Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400032811
CDS Infomation

pacid=37429026 polypeptide=PGSC0003DMP400022319 locus=PGSC0003DMG400012601 ID=PGSC0003DMT400032811.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGAACAAAATGGGACTGCAAATGGTGTTAAAATCAAGCTGGAGGAAGAAGAAACT
AATGATGACCTAAGAACTACTCCCGACCATCAAAACGACACCGGCGCTTCTCAACCTCTT
ACCGGAGATGGTGCTAGTCCTGGAAAGATTTTTATTGGGGGCTTGGCTAGAGAGACAACT
TCAGCTCAATTTGTCAAGCACTTTGGTAAATATGGTGAAATTATTGATTCCGTGATTATG
AAGGAAAGGCGGACAGGACAGCCACGTGGGTTTGGTTTTGTGACTTATGCTGACCCCTCC
GTGGTAGATAAAGTCATTGAGGACGACCATGTTATAAATGGAAAGCAAGTGGAAATCAAG
CGAACTATACCTAGAGGAGGAGGTTCCAGCTCAAAAGATTTCAAGACGAAGAAGATTTTT
GTGGGCGGCATCCCAACAACAATTAGTGAAGATGAGTTCAGAGACTTCTTTTTAAAGTTT
GGAGAGGTGAAGGAGCACCAGATCATGCGTGACCATTCTACTAGTCGTTCTCGTGGCTTT
GGATTCATCACTTTTGACACAGAAAAATCTGTTGAGGATATCTTGGCTAATGGAAACAAG
CTTGATTTTTCTGGAACCCAGGTGGAAATCAAGAAGGCTGAGCCCAAGAGACCTAATGCG
CCACAACCAGCCCCATTCAGGCGTCAAGGGAATCCAAGAGCTGCATTTGGTGGTGGATTA
TCAGATGCTTATGGTGGATATGGAGACTCTGGTTATGGTATTGGTGCTGGTGCTGGTCCT
TATAGGTCTGGTGGCCCCTATGGTGGCAGATCCAGTGCATTTGGTGGATATAGTGGTGCA
GGAATGGGTGGATATGGAGCATATGGTGGCGGTGGTGCCTACGGAGGAGGCTTCAGGGAG
GAGGCTTCTTTTGGGTATTCTAGCCGTTATGGCAGTGGAGCCTTTGGTAGAGGCTACGAT
GTTGGTGGTGGATATGGAGGAGCAGGTGAAGGTTATGGAGGATATGCTGCTGGTGGCGGT
GGATATGGCAGTGGATATGGTGCTGCTGGTCTTGGCAGTGGGTATGGAGGAGATAGTGCC
GGAGGTTCAATGTATGGAAGTAGTAGAGGAAGCTATGGTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGT
TCAGGCAGATACCACCCTTATGGGAGATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400022319
PEP Infomation

pacid=37429026 transcript=PGSC0003DMT400032811 locus=PGSC0003DMG400012601 ID=PGSC0003DMT400032811.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEEQNGTANGVKIKLEEEETNDDLRTTPDHQNDTGASQPLTGDGASPGKIFIGGLARETT
SAQFVKHFGKYGEIIDSVIMKERRTGQPRGFGFVTYADPSVVDKVIEDDHVINGKQVEIK
RTIPRGGGSSSKDFKTKKIFVGGIPTTISEDEFRDFFLKFGEVKEHQIMRDHSTSRSRGF
GFITFDTEKSVEDILANGNKLDFSGTQVEIKKAEPKRPNAPQPAPFRRQGNPRAAFGGGL
SDAYGGYGDSGYGIGAGAGPYRSGGPYGGRSSAFGGYSGAGMGGYGAYGGGGAYGGGFRE
EASFGYSSRYGSGAFGRGYDVGGGYGGAGEGYGGYAAGGGGYGSGYGAAGLGSGYGGDSA
GGSMYGSSRGSYGGAGAGAGSGRYHPYGR*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400032811
Transcript Infomation

pacid=37429026 locus=PGSC0003DMG400012601 ID=PGSC0003DMT400032811.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGAACAAAATGGGACTGCAAATGGTGTTAAAATCAAGCTGGAGGAAGAAGAAACT
AATGATGACCTAAGAACTACTCCCGACCATCAAAACGACACCGGCGCTTCTCAACCTCTT
ACCGGAGATGGTGCTAGTCCTGGAAAGATTTTTATTGGGGGCTTGGCTAGAGAGACAACT
TCAGCTCAATTTGTCAAGCACTTTGGTAAATATGGTGAAATTATTGATTCCGTGATTATG
AAGGAAAGGCGGACAGGACAGCCACGTGGGTTTGGTTTTGTGACTTATGCTGACCCCTCC
GTGGTAGATAAAGTCATTGAGGACGACCATGTTATAAATGGAAAGCAAGTGGAAATCAAG
CGAACTATACCTAGAGGAGGAGGTTCCAGCTCAAAAGATTTCAAGACGAAGAAGATTTTT
GTGGGCGGCATCCCAACAACAATTAGTGAAGATGAGTTCAGAGACTTCTTTTTAAAGTTT
GGAGAGGTGAAGGAGCACCAGATCATGCGTGACCATTCTACTAGTCGTTCTCGTGGCTTT
GGATTCATCACTTTTGACACAGAAAAATCTGTTGAGGATATCTTGGCTAATGGAAACAAG
CTTGATTTTTCTGGAACCCAGGTGGAAATCAAGAAGGCTGAGCCCAAGAGACCTAATGCG
CCACAACCAGCCCCATTCAGGCGTCAAGGGAATCCAAGAGCTGCATTTGGTGGTGGATTA
TCAGATGCTTATGGTGGATATGGAGACTCTGGTTATGGTATTGGTGCTGGTGCTGGTCCT
TATAGGTCTGGTGGCCCCTATGGTGGCAGATCCAGTGCATTTGGTGGATATAGTGGTGCA
GGAATGGGTGGATATGGAGCATATGGTGGCGGTGGTGCCTACGGAGGAGGCTTCAGGGAG
GAGGCTTCTTTTGGGTATTCTAGCCGTTATGGCAGTGGAGCCTTTGGTAGAGGCTACGAT
GTTGGTGGTGGATATGGAGGAGCAGGTGAAGGTTATGGAGGATATGCTGCTGGTGGCGGT
GGATATGGCAGTGGATATGGTGCTGCTGGTCTTGGCAGTGGGTATGGAGGAGATAGTGCC
GGAGGTTCAATGTATGGAAGTAGTAGAGGAAGCTATGGTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGT
TCAGGCAGATACCACCCTTATGGGAGATAG