Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400035605
CDS Infomation

pacid=37443198 polypeptide=PGSC0003DMP400024214 locus=PGSC0003DMG400013693 ID=PGSC0003DMT400035605.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGTTAACCGAAAGCTCCTCAAAGCAACTCATCAAACTCAATTGCCTTCTTTCAAAC
TTCACTCATTCCCACCAATTCTCCGATGCTCTCTCTCTCTTCAACCAAATTCACTCTTCC
CTTCATCTCCGACCAGATCATTACACCCTTTCAACCACTCTCACCGCATGTGCCAACATT
GTAAACACTAGCTTCGGCAATCAGCTCCACGGTTTCGCCATTAAAACAGACCTTAAACAA
TTCCCACATGTATCAAATTCTCTTCTTTCATTCTACGCCAAATCTAAAGATTTGGGTTCA
GTTAAAAGGGTCTTTAAAGAAATTGAAACCCCAGATGTTTATTCTTGGACTACGCTATTG
TCTGCCTGTACTAAGTTGGGGGAAGTTGGGTATGCTTGTAAGGTGTTTGATGAAATGCCG
CAGAGGAATTTGGCTGTTTGGAATGCAATGATTACTGGGTGTGCTGAAAGTGGGTATCAC
GGGATTGCTTTGAATTTGTTTCAAAGAATGCATTTTTTAGGTGTTAGATATGATAATTAT
GCTTTTGCTAGTGTTTTAAGTTTGTGTGATATGGAGTTATTGGATTTCGGAAGACAAGTG
CATTCGATGGTCATCAAGACGGGTTTTTTGGTAAGAGCTTCAGTGATTAATGCTTTGGTT
ACCATGTATTTTAACTGTAATAATGATTTTGATGCTTTTGGAGTATTTGAAGAAGCTGAG
GATGAAGTGCTTGATCCTGTAACTTATAATGCAATGATAGCTGGTTTAGTGAGTATGGAA
AGAGCTGAGGAGGCATTAGTAATGTTCAAGGATATGCGTAAGTTTTCTTTGAGACCTACT
GAGTTCACTTTTGTGAGTATAATGAGTTCATGTTCATGTATTAGAATTGCTTCTCAACTG
CATGCTCAAGTTGCTAGAATAGGTTTAGAAAACTATACGTCTATCGCTAATGCAACAATA
ACCATGTATGCTAGTTGCGGGAACTTGAATGCAGCCTTTTTAGTTTTTGAAAGACTGAAG
GTGAAGGATAGCGTGTCGTGGAATGCCATGATTACAAGTTATGCCCAAAATTGTTTGGAC
AGTGCAGCAATTTCTGCATACATTCAGATGCAGAAGGAAGGGTTAGAGCCAGACGAGTTT
ACGATAGGAAGCATACTCGCAAGCTCAGAGTCTCTAGTAATTGTTGAAATAATTTTGGGT
GTTGTTTTGAAGAAGGCCCTTATCTTGAAGACTGAAGTATCTAATGCGCTGCTCTCTGCC
TTCTGTAAGCATGGTGAAATGAAGCAAGCTTATCAAGTTTTTCATGACATGTTCCCTAGA
AACATGATCTCTTGGAATACTTTGATTTCTGGTTGTCATCTCAATGGACTACCCATGGGG
TGCTTGCACCTCTTCTCTGAGGTTGTGAGTGAACGTTTGATGCCTAATCCTTTTACTCTA
AGCATCATTTTGAGTGTTTGTGCCAGCATTTCAGCTCTACAACAAGGGAAGGAGATTCAT
ACTTACATTCTCAAATCTGGATTCATTTCAGAAATATCTTTAGGAAATGCCCTCATTACA
TTGTATGCAAAATGTGGACTGTTGCATTGGTCTCTAAAGGTGTTCCAGATAATGACACAA
AAAGACACAGTTTCTTGGAATTCAATTATTACTGCATATGCACAGCATGGGAAAGGCAAG
GAAGCTGTACATTGCTTTGAGATGATGCAAGAATTAGGTGGGGTCAAACCAGATAACACG
ACCTTTAATGCAGTTCTATCAGCTTGCAGCCATTCAGGCTTAATCGATAAAGGCATTGAA
GTTTTTACCTCCATGGTTCATACCTACGGTATAGAACCTACAGCAGACCACTTCTCTTGC
ATTGTTGATCTTCTAGGTCGGGCTGGATATCTTGATGAGGCAGAAAAACTGGTAAAAGAT
AGGCATGTTGATGTAGATTCCACTGTTTGGTGGACATTATTCAGTTCATGTGCTGCTTAT
GGCAACGTTAGACTAGGCAGAATTGCTGCGGGATTTCTGCTTGAGACTGAGAAGAATAAC
CCCACGGTGTATGTGCTTTTATCCAATATTTATGCTAGTGCGGAGAACTGGGAGGACTCT
GCTAATGTGAGGAAACTGATGAATAAATGTGGAGTGTTAAAGCAACCAGGAAGCAGTTGG
ATAGGGTCCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400024214
PEP Infomation

pacid=37443198 transcript=PGSC0003DMT400035605 locus=PGSC0003DMG400013693 ID=PGSC0003DMT400035605.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MKLTESSSKQLIKLNCLLSNFTHSHQFSDALSLFNQIHSSLHLRPDHYTLSTTLTACANI
VNTSFGNQLHGFAIKTDLKQFPHVSNSLLSFYAKSKDLGSVKRVFKEIETPDVYSWTTLL
SACTKLGEVGYACKVFDEMPQRNLAVWNAMITGCAESGYHGIALNLFQRMHFLGVRYDNY
AFASVLSLCDMELLDFGRQVHSMVIKTGFLVRASVINALVTMYFNCNNDFDAFGVFEEAE
DEVLDPVTYNAMIAGLVSMERAEEALVMFKDMRKFSLRPTEFTFVSIMSSCSCIRIASQL
HAQVARIGLENYTSIANATITMYASCGNLNAAFLVFERLKVKDSVSWNAMITSYAQNCLD
SAAISAYIQMQKEGLEPDEFTIGSILASSESLVIVEIILGVVLKKALILKTEVSNALLSA
FCKHGEMKQAYQVFHDMFPRNMISWNTLISGCHLNGLPMGCLHLFSEVVSERLMPNPFTL
SIILSVCASISALQQGKEIHTYILKSGFISEISLGNALITLYAKCGLLHWSLKVFQIMTQ
KDTVSWNSIITAYAQHGKGKEAVHCFEMMQELGGVKPDNTTFNAVLSACSHSGLIDKGIE
VFTSMVHTYGIEPTADHFSCIVDLLGRAGYLDEAEKLVKDRHVDVDSTVWWTLFSSCAAY
GNVRLGRIAAGFLLETEKNNPTVYVLLSNIYASAENWEDSANVRKLMNKCGVLKQPGSSW
IGS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400035605
Transcript Infomation

pacid=37443198 locus=PGSC0003DMG400013693 ID=PGSC0003DMT400035605.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGTTAACCGAAAGCTCCTCAAAGCAACTCATCAAACTCAATTGCCTTCTTTCAAAC
TTCACTCATTCCCACCAATTCTCCGATGCTCTCTCTCTCTTCAACCAAATTCACTCTTCC
CTTCATCTCCGACCAGATCATTACACCCTTTCAACCACTCTCACCGCATGTGCCAACATT
GTAAACACTAGCTTCGGCAATCAGCTCCACGGTTTCGCCATTAAAACAGACCTTAAACAA
TTCCCACATGTATCAAATTCTCTTCTTTCATTCTACGCCAAATCTAAAGATTTGGGTTCA
GTTAAAAGGGTCTTTAAAGAAATTGAAACCCCAGATGTTTATTCTTGGACTACGCTATTG
TCTGCCTGTACTAAGTTGGGGGAAGTTGGGTATGCTTGTAAGGTGTTTGATGAAATGCCG
CAGAGGAATTTGGCTGTTTGGAATGCAATGATTACTGGGTGTGCTGAAAGTGGGTATCAC
GGGATTGCTTTGAATTTGTTTCAAAGAATGCATTTTTTAGGTGTTAGATATGATAATTAT
GCTTTTGCTAGTGTTTTAAGTTTGTGTGATATGGAGTTATTGGATTTCGGAAGACAAGTG
CATTCGATGGTCATCAAGACGGGTTTTTTGGTAAGAGCTTCAGTGATTAATGCTTTGGTT
ACCATGTATTTTAACTGTAATAATGATTTTGATGCTTTTGGAGTATTTGAAGAAGCTGAG
GATGAAGTGCTTGATCCTGTAACTTATAATGCAATGATAGCTGGTTTAGTGAGTATGGAA
AGAGCTGAGGAGGCATTAGTAATGTTCAAGGATATGCGTAAGTTTTCTTTGAGACCTACT
GAGTTCACTTTTGTGAGTATAATGAGTTCATGTTCATGTATTAGAATTGCTTCTCAACTG
CATGCTCAAGTTGCTAGAATAGGTTTAGAAAACTATACGTCTATCGCTAATGCAACAATA
ACCATGTATGCTAGTTGCGGGAACTTGAATGCAGCCTTTTTAGTTTTTGAAAGACTGAAG
GTGAAGGATAGCGTGTCGTGGAATGCCATGATTACAAGTTATGCCCAAAATTGTTTGGAC
AGTGCAGCAATTTCTGCATACATTCAGATGCAGAAGGAAGGGTTAGAGCCAGACGAGTTT
ACGATAGGAAGCATACTCGCAAGCTCAGAGTCTCTAGTAATTGTTGAAATAATTTTGGGT
GTTGTTTTGAAGAAGGCCCTTATCTTGAAGACTGAAGTATCTAATGCGCTGCTCTCTGCC
TTCTGTAAGCATGGTGAAATGAAGCAAGCTTATCAAGTTTTTCATGACATGTTCCCTAGA
AACATGATCTCTTGGAATACTTTGATTTCTGGTTGTCATCTCAATGGACTACCCATGGGG
TGCTTGCACCTCTTCTCTGAGGTTGTGAGTGAACGTTTGATGCCTAATCCTTTTACTCTA
AGCATCATTTTGAGTGTTTGTGCCAGCATTTCAGCTCTACAACAAGGGAAGGAGATTCAT
ACTTACATTCTCAAATCTGGATTCATTTCAGAAATATCTTTAGGAAATGCCCTCATTACA
TTGTATGCAAAATGTGGACTGTTGCATTGGTCTCTAAAGGTGTTCCAGATAATGACACAA
AAAGACACAGTTTCTTGGAATTCAATTATTACTGCATATGCACAGCATGGGAAAGGCAAG
GAAGCTGTACATTGCTTTGAGATGATGCAAGAATTAGGTGGGGTCAAACCAGATAACACG
ACCTTTAATGCAGTTCTATCAGCTTGCAGCCATTCAGGCTTAATCGATAAAGGCATTGAA
GTTTTTACCTCCATGGTTCATACCTACGGTATAGAACCTACAGCAGACCACTTCTCTTGC
ATTGTTGATCTTCTAGGTCGGGCTGGATATCTTGATGAGGCAGAAAAACTGGTAAAAGAT
AGGCATGTTGATGTAGATTCCACTGTTTGGTGGACATTATTCAGTTCATGTGCTGCTTAT
GGCAACGTTAGACTAGGCAGAATTGCTGCGGGATTTCTGCTTGAGACTGAGAAGAATAAC
CCCACGGTGTATGTGCTTTTATCCAATATTTATGCTAGTGCGGAGAACTGGGAGGACTCT
GCTAATGTGAGGAAACTGATGAATAAATGTGGAGTGTTAAAGCAACCAGGAAGCAGTTGG
ATAGGGTCCTAA