Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400035000
CDS Infomation	pacid=37461902 polypeptide=PGSC0003DMP400023807 locus=PGSC0003DMG400013456 ID=PGSC0003DMT400035000.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGATTCAGATCAAGCAAAGCTATTTATTGGTGGGATATCATGGGAAACATCAGAGGAG AGGATGAAGGAGTATTTTCAAGGGTATGGTGATGTTTTACAGACCGTAGTAATGAGGGAT AAGATTACTGGGAAGCCTAGAGGATTTGGGTTTGTTGTATTTGCAGATCCTAGTGTTCTT GATAGGGTTCTTCAGGATACCCATGTAATTGATGGACGTACGGTTGAGGCTAAGAGGGCC TTGTCCAGAGAGGAACAACAGGGTCCAAAATCTGGAAATATGGGTAGTGCTAGAAGTTTT GGAGGCGGTGGAAATACCAAGACCAAGAAAATATTTGTTGGGGGATTGCCTCCTACTCTG ACTGAGGATGGCTTTAGAACTTACTTTGAAACTTACGGTAATGTCACTGATGTCGCAATT ATGTTTGATCAACAGACCAACCGACCTCGTGGGTTTGGCTTCATTTCATTTGATTCTGAA GACGCAGTAGATAGGGTTTTGCACAAGACATATCATGATCTCAGTGGGAAACAAGTAGAA GTAAAACGTGCTCTTCCTAAAGATGGTAATTCTGGTTTTGGTGGTCGTTCCACGGGCAAC GGTGGTAGTGGTATGGGTGGTGGAAGTTACCAGGGGTATGGTGCATCTGGTGACAATCCC AGTTCTTATGACAGAATGGATACCAGCAGGTACATGCAATCACAAAACACCGGAGGTGGT TATCCATCTTATGGTTCCTCCGGATATGGTACCGCAGGTTATGGTTATGGATCGTCCAAC AATGGCATGGGTTATGGTGCTTATGGAAGTTACGGTGGAGCCAATCCTGGCTATGGGGGT GTCAATCCTGGATATGGTAGTCCTGCAGTTGCTGCCTTCGGAAATCCAAATGTGCCCGGT ACTGGTTATGGTAGTGGTCAAGCTGGTGGACCAAGAAGCTCGTGGGGCTCTCAGATTCCT TCTGGATATGGAAATATGGGCTATGGTAATGCATCCTGGGGTGCTTCAAGTGCAGGTGGG GCTGCTAACGGAGGATCTGCTACTGGCCAGTCACCAACTGGGGCCACAGGATATGGAAAT CAAGGTTATGGCTATGGTGGATATGGCGGAAATGATGGTGCTTATGGAAATCCATCTATT GGAGGTGGTGCATCGGGAGACATGCAATCAGGTGGAGGTTACATGGGCAGTGGCTATGGC GATGCTAATGGAAATTCAACATTGAGGTCTGATACCTCACAAGGTTCTGGTAATTATGGT GCTCAGCAAAATGGACCCTATGGTGGTGGCTACGGTGGTGCTCCAAGTCGGCAGGCTCAA CAGCACTGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400023807
PEP Infomation	pacid=37461902 transcript=PGSC0003DMT400035000 locus=PGSC0003DMG400013456 ID=PGSC0003DMT400035000.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MDSDQAKLFIGGISWETSEERMKEYFQGYGDVLQTVVMRDKITGKPRGFGFVVFADPSVL DRVLQDTHVIDGRTVEAKRALSREEQQGPKSGNMGSARSFGGGGNTKTKKIFVGGLPPTL TEDGFRTYFETYGNVTDVAIMFDQQTNRPRGFGFISFDSEDAVDRVLHKTYHDLSGKQVE VKRALPKDGNSGFGGRSTGNGGSGMGGGSYQGYGASGDNPSSYDRMDTSRYMQSQNTGGG YPSYGSSGYGTAGYGYGSSNNGMGYGAYGSYGGANPGYGGVNPGYGSPAVAAFGNPNVPG TGYGSGQAGGPRSSWGSQIPSGYGNMGYGNASWGASSAGGAANGGSATGQSPTGATGYGN QGYGYGGYGGNDGAYGNPSIGGGASGDMQSGGGYMGSGYGDANGNSTLRSDTSQGSGNYG AQQNGPYGGGYGGAPSRQAQQH*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400035000
Transcript Infomation	pacid=37461902 locus=PGSC0003DMG400013456 ID=PGSC0003DMT400035000.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGATTCAGATCAAGCAAAGCTATTTATTGGTGGGATATCATGGGAAACATCAGAGGAG AGGATGAAGGAGTATTTTCAAGGGTATGGTGATGTTTTACAGACCGTAGTAATGAGGGAT AAGATTACTGGGAAGCCTAGAGGATTTGGGTTTGTTGTATTTGCAGATCCTAGTGTTCTT GATAGGGTTCTTCAGGATACCCATGTAATTGATGGACGTACGGTTGAGGCTAAGAGGGCC TTGTCCAGAGAGGAACAACAGGGTCCAAAATCTGGAAATATGGGTAGTGCTAGAAGTTTT GGAGGCGGTGGAAATACCAAGACCAAGAAAATATTTGTTGGGGGATTGCCTCCTACTCTG ACTGAGGATGGCTTTAGAACTTACTTTGAAACTTACGGTAATGTCACTGATGTCGCAATT ATGTTTGATCAACAGACCAACCGACCTCGTGGGTTTGGCTTCATTTCATTTGATTCTGAA GACGCAGTAGATAGGGTTTTGCACAAGACATATCATGATCTCAGTGGGAAACAAGTAGAA GTAAAACGTGCTCTTCCTAAAGATGGTAATTCTGGTTTTGGTGGTCGTTCCACGGGCAAC GGTGGTAGTGGTATGGGTGGTGGAAGTTACCAGGGGTATGGTGCATCTGGTGACAATCCC AGTTCTTATGACAGAATGGATACCAGCAGGTACATGCAATCACAAAACACCGGAGGTGGT TATCCATCTTATGGTTCCTCCGGATATGGTACCGCAGGTTATGGTTATGGATCGTCCAAC AATGGCATGGGTTATGGTGCTTATGGAAGTTACGGTGGAGCCAATCCTGGCTATGGGGGT GTCAATCCTGGATATGGTAGTCCTGCAGTTGCTGCCTTCGGAAATCCAAATGTGCCCGGT ACTGGTTATGGTAGTGGTCAAGCTGGTGGACCAAGAAGCTCGTGGGGCTCTCAGATTCCT TCTGGATATGGAAATATGGGCTATGGTAATGCATCCTGGGGTGCTTCAAGTGCAGGTGGG GCTGCTAACGGAGGATCTGCTACTGGCCAGTCACCAACTGGGGCCACAGGATATGGAAAT CAAGGTTATGGCTATGGTGGATATGGCGGAAATGATGGTGCTTATGGAAATCCATCTATT GGAGGTGGTGCATCGGGAGACATGCAATCAGGTGGAGGTTACATGGGCAGTGGCTATGGC GATGCTAATGGAAATTCAACATTGAGGTCTGATACCTCACAAGGTTCTGGTAATTATGGT GCTCAGCAAAATGGACCCTATGGTGGTGGCTACGGTGGTGCTCCAAGTCGGCAGGCTCAA CAGCACTGA