Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400037667
CDS Infomation

pacid=37424742 polypeptide=PGSC0003DMP400025594 locus=PGSC0003DMG400014528 ID=PGSC0003DMT400037667.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAGGTTTGAATGAACAGTTAAAGTCGTTGTTGTTGTTGAAAGGATGGAAATTGTAC
CATCTGAAACAGATGAACTGTGTCATCGTCACTTGTGGCCTCTCACATCACACTTGTTTT
TTCAGCAAACTACTCCGCCTTTGCTTACTTCTTCCTTCATTCCCATCTTCTTATGCTTCT
TCTCTCTTCAATCACATCACAAAACCCACTATACATATATGGAACATCATGTTCAAAGGA
TTTTCTAATACTTCACACCCTCAAAACTCCATTAGTTTCTACATTCAAATGCGCCAACAT
GATGTTTTTCCTAATAAACATACTTTTCCTTTGCTTCTTAGAGCCAACAATGAAAACCCA
CATCTCATTTTCCCACAAATATTTAAGTTCGGATACATTTCTGACCAATTTGTGCAGAAT
TCTTTGGTTTCTAGTTTTGCTAGCAGTGGGTACGTTGACCTTGCACGCCAAGTGTTTGAT
GATATTACGCATAAGGATGTGCTTTCTTATACTGCTTTGATTGATGGGTATGCCCGGAAT
GCTCTGCCAGTTAGAGCTTTAGAACTTTTCCTGGAGATGAAACAAGCACAAGTTAAGGTG
GATGAAGTGGCTGTTGTAGCAGCTCTTTCTCCTGCTGGAACGTTAAGATGTGTTTGGTTT
GGGAAGTGTCTTCATGCTTTCTATGTCGAGCCAGGGAGGGTTTCTAGGGATGTTTACATT
GGTAGTGCTCTTGTTGATATGTATGCTAAATGTGGATATTGGGATGATGCCTTGAAAGTT
TTTGAAGACATGCCTTACAAGAATCTTATTTCTTGGACTGCTATGATTGCTGGTTCTGTA
CACTGCAATAGATTTAGGGAAGCACTCTCTGTTTTCGAAGAGATGCTGTCCAGAAAGGTT
GTGCCCAATCAAGTAACATTGACAAGCGTTCTCAGTGCATCTACTAAGCTTGGGGCATTG
GAGCAGGGCAGATGGATTGCTAATTATATAAAAGCTCACAACGTAAAATTTAATACAGCA
CTTGCCACTGCTTTGATAGATATGTATGCAAAGTGTGGGTGCATTGAAGAGGCATTGTTG
GTTTTCGATAAGCTTCCAAATAAAGATGTTTATCTATGGACTGCTATGATAAATGGCTTG
GCAACACATGGTGATGCTGCAAAGTCCATGACCTTCTTCTTAGAAATGTTGAGAAATGGT
TTAAGGCCCAATGAAGTAACCTTCATTGGTATTCTCAGTGCGTGTTCTCATGGAGGACTC
GTGGATGAAGGACGCCAGTTGTTCTCATTAATGGACCAAGTTTACGGTGTAAAACCTAAT
TTAGATCATTATGGCTGTATGGTCAATCTTTTGGGTCGGGCAGGATATCTGGAAGAAGCT
TGTAAATTGATTCAAGATATGCCAATGAAACCTACTCCTAGCATATGGGGTGCTCTCTTT
GGTTCTTGCATGATTCACAAGGCGTATGAATTAGGTGAATGGATAGGAAGATATCTAATC
GACATACAGCCTTATCACAGTGGCAGATATACACTCTTGGCGAATTTGTATTCTACTTGT
AAAAATTGGGAAGGGGTAGCTCATGTTAGGAAAATGATGAAAGAGATGGGTGTGGAAAAG
ACCCGGGGGTGTAGTTGGATCGAATTGAACGGGGAAGTGCATGAGTTTATTGCCTTTGAT
GGTTCACATGCTAAGTCTGAATATATTTACACCACTTTAGATAACCTAGTCAGTCATCTA
CAACACATTGCCATTTCTCCATGTGCTGATTCATTACTTCTTGAAAGAAGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400025594
PEP Infomation

pacid=37424742 transcript=PGSC0003DMT400037667 locus=PGSC0003DMG400014528 ID=PGSC0003DMT400037667.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAGLNEQLKSLLLLKGWKLYHLKQMNCVIVTCGLSHHTCFFSKLLRLCLLLPSFPSSYAS
SLFNHITKPTIHIWNIMFKGFSNTSHPQNSISFYIQMRQHDVFPNKHTFPLLLRANNENP
HLIFPQIFKFGYISDQFVQNSLVSSFASSGYVDLARQVFDDITHKDVLSYTALIDGYARN
ALPVRALELFLEMKQAQVKVDEVAVVAALSPAGTLRCVWFGKCLHAFYVEPGRVSRDVYI
GSALVDMYAKCGYWDDALKVFEDMPYKNLISWTAMIAGSVHCNRFREALSVFEEMLSRKV
VPNQVTLTSVLSASTKLGALEQGRWIANYIKAHNVKFNTALATALIDMYAKCGCIEEALL
VFDKLPNKDVYLWTAMINGLATHGDAAKSMTFFLEMLRNGLRPNEVTFIGILSACSHGGL
VDEGRQLFSLMDQVYGVKPNLDHYGCMVNLLGRAGYLEEACKLIQDMPMKPTPSIWGALF
GSCMIHKAYELGEWIGRYLIDIQPYHSGRYTLLANLYSTCKNWEGVAHVRKMMKEMGVEK
TRGCSWIELNGEVHEFIAFDGSHAKSEYIYTTLDNLVSHLQHIAISPCADSLLLERS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400037667
Transcript Infomation

pacid=37424742 locus=PGSC0003DMG400014528 ID=PGSC0003DMT400037667.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAGGTTTGAATGAACAGTTAAAGTCGTTGTTGTTGTTGAAAGGATGGAAATTGTAC
CATCTGAAACAGATGAACTGTGTCATCGTCACTTGTGGCCTCTCACATCACACTTGTTTT
TTCAGCAAACTACTCCGCCTTTGCTTACTTCTTCCTTCATTCCCATCTTCTTATGCTTCT
TCTCTCTTCAATCACATCACAAAACCCACTATACATATATGGAACATCATGTTCAAAGGA
TTTTCTAATACTTCACACCCTCAAAACTCCATTAGTTTCTACATTCAAATGCGCCAACAT
GATGTTTTTCCTAATAAACATACTTTTCCTTTGCTTCTTAGAGCCAACAATGAAAACCCA
CATCTCATTTTCCCACAAATATTTAAGTTCGGATACATTTCTGACCAATTTGTGCAGAAT
TCTTTGGTTTCTAGTTTTGCTAGCAGTGGGTACGTTGACCTTGCACGCCAAGTGTTTGAT
GATATTACGCATAAGGATGTGCTTTCTTATACTGCTTTGATTGATGGGTATGCCCGGAAT
GCTCTGCCAGTTAGAGCTTTAGAACTTTTCCTGGAGATGAAACAAGCACAAGTTAAGGTG
GATGAAGTGGCTGTTGTAGCAGCTCTTTCTCCTGCTGGAACGTTAAGATGTGTTTGGTTT
GGGAAGTGTCTTCATGCTTTCTATGTCGAGCCAGGGAGGGTTTCTAGGGATGTTTACATT
GGTAGTGCTCTTGTTGATATGTATGCTAAATGTGGATATTGGGATGATGCCTTGAAAGTT
TTTGAAGACATGCCTTACAAGAATCTTATTTCTTGGACTGCTATGATTGCTGGTTCTGTA
CACTGCAATAGATTTAGGGAAGCACTCTCTGTTTTCGAAGAGATGCTGTCCAGAAAGGTT
GTGCCCAATCAAGTAACATTGACAAGCGTTCTCAGTGCATCTACTAAGCTTGGGGCATTG
GAGCAGGGCAGATGGATTGCTAATTATATAAAAGCTCACAACGTAAAATTTAATACAGCA
CTTGCCACTGCTTTGATAGATATGTATGCAAAGTGTGGGTGCATTGAAGAGGCATTGTTG
GTTTTCGATAAGCTTCCAAATAAAGATGTTTATCTATGGACTGCTATGATAAATGGCTTG
GCAACACATGGTGATGCTGCAAAGTCCATGACCTTCTTCTTAGAAATGTTGAGAAATGGT
TTAAGGCCCAATGAAGTAACCTTCATTGGTATTCTCAGTGCGTGTTCTCATGGAGGACTC
GTGGATGAAGGACGCCAGTTGTTCTCATTAATGGACCAAGTTTACGGTGTAAAACCTAAT
TTAGATCATTATGGCTGTATGGTCAATCTTTTGGGTCGGGCAGGATATCTGGAAGAAGCT
TGTAAATTGATTCAAGATATGCCAATGAAACCTACTCCTAGCATATGGGGTGCTCTCTTT
GGTTCTTGCATGATTCACAAGGCGTATGAATTAGGTGAATGGATAGGAAGATATCTAATC
GACATACAGCCTTATCACAGTGGCAGATATACACTCTTGGCGAATTTGTATTCTACTTGT
AAAAATTGGGAAGGGGTAGCTCATGTTAGGAAAATGATGAAAGAGATGGGTGTGGAAAAG
ACCCGGGGGTGTAGTTGGATCGAATTGAACGGGGAAGTGCATGAGTTTATTGCCTTTGAT
GGTTCACATGCTAAGTCTGAATATATTTACACCACTTTAGATAACCTAGTCAGTCATCTA
CAACACATTGCCATTTCTCCATGTGCTGATTCATTACTTCTTGAAAGAAGCTGA