Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400032790
CDS Infomation

pacid=37435237 polypeptide=PGSC0003DMP400022300 locus=PGSC0003DMG400012590 ID=PGSC0003DMT400032790.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACCACCACATCTGCTGCTGCAGTGCTAAATGGCTTGAGCTCCTCTTTCTTGACTGGT
GGCAAGAAAACTCAAGCCTTGTTAGGTGCTCCTGTTACTGCCAGAGTTGCCACTCCCAAG
AGGTTCATTGTGGCAGCTGCTGCTGTTGCTCCCAAGAAATCTTGGATTCCTGGTGTAAAA
GCTGGTGGCAACTTGGTTGACCCCGAGTGGCTCGATGGCTCGCTCCCTGGTGACTTTGGT
TTTGACCCACTTGGTCTTGGCAAGGACCCTGCATTCTTGAAATGGTACAGAGAAGCTGAG
CTCATTCATGGCAGATGGGCAATGGCTGCTGTATTGGGTATCTTTGTTGGTCAAGCATGG
AGTGGCATTCCATGGTTTGAGGCTGGTGCTGATCCTGGTGCTATTGCACCTTTCTCTTTT
GGCACACTTCTTGGCACTCAGCTTCTCCTCATGGGTTGGGTTGAGAGCAAAAGATGGGTC
GACTTCTTCGACAATGACTCTCAGTCTATAGATTGGGCCACTCCATGGTCCAAAACCGCT
GAGAACTTTGCCAACTTCACAGGCGAACAGGGTTACCCTGGTGGCAAATTCTTCGATCCT
TTGGCATTAGCTGGTACACTTAACAATGGAGTTTATGTCCCCGACACAGAAAAGCTTGAG
AGATTAAAGCTTGCTGAGATCAAGCATGCTAGACTTGCTATGTTAGCCATGTTAATTTTC
TATTTTGAGGCTGGACAAGGGAAGACACCCCTTGGAGCTCTTGGTTTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400022300
PEP Infomation

pacid=37435237 transcript=PGSC0003DMT400032790 locus=PGSC0003DMG400012590 ID=PGSC0003DMT400032790.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MTTTSAAAVLNGLSSSFLTGGKKTQALLGAPVTARVATPKRFIVAAAAVAPKKSWIPGVK
AGGNLVDPEWLDGSLPGDFGFDPLGLGKDPAFLKWYREAELIHGRWAMAAVLGIFVGQAW
SGIPWFEAGADPGAIAPFSFGTLLGTQLLLMGWVESKRWVDFFDNDSQSIDWATPWSKTA
ENFANFTGEQGYPGGKFFDPLALAGTLNNGVYVPDTEKLERLKLAEIKHARLAMLAMLIF
YFEAGQGKTPLGALGL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400032790
Transcript Infomation

pacid=37435237 locus=PGSC0003DMG400012590 ID=PGSC0003DMT400032790.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACCACCACATCTGCTGCTGCAGTGCTAAATGGCTTGAGCTCCTCTTTCTTGACTGGT
GGCAAGAAAACTCAAGCCTTGTTAGGTGCTCCTGTTACTGCCAGAGTTGCCACTCCCAAG
AGGTTCATTGTGGCAGCTGCTGCTGTTGCTCCCAAGAAATCTTGGATTCCTGGTGTAAAA
GCTGGTGGCAACTTGGTTGACCCCGAGTGGCTCGATGGCTCGCTCCCTGGTGACTTTGGT
TTTGACCCACTTGGTCTTGGCAAGGACCCTGCATTCTTGAAATGGTACAGAGAAGCTGAG
CTCATTCATGGCAGATGGGCAATGGCTGCTGTATTGGGTATCTTTGTTGGTCAAGCATGG
AGTGGCATTCCATGGTTTGAGGCTGGTGCTGATCCTGGTGCTATTGCACCTTTCTCTTTT
GGCACACTTCTTGGCACTCAGCTTCTCCTCATGGGTTGGGTTGAGAGCAAAAGATGGGTC
GACTTCTTCGACAATGACTCTCAGTCTATAGATTGGGCCACTCCATGGTCCAAAACCGCT
GAGAACTTTGCCAACTTCACAGGCGAACAGGGTTACCCTGGTGGCAAATTCTTCGATCCT
TTGGCATTAGCTGGTACACTTAACAATGGAGTTTATGTCCCCGACACAGAAAAGCTTGAG
AGATTAAAGCTTGCTGAGATCAAGCATGCTAGACTTGCTATGTTAGCCATGTTAATTTTC
TATTTTGAGGCTGGACAAGGGAAGACACCCCTTGGAGCTCTTGGTTTGTAA