Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400036346
CDS Infomation

pacid=37462441 polypeptide=PGSC0003DMP400024647 locus=PGSC0003DMG400013982 ID=PGSC0003DMT400036346.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAAACGACCGCTATGATACCCCTTCTCGTAAGGAGAAAAATGACGAAGAGGCCTCT
GTTATCATTCCTGAAACCGCCCATCAAGTTAGCAATGATTCATGGTTTCAGGTGGGAGTT
GTTCTGAGCATGGGTGTCAACAGCGCGTATGCACTAGGATATTCTGGTACAATCATGGTT
CCTCTAGGTTGGATAGGTGGTGTTGTTGGTTTGGTAATGTCCACAATTGTGTCTTTGTAT
GCAAGTGCTCTTATGGCTAAGCTCCATGAAGTTGGGGGCAAGAGGCATATCAGATATAGA
GACCTTGCCGGATTTTTGTATGGTCGGACAGCTTATTTGCTTATATGGGCACTACAATAT
GCGAATCTCTTCTTGATAAATATTGGATATGTCATCATGAGTGGTTCAGCCCTAAAGGCT
TTCTATATGCTCTTTAGGGATGACCATATGCTAAAGCTGCCACACTTTATAGCTATAGCT
GGAGTTGCATGCATCCTCTTTGCCATTGCAACACCTCATTTATCAGCACTGAGGGTTTGG
CTCGGGTTTTCAACACTATTCATGATACTGTATCTCACCATAGCATTTGTGTTGTCCGTT
CAAGATGGTGTAAAGGCTCCTCCTAGGGACTATCACATTCCAGGATCAGGAGACAATAAA
ATTTGGGCAATTATTGGTGCAATTGGAAACCTTTTCTTTGCATTTAACACTGGAATGATT
CCAGAGATACAGGCTACAATCAGACAACCTGTCGTTGGAAACATGGTGAAAGCGCTTAAC
TTTCAGTTCACGGTGGGAGTTGTGCCTATGCATGCTGTTACTTACATTGGGTATTGGGCT
TACGGATCTGTTGTTTCGTCCTATTTGCTCAACAATGTTCATGGTCCAGCTTGGGTGTTG
GGAGTGGCTCACTTATCTGCTTTTTTCCAAGCTATCATTACCTTGCATATATTTGCAAGT
CCAACATATGAGTACCTGGATACTAAATATGGAGTCAAAGGAAGTGCCTTGGCTCCACGA
AATATTCTATTCAGACTGGTTGTCAGAGGTGGTTACCTTATCATGACCACTTTCCTCTCA
GCTTTGCTACCTTTCCTGGGAAACTTCATGAGCCTTACTGGTGCTATCAGCACGATTCCG
CTCACATTCATACTCCCAAACCACATGTACCTTATCGCTAAGAAAGACAAGTTATCTAGC
TTACAGAAGAGTTGGCATTGGCTAAATATTGTTGTCTTTGGATGCGTGTCAGTTGCTGCA
TTTGTAGCTGCCTTGAAGCTTACCGTTGTACAGACTCAAACTTATCATGTCTTTGCTGAT
CTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400024647
PEP Infomation

pacid=37462441 transcript=PGSC0003DMT400036346 locus=PGSC0003DMG400013982 ID=PGSC0003DMT400036346.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MENDRYDTPSRKEKNDEEASVIIPETAHQVSNDSWFQVGVVLSMGVNSAYALGYSGTIMV
PLGWIGGVVGLVMSTIVSLYASALMAKLHEVGGKRHIRYRDLAGFLYGRTAYLLIWALQY
ANLFLINIGYVIMSGSALKAFYMLFRDDHMLKLPHFIAIAGVACILFAIATPHLSALRVW
LGFSTLFMILYLTIAFVLSVQDGVKAPPRDYHIPGSGDNKIWAIIGAIGNLFFAFNTGMI
PEIQATIRQPVVGNMVKALNFQFTVGVVPMHAVTYIGYWAYGSVVSSYLLNNVHGPAWVL
GVAHLSAFFQAIITLHIFASPTYEYLDTKYGVKGSALAPRNILFRLVVRGGYLIMTTFLS
ALLPFLGNFMSLTGAISTIPLTFILPNHMYLIAKKDKLSSLQKSWHWLNIVVFGCVSVAA
FVAALKLTVVQTQTYHVFADL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400036346
Transcript Infomation

pacid=37462441 locus=PGSC0003DMG400013982 ID=PGSC0003DMT400036346.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAAACGACCGCTATGATACCCCTTCTCGTAAGGAGAAAAATGACGAAGAGGCCTCT
GTTATCATTCCTGAAACCGCCCATCAAGTTAGCAATGATTCATGGTTTCAGGTGGGAGTT
GTTCTGAGCATGGGTGTCAACAGCGCGTATGCACTAGGATATTCTGGTACAATCATGGTT
CCTCTAGGTTGGATAGGTGGTGTTGTTGGTTTGGTAATGTCCACAATTGTGTCTTTGTAT
GCAAGTGCTCTTATGGCTAAGCTCCATGAAGTTGGGGGCAAGAGGCATATCAGATATAGA
GACCTTGCCGGATTTTTGTATGGTCGGACAGCTTATTTGCTTATATGGGCACTACAATAT
GCGAATCTCTTCTTGATAAATATTGGATATGTCATCATGAGTGGTTCAGCCCTAAAGGCT
TTCTATATGCTCTTTAGGGATGACCATATGCTAAAGCTGCCACACTTTATAGCTATAGCT
GGAGTTGCATGCATCCTCTTTGCCATTGCAACACCTCATTTATCAGCACTGAGGGTTTGG
CTCGGGTTTTCAACACTATTCATGATACTGTATCTCACCATAGCATTTGTGTTGTCCGTT
CAAGATGGTGTAAAGGCTCCTCCTAGGGACTATCACATTCCAGGATCAGGAGACAATAAA
ATTTGGGCAATTATTGGTGCAATTGGAAACCTTTTCTTTGCATTTAACACTGGAATGATT
CCAGAGATACAGGCTACAATCAGACAACCTGTCGTTGGAAACATGGTGAAAGCGCTTAAC
TTTCAGTTCACGGTGGGAGTTGTGCCTATGCATGCTGTTACTTACATTGGGTATTGGGCT
TACGGATCTGTTGTTTCGTCCTATTTGCTCAACAATGTTCATGGTCCAGCTTGGGTGTTG
GGAGTGGCTCACTTATCTGCTTTTTTCCAAGCTATCATTACCTTGCATATATTTGCAAGT
CCAACATATGAGTACCTGGATACTAAATATGGAGTCAAAGGAAGTGCCTTGGCTCCACGA
AATATTCTATTCAGACTGGTTGTCAGAGGTGGTTACCTTATCATGACCACTTTCCTCTCA
GCTTTGCTACCTTTCCTGGGAAACTTCATGAGCCTTACTGGTGCTATCAGCACGATTCCG
CTCACATTCATACTCCCAAACCACATGTACCTTATCGCTAAGAAAGACAAGTTATCTAGC
TTACAGAAGAGTTGGCATTGGCTAAATATTGTTGTCTTTGGATGCGTGTCAGTTGCTGCA
TTTGTAGCTGCCTTGAAGCTTACCGTTGTACAGACTCAAACTTATCATGTCTTTGCTGAT
CTGTAA