Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400032342
CDS Infomation	pacid=37433105 polypeptide=PGSC0003DMP400021970 locus=PGSC0003DMG400012423 ID=PGSC0003DMT400032342.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGAGAGGACCTTTAGGGGCTGTAATAGGGAAGTACCCTTCAAGTGATGGTGGGGTAGCT GAAAAAGGGGATGGAATTATCAAACACAACAGGAAATGTAGAGATGTAGTGTTTCTTGTT ATCTTTATTGCCTTTTGGGTTGCTATGATTGTTAATTCCAGCTTTGGATTCAACCAAGGA AACCCATTGAGGCTAACATATGGGCTGGACTATAAAGGCAATGTTTGTGGTGATAGACAT GCCGATCCTGATCTTCGTGAATTGGAACTCAGATACTGGGTGAACCCAAATCAAGTTTAT GAAAGTGGTTCAAAGGATAATCAGGCCAAACTTTCTAATGCTAGAACTATTTGCTTGATG GACTGCCCTATCCCATCTGAAGATTCTCTAAATTGGGTGTGTGACTATCCAGAAGGCGAG GTTCGTCTGTCAGTAGATGACTGGATCGATAGAAATTATGATTATTTTGCGGACCTAACT CCAGACCTAAGAAACACTTCACTTCAGCTTCAAGGTCCCTGCTACCCTGTCATATTTCCA AGTGTTAATGTTTATTGGAGCTGTCAGCTTATTTCCCGTGCATCAAATGTATCTTTGCGG CATTGGAGGGAGATGGGTGGTGTAAACATTGTTGAGGACATCGCAGTTGATAAGTCTATC CATGGCTTAATTAACTCTCGATCTTTGGTCTTAAAGAGATATGTAGCTGATGTTGGCAAG TCATGGGGAGTGTTGATTGTTTGTGGAGGAATTTTGCCAGTTTTTCTATCAGTGATATGG CTTTTGATGATTCGTCACTTTGTGGCTGCAATGCCTTGGATAACTGTCGTCCTCTTTAAT GGCCTCATAGTTTCAGTCACAATGTTCTACTATCTGAAAGCTGGATGGATAGGGAACGAC TCTATCTCCCCCATCATTGGTGAACATGATCCGTATTATCATGTATCTGCAAGGGAAATA AGTCATCTCCATGCTGCTGCTGTTATCATGACTGCTGTAATGATTATTTCGGTCTTGTCA TCCATCGCTATAGTGCGACGTATCCTTATGGCTACTTCAGTCCTGAAGGTAGCTGCTAAG GTCATTGGAGAAGTACAAGCATTAATAATTTTCCCCATCATTCCGTATGCTATCCTAGCA ATCTTCTACATGTTTTGGTTTTCTGCTGCTCTTCACCTTTTTAGTTCTGGACGCGTTGTC CAGAATGATTGCAACACCAACTGCTGTGCTTATGATCTTAAATTAAAAAGGGTGAGCTGT GATCGATGCTGTGGTTACAGCATCCAGTATACTTCTCATATTGCTGTTGCAATTTTTTTC CATTTGTTTGGAGGCTATTGGGCCACTCAGTTTTTTGTGGCAAGCTCTGCAACAGTCATT GCAGGCTCTGTCGCTACATACTATTGGGCTCGAGGTGGAACATCGCCAGAAATTTCATTT CTCCCAGTGCTCTCCTCTATGAAGCGGCTTTTACGTTACAGCATTGGATCTGTTGCTCTT GGTTCTCTGATTGTTTCATTTATAGAGTCTATCAGGTTTATACTTGAAGCACTCCGGCGT AAACTTAAAGTTTCTAATTCTGCACCAGAAAGTTGGTTTGGAAGAATGGTATATAATTCC TCACAATGTCTCCTGCGGTGTATTGGTTGGACCATCAAATCTGTGAATCGTAATGCTTAC ATCTTGATAGCGATAACAGGAAAAGGCTTTTTTAAGTCTTCTGAGATTGCAACTGATCTC ATTATCAGTAACATTCTTCGGATTGGGAAGGTGAACGTCATTGGTGATGTTATTCTCTTT CTTGGGAAGCTGTGTGTCAGTCTTGCAAGTGCACTTTTTGCTTTTCTCATGTTGGATACT CACAAGTACAACATTGGACATAACAAGATCTCGTCACCAATTTTCCCGGTGCTGGTGTGC TGGTTTCTTGGATACGTCGTGGCAACTCTCTTCTTTGCAGTTGTTGAGATGTCAATTGAT ACTATAATACTTTCATTTTGTCAAGATTCAGAGGAGCATCAGGGAACTGCTCAATACGCC CCTCCGCTTCTTCTCGCGACATTGAATGATCAAACTGAGATGCAAAGGCTTACACAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400021970
PEP Infomation	pacid=37433105 transcript=PGSC0003DMT400032342 locus=PGSC0003DMG400012423 ID=PGSC0003DMT400032342.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MRGPLGAVIGKYPSSDGGVAEKGDGIIKHNRKCRDVVFLVIFIAFWVAMIVNSSFGFNQG NPLRLTYGLDYKGNVCGDRHADPDLRELELRYWVNPNQVYESGSKDNQAKLSNARTICLM DCPIPSEDSLNWVCDYPEGEVRLSVDDWIDRNYDYFADLTPDLRNTSLQLQGPCYPVIFP SVNVYWSCQLISRASNVSLRHWREMGGVNIVEDIAVDKSIHGLINSRSLVLKRYVADVGK SWGVLIVCGGILPVFLSVIWLLMIRHFVAAMPWITVVLFNGLIVSVTMFYYLKAGWIGND SISPIIGEHDPYYHVSAREISHLHAAAVIMTAVMIISVLSSIAIVRRILMATSVLKVAAK VIGEVQALIIFPIIPYAILAIFYMFWFSAALHLFSSGRVVQNDCNTNCCAYDLKLKRVSC DRCCGYSIQYTSHIAVAIFFHLFGGYWATQFFVASSATVIAGSVATYYWARGGTSPEISF LPVLSSMKRLLRYSIGSVALGSLIVSFIESIRFILEALRRKLKVSNSAPESWFGRMVYNS SQCLLRCIGWTIKSVNRNAYILIAITGKGFFKSSEIATDLIISNILRIGKVNVIGDVILF LGKLCVSLASALFAFLMLDTHKYNIGHNKISSPIFPVLVCWFLGYVVATLFFAVVEMSID TIILSFCQDSEEHQGTAQYAPPLLLATLNDQTEMQRLTQ*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400032342
Transcript Infomation	pacid=37433105 locus=PGSC0003DMG400012423 ID=PGSC0003DMT400032342.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGAGAGGACCTTTAGGGGCTGTAATAGGGAAGTACCCTTCAAGTGATGGTGGGGTAGCT GAAAAAGGGGATGGAATTATCAAACACAACAGGAAATGTAGAGATGTAGTGTTTCTTGTT ATCTTTATTGCCTTTTGGGTTGCTATGATTGTTAATTCCAGCTTTGGATTCAACCAAGGA AACCCATTGAGGCTAACATATGGGCTGGACTATAAAGGCAATGTTTGTGGTGATAGACAT GCCGATCCTGATCTTCGTGAATTGGAACTCAGATACTGGGTGAACCCAAATCAAGTTTAT GAAAGTGGTTCAAAGGATAATCAGGCCAAACTTTCTAATGCTAGAACTATTTGCTTGATG GACTGCCCTATCCCATCTGAAGATTCTCTAAATTGGGTGTGTGACTATCCAGAAGGCGAG GTTCGTCTGTCAGTAGATGACTGGATCGATAGAAATTATGATTATTTTGCGGACCTAACT CCAGACCTAAGAAACACTTCACTTCAGCTTCAAGGTCCCTGCTACCCTGTCATATTTCCA AGTGTTAATGTTTATTGGAGCTGTCAGCTTATTTCCCGTGCATCAAATGTATCTTTGCGG CATTGGAGGGAGATGGGTGGTGTAAACATTGTTGAGGACATCGCAGTTGATAAGTCTATC CATGGCTTAATTAACTCTCGATCTTTGGTCTTAAAGAGATATGTAGCTGATGTTGGCAAG TCATGGGGAGTGTTGATTGTTTGTGGAGGAATTTTGCCAGTTTTTCTATCAGTGATATGG CTTTTGATGATTCGTCACTTTGTGGCTGCAATGCCTTGGATAACTGTCGTCCTCTTTAAT GGCCTCATAGTTTCAGTCACAATGTTCTACTATCTGAAAGCTGGATGGATAGGGAACGAC TCTATCTCCCCCATCATTGGTGAACATGATCCGTATTATCATGTATCTGCAAGGGAAATA AGTCATCTCCATGCTGCTGCTGTTATCATGACTGCTGTAATGATTATTTCGGTCTTGTCA TCCATCGCTATAGTGCGACGTATCCTTATGGCTACTTCAGTCCTGAAGGTAGCTGCTAAG GTCATTGGAGAAGTACAAGCATTAATAATTTTCCCCATCATTCCGTATGCTATCCTAGCA ATCTTCTACATGTTTTGGTTTTCTGCTGCTCTTCACCTTTTTAGTTCTGGACGCGTTGTC CAGAATGATTGCAACACCAACTGCTGTGCTTATGATCTTAAATTAAAAAGGGTGAGCTGT GATCGATGCTGTGGTTACAGCATCCAGTATACTTCTCATATTGCTGTTGCAATTTTTTTC CATTTGTTTGGAGGCTATTGGGCCACTCAGTTTTTTGTGGCAAGCTCTGCAACAGTCATT GCAGGCTCTGTCGCTACATACTATTGGGCTCGAGGTGGAACATCGCCAGAAATTTCATTT CTCCCAGTGCTCTCCTCTATGAAGCGGCTTTTACGTTACAGCATTGGATCTGTTGCTCTT GGTTCTCTGATTGTTTCATTTATAGAGTCTATCAGGTTTATACTTGAAGCACTCCGGCGT AAACTTAAAGTTTCTAATTCTGCACCAGAAAGTTGGTTTGGAAGAATGGTATATAATTCC TCACAATGTCTCCTGCGGTGTATTGGTTGGACCATCAAATCTGTGAATCGTAATGCTTAC ATCTTGATAGCGATAACAGGAAAAGGCTTTTTTAAGTCTTCTGAGATTGCAACTGATCTC ATTATCAGTAACATTCTTCGGATTGGGAAGGTGAACGTCATTGGTGATGTTATTCTCTTT CTTGGGAAGCTGTGTGTCAGTCTTGCAAGTGCACTTTTTGCTTTTCTCATGTTGGATACT CACAAGTACAACATTGGACATAACAAGATCTCGTCACCAATTTTCCCGGTGCTGGTGTGC TGGTTTCTTGGATACGTCGTGGCAACTCTCTTCTTTGCAGTTGTTGAGATGTCAATTGAT ACTATAATACTTTCATTTTGTCAAGATTCAGAGGAGCATCAGGGAACTGCTCAATACGCC CCTCCGCTTCTTCTCGCGACATTGAATGATCAAACTGAGATGCAAAGGCTTACACAATGA