Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400035763
CDS Infomation

pacid=37469274 polypeptide=PGSC0003DMP400024319 locus=PGSC0003DMG400013761 ID=PGSC0003DMT400035763.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGCCGAGCACGATTCGGAAGGCGATTGGGGCGGTGAAGGACCAGACGAGCATAGGG
ATTGCGAAGGTAGGGAGTAATATGGCACCGGAGCTGGAAGTTGCTATTGTTAAGGCGACA
AGCCATGATGATGACCCTGCAAGCGAGAAGTATATCCGGGAGATTCTTCACTTGACTTCT
TCTTCACGTGGCTATGTCACTGCTTGTGTTTCATCTATTTCTAAAAGGTTAGGTAAAACC
AGGGATTGGATCGTTGCCATCAAGTGTTTGATGCTCATTCACCGTCTTCTCAACGATGGT
GATCCTGTTTTTTACCAAGAAATTATGTATGCCACCAGGAGAGGCACTAGACTTCTTAAT
TTGTCTGATTTTCGCGATGAGGCTCATTCTAATTCGTGGGATCATTCGGCCTTTGTTAGA
ACGTATGCTTTGTATTTAGATCAAAGATTGGAGATGATGGTTTTTGAGAGGAAGCAAAAT
GGGGGTGGTGGAGAGATTGAGAGGTATGGATCTAGAGAAGAAAGATGGAGATCTCCACCT
GCCTCTAACAACAGAGGCTATGATTATGGTGAGTTCGGAGATGAGCCTGCTTATGGAATG
AGGAAGTCCAGATCATCTGGGGATGTGAGGGAGTCAACAGTACAGGATCAGAAAGATGTG
ACCCCAATGCGACAGATGGAACCCGAGAGGATCTTTGGGAAGATGAGTCATTTGCAGAGG
TTGTTGGATCGGTTTTTGTCTTGTCGACCAACTGGATTAGCGAAAAATGAAAGAATGGTG
TTGGTTACTTTGTATCCTATGGTGAAAGAAAGTTTTCAGCTTTATGCTGATATATGTGAG
GTTTTAGCTATTTTGTTGGATAAATTCTTTGACATGGAGTATGAGGATTGTGTTAAGGCC
TTTGATGCATATGCTAGCGCATCAAAGCAGATCGATGAGCTGGTGGGATTCTATAACTGG
TGCAAGGATATTGGTATTGCTAGGTCGTCCGAGTATCCAGAAGTTCAGAGGATAACAAGC
AAGCTATTGGATACACTAGAAGAGTTTGTGAGGGATAGGGCTAAGGCAACAAAAAGTCCC
GAGAGGAAAGTTGAGGCTCTGCCAGCTCCACCAGAAGAACCAGCACCAGATATGAATGAG
ATTAAAGCATTGCCTCCACCAGAGGATTATACTCCACCACCACCTCCTGAACCAGAGTCT
CCTAAGCCAGCGGCGGTGGTTCAGGAGACTGGGGATTTGATGGATTTAAGAGAGGAAGGT
GTTACTGCCGATGATCAAGGAAACAAATTTGCATTGGCATTGTTTGCAGGGCCTGGAACA
AACAATGGATCATGGGAAGCATTCTCCTCAAATGGGGGACCTGAGGTGACCTCTGCTTGG
CAGAATCCAGCGGCTGAGAGTGGTAAGGCTGATTGGGAGTTGGCTTTGGTTGAGACAGCT
AGTCATCTGTCTCAGCAGAAGGCAGCAATGGGCGGTGGACTTGATCCGCTGCTGTTGAAT
GGCATGTATGATCAAGGGATGGTTAGGCAACATGTTGCCACTGCCCAGTCAAGTGGTGGT
AGTGCGAGCAGTGTGGCATTACCTGGGCTAGGGAAGAGTTCAACACCGGTTTTAGCACTC
CCTGCACCCGATGGAACAGTCCAGACAGTTGGACTGGATCCATTTGCTGCATCTTTGACT
GTCCCACCTCCTTCGTATGTACAAATGGCGGATTTGGAGAAGAAACAGCAATTACTTGTA
CAGGAGCAAATTGTATGGCAGCAATACGCTAGAAATGGGATGCAAGGACAGATGAGTTTG
TCCAAGATCAGCAGCGGCGGATACTATGGTACACAACCAGCTGGGATGCCTTATGGCATG
CCACCAGTAAATGGCGTTGGAGTGCCACCTGCTGGAGGGTACTACTACACTCCTTACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400024319
PEP Infomation

pacid=37469274 transcript=PGSC0003DMT400035763 locus=PGSC0003DMG400013761 ID=PGSC0003DMT400035763.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAPSTIRKAIGAVKDQTSIGIAKVGSNMAPELEVAIVKATSHDDDPASEKYIREILHLTS
SSRGYVTACVSSISKRLGKTRDWIVAIKCLMLIHRLLNDGDPVFYQEIMYATRRGTRLLN
LSDFRDEAHSNSWDHSAFVRTYALYLDQRLEMMVFERKQNGGGGEIERYGSREERWRSPP
ASNNRGYDYGEFGDEPAYGMRKSRSSGDVRESTVQDQKDVTPMRQMEPERIFGKMSHLQR
LLDRFLSCRPTGLAKNERMVLVTLYPMVKESFQLYADICEVLAILLDKFFDMEYEDCVKA
FDAYASASKQIDELVGFYNWCKDIGIARSSEYPEVQRITSKLLDTLEEFVRDRAKATKSP
ERKVEALPAPPEEPAPDMNEIKALPPPEDYTPPPPPEPESPKPAAVVQETGDLMDLREEG
VTADDQGNKFALALFAGPGTNNGSWEAFSSNGGPEVTSAWQNPAAESGKADWELALVETA
SHLSQQKAAMGGGLDPLLLNGMYDQGMVRQHVATAQSSGGSASSVALPGLGKSSTPVLAL
PAPDGTVQTVGLDPFAASLTVPPPSYVQMADLEKKQQLLVQEQIVWQQYARNGMQGQMSL
SKISSGGYYGTQPAGMPYGMPPVNGVGVPPAGGYYYTPY*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400035763
Transcript Infomation

pacid=37469274 locus=PGSC0003DMG400013761 ID=PGSC0003DMT400035763.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGCCGAGCACGATTCGGAAGGCGATTGGGGCGGTGAAGGACCAGACGAGCATAGGG
ATTGCGAAGGTAGGGAGTAATATGGCACCGGAGCTGGAAGTTGCTATTGTTAAGGCGACA
AGCCATGATGATGACCCTGCAAGCGAGAAGTATATCCGGGAGATTCTTCACTTGACTTCT
TCTTCACGTGGCTATGTCACTGCTTGTGTTTCATCTATTTCTAAAAGGTTAGGTAAAACC
AGGGATTGGATCGTTGCCATCAAGTGTTTGATGCTCATTCACCGTCTTCTCAACGATGGT
GATCCTGTTTTTTACCAAGAAATTATGTATGCCACCAGGAGAGGCACTAGACTTCTTAAT
TTGTCTGATTTTCGCGATGAGGCTCATTCTAATTCGTGGGATCATTCGGCCTTTGTTAGA
ACGTATGCTTTGTATTTAGATCAAAGATTGGAGATGATGGTTTTTGAGAGGAAGCAAAAT
GGGGGTGGTGGAGAGATTGAGAGGTATGGATCTAGAGAAGAAAGATGGAGATCTCCACCT
GCCTCTAACAACAGAGGCTATGATTATGGTGAGTTCGGAGATGAGCCTGCTTATGGAATG
AGGAAGTCCAGATCATCTGGGGATGTGAGGGAGTCAACAGTACAGGATCAGAAAGATGTG
ACCCCAATGCGACAGATGGAACCCGAGAGGATCTTTGGGAAGATGAGTCATTTGCAGAGG
TTGTTGGATCGGTTTTTGTCTTGTCGACCAACTGGATTAGCGAAAAATGAAAGAATGGTG
TTGGTTACTTTGTATCCTATGGTGAAAGAAAGTTTTCAGCTTTATGCTGATATATGTGAG
GTTTTAGCTATTTTGTTGGATAAATTCTTTGACATGGAGTATGAGGATTGTGTTAAGGCC
TTTGATGCATATGCTAGCGCATCAAAGCAGATCGATGAGCTGGTGGGATTCTATAACTGG
TGCAAGGATATTGGTATTGCTAGGTCGTCCGAGTATCCAGAAGTTCAGAGGATAACAAGC
AAGCTATTGGATACACTAGAAGAGTTTGTGAGGGATAGGGCTAAGGCAACAAAAAGTCCC
GAGAGGAAAGTTGAGGCTCTGCCAGCTCCACCAGAAGAACCAGCACCAGATATGAATGAG
ATTAAAGCATTGCCTCCACCAGAGGATTATACTCCACCACCACCTCCTGAACCAGAGTCT
CCTAAGCCAGCGGCGGTGGTTCAGGAGACTGGGGATTTGATGGATTTAAGAGAGGAAGGT
GTTACTGCCGATGATCAAGGAAACAAATTTGCATTGGCATTGTTTGCAGGGCCTGGAACA
AACAATGGATCATGGGAAGCATTCTCCTCAAATGGGGGACCTGAGGTGACCTCTGCTTGG
CAGAATCCAGCGGCTGAGAGTGGTAAGGCTGATTGGGAGTTGGCTTTGGTTGAGACAGCT
AGTCATCTGTCTCAGCAGAAGGCAGCAATGGGCGGTGGACTTGATCCGCTGCTGTTGAAT
GGCATGTATGATCAAGGGATGGTTAGGCAACATGTTGCCACTGCCCAGTCAAGTGGTGGT
AGTGCGAGCAGTGTGGCATTACCTGGGCTAGGGAAGAGTTCAACACCGGTTTTAGCACTC
CCTGCACCCGATGGAACAGTCCAGACAGTTGGACTGGATCCATTTGCTGCATCTTTGACT
GTCCCACCTCCTTCGTATGTACAAATGGCGGATTTGGAGAAGAAACAGCAATTACTTGTA
CAGGAGCAAATTGTATGGCAGCAATACGCTAGAAATGGGATGCAAGGACAGATGAGTTTG
TCCAAGATCAGCAGCGGCGGATACTATGGTACACAACCAGCTGGGATGCCTTATGGCATG
CCACCAGTAAATGGCGTTGGAGTGCCACCTGCTGGAGGGTACTACTACACTCCTTACTGA