATGTCTTGGAAAATGGGGGTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400025612
PEP Infomation

pacid=37443500 transcript=PGSC0003DMT400037696 locus=PGSC0003DMG400014540 ID=PGSC0003DMT400037696.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MKFFFSSSFLLVFTICIIGCVNLVYTAPTKIGNGYSLIAIEESPDGGLIGYLKVKKKNNI
YGPDIPNLQLYVKHETDNRLRIHITDADKQRWEVPYNLLPRETPPSLKQTIGKSRKGQFS
LLSNQEYSGNELMFSYTSDPFSFSVKRKSNGQTLFNSSSEDSDPYSNLVFKDQYLEISTK
LPKDASLYGLGENTQPHGIKIYPNDPYTLYTTDQSSINLNMDLYGSHPMYMDLRNVNGEA
YAHAVLLMNSNGMDVFYRGDSLTYKVIGGVLDFYFFSGPTPLAVVDQYTQFIGRPAPMPY
WSFGFHQCRWGYHNLSVIEDVIANYKKAKIPLDVIWNDDDHMDGKKDFTLHPVNYPGPKL
RAFLEKIHAEGMHYIVINDPGIGVNKSYGTYQRGLANDVFIKYEGKPFLAQVWPGAVHFP
DFLNPKTVEWWGDEIRRFHELAPIDGLWIDMNEVSNFCNGLCTIPKGRICPNGTGPGWIC
CLDCKNVTKTKWDDPPYKINASGIQAPIGYKTIATSATHYNGVREYDAHSLYGFSETIAT
HKGLQAIEGKRPFILTRATFVGSGHYAAHWTGDNKGTWKDLKYSISTVLNFGIFGVPMVG
SDICGFYPAAPPLEELCNRWIQVGAFYPFSRDHANYYSPRQELYQWKSVTKSSRNALGMR
YKLLPYLYTLSYEAHKTGAPIVRPLFFTFPNIPELYELSTQFLVGSNVMVSPVLEKAKTK
VSALFPPGTWYSLFDMTQVIVTKEPHYRSLDAPLHVVNVHLYQNTILPMQRGGMLTKEAR
MTPFTIVVAFPLGASEGVAKGNLFLDDDELPEMKLGNGKSTYMDFHATTSNGTVKIWSEV
QESKYALDKGWYIEKVTVLGLNGIGGAFDILVDGSKVEDTSKLEFETEEHKFIDKLEEGG
HKKSMMLDIKGLELPIGKNFAMSWKMGV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400037696
Transcript Infomation

pacid=37443500 locus=PGSC0003DMG400014540 ID=PGSC0003DMT400037696.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAATTTTTCTTTTCTTCCTCATTCTTACTAGTCTTTACAATATGCATAATAGGTTGT
GTGAATTTGGTCTACACAGCTCCAACCAAGATTGGCAATGGCTATAGTTTGATAGCCATT
GAAGAGTCACCAGATGGTGGCCTCATAGGTTACCTTAAAGTTAAGAAGAAAAACAACATT
TATGGCCCTGATATTCCTAACTTGCAGCTCTATGTCAAGCATGAGACAGATAATCGTTTG
AGGATTCACATAACAGATGCAGATAAGCAAAGATGGGAAGTTCCTTACAACTTATTACCA
AGAGAAACACCTCCATCACTTAAACAAACAATTGGCAAATCAAGAAAAGGCCAATTTTCA
CTTTTGTCCAATCAAGAATACTCAGGAAATGAGTTAATGTTCAGTTACACAAGTGACCCT
TTTAGTTTTTCTGTTAAAAGAAAATCAAATGGACAAACCCTTTTCAATTCAAGTAGTGAA
GATTCTGATCCATATAGTAATTTGGTATTTAAAGATCAGTATCTTGAAATATCAACAAAA
TTGCCTAAAGATGCTTCATTATATGGTCTTGGTGAAAATACACAACCTCATGGTATTAAA
ATTTACCCAAATGACCCTTACACTTTGTACACAACAGATCAATCATCAATCAATTTGAAT
ATGGATTTATATGGATCACATCCAATGTATATGGATTTGAGAAATGTGAATGGTGAAGCT
TATGCTCATGCAGTTTTGTTGATGAATAGTAATGGTATGGATGTGTTCTATAGAGGGGAT
TCATTGACATACAAAGTGATTGGGGGTGTTTTGGACTTTTACTTCTTCTCTGGGCCCACA
CCTCTTGCTGTTGTTGATCAATATACTCAATTTATAGGAAGGCCTGCTCCTATGCCCTAT
TGGTCCTTTGGTTTCCATCAATGTAGATGGGGTTACCACAATTTATCTGTGATTGAAGAT
GTTATTGCCAATTACAAGAAAGCAAAAATCCCTCTTGATGTTATATGGAATGATGATGAT
CATATGGATGGGAAAAAGGACTTCACCCTCCATCCTGTTAACTACCCTGGCCCAAAGTTG
AGAGCTTTCTTAGAGAAAATTCATGCTGAAGGAATGCATTACATTGTGATCAATGATCCT
GGAATTGGAGTTAACAAAAGTTATGGTACTTACCAAAGAGGTTTAGCCAATGATGTTTTC
ATCAAATACGAAGGGAAACCGTTTCTAGCACAAGTCTGGCCTGGTGCTGTTCATTTCCCT
GACTTCCTCAACCCGAAAACAGTTGAGTGGTGGGGTGATGAGATTCGACGTTTCCATGAA
CTTGCTCCTATTGATGGACTATGGATTGACATGAATGAAGTTTCCAACTTTTGTAATGGT
TTGTGCACGATCCCCAAGGGTAGGATATGTCCTAATGGGACAGGTCCTGGTTGGATATGT
TGCTTGGATTGCAAGAATGTAACGAAAACAAAGTGGGATGATCCGCCTTACAAGATAAAT
GCTTCTGGTATTCAAGCTCCAATAGGTTACAAAACGATTGCTACGAGTGCAACACATTAT
AATGGTGTTAGGGAATATGATGCTCATAGTCTTTATGGTTTCTCTGAGACTATTGCAACT
CACAAGGGTCTACAAGCTATAGAGGGAAAACGTCCGTTCATATTGACTCGTGCCACGTTT
GTTGGTTCAGGACATTATGCTGCACATTGGACAGGGGATAACAAAGGTACTTGGAAGGAT
TTGAAGTATTCAATCTCTACTGTCTTGAACTTTGGTATATTTGGTGTTCCTATGGTTGGT
TCAGACATATGTGGATTTTACCCCGCGGCTCCTCCTTTGGAGGAGCTATGCAACCGTTGG
ATTCAAGTAGGCGCGTTCTATCCCTTCTCAAGGGATCACGCGAACTATTACTCACCAAGA
CAAGAGCTTTACCAATGGAAAAGTGTGACTAAATCTTCGCGTAATGCTTTAGGAATGAGA
TACAAATTGTTGCCTTATCTCTACACATTGAGCTACGAGGCACACAAAACCGGAGCACCA
ATTGTAAGGCCACTCTTCTTCACTTTCCCAAACATTCCAGAGCTTTACGAGTTAAGCACT
CAATTCTTGGTAGGAAGCAATGTCATGGTCTCTCCAGTGCTAGAAAAGGCTAAAACTAAG
GTAAGCGCGCTCTTTCCTCCAGGTACTTGGTACAGTTTATTCGATATGACACAAGTCATT
GTCACAAAAGAGCCACATTACCGCTCACTTGATGCACCATTGCACGTAGTCAACGTGCAT
TTGTACCAAAACACCATACTACCAATGCAACGCGGAGGGATGTTAACAAAAGAAGCAAGA
ATGACACCTTTCACAATCGTTGTAGCCTTCCCACTCGGGGCATCAGAAGGGGTAGCTAAA
GGAAATCTTTTCCTCGACGATGATGAGCTTCCTGAGATGAAACTAGGAAATGGGAAGTCA
ACATACATGGATTTCCACGCGACAACTAGCAATGGTACAGTGAAGATTTGGTCTGAAGTT
CAAGAAAGTAAATACGCGTTGGATAAAGGTTGGTACATCGAAAAGGTTACCGTGTTAGGA
TTGAATGGAATTGGAGGTGCATTTGACATTCTTGTTGATGGAAGTAAAGTTGAAGATACT
TCAAAGTTGGAATTTGAAACAGAAGAGCACAAGTTTATAGACAAATTGGAAGAGGGAGGT
CACAAGAAGAGTATGATGCTAGATATTAAAGGATTAGAATTACCAATTGGTAAAAACTTT
GCTATGTCTTGGAAAATGGGGGTTTAA