Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400032781
CDS Infomation

pacid=37438534 polypeptide=PGSC0003DMP400022295 locus=PGSC0003DMG400012585 ID=PGSC0003DMT400032781.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACGGACGAGGGTTTCGAGAGGGAAAATGGTGGATTAACGTCTATGGAATCGATTGAG
TCACGGTGGGTATTTCAGGGCGAGGATGATTTGGATATCGATAGTGGTGATCGAGATACT
GTGGATGGAGATGATGATTCGACAACATGCAATGGCATGGAATTGGAATCTGATGATGAG
GATAATGTGGAGCAGAAACTGATCCGTACTGGTCCTCGTATTGATTCGTTTGATGTCGAA
GCTCTTGAAGTTCCCGGTGTTCAAAAGAACGACTTTGAGGATGTCTCAGTGGGTAGAGCA
ATCCTATTGGCCTTTCAGACTCTTGGAGTTGTTTTTGGCGATGTGGGAACGAGTCCCTTG
TATACATTTAGTGTGATGTTTAGTAAGGCCCCAGTCAATGGCAATGAAGACGTTCTTGGT
GCATTATCTCTGGTTTTATATACCTTAATCCTCGTTCCCTTGGTTAAATATGTCCTAATT
GTTGTTTGGGCCAATGATGACGGTGAAGGTGGTACCTTTGCTTTGTACTCATTGCTTTGT
AGGCATGCAAAGGTTAATCTTCTCCCCAATCAACTACGATCAGATGCTCGCATATCAAGC
TTTAGACTGAAGGTGCCATCTCCAGAACTTGAGAGGTCCTTAAAAATAAAAGAAAGACTA
GAAGCTTCATTGACATTGAAAAAGCTTCTTCTGATGTTAGTTCTTGTTGGCACTTCAATG
GTGATTGCTGATGGTGTTGTTACACCTGCTATGTCAGTAATGTCTGCTGTTGGTGGCTTA
AAAGTTGGACTTTCTGGGGTTAAGCAAGATCAAGTAGTGATGATCTCGGTGGCATGTCTT
GTAGTTCTCTTCAGCGTACAGAAGTATGGGACAAGTAAAGTGGGTCTTGTAGTTGGTCCA
GCTTTGTTTATATGGTTTTGTTCCCTGGGTGGTATTGGTGTCTACAACCTCATTAAGTAT
GATTCTCATGTTTGGAGGGCTTTTAATCCTGTTCACATATACTATTATTTCAAGCGCAAC
TCAACAAAGGCCTGGTACTCTCTTGGTGGCTGTCTTTTGTGTGCAACAGGTTCCGAGGCA
ATGTTTGCAGACCTTTGCTATTTTTCTGTAAGATCAGTTCAGCTTACATTTATGTTCCTT
GTGCTTCCGTGCCTTCTATTGGGATACCTTGGTCAAGCTGCTTACCTGATGGAGAACCAT
GCCGACACAACACAAGCTTTCTTCTCTTCTGTGCCAAGTGGAGCTTTCTGGCCTGTCTTC
TTGATTGCCAATATAGCTGCTTTGATTGCCAGTAGGGCAATGACCACAGCGACCTTTTCT
TGCATTAAACAATCCACAGCTCTAGGCTGCTTCCCTCGCCTCAAGATTGTTCATACGTCC
CGGAAGTTCATGGGTCAGATTTATATCCCAGTCATGAACTGGTTTCTTCTGGCGTTGTCT
TTGGTGTTGGTCTGCTCTATCTCAAGTATATACGAGATCGGAAATGCTTATGCCATAGCA
GAGCTTGGAGTGATGATGATGACAACAATATTGGTTACGATTGTTATGCTTCTGATATGG
CAGATCAACATCTTAATTGTGCTAAGTTTTATCATTATCTTCTTGGGATTGGAGTTAACA
TTCTTCTCGTCTGTTTTATGGAGTGTGGGAGATGGAAGTTGGATTATACTTGTTTTTGCT
GTTGTTTTGTTCCTGATTATGTACATCTGGAATTATGGAAGCAAGCTGAAGTATGAAACT
GAAGTCAAGAAAAAGATGTCTATGGATTTGTTGCGCGAATTAGGCCCCAACCTTGGTACT
ATAAGAGCTCCTGGAATTGGCTTGCTTTACAATGAACTAGCAAAGGGAATACCGGCCATA
TTTGGACATTTTCTCACCACTCTACCTGCTGTGCATTCCATGATCATTTTTGTTTGTATA
AAGTATGTTCCTGTTCCAGTTGTACCACAAAATGAAAGGTTCCTGTTCCGGCGAGTCTGC
CCCAGAAGCTACCACATATTCCGTTGTATTGCCAGATATGGGTACAAGGATGCTCGTAAA
GAAAATCACCACACTTTTGAGCAACTGCTCATTGAAAGTCTTGAGAAGTTCATACGCAGA
GAAGCTCAGGAGCGATCACTTGAAAGTGATGGCGATTGTTCAGACTCTGAAGAAGAGTAC
TCCTTCTCAAGGGTCCTTGTAGCTCCGAATGGAAGTGTTTATTCGCTTGGCATTCCTCTC
TTAGCTGATTTTAGGGACACAGGAAAGGCAGTTATGGAAGAAAGCACTTCAGAAGAGTTG
AAACCTGGAACGTCTTCCGAGTCGTTAGTGTCCGAGGCAGAGCAATCCCTTGAAAAGGAG
CTCTCATTCATACGCAAGGCCAAAGAATCTGGTGTGGTCTATCTTCTTGGTCACGGAGAT
ATTAGGGCAAGGAAGAATTCATGGTTCATTAAGAAGCTTATCATAAATTATTTTTATGCT
TTCTTGAGAAAGAATAGCAGGAGGGGAACTGCCAATTTGAGTGTACCACATTCGCATTTA
GTGCAGGTCGGCATGCAATATATGGTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400022295
PEP Infomation

pacid=37438534 transcript=PGSC0003DMT400032781 locus=PGSC0003DMG400012585 ID=PGSC0003DMT400032781.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MTDEGFERENGGLTSMESIESRWVFQGEDDLDIDSGDRDTVDGDDDSTTCNGMELESDDE
DNVEQKLIRTGPRIDSFDVEALEVPGVQKNDFEDVSVGRAILLAFQTLGVVFGDVGTSPL
YTFSVMFSKAPVNGNEDVLGALSLVLYTLILVPLVKYVLIVVWANDDGEGGTFALYSLLC
RHAKVNLLPNQLRSDARISSFRLKVPSPELERSLKIKERLEASLTLKKLLLMLVLVGTSM
VIADGVVTPAMSVMSAVGGLKVGLSGVKQDQVVMISVACLVVLFSVQKYGTSKVGLVVGP
ALFIWFCSLGGIGVYNLIKYDSHVWRAFNPVHIYYYFKRNSTKAWYSLGGCLLCATGSEA
MFADLCYFSVRSVQLTFMFLVLPCLLLGYLGQAAYLMENHADTTQAFFSSVPSGAFWPVF
LIANIAALIASRAMTTATFSCIKQSTALGCFPRLKIVHTSRKFMGQIYIPVMNWFLLALS
LVLVCSISSIYEIGNAYAIAELGVMMMTTILVTIVMLLIWQINILIVLSFIIIFLGLELT
FFSSVLWSVGDGSWIILVFAVVLFLIMYIWNYGSKLKYETEVKKKMSMDLLRELGPNLGT
IRAPGIGLLYNELAKGIPAIFGHFLTTLPAVHSMIIFVCIKYVPVPVVPQNERFLFRRVC
PRSYHIFRCIARYGYKDARKENHHTFEQLLIESLEKFIRREAQERSLESDGDCSDSEEEY
SFSRVLVAPNGSVYSLGIPLLADFRDTGKAVMEESTSEELKPGTSSESLVSEAEQSLEKE
LSFIRKAKESGVVYLLGHGDIRARKNSWFIKKLIINYFYAFLRKNSRRGTANLSVPHSHL
VQVGMQYMV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400032781
Transcript Infomation

pacid=37438534 locus=PGSC0003DMG400012585 ID=PGSC0003DMT400032781.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACGGACGAGGGTTTCGAGAGGGAAAATGGTGGATTAACGTCTATGGAATCGATTGAG
TCACGGTGGGTATTTCAGGGCGAGGATGATTTGGATATCGATAGTGGTGATCGAGATACT
GTGGATGGAGATGATGATTCGACAACATGCAATGGCATGGAATTGGAATCTGATGATGAG
GATAATGTGGAGCAGAAACTGATCCGTACTGGTCCTCGTATTGATTCGTTTGATGTCGAA
GCTCTTGAAGTTCCCGGTGTTCAAAAGAACGACTTTGAGGATGTCTCAGTGGGTAGAGCA
ATCCTATTGGCCTTTCAGACTCTTGGAGTTGTTTTTGGCGATGTGGGAACGAGTCCCTTG
TATACATTTAGTGTGATGTTTAGTAAGGCCCCAGTCAATGGCAATGAAGACGTTCTTGGT
GCATTATCTCTGGTTTTATATACCTTAATCCTCGTTCCCTTGGTTAAATATGTCCTAATT
GTTGTTTGGGCCAATGATGACGGTGAAGGTGGTACCTTTGCTTTGTACTCATTGCTTTGT
AGGCATGCAAAGGTTAATCTTCTCCCCAATCAACTACGATCAGATGCTCGCATATCAAGC
TTTAGACTGAAGGTGCCATCTCCAGAACTTGAGAGGTCCTTAAAAATAAAAGAAAGACTA
GAAGCTTCATTGACATTGAAAAAGCTTCTTCTGATGTTAGTTCTTGTTGGCACTTCAATG
GTGATTGCTGATGGTGTTGTTACACCTGCTATGTCAGTAATGTCTGCTGTTGGTGGCTTA
AAAGTTGGACTTTCTGGGGTTAAGCAAGATCAAGTAGTGATGATCTCGGTGGCATGTCTT
GTAGTTCTCTTCAGCGTACAGAAGTATGGGACAAGTAAAGTGGGTCTTGTAGTTGGTCCA
GCTTTGTTTATATGGTTTTGTTCCCTGGGTGGTATTGGTGTCTACAACCTCATTAAGTAT
GATTCTCATGTTTGGAGGGCTTTTAATCCTGTTCACATATACTATTATTTCAAGCGCAAC
TCAACAAAGGCCTGGTACTCTCTTGGTGGCTGTCTTTTGTGTGCAACAGGTTCCGAGGCA
ATGTTTGCAGACCTTTGCTATTTTTCTGTAAGATCAGTTCAGCTTACATTTATGTTCCTT
GTGCTTCCGTGCCTTCTATTGGGATACCTTGGTCAAGCTGCTTACCTGATGGAGAACCAT
GCCGACACAACACAAGCTTTCTTCTCTTCTGTGCCAAGTGGAGCTTTCTGGCCTGTCTTC
TTGATTGCCAATATAGCTGCTTTGATTGCCAGTAGGGCAATGACCACAGCGACCTTTTCT
TGCATTAAACAATCCACAGCTCTAGGCTGCTTCCCTCGCCTCAAGATTGTTCATACGTCC
CGGAAGTTCATGGGTCAGATTTATATCCCAGTCATGAACTGGTTTCTTCTGGCGTTGTCT
TTGGTGTTGGTCTGCTCTATCTCAAGTATATACGAGATCGGAAATGCTTATGCCATAGCA
GAGCTTGGAGTGATGATGATGACAACAATATTGGTTACGATTGTTATGCTTCTGATATGG
CAGATCAACATCTTAATTGTGCTAAGTTTTATCATTATCTTCTTGGGATTGGAGTTAACA
TTCTTCTCGTCTGTTTTATGGAGTGTGGGAGATGGAAGTTGGATTATACTTGTTTTTGCT
GTTGTTTTGTTCCTGATTATGTACATCTGGAATTATGGAAGCAAGCTGAAGTATGAAACT
GAAGTCAAGAAAAAGATGTCTATGGATTTGTTGCGCGAATTAGGCCCCAACCTTGGTACT
ATAAGAGCTCCTGGAATTGGCTTGCTTTACAATGAACTAGCAAAGGGAATACCGGCCATA
TTTGGACATTTTCTCACCACTCTACCTGCTGTGCATTCCATGATCATTTTTGTTTGTATA
AAGTATGTTCCTGTTCCAGTTGTACCACAAAATGAAAGGTTCCTGTTCCGGCGAGTCTGC
CCCAGAAGCTACCACATATTCCGTTGTATTGCCAGATATGGGTACAAGGATGCTCGTAAA
GAAAATCACCACACTTTTGAGCAACTGCTCATTGAAAGTCTTGAGAAGTTCATACGCAGA
GAAGCTCAGGAGCGATCACTTGAAAGTGATGGCGATTGTTCAGACTCTGAAGAAGAGTAC
TCCTTCTCAAGGGTCCTTGTAGCTCCGAATGGAAGTGTTTATTCGCTTGGCATTCCTCTC
TTAGCTGATTTTAGGGACACAGGAAAGGCAGTTATGGAAGAAAGCACTTCAGAAGAGTTG
AAACCTGGAACGTCTTCCGAGTCGTTAGTGTCCGAGGCAGAGCAATCCCTTGAAAAGGAG
CTCTCATTCATACGCAAGGCCAAAGAATCTGGTGTGGTCTATCTTCTTGGTCACGGAGAT
ATTAGGGCAAGGAAGAATTCATGGTTCATTAAGAAGCTTATCATAAATTATTTTTATGCT
TTCTTGAGAAAGAATAGCAGGAGGGGAACTGCCAATTTGAGTGTACCACATTCGCATTTA
GTGCAGGTCGGCATGCAATATATGGTGTGA