Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400034189
CDS Infomation

pacid=37465303 polypeptide=PGSC0003DMP400023260 locus=PGSC0003DMG400013140 ID=PGSC0003DMT400034189.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGAGGGGAGTTGATTTTTGGGCCTCTCCTAAAGGTCAAGTGGAGGGCGTTGCCTCG
TTTGATGCTAGTTCAAGGTCTTCAAATGTTGATTCATTCAACAATGTTATGGAGATTATG
AATCTTGATGCTTATGCTGGATGGTGCACTAGCCCTAGTGCAGCAGAGCACATGATAGCC
TCTTATGCCGCATTTTCGCCAATTAATCACATGTCTCAAAGTTATGCACCATTTGAAGGA
ATGAGTTATACAGAACAAAATACTGGAGCATTTCCTCCAATGGACGCCAATATGGTGGCA
AGTAATCATGATGGAGGAGAGAAAATGATGTTTGGGCAAAATGATGACCAGTTACATTTT
ATGGTAGATTCAGTTGATGGGGAGGATGGTTTGGTAGCTAAAAAAAGTAGAAGATCAAGC
CAACAGTCTGACGGTGCGGATATTGGCAACTCTATGATCCTCAGGTCACCTTCTCAACCA
CTTGCTGAGAGAATGCTTAGGGCATTGGCAATGTTTAAAGAGTCATCTGCTGCAGGAATT
TTGGCTCAAGTTTGGATTCCAATGAAGAATGGTGATCAGTACGTCTTGAGCACATGTGAA
CAGCCATATCTTCTTGATCAGGTGCTTTCTGGCTATCGGGAGGTCTCCAGGAAGTTCACT
TTTGATACAGAAATAAAACCAGGAGCAATCCCAGGTCTTCCTGGTCGGGTGTTTAGTTCA
AGAATTCCAGAGTGGACGTCAAATGTTCTGTACTACAAGGAGGCTGAATACTTACGTGTA
CAATATGCTGTTGACCATGAAGTTCGTGGATCTATTGCTTTACCTGTCTTTGAGGATGAT
GCCTGTGAAACTCCATGTTGTGCAGTATTGGAACTCGTTACAATGAAGGAGAAACCTAAT
TTTGATTTGGAAATGGATAATGTTTGCCAGGCTCTCCAGGCTGTGAATTTAAGGAGTATC
GCGCCTCCTCGACTTCATTCTCAGAATCTCTCAAATAACCAAAGAGATGCTTTAGCTGAG
ATAACAGATGTTCTGCTAGCAGTTTGCCATGCACATAAGCTGCCTCTTGCTCTGACATGG
ATTCCCTGTAATGTCACTGAAGGAGAAGGAGATGAACCCATCAGAGTGCGTGCTAGAGGA
TGTAATACAAGTTCAAATGAAAAATGTGTGTTATGTGTTGAGGATACAGCTTGTTATGTG
AGTGACAAGGAAATGCAAGGATTTGTACATGCATGTAAGGAACATTTTCTCGAGGAAGGT
GAAGGTATTGTTGGGAAAGCTCTGCAATCTAACCATCCCTTCTTCTACCCTGATGTGAAG
GAGTATCATATAAGTGAGTACCCACTTGTTCATCATGCACGAAAGTTTGGTCTAAATGCT
GCTGTGGCTATCAGATTACGTAGTACATTCACCGGCAATGACGATTACATATTGGAGTTC
TTTCTTCCTACAAGTATGAAGGGAAGTACCGAGCAACAGCTTCTCTTGAATAACCTTTCA
GGTACCATGCAAAGAATTTGCAAAAGTTTGAGAACAGTAGCAGATGCGGAATTGGTTGGA
CAAGGTGCTAAGTTTGGGTTACAGGATGGATCTGTTCCAAATTTACCACCGATTGCATTG
TCTAGGAAGAACTCTCAGCACTCATTAGACAGTAATTCAAATTCTGTAAACGGGGCTCCT
TTAGGTGCCTGTGATTCAAAGAGTGCTGGAACGCATGCTGATGATTCTCGTGAACAGACA
ATGACTGGATCAAGAAGACAGATTGAGAAAAAACGAAGTACAGCAGAAAAACATGTCAGC
TTAAGTGTTCTTCAGCAATACTTCTCTGGGAGCTTGAAGGATGCTGCAAAAAGCATTGGT
GTGTGTCCAACTACCTTGAAAAGGATATGCCGACAACATGGGATATCTAGATGGCCATCC
CGGAAGATAAACAAAGTCAACCGGTCTTTGAAAAAGATACAAACAGTGCTTGAATCTGTC
CAAGGGGTAGAAGGGGGATTGAAGTTCGATCCAGCAACTGGAGGTCTAGTTCCAGCTGGC
TCAATTATCCAAGATTTCAATGCACAGAAAAGCATATTTTTCCCATTCAAAGATGTCTCT
GTCAAAAATCCTACTTCTGTTTTCCAGGATGCTGCTGTACCCTCATCTTCAGGCAATGAC
AAAGAGAATTCTGTGGTGAAAATGGAGGACTTTTATGCTGATGGGAACCAACTCAGCCAA
TCAAATCATATCAATACTTCCTCTTTTAAGGAAGGGAATAAATCAAGTATTGAAGTGTCT
GGATATTGTTATGAATCCAAGTTGGCAACATTAGATGCAGGATCATCCGGACTTGCAAGT
CTGAATGCGATGCCATTGACTGATTCCGGAAATGCATCATTGGGATCTTTCCTTACAAAA
GAAGGATGCAGGAGGTGGGGATTGAACAATGACACCTTGGACAATTTTGACCGTCATTTC
ACTTCTCGGTGCTCGTATCCCATGGTTGTTGGGGGTGATGTTGACAGTAAGATGAAAGGA
GATAATGAAATGGATGGTGATGGTAGGGTGATTGAACATAACCAGGCCAGTTCTTCAGCC
ATGACAGATTCATCCAATGGGTCTGGGTCTGGGTCGATGATAAATGGTAGTTCATCAAGC
TCTCACAGTCGTGGTGCAGAGAAGCATTCTAAAGTTGAAGTGAACTGTGGTGATAACGGG
TCAACAATTACTGTGAAAGCTACTTACAAAGAAGATACCATCCGATTTAAGTTTGACCTT
TCAGCAGGGTGCTTCCAACTCTATGAGGATGTTGCTAAGAGGTTTAAACTGCAGACGGGG
ACATTCCAACTCAAGTATCTTGATGATGAGGAGGAATGGGTGATGTTGGTAAATGACGCA
GATCTGCATGAGTGTCTTGAGATACTGGAATTTGGTGGTGGTCGTACTGTCAAGTTTCTT
GTTCGCGATACACCATGTGCTCTGGGAAGCTCAGGCAGCAGTAACTGTTTTTTGGCTAGT
GGCTCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400023260
PEP Infomation

pacid=37465303 transcript=PGSC0003DMT400034189 locus=PGSC0003DMG400013140 ID=PGSC0003DMT400034189.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MERGVDFWASPKGQVEGVASFDASSRSSNVDSFNNVMEIMNLDAYAGWCTSPSAAEHMIA
SYAAFSPINHMSQSYAPFEGMSYTEQNTGAFPPMDANMVASNHDGGEKMMFGQNDDQLHF
MVDSVDGEDGLVAKKSRRSSQQSDGADIGNSMILRSPSQPLAERMLRALAMFKESSAAGI
LAQVWIPMKNGDQYVLSTCEQPYLLDQVLSGYREVSRKFTFDTEIKPGAIPGLPGRVFSS
RIPEWTSNVLYYKEAEYLRVQYAVDHEVRGSIALPVFEDDACETPCCAVLELVTMKEKPN
FDLEMDNVCQALQAVNLRSIAPPRLHSQNLSNNQRDALAEITDVLLAVCHAHKLPLALTW
IPCNVTEGEGDEPIRVRARGCNTSSNEKCVLCVEDTACYVSDKEMQGFVHACKEHFLEEG
EGIVGKALQSNHPFFYPDVKEYHISEYPLVHHARKFGLNAAVAIRLRSTFTGNDDYILEF
FLPTSMKGSTEQQLLLNNLSGTMQRICKSLRTVADAELVGQGAKFGLQDGSVPNLPPIAL
SRKNSQHSLDSNSNSVNGAPLGACDSKSAGTHADDSREQTMTGSRRQIEKKRSTAEKHVS
LSVLQQYFSGSLKDAAKSIGVCPTTLKRICRQHGISRWPSRKINKVNRSLKKIQTVLESV
QGVEGGLKFDPATGGLVPAGSIIQDFNAQKSIFFPFKDVSVKNPTSVFQDAAVPSSSGND
KENSVVKMEDFYADGNQLSQSNHINTSSFKEGNKSSIEVSGYCYESKLATLDAGSSGLAS
LNAMPLTDSGNASLGSFLTKEGCRRWGLNNDTLDNFDRHFTSRCSYPMVVGGDVDSKMKG
DNEMDGDGRVIEHNQASSSAMTDSSNGSGSGSMINGSSSSSHSRGAEKHSKVEVNCGDNG
STITVKATYKEDTIRFKFDLSAGCFQLYEDVAKRFKLQTGTFQLKYLDDEEEWVMLVNDA
DLHECLEILEFGGGRTVKFLVRDTPCALGSSGSSNCFLASGS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400034189
Transcript Infomation

pacid=37465303 locus=PGSC0003DMG400013140 ID=PGSC0003DMT400034189.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGAGGGGAGTTGATTTTTGGGCCTCTCCTAAAGGTCAAGTGGAGGGCGTTGCCTCG
TTTGATGCTAGTTCAAGGTCTTCAAATGTTGATTCATTCAACAATGTTATGGAGATTATG
AATCTTGATGCTTATGCTGGATGGTGCACTAGCCCTAGTGCAGCAGAGCACATGATAGCC
TCTTATGCCGCATTTTCGCCAATTAATCACATGTCTCAAAGTTATGCACCATTTGAAGGA
ATGAGTTATACAGAACAAAATACTGGAGCATTTCCTCCAATGGACGCCAATATGGTGGCA
AGTAATCATGATGGAGGAGAGAAAATGATGTTTGGGCAAAATGATGACCAGTTACATTTT
ATGGTAGATTCAGTTGATGGGGAGGATGGTTTGGTAGCTAAAAAAAGTAGAAGATCAAGC
CAACAGTCTGACGGTGCGGATATTGGCAACTCTATGATCCTCAGGTCACCTTCTCAACCA
CTTGCTGAGAGAATGCTTAGGGCATTGGCAATGTTTAAAGAGTCATCTGCTGCAGGAATT
TTGGCTCAAGTTTGGATTCCAATGAAGAATGGTGATCAGTACGTCTTGAGCACATGTGAA
CAGCCATATCTTCTTGATCAGGTGCTTTCTGGCTATCGGGAGGTCTCCAGGAAGTTCACT
TTTGATACAGAAATAAAACCAGGAGCAATCCCAGGTCTTCCTGGTCGGGTGTTTAGTTCA
AGAATTCCAGAGTGGACGTCAAATGTTCTGTACTACAAGGAGGCTGAATACTTACGTGTA
CAATATGCTGTTGACCATGAAGTTCGTGGATCTATTGCTTTACCTGTCTTTGAGGATGAT
GCCTGTGAAACTCCATGTTGTGCAGTATTGGAACTCGTTACAATGAAGGAGAAACCTAAT
TTTGATTTGGAAATGGATAATGTTTGCCAGGCTCTCCAGGCTGTGAATTTAAGGAGTATC
GCGCCTCCTCGACTTCATTCTCAGAATCTCTCAAATAACCAAAGAGATGCTTTAGCTGAG
ATAACAGATGTTCTGCTAGCAGTTTGCCATGCACATAAGCTGCCTCTTGCTCTGACATGG
ATTCCCTGTAATGTCACTGAAGGAGAAGGAGATGAACCCATCAGAGTGCGTGCTAGAGGA
TGTAATACAAGTTCAAATGAAAAATGTGTGTTATGTGTTGAGGATACAGCTTGTTATGTG
AGTGACAAGGAAATGCAAGGATTTGTACATGCATGTAAGGAACATTTTCTCGAGGAAGGT
GAAGGTATTGTTGGGAAAGCTCTGCAATCTAACCATCCCTTCTTCTACCCTGATGTGAAG
GAGTATCATATAAGTGAGTACCCACTTGTTCATCATGCACGAAAGTTTGGTCTAAATGCT
GCTGTGGCTATCAGATTACGTAGTACATTCACCGGCAATGACGATTACATATTGGAGTTC
TTTCTTCCTACAAGTATGAAGGGAAGTACCGAGCAACAGCTTCTCTTGAATAACCTTTCA
GGTACCATGCAAAGAATTTGCAAAAGTTTGAGAACAGTAGCAGATGCGGAATTGGTTGGA
CAAGGTGCTAAGTTTGGGTTACAGGATGGATCTGTTCCAAATTTACCACCGATTGCATTG
TCTAGGAAGAACTCTCAGCACTCATTAGACAGTAATTCAAATTCTGTAAACGGGGCTCCT
TTAGGTGCCTGTGATTCAAAGAGTGCTGGAACGCATGCTGATGATTCTCGTGAACAGACA
ATGACTGGATCAAGAAGACAGATTGAGAAAAAACGAAGTACAGCAGAAAAACATGTCAGC
TTAAGTGTTCTTCAGCAATACTTCTCTGGGAGCTTGAAGGATGCTGCAAAAAGCATTGGT
GTGTGTCCAACTACCTTGAAAAGGATATGCCGACAACATGGGATATCTAGATGGCCATCC
CGGAAGATAAACAAAGTCAACCGGTCTTTGAAAAAGATACAAACAGTGCTTGAATCTGTC
CAAGGGGTAGAAGGGGGATTGAAGTTCGATCCAGCAACTGGAGGTCTAGTTCCAGCTGGC
TCAATTATCCAAGATTTCAATGCACAGAAAAGCATATTTTTCCCATTCAAAGATGTCTCT
GTCAAAAATCCTACTTCTGTTTTCCAGGATGCTGCTGTACCCTCATCTTCAGGCAATGAC
AAAGAGAATTCTGTGGTGAAAATGGAGGACTTTTATGCTGATGGGAACCAACTCAGCCAA
TCAAATCATATCAATACTTCCTCTTTTAAGGAAGGGAATAAATCAAGTATTGAAGTGTCT
GGATATTGTTATGAATCCAAGTTGGCAACATTAGATGCAGGATCATCCGGACTTGCAAGT
CTGAATGCGATGCCATTGACTGATTCCGGAAATGCATCATTGGGATCTTTCCTTACAAAA
GAAGGATGCAGGAGGTGGGGATTGAACAATGACACCTTGGACAATTTTGACCGTCATTTC
ACTTCTCGGTGCTCGTATCCCATGGTTGTTGGGGGTGATGTTGACAGTAAGATGAAAGGA
GATAATGAAATGGATGGTGATGGTAGGGTGATTGAACATAACCAGGCCAGTTCTTCAGCC
ATGACAGATTCATCCAATGGGTCTGGGTCTGGGTCGATGATAAATGGTAGTTCATCAAGC
TCTCACAGTCGTGGTGCAGAGAAGCATTCTAAAGTTGAAGTGAACTGTGGTGATAACGGG
TCAACAATTACTGTGAAAGCTACTTACAAAGAAGATACCATCCGATTTAAGTTTGACCTT
TCAGCAGGGTGCTTCCAACTCTATGAGGATGTTGCTAAGAGGTTTAAACTGCAGACGGGG
ACATTCCAACTCAAGTATCTTGATGATGAGGAGGAATGGGTGATGTTGGTAAATGACGCA
GATCTGCATGAGTGTCTTGAGATACTGGAATTTGGTGGTGGTCGTACTGTCAAGTTTCTT
GTTCGCGATACACCATGTGCTCTGGGAAGCTCAGGCAGCAGTAACTGTTTTTTGGCTAGT
GGCTCTTAA