Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400032733
CDS Infomation

pacid=37440026 polypeptide=PGSC0003DMP400022250 locus=PGSC0003DMG400012568 ID=PGSC0003DMT400032733.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTGGCATATTGAGTCGGAGTAACCACAACTCTAATGTGGGGGATCTCATTGAGGGC
TCCCAAAGTGCATCATGCAAGAGACAAAGGACATCAGATAGCTTCTGGGAGCATAGCCCA
CGATTGATTCCAAGTCTGCCTGATGAAATATCTATTCAAATCCTCGCCAGACTTCCTAGA
ATACACCACTTAAATGCAAAATTAGTTTCGCCTAGCTGGAAAGGTGCTATTATGAGTCCA
GAACTTTATAGGTGTAGAAAAAAACTTGGAACAACAGAAGTGTGGCTCTATCTTTTGACA
AAGACTGAAGGTGATAAGTTTTTGTGGTATGCTTTTGATCCGATCTCCGTGAGATGGCAA
AAGTTGCCACCAATGCCCGCAATTGCGGTCAATGATGAACCTAAAAGTGGTTTATCTGGA
ATTCGGGCATGGAACATGGCAGGTTCAAGTATAAGAATTGCTGATGCCATAAGGGGTTGG
CTTGGAAGGAGAAATGCTCTGGATCAAGTTCCATTTTGTGGTTGTGCTATTGGAGCTGTT
GATGGATGCCTCTATGCCCTTGGGGGATTCTTCAGAGCTGCAGCCATGAGATCTGTCTGG
CGTTATGACCCCATTGTAAATGCCTGGAATGAAGTAAGTCCCATGTCTACTGCAAGAGCT
TATTGCAAGACAGGTGTCTTGAATGGAAAACTTTATGTAGTAGGAGGTGTTACTCGGGAT
CGTGGGGGACTTACTCCCCTTCAATCTGCAGAAGTATTTAATCCGCATACTGGTATCTGG
TCTGAAATCCCAAGCATGCCATTTTCAAAAGCTCAGATGCTACCCACTGCTTTTCTAGCT
GATCTACTCAAGCCTATAGCTACAGGGATGACATCTTATCGGGGTAAACTATATGTTCCT
CAAAGTTTGTATTGCTGGCCTTTTTTTGTTGATGTTGGAGGAGAAGTATATGATCCCGAA
ACAAATGCATGGATTGATATGCCACTTGGCATGGGAGATGGCTGGCCTGCTAGGCAGGCA
GGAACAAAGTTGAGTGTCACTGTTGAAGGAGAGTTGTATGCGTTGGATCCTTCTAGTACT
CTAGATAGTGCTAGAATAAAAGTTTATGATCATCAAGATGACACTTGGAAGGTGATTGAA
GGAGATATACCTATTAATGACAATTCAGAGTCTCCTTATCTTCTTGCTGGTTTTCTTGGA
AAGCTCCATGTGATCACTAAAGATGCAAATCACAATATCATGGTCATGCAGGCTGATAGG
CAAAATCATTCAGCTCCTTCTCCATCAACCTCAGCAAACTCTTCACAAAAAAACTTACAC
GAAGTTCCAGAACCGGTTTTAGGATCTGAAGCGAATATGTGGAGAGTTGTTGCTTTGAGA
AGTGGTGGAACTGCAGAGCTGGTTAGCTGCCAAATCCTAGATGTATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400022250
PEP Infomation

pacid=37440026 transcript=PGSC0003DMT400032733 locus=PGSC0003DMG400012568 ID=PGSC0003DMT400032733.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGGILSRSNHNSNVGDLIEGSQSASCKRQRTSDSFWEHSPRLIPSLPDEISIQILARLPR
IHHLNAKLVSPSWKGAIMSPELYRCRKKLGTTEVWLYLLTKTEGDKFLWYAFDPISVRWQ
KLPPMPAIAVNDEPKSGLSGIRAWNMAGSSIRIADAIRGWLGRRNALDQVPFCGCAIGAV
DGCLYALGGFFRAAAMRSVWRYDPIVNAWNEVSPMSTARAYCKTGVLNGKLYVVGGVTRD
RGGLTPLQSAEVFNPHTGIWSEIPSMPFSKAQMLPTAFLADLLKPIATGMTSYRGKLYVP
QSLYCWPFFVDVGGEVYDPETNAWIDMPLGMGDGWPARQAGTKLSVTVEGELYALDPSST
LDSARIKVYDHQDDTWKVIEGDIPINDNSESPYLLAGFLGKLHVITKDANHNIMVMQADR
QNHSAPSPSTSANSSQKNLHEVPEPVLGSEANMWRVVALRSGGTAELVSCQILDV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400032733
Transcript Infomation

pacid=37440026 locus=PGSC0003DMG400012568 ID=PGSC0003DMT400032733.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTGGCATATTGAGTCGGAGTAACCACAACTCTAATGTGGGGGATCTCATTGAGGGC
TCCCAAAGTGCATCATGCAAGAGACAAAGGACATCAGATAGCTTCTGGGAGCATAGCCCA
CGATTGATTCCAAGTCTGCCTGATGAAATATCTATTCAAATCCTCGCCAGACTTCCTAGA
ATACACCACTTAAATGCAAAATTAGTTTCGCCTAGCTGGAAAGGTGCTATTATGAGTCCA
GAACTTTATAGGTGTAGAAAAAAACTTGGAACAACAGAAGTGTGGCTCTATCTTTTGACA
AAGACTGAAGGTGATAAGTTTTTGTGGTATGCTTTTGATCCGATCTCCGTGAGATGGCAA
AAGTTGCCACCAATGCCCGCAATTGCGGTCAATGATGAACCTAAAAGTGGTTTATCTGGA
ATTCGGGCATGGAACATGGCAGGTTCAAGTATAAGAATTGCTGATGCCATAAGGGGTTGG
CTTGGAAGGAGAAATGCTCTGGATCAAGTTCCATTTTGTGGTTGTGCTATTGGAGCTGTT
GATGGATGCCTCTATGCCCTTGGGGGATTCTTCAGAGCTGCAGCCATGAGATCTGTCTGG
CGTTATGACCCCATTGTAAATGCCTGGAATGAAGTAAGTCCCATGTCTACTGCAAGAGCT
TATTGCAAGACAGGTGTCTTGAATGGAAAACTTTATGTAGTAGGAGGTGTTACTCGGGAT
CGTGGGGGACTTACTCCCCTTCAATCTGCAGAAGTATTTAATCCGCATACTGGTATCTGG
TCTGAAATCCCAAGCATGCCATTTTCAAAAGCTCAGATGCTACCCACTGCTTTTCTAGCT
GATCTACTCAAGCCTATAGCTACAGGGATGACATCTTATCGGGGTAAACTATATGTTCCT
CAAAGTTTGTATTGCTGGCCTTTTTTTGTTGATGTTGGAGGAGAAGTATATGATCCCGAA
ACAAATGCATGGATTGATATGCCACTTGGCATGGGAGATGGCTGGCCTGCTAGGCAGGCA
GGAACAAAGTTGAGTGTCACTGTTGAAGGAGAGTTGTATGCGTTGGATCCTTCTAGTACT
CTAGATAGTGCTAGAATAAAAGTTTATGATCATCAAGATGACACTTGGAAGGTGATTGAA
GGAGATATACCTATTAATGACAATTCAGAGTCTCCTTATCTTCTTGCTGGTTTTCTTGGA
AAGCTCCATGTGATCACTAAAGATGCAAATCACAATATCATGGTCATGCAGGCTGATAGG
CAAAATCATTCAGCTCCTTCTCCATCAACCTCAGCAAACTCTTCACAAAAAAACTTACAC
GAAGTTCCAGAACCGGTTTTAGGATCTGAAGCGAATATGTGGAGAGTTGTTGCTTTGAGA
AGTGGTGGAACTGCAGAGCTGGTTAGCTGCCAAATCCTAGATGTATAG