Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400034283
CDS Infomation

pacid=37460985 polypeptide=PGSC0003DMP400023320 locus=PGSC0003DMG400013180 ID=PGSC0003DMT400034283.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTTCGGGCAAAGCAGCTCGGCACACTCTCCCAGTCAGCTAGGTCTTTTTTTCTAGGT
GGATCACGATGTAGTGCAGGAGATGGAAGTTCCTGCACTTGTTCAGAAGATGACACTTGT
ATTTCAAAAAGGCCGCAGACTAGAAATGACGTTCGACATCCACAAATATCATCCAACCTA
GTGTCAAAATCCTCTGTAGGGGTTGGTGCCTTATTATCTGGAGATGCTGTAAAGGTTGTG
AGCTCCAAAAAAAATGAGACTTTAGACTCTCCAGTTTCTAGGCCGCAGGCCATACCAGTA
TCTACCTTGTCTGGGCGGGTAGACTCTGTTAAATATGGTAACATTGATGCCGAGATAACT
GTACAGTCCTCACCTCCCATCTCAGACCAGTTTGTCCGGGCAGGTATTGCAGCAGTCAGT
TTTTTATCTGATGTGGTAAACTATAAGATACCTATGTTAGATGGAAGCGAAGTGCTTAGC
TCATCCAACAACTGTGTGGTGGATCGTACAAAGCCTGTATCCAATGTGAGACCATCAAAT
ATAAAGACCTCCAGAAATGACAAACTTCAAGGAAAAGCTTCTACTGATACACCTGTAACG
TCAACCCTTGCACATAATTCGAATTACACAAAAAACAAAGGTGATAAATGTAATTCAGTC
AGAGGCAGGAATCCTGTTTCGAACAATGGTGTTGGGGAAGTGGAGACCCATGGTGTTATC
CCAGATTCTTGTGACCGGAGGAGGACAATGCCTCCAAAGCCCAGAACATATCCAAATCGT
AACATGACAAATGTGCGTGGCTCTGAAGGAAAGCTTAAGCATGAGATTCCTGAAGGTTTC
AGCAGGCCACAACGAGCAACAAAGTTGCAAAATGCAGGAGTAATGGTCAGGCAGTTCTCT
AATAGTAGTCATGTTGTTGGAACAGTTTCTCGCATTATACAACAGTTAAATTGGAGTCCT
GAGACGGAAAATGCTCTTCGTGAACTCAACTATTTATTAGATCCATACCAAGCAAACCAA
GTTCTTAAGCAGATCCATGATCATGCAGTTGCTCTTGGCTTTTTCTACTGGTTGAAGCAG
CAACCAGGATTTAAACATGACGGACACACCTATACCACCATGGTTGGCATCCTGGGACGT
GCTAGGCAGTTTGGGGCAATTAACAAGTTGCTTGAGCAGATGGTCAAAGATGGGTGCCAA
CCAAATGTAGTGACATATAACCGTCTCATTCACAGTTACGGCAGAGCAAACTACTTGCGT
GAAGCATTACATGTCTTTAGTCAAATGCAGGAAGCTAGAGTTGAACCTGACCGTGTAACC
TATTGTACTCTAATTGACATCCATGCAAAAGCTGGTTACCTTGATGTTGCCATGGACTTG
TATGAAAGGATGCAAGATGCTGGGCTCTCTCCAGACACTTTCACCTACAGTGTCATTATT
AATTGCCTTGGAAAAGCAGGCCACTTAGCTGCTGCGCACAAACTGTTCTGTGAGATGGTT
AATCAGGGCTGTGTACCAAACTTGGTAACCTACAACATTATGATTGCATTGCATGCAAAA
GCAAGGAACTATTCTAGTGCATTACAATTATATCGAGACATGCAGAATGCTGGATTTGAG
CCAGACAAGGTGACATACAGTATTGTGATGGAGGTGCTTGGCCATTGTGGCTATCTGGAG
GAAGCTGAGGCAGTTTTTACAGAGATGAAAAGGAAGAATTGGGTACCTGATGAACCTGTA
TATGGTCTACTAGTGGACTTATGGGGAAAGGCTGGGAATGTAGAAAAGGCTTGGAACTGG
TATCATGCGATGATTAATGCAGGTTTATGCCCCAATGTGCCTACTTGCAATTCTCTGCTC
AGTGCTTTCCTTAGAGTTCACCGGTTGCCTGATGCGTACAACTTGCTTCAAAGCATGCTT
GAATTGGGTCTAAACCCTTCTCTGCAAACTTATACCTTGCTCCTCAGTTGCTGCACAGAA
GCTCAAACATCCTTTGACATGTCATTTTGTTGTGAGCTGATGGCAATCACACGTCACCCA
GCACACACATTCCTTCTGACCATGCCAGCAGCAGGACCCGATGGGCAAAATGTGAGGGAT
CATGTGGGCACCTTTTTGGATCTGATGCATAGTGAGGACAGAGAGAGTAAAAGGGGTCTT
GTTGATTCAGTTGTTGATTTTCTGCACAAATCAGGACTCAAGGAGGAAGCTGGATCTGTC
TGGGAGGTGGCAGCGGACAAGAATGTCTACCCTGATGCAGTTAGAGAGAAAAGCTCCTCA
TATTGGCTTATAAACCTCCATGTAATGTCAGATGGAACTGCGATCATCGCACTGTCAAGA
ACACTTGCCTGGTTCCGCCGACAGATGCTTATCTCGGGAATCCGTCCAAGCCGCATTGAT
ATTGTGACAGGATGGGGCCGTAGGAGTCGTGTGACTGGATCCTCTATGGTGAGGCAAGCA
GTACAGGAGTTGCTTAACATGTTCGGCTTCCCATTTCTTGCTCAGAATGGGAATTCAGGG
TGCTTTGTGGGCTGTGGGGAGCCTCTCAGTAGATGGTTGGTCCAGCCTTATGTCGAGAGG
ATGCATTTGCTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400023320
PEP Infomation

pacid=37460985 transcript=PGSC0003DMT400034283 locus=PGSC0003DMG400013180 ID=PGSC0003DMT400034283.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLRAKQLGTLSQSARSFFLGGSRCSAGDGSSCTCSEDDTCISKRPQTRNDVRHPQISSNL
VSKSSVGVGALLSGDAVKVVSSKKNETLDSPVSRPQAIPVSTLSGRVDSVKYGNIDAEIT
VQSSPPISDQFVRAGIAAVSFLSDVVNYKIPMLDGSEVLSSSNNCVVDRTKPVSNVRPSN
IKTSRNDKLQGKASTDTPVTSTLAHNSNYTKNKGDKCNSVRGRNPVSNNGVGEVETHGVI
PDSCDRRRTMPPKPRTYPNRNMTNVRGSEGKLKHEIPEGFSRPQRATKLQNAGVMVRQFS
NSSHVVGTVSRIIQQLNWSPETENALRELNYLLDPYQANQVLKQIHDHAVALGFFYWLKQ
QPGFKHDGHTYTTMVGILGRARQFGAINKLLEQMVKDGCQPNVVTYNRLIHSYGRANYLR
EALHVFSQMQEARVEPDRVTYCTLIDIHAKAGYLDVAMDLYERMQDAGLSPDTFTYSVII
NCLGKAGHLAAAHKLFCEMVNQGCVPNLVTYNIMIALHAKARNYSSALQLYRDMQNAGFE
PDKVTYSIVMEVLGHCGYLEEAEAVFTEMKRKNWVPDEPVYGLLVDLWGKAGNVEKAWNW
YHAMINAGLCPNVPTCNSLLSAFLRVHRLPDAYNLLQSMLELGLNPSLQTYTLLLSCCTE
AQTSFDMSFCCELMAITRHPAHTFLLTMPAAGPDGQNVRDHVGTFLDLMHSEDRESKRGL
VDSVVDFLHKSGLKEEAGSVWEVAADKNVYPDAVREKSSSYWLINLHVMSDGTAIIALSR
TLAWFRRQMLISGIRPSRIDIVTGWGRRSRVTGSSMVRQAVQELLNMFGFPFLAQNGNSG
CFVGCGEPLSRWLVQPYVERMHLL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400034283
Transcript Infomation

pacid=37460985 locus=PGSC0003DMG400013180 ID=PGSC0003DMT400034283.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTTCGGGCAAAGCAGCTCGGCACACTCTCCCAGTCAGCTAGGTCTTTTTTTCTAGGT
GGATCACGATGTAGTGCAGGAGATGGAAGTTCCTGCACTTGTTCAGAAGATGACACTTGT
ATTTCAAAAAGGCCGCAGACTAGAAATGACGTTCGACATCCACAAATATCATCCAACCTA
GTGTCAAAATCCTCTGTAGGGGTTGGTGCCTTATTATCTGGAGATGCTGTAAAGGTTGTG
AGCTCCAAAAAAAATGAGACTTTAGACTCTCCAGTTTCTAGGCCGCAGGCCATACCAGTA
TCTACCTTGTCTGGGCGGGTAGACTCTGTTAAATATGGTAACATTGATGCCGAGATAACT
GTACAGTCCTCACCTCCCATCTCAGACCAGTTTGTCCGGGCAGGTATTGCAGCAGTCAGT
TTTTTATCTGATGTGGTAAACTATAAGATACCTATGTTAGATGGAAGCGAAGTGCTTAGC
TCATCCAACAACTGTGTGGTGGATCGTACAAAGCCTGTATCCAATGTGAGACCATCAAAT
ATAAAGACCTCCAGAAATGACAAACTTCAAGGAAAAGCTTCTACTGATACACCTGTAACG
TCAACCCTTGCACATAATTCGAATTACACAAAAAACAAAGGTGATAAATGTAATTCAGTC
AGAGGCAGGAATCCTGTTTCGAACAATGGTGTTGGGGAAGTGGAGACCCATGGTGTTATC
CCAGATTCTTGTGACCGGAGGAGGACAATGCCTCCAAAGCCCAGAACATATCCAAATCGT
AACATGACAAATGTGCGTGGCTCTGAAGGAAAGCTTAAGCATGAGATTCCTGAAGGTTTC
AGCAGGCCACAACGAGCAACAAAGTTGCAAAATGCAGGAGTAATGGTCAGGCAGTTCTCT
AATAGTAGTCATGTTGTTGGAACAGTTTCTCGCATTATACAACAGTTAAATTGGAGTCCT
GAGACGGAAAATGCTCTTCGTGAACTCAACTATTTATTAGATCCATACCAAGCAAACCAA
GTTCTTAAGCAGATCCATGATCATGCAGTTGCTCTTGGCTTTTTCTACTGGTTGAAGCAG
CAACCAGGATTTAAACATGACGGACACACCTATACCACCATGGTTGGCATCCTGGGACGT
GCTAGGCAGTTTGGGGCAATTAACAAGTTGCTTGAGCAGATGGTCAAAGATGGGTGCCAA
CCAAATGTAGTGACATATAACCGTCTCATTCACAGTTACGGCAGAGCAAACTACTTGCGT
GAAGCATTACATGTCTTTAGTCAAATGCAGGAAGCTAGAGTTGAACCTGACCGTGTAACC
TATTGTACTCTAATTGACATCCATGCAAAAGCTGGTTACCTTGATGTTGCCATGGACTTG
TATGAAAGGATGCAAGATGCTGGGCTCTCTCCAGACACTTTCACCTACAGTGTCATTATT
AATTGCCTTGGAAAAGCAGGCCACTTAGCTGCTGCGCACAAACTGTTCTGTGAGATGGTT
AATCAGGGCTGTGTACCAAACTTGGTAACCTACAACATTATGATTGCATTGCATGCAAAA
GCAAGGAACTATTCTAGTGCATTACAATTATATCGAGACATGCAGAATGCTGGATTTGAG
CCAGACAAGGTGACATACAGTATTGTGATGGAGGTGCTTGGCCATTGTGGCTATCTGGAG
GAAGCTGAGGCAGTTTTTACAGAGATGAAAAGGAAGAATTGGGTACCTGATGAACCTGTA
TATGGTCTACTAGTGGACTTATGGGGAAAGGCTGGGAATGTAGAAAAGGCTTGGAACTGG
TATCATGCGATGATTAATGCAGGTTTATGCCCCAATGTGCCTACTTGCAATTCTCTGCTC
AGTGCTTTCCTTAGAGTTCACCGGTTGCCTGATGCGTACAACTTGCTTCAAAGCATGCTT
GAATTGGGTCTAAACCCTTCTCTGCAAACTTATACCTTGCTCCTCAGTTGCTGCACAGAA
GCTCAAACATCCTTTGACATGTCATTTTGTTGTGAGCTGATGGCAATCACACGTCACCCA
GCACACACATTCCTTCTGACCATGCCAGCAGCAGGACCCGATGGGCAAAATGTGAGGGAT
CATGTGGGCACCTTTTTGGATCTGATGCATAGTGAGGACAGAGAGAGTAAAAGGGGTCTT
GTTGATTCAGTTGTTGATTTTCTGCACAAATCAGGACTCAAGGAGGAAGCTGGATCTGTC
TGGGAGGTGGCAGCGGACAAGAATGTCTACCCTGATGCAGTTAGAGAGAAAAGCTCCTCA
TATTGGCTTATAAACCTCCATGTAATGTCAGATGGAACTGCGATCATCGCACTGTCAAGA
ACACTTGCCTGGTTCCGCCGACAGATGCTTATCTCGGGAATCCGTCCAAGCCGCATTGAT
ATTGTGACAGGATGGGGCCGTAGGAGTCGTGTGACTGGATCCTCTATGGTGAGGCAAGCA
GTACAGGAGTTGCTTAACATGTTCGGCTTCCCATTTCTTGCTCAGAATGGGAATTCAGGG
TGCTTTGTGGGCTGTGGGGAGCCTCTCAGTAGATGGTTGGTCCAGCCTTATGTCGAGAGG
ATGCATTTGCTTTAG