Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400035747
CDS Infomation

pacid=37445744 polypeptide=PGSC0003DMP400024308 locus=PGSC0003DMG400013751 ID=PGSC0003DMT400035747.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCTTCCACTCTTTCTCATGTAATTCCTTCTCAGCTATGCTCAAGCAAAAGTGGC
GTTTCATCGGTTTCACAAGCGTTGCTTGTGAAGCCGATGAAGATTAATGGTCATGGAATG
GGAAAGGATAAGAGGATGAAAGTGAAATGTATGGCAGCTAGCATTCCAGCAGATGATAGA
GTGCCTGATATGGAAAAAAGGAATCTCATGAATTTGCTTTTATTGGGTGCACTTGCTTTA
CCAACTGGTGGAATGCTTGTACCTTATGCTACTTTCTTTGCACCTCCTGGATCAGGAGGT
GGTAGTAGTGGCACCATTGCCAAAGATGCTAATGGCAATGATGTTGTTGTAACTGAATGG
CTCAAAACTCATTCACCTGGAACTCGAACCCTCACACAAGGACTAAAGGGAGATCCTACT
TACCTTGTTGTGGAGAACGATGGAACACTCGCGACCTATGGTATCAATGCCGTGTGCACT
CACCTTGGTTGTGTTGTGCCGTGGAATACTGCTGAGAACAAGTTCATTTGCCCTTGCCAT
GGATCTCAATACAACAATCAAGGAAAAGTTGTTAGAGGACCTGCTCCTTTGTCCTTGGCA
TTGGCTCATGCAGACATTGATGATGGGAAGGTGGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACAGAC
TTCAGAACTGGTGATGCTCCATGGTGGGCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400024308
PEP Infomation

pacid=37445744 transcript=PGSC0003DMT400035747 locus=PGSC0003DMG400013751 ID=PGSC0003DMT400035747.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MASSTLSHVIPSQLCSSKSGVSSVSQALLVKPMKINGHGMGKDKRMKVKCMAASIPADDR
VPDMEKRNLMNLLLLGALALPTGGMLVPYATFFAPPGSGGGSSGTIAKDANGNDVVVTEW
LKTHSPGTRTLTQGLKGDPTYLVVENDGTLATYGINAVCTHLGCVVPWNTAENKFICPCH
GSQYNNQGKVVRGPAPLSLALAHADIDDGKVVFVPWVETDFRTGDAPWWA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400035747
Transcript Infomation

pacid=37445744 locus=PGSC0003DMG400013751 ID=PGSC0003DMT400035747.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCTTCCACTCTTTCTCATGTAATTCCTTCTCAGCTATGCTCAAGCAAAAGTGGC
GTTTCATCGGTTTCACAAGCGTTGCTTGTGAAGCCGATGAAGATTAATGGTCATGGAATG
GGAAAGGATAAGAGGATGAAAGTGAAATGTATGGCAGCTAGCATTCCAGCAGATGATAGA
GTGCCTGATATGGAAAAAAGGAATCTCATGAATTTGCTTTTATTGGGTGCACTTGCTTTA
CCAACTGGTGGAATGCTTGTACCTTATGCTACTTTCTTTGCACCTCCTGGATCAGGAGGT
GGTAGTAGTGGCACCATTGCCAAAGATGCTAATGGCAATGATGTTGTTGTAACTGAATGG
CTCAAAACTCATTCACCTGGAACTCGAACCCTCACACAAGGACTAAAGGGAGATCCTACT
TACCTTGTTGTGGAGAACGATGGAACACTCGCGACCTATGGTATCAATGCCGTGTGCACT
CACCTTGGTTGTGTTGTGCCGTGGAATACTGCTGAGAACAAGTTCATTTGCCCTTGCCAT
GGATCTCAATACAACAATCAAGGAAAAGTTGTTAGAGGACCTGCTCCTTTGTCCTTGGCA
TTGGCTCATGCAGACATTGATGATGGGAAGGTGGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACAGAC
TTCAGAACTGGTGATGCTCCATGGTGGGCTTAG