Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400035064
CDS Infomation	pacid=37444075 polypeptide=PGSC0003DMP400023850 locus=PGSC0003DMG400013485 ID=PGSC0003DMT400035064.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCCAGGAAGAAGATCAGAGAGTATGATTCAAAGAGATTGTTGAAGGAGCATTTCAAG AGACTTGGAGGTTATGATTTGGCTATCAAATCTGCACAGGTGACAGAGTCTACTGACATC AATGAGCTAGCAGAGAAAGAGCCTTGGCTCAACTCAACAAAGTTGGTTGTAAAGCCAGAT ATGTTGTTTGGCAAGCGTGGAAAGAGTGGACTTGTTGCCTTGAATCTTGATCTTGCTCAA GTTGCTACTTTTGTGAAGGAGCGTCTTGGCAAAGAGGTGGAGATGGGCGGATGCAAAGGT CCCATCACGACCTTCATTGTTGAGCCATTCATTCCCCACAATGAAGAGTTTTATCTTAAT ATTGTCTCGGAGAGGCTTGGTTGCAGCATAAGCTTTTCTGAATGTGGAGGAATTGACATC GAAGAGAACTGGGACAAGGTTAAGACTATCTTTGTGCCGACAGGAACTTCTTTTACATCA GAGATATGTGCTCCACTTGTTGCCACTCTACCATTGGAGATTAAGGGTGTCATTGAAGAG TTCCTCAAAGTGATTTACACTCTATTTCAAGATCTGGACTTCACTTTCCTAGAAATGAAT CCTTTCACATTGGTTGAAGGAAAGCCTTATCCTCTTGATATGAGGGGAGAGCTTGATGAC ACTGCTGCTTTCAAGAACTTCAAAAAGTGGGGAAATGTTGAATTTCCATTGCCATTTGGA AGGGTTATGAGTGCTACAGAGAGCTTCATTCATGGGCTTGATGAAAAGACAAGTGCATCT CTGAAGTTCACAGTCTTGAACCCCATGGGGCGAATTTGGACTATGGTTGCTGGTGGAGGA GCTAGTGTCATCTATGCAGATACTGTAGGTGATCTTGGATATGCTTCAGAGCTTGGGAAC TATGCAGAGTACAGCGGTGCTCCCAATGAAGAAGAGGTCTTGCAGTATGCTAGAGTTGTA ATTGATTGTGCCACTGCAAATCCTGATGGCCGTAAGAGAGCCCTCGTGATTGGTGGTGGA ATAGCCAACTTCACTGACGTTGCTGCTACATTTAGTGGTATTATTCGAGCTCTTAAGGAG AAGGAGTCAAAACTTAAAGCTGCTAGTATGAACATATATGTTAGAAGAGGAGGTCCAAAC TACCAAAAAGGTCTTGCAAAAATGAGGTCTCTTGGCGAGGAAATTGGCATCCCAATTGAG GTTTATGGACCTGAGGAAACCATGACTGGCATCTGCAAACAGGCTATTGAGTGCATCACT GCAGCTGCATAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400023850
PEP Infomation	pacid=37444075 transcript=PGSC0003DMT400035064 locus=PGSC0003DMG400013485 ID=PGSC0003DMT400035064.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MARKKIREYDSKRLLKEHFKRLGGYDLAIKSAQVTESTDINELAEKEPWLNSTKLVVKPD MLFGKRGKSGLVALNLDLAQVATFVKERLGKEVEMGGCKGPITTFIVEPFIPHNEEFYLN IVSERLGCSISFSECGGIDIEENWDKVKTIFVPTGTSFTSEICAPLVATLPLEIKGVIEE FLKVIYTLFQDLDFTFLEMNPFTLVEGKPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNVEFPLPFG RVMSATESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPMGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATANPDGRKRALVIGGGIANFTDVAATFSGIIRALKE KESKLKAASMNIYVRRGGPNYQKGLAKMRSLGEEIGIPIEVYGPEETMTGICKQAIECIT AAA*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400035064
Transcript Infomation	pacid=37444075 locus=PGSC0003DMG400013485 ID=PGSC0003DMT400035064.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCCAGGAAGAAGATCAGAGAGTATGATTCAAAGAGATTGTTGAAGGAGCATTTCAAG AGACTTGGAGGTTATGATTTGGCTATCAAATCTGCACAGGTGACAGAGTCTACTGACATC AATGAGCTAGCAGAGAAAGAGCCTTGGCTCAACTCAACAAAGTTGGTTGTAAAGCCAGAT ATGTTGTTTGGCAAGCGTGGAAAGAGTGGACTTGTTGCCTTGAATCTTGATCTTGCTCAA GTTGCTACTTTTGTGAAGGAGCGTCTTGGCAAAGAGGTGGAGATGGGCGGATGCAAAGGT CCCATCACGACCTTCATTGTTGAGCCATTCATTCCCCACAATGAAGAGTTTTATCTTAAT ATTGTCTCGGAGAGGCTTGGTTGCAGCATAAGCTTTTCTGAATGTGGAGGAATTGACATC GAAGAGAACTGGGACAAGGTTAAGACTATCTTTGTGCCGACAGGAACTTCTTTTACATCA GAGATATGTGCTCCACTTGTTGCCACTCTACCATTGGAGATTAAGGGTGTCATTGAAGAG TTCCTCAAAGTGATTTACACTCTATTTCAAGATCTGGACTTCACTTTCCTAGAAATGAAT CCTTTCACATTGGTTGAAGGAAAGCCTTATCCTCTTGATATGAGGGGAGAGCTTGATGAC ACTGCTGCTTTCAAGAACTTCAAAAAGTGGGGAAATGTTGAATTTCCATTGCCATTTGGA AGGGTTATGAGTGCTACAGAGAGCTTCATTCATGGGCTTGATGAAAAGACAAGTGCATCT CTGAAGTTCACAGTCTTGAACCCCATGGGGCGAATTTGGACTATGGTTGCTGGTGGAGGA GCTAGTGTCATCTATGCAGATACTGTAGGTGATCTTGGATATGCTTCAGAGCTTGGGAAC TATGCAGAGTACAGCGGTGCTCCCAATGAAGAAGAGGTCTTGCAGTATGCTAGAGTTGTA ATTGATTGTGCCACTGCAAATCCTGATGGCCGTAAGAGAGCCCTCGTGATTGGTGGTGGA ATAGCCAACTTCACTGACGTTGCTGCTACATTTAGTGGTATTATTCGAGCTCTTAAGGAG AAGGAGTCAAAACTTAAAGCTGCTAGTATGAACATATATGTTAGAAGAGGAGGTCCAAAC TACCAAAAAGGTCTTGCAAAAATGAGGTCTCTTGGCGAGGAAATTGGCATCCCAATTGAG GTTTATGGACCTGAGGAAACCATGACTGGCATCTGCAAACAGGCTATTGAGTGCATCACT GCAGCTGCATAA