Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400036847
CDS Infomation

pacid=37460528 polypeptide=PGSC0003DMP400024993 locus=PGSC0003DMG400014208 ID=PGSC0003DMT400036847.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGGTCGGCGTTGTTGCCAGATCTAGGGACAGAGATAGTGATTCCAGTATGTGCCGTC
GTTGGAATCGTCTTCTCTTTATTCCAGTGGTACCTTGTCTCGCGTGTTAAAGTCTCGTCG
GAACGTGGAGCTACTTCTCCGAGTAACAATAATAAGAATGGATATGGAGACTATTTGATT
GAAGAAGAGGAAGGAATTAACGACCAGAACGTTGTTGCGAAGTGCGCCGAGATACAGAAT
GCCATCTCTGAAGGGGCAACATCTTTTTTATTTACTGAGTATCAGTATGTGGGTATCTTC
ATGATTGCTTTTGCAATCCTGATCTTCCTTTTCTTGGGCTCAGTTGAAGGTTTCAGCACT
AAGGGCCAGCCATGTACTTACAACAAGGAGAAGATGTGCAAGCCAGCCCTTGCAACTGCA
ATCTTCAGCACGATATCCTTCTTGCTTGGTGCTGTCACTTCTGTTATCTCTGGTTTCTTA
GGGATGAAAATTGCAACATATGCAAATGCAAGAACAACTTTGGAAGCGAGAAAAGGTGTT
GGGAAAGCTTTTATTGTTGCATTCAGGTCTGGTGCAGTGATGGGTTTTCTCCTTGCCGCC
AATGGCCTCCTAGTTCTTTACATTGCCATTAATCTCTTCAAGCTTTACTATGGTGATGAC
TGGGAGGGTCTTTTTGAGGCAATTACTGGATATGGGCTTGGTGGATCCTCAATGGCTCTT
TTCGGTAGGGTTGGTGGTGGTATTTACACCAAAGCTGCTGATGTTGGTGCTGATCTCGTT
GGTAAGGTTGAAAGGAACATTCCAGAAGATGATCCCAGAAATCCTGCTGTGATTGCTGAT
AATGTTGGGGATAATGTTGGGGACATTGCAGGAATGGGGTCTGATCTTTTTGGTTCATAT
GCTGAATCATCTTGTGCTGCTCTTGTGGTGGCTTCCATCTCATCTTTTGGAATTGAACAT
GATTTTACATCCATGTGTTACCCCCTGCTTATAAGCTCCATGGGGATTCTCGTTTGTTTG
ATAACCACCCTTTTTGCTACTGACTTTTTTGAAATTAAGGCTGTCAAAGAAATTGAACCA
GCACTGAAGAACCAACTCATTATATCAACTGTTCTTATGACAATTGGAATTGCAATTGTT
ACATGGACTTGCCTTCCGTCTTCCTTCACCATTTTTAATTTTGGCACTCAGAAAGTTGTC
AAGAATTGGGAACTCTTTTTATGTGTGGCCGTTGGTCTTTGGGCTGGACTTATCATCGGA
TTTGTCACCGAGTACTACACTAGCAATGCTTACAGCCCTGTCCAAGATGTAGCAGACTCC
TGCAGGACTGGTGCTGCGACAAATGTTATTTTTGGCCTTGCTCTTGGATACAAATCTGTC
ATCATTCCTATCTTTGCCATTGCAATAGCTATCTTTGTCAGTTTTTCTTTTGCTGCCATG
TATGGTATTGCAGTTGCTGCTCTTGGAATGTTGAGCACAATTGCAACTGGATTGGCGATT
GATGCATATGGTCCTATCAGTGACAATGCTGGAGGCATTGCTGAGATGGCTGGCATGAGC
CACCGGATCCGTGAAAGAACTGATGCCCTTGATGCAGCTGGAAATACCACTGCTGCGATT
GGAAAGGGCTTTGCCATTGGATCTGCTGCACTTGTGTCTCTGGCTCTGTTTGGTGCTTTT
GTTAGTCGGGCTGCAATTTCAACGGTTGATGTCTTGACCCCCAAGGTGTTTATTGGTTTG
ATTGTTGGAGCCATGCTTCCCTACTGGTTCTCTGCCATGACCATGAAGAGTGTGGGTAGT
GCAGCTTTGAAGATGGTTGAGGAAGTGCGCAGACAATTTAACACTATTCCTGGTCTCATG
GAAGGCCTTGCTAAACCTGATTATGCCACTTGTGTTAAGATCTCGACTGATGCATCTATC
AAGGAAATGATTCCACCAGGTGCCCTAGTCATGCTCACACCCCTCATAGTTGGTATTTTC
TTTGGAGTGGAGACACTTTCTGGTGTACTTGCCGGTGCTTTGGTATCCGGTGTACAGATA
GCAATATCTGCATCAAACACTGGAGGTGCATGGGACAACGCCAAGAAGTATATTGAGGCT
GGTGCTTCAGAGCATGCAAGGACTCTCGGCCCAAAGGGTTCTGAACCTCACAAGGCTGCT
GTTATTGGCGACACCATCGGTGACCCCCTGAAGGACACTTCAGGCCCATCACTCAACATT
TTGATCAAACTGATGGCAGTTGAGTCACTTGTATTTGCTCCATTCTTTGCCACTCATGGT
GGTATCCTTTTCAAGATCTTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400024993
PEP Infomation

pacid=37460528 transcript=PGSC0003DMT400036847 locus=PGSC0003DMG400014208 ID=PGSC0003DMT400036847.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGSALLPDLGTEIVIPVCAVVGIVFSLFQWYLVSRVKVSSERGATSPSNNNKNGYGDYLI
EEEEGINDQNVVAKCAEIQNAISEGATSFLFTEYQYVGIFMIAFAILIFLFLGSVEGFST
KGQPCTYNKEKMCKPALATAIFSTISFLLGAVTSVISGFLGMKIATYANARTTLEARKGV
GKAFIVAFRSGAVMGFLLAANGLLVLYIAINLFKLYYGDDWEGLFEAITGYGLGGSSMAL
FGRVGGGIYTKAADVGADLVGKVERNIPEDDPRNPAVIADNVGDNVGDIAGMGSDLFGSY
AESSCAALVVASISSFGIEHDFTSMCYPLLISSMGILVCLITTLFATDFFEIKAVKEIEP
ALKNQLIISTVLMTIGIAIVTWTCLPSSFTIFNFGTQKVVKNWELFLCVAVGLWAGLIIG
FVTEYYTSNAYSPVQDVADSCRTGAATNVIFGLALGYKSVIIPIFAIAIAIFVSFSFAAM
YGIAVAALGMLSTIATGLAIDAYGPISDNAGGIAEMAGMSHRIRERTDALDAAGNTTAAI
GKGFAIGSAALVSLALFGAFVSRAAISTVDVLTPKVFIGLIVGAMLPYWFSAMTMKSVGS
AALKMVEEVRRQFNTIPGLMEGLAKPDYATCVKISTDASIKEMIPPGALVMLTPLIVGIF
FGVETLSGVLAGALVSGVQIAISASNTGGAWDNAKKYIEAGASEHARTLGPKGSEPHKAA
VIGDTIGDPLKDTSGPSLNILIKLMAVESLVFAPFFATHGGILFKIF*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400036847
Transcript Infomation

pacid=37460528 locus=PGSC0003DMG400014208 ID=PGSC0003DMT400036847.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGGTCGGCGTTGTTGCCAGATCTAGGGACAGAGATAGTGATTCCAGTATGTGCCGTC
GTTGGAATCGTCTTCTCTTTATTCCAGTGGTACCTTGTCTCGCGTGTTAAAGTCTCGTCG
GAACGTGGAGCTACTTCTCCGAGTAACAATAATAAGAATGGATATGGAGACTATTTGATT
GAAGAAGAGGAAGGAATTAACGACCAGAACGTTGTTGCGAAGTGCGCCGAGATACAGAAT
GCCATCTCTGAAGGGGCAACATCTTTTTTATTTACTGAGTATCAGTATGTGGGTATCTTC
ATGATTGCTTTTGCAATCCTGATCTTCCTTTTCTTGGGCTCAGTTGAAGGTTTCAGCACT
AAGGGCCAGCCATGTACTTACAACAAGGAGAAGATGTGCAAGCCAGCCCTTGCAACTGCA
ATCTTCAGCACGATATCCTTCTTGCTTGGTGCTGTCACTTCTGTTATCTCTGGTTTCTTA
GGGATGAAAATTGCAACATATGCAAATGCAAGAACAACTTTGGAAGCGAGAAAAGGTGTT
GGGAAAGCTTTTATTGTTGCATTCAGGTCTGGTGCAGTGATGGGTTTTCTCCTTGCCGCC
AATGGCCTCCTAGTTCTTTACATTGCCATTAATCTCTTCAAGCTTTACTATGGTGATGAC
TGGGAGGGTCTTTTTGAGGCAATTACTGGATATGGGCTTGGTGGATCCTCAATGGCTCTT
TTCGGTAGGGTTGGTGGTGGTATTTACACCAAAGCTGCTGATGTTGGTGCTGATCTCGTT
GGTAAGGTTGAAAGGAACATTCCAGAAGATGATCCCAGAAATCCTGCTGTGATTGCTGAT
AATGTTGGGGATAATGTTGGGGACATTGCAGGAATGGGGTCTGATCTTTTTGGTTCATAT
GCTGAATCATCTTGTGCTGCTCTTGTGGTGGCTTCCATCTCATCTTTTGGAATTGAACAT
GATTTTACATCCATGTGTTACCCCCTGCTTATAAGCTCCATGGGGATTCTCGTTTGTTTG
ATAACCACCCTTTTTGCTACTGACTTTTTTGAAATTAAGGCTGTCAAAGAAATTGAACCA
GCACTGAAGAACCAACTCATTATATCAACTGTTCTTATGACAATTGGAATTGCAATTGTT
ACATGGACTTGCCTTCCGTCTTCCTTCACCATTTTTAATTTTGGCACTCAGAAAGTTGTC
AAGAATTGGGAACTCTTTTTATGTGTGGCCGTTGGTCTTTGGGCTGGACTTATCATCGGA
TTTGTCACCGAGTACTACACTAGCAATGCTTACAGCCCTGTCCAAGATGTAGCAGACTCC
TGCAGGACTGGTGCTGCGACAAATGTTATTTTTGGCCTTGCTCTTGGATACAAATCTGTC
ATCATTCCTATCTTTGCCATTGCAATAGCTATCTTTGTCAGTTTTTCTTTTGCTGCCATG
TATGGTATTGCAGTTGCTGCTCTTGGAATGTTGAGCACAATTGCAACTGGATTGGCGATT
GATGCATATGGTCCTATCAGTGACAATGCTGGAGGCATTGCTGAGATGGCTGGCATGAGC
CACCGGATCCGTGAAAGAACTGATGCCCTTGATGCAGCTGGAAATACCACTGCTGCGATT
GGAAAGGGCTTTGCCATTGGATCTGCTGCACTTGTGTCTCTGGCTCTGTTTGGTGCTTTT
GTTAGTCGGGCTGCAATTTCAACGGTTGATGTCTTGACCCCCAAGGTGTTTATTGGTTTG
ATTGTTGGAGCCATGCTTCCCTACTGGTTCTCTGCCATGACCATGAAGAGTGTGGGTAGT
GCAGCTTTGAAGATGGTTGAGGAAGTGCGCAGACAATTTAACACTATTCCTGGTCTCATG
GAAGGCCTTGCTAAACCTGATTATGCCACTTGTGTTAAGATCTCGACTGATGCATCTATC
AAGGAAATGATTCCACCAGGTGCCCTAGTCATGCTCACACCCCTCATAGTTGGTATTTTC
TTTGGAGTGGAGACACTTTCTGGTGTACTTGCCGGTGCTTTGGTATCCGGTGTACAGATA
GCAATATCTGCATCAAACACTGGAGGTGCATGGGACAACGCCAAGAAGTATATTGAGGCT
GGTGCTTCAGAGCATGCAAGGACTCTCGGCCCAAAGGGTTCTGAACCTCACAAGGCTGCT
GTTATTGGCGACACCATCGGTGACCCCCTGAAGGACACTTCAGGCCCATCACTCAACATT
TTGATCAAACTGATGGCAGTTGAGTCACTTGTATTTGCTCCATTCTTTGCCACTCATGGT
GGTATCCTTTTCAAGATCTTTTAA