Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400032028
CDS Infomation

pacid=37470613 polypeptide=PGSC0003DMP400021750 locus=PGSC0003DMG400012288 ID=PGSC0003DMT400032028.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGGGTTTTGTTGGTTCTCTGGTTTTTCTGATTATTCTTGTTGTTCCAGTAGCATTA
GCTGGGCATAATTATGGTGAAGCTTTGAGTAAGAGCTTTTTATTTTATGAAGCTCAGAGA
TCTGGGTATCTTCCTCATAACCAGAGAGTTCAATGGAGGGGTAATTCTGGACTTAATGAT
GGAAAAGCTAGTGGGATTGATTTGGTTGGAGGGTATTATGATGCTGGTGATAATGTGAAA
TTTGGTTTACCCATGGCATTTACTGTCACAATGTTATCATGGAGTATTTTGGAATATGGT
AGACAAATGGCTGCTAGTGGTGAACTTAGCCATGCTATGGATGCTGTTAAGTGGGGTACT
GATTATCTACTCAAAGCTCATCCTGAACCTTATGTTCTTTACGGAGAGGTGGGAGATGGT
AATACGGACCATTACTGTTGGCAAAGACCAGAAGATATGACTACATCAAGAGCTGCTTAT
CGAATCGACCCGAACCATCCCGGGTCGGATCTTGCCGGTGAAACAGCCGCCGCTATGGCG
GCTGCTTCCATCGTCTTCCGTCGTTACAATCCGGGTTATGCTAATGAACTCCTTAATCAT
GCACATCAGCTGTTCGAGTTTGCTGATAAGTATAGGGGCAAATATGATAGCAGTATTAGT
GTGGCCCAGAAGTACTACCGATCTGTCAGTGGATACGCGGATGAATTACTATGGGGAGCA
GCATGGTTATACAAGGCATCAAACAATCAATTTTACTTGAATTATTTGGGAAGAAATGGT
GATGCCCTTGGTGGAACTGGTTGGTCCATGACTGAATTTGGTTGGGATGTCAAGTATGCT
GGTGTCCAAACTCTTGTTGCTCAGTTCTTGATGTCTGGTAAAGCTGGTCATAATGCACCT
GTATTTGAGAAGTACCAGCAGAAAGCAGAGAACTTTATGTGTTCATGTCTTGGAAAGGGT
GACAGAAATACCCAGAGAACTCCTGGAGGTCTCATCTATAGGCAAAGATGGAACAATATG
CAGTTTGTTACTAGTGCTGCATTCCTTGCCACTACTTATTCTGACTATTTGGCCTCTGCT
GGCAAATACCTCAAGTGTTCTTCTGGTTCTGTTTCTCCGAATGAGCTCCTCTCATTCGCC
AAGTCTCAGGTGGACTACATTCTTGGTGACAACCCAAGAGCAACAAGTTACATGGTGGGA
TATGGAAACAATTACCCGAGACAAGTACACCACAGAGCTTCCTCCATCGTCTCGTTTAAG
GTTAATCCTAGTTTTGTTAGCTGCCGGGGAGGCTATGCTACCTGGTATAGTAGAAAGGCA
AGCGATCCTAATCTCCTTACTGGTGCTCTTGTTGGTGGACCTGATGCCTATGACAACTTT
GCTGATCAAAGAGATAACTATGAGCAAACTGAGCCTGCCACTTACAACAATGCTCCGTTG
ATCGGTGTGTTGGCAAGACTTCACGCTGGTCACAGCGGTTACAATCAGCTCCTTCCAGTT
GTTCCTGACCCAAAGCCAACGCCAAAGCCAGCTCCAAGAACTAAAGTAACTCCAGCTCCA
AGGCAAAGAGTACTTCCAGTCCCAGCTAATGCTCATGTTACTATTCAACAAAAGGCAACT
AGTTCATGGGCTCTGAATGGGAAGACTTACTACAGATACTCAGCAGTTGTAACCAACAAG
TCTGGAAAGACGGTTAAGAACTTGAAGCTCTCAATAGTCAAGCTCTATGGTCCTCTCTGG
GGTCTAACAAAGTATGGTAACTCGTTCATCTTCCCAGCTTGGCTCAACTCATTACCAGCT
GGTAAAAGCCTAGAGTTTGTGTACATTCACACTGCTTCACCTGCAATCGTCTCCGTTTCA
AGCTACACTCTAGTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400021750
PEP Infomation

pacid=37470613 transcript=PGSC0003DMT400032028 locus=PGSC0003DMG400012288 ID=PGSC0003DMT400032028.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MKGFVGSLVFLIILVVPVALAGHNYGEALSKSFLFYEAQRSGYLPHNQRVQWRGNSGLND
GKASGIDLVGGYYDAGDNVKFGLPMAFTVTMLSWSILEYGRQMAASGELSHAMDAVKWGT
DYLLKAHPEPYVLYGEVGDGNTDHYCWQRPEDMTTSRAAYRIDPNHPGSDLAGETAAAMA
AASIVFRRYNPGYANELLNHAHQLFEFADKYRGKYDSSISVAQKYYRSVSGYADELLWGA
AWLYKASNNQFYLNYLGRNGDALGGTGWSMTEFGWDVKYAGVQTLVAQFLMSGKAGHNAP
VFEKYQQKAENFMCSCLGKGDRNTQRTPGGLIYRQRWNNMQFVTSAAFLATTYSDYLASA
GKYLKCSSGSVSPNELLSFAKSQVDYILGDNPRATSYMVGYGNNYPRQVHHRASSIVSFK
VNPSFVSCRGGYATWYSRKASDPNLLTGALVGGPDAYDNFADQRDNYEQTEPATYNNAPL
IGVLARLHAGHSGYNQLLPVVPDPKPTPKPAPRTKVTPAPRQRVLPVPANAHVTIQQKAT
SSWALNGKTYYRYSAVVTNKSGKTVKNLKLSIVKLYGPLWGLTKYGNSFIFPAWLNSLPA
GKSLEFVYIHTASPAIVSVSSYTLV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400032028
Transcript Infomation

pacid=37470613 locus=PGSC0003DMG400012288 ID=PGSC0003DMT400032028.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGGGTTTTGTTGGTTCTCTGGTTTTTCTGATTATTCTTGTTGTTCCAGTAGCATTA
GCTGGGCATAATTATGGTGAAGCTTTGAGTAAGAGCTTTTTATTTTATGAAGCTCAGAGA
TCTGGGTATCTTCCTCATAACCAGAGAGTTCAATGGAGGGGTAATTCTGGACTTAATGAT
GGAAAAGCTAGTGGGATTGATTTGGTTGGAGGGTATTATGATGCTGGTGATAATGTGAAA
TTTGGTTTACCCATGGCATTTACTGTCACAATGTTATCATGGAGTATTTTGGAATATGGT
AGACAAATGGCTGCTAGTGGTGAACTTAGCCATGCTATGGATGCTGTTAAGTGGGGTACT
GATTATCTACTCAAAGCTCATCCTGAACCTTATGTTCTTTACGGAGAGGTGGGAGATGGT
AATACGGACCATTACTGTTGGCAAAGACCAGAAGATATGACTACATCAAGAGCTGCTTAT
CGAATCGACCCGAACCATCCCGGGTCGGATCTTGCCGGTGAAACAGCCGCCGCTATGGCG
GCTGCTTCCATCGTCTTCCGTCGTTACAATCCGGGTTATGCTAATGAACTCCTTAATCAT
GCACATCAGCTGTTCGAGTTTGCTGATAAGTATAGGGGCAAATATGATAGCAGTATTAGT
GTGGCCCAGAAGTACTACCGATCTGTCAGTGGATACGCGGATGAATTACTATGGGGAGCA
GCATGGTTATACAAGGCATCAAACAATCAATTTTACTTGAATTATTTGGGAAGAAATGGT
GATGCCCTTGGTGGAACTGGTTGGTCCATGACTGAATTTGGTTGGGATGTCAAGTATGCT
GGTGTCCAAACTCTTGTTGCTCAGTTCTTGATGTCTGGTAAAGCTGGTCATAATGCACCT
GTATTTGAGAAGTACCAGCAGAAAGCAGAGAACTTTATGTGTTCATGTCTTGGAAAGGGT
GACAGAAATACCCAGAGAACTCCTGGAGGTCTCATCTATAGGCAAAGATGGAACAATATG
CAGTTTGTTACTAGTGCTGCATTCCTTGCCACTACTTATTCTGACTATTTGGCCTCTGCT
GGCAAATACCTCAAGTGTTCTTCTGGTTCTGTTTCTCCGAATGAGCTCCTCTCATTCGCC
AAGTCTCAGGTGGACTACATTCTTGGTGACAACCCAAGAGCAACAAGTTACATGGTGGGA
TATGGAAACAATTACCCGAGACAAGTACACCACAGAGCTTCCTCCATCGTCTCGTTTAAG
GTTAATCCTAGTTTTGTTAGCTGCCGGGGAGGCTATGCTACCTGGTATAGTAGAAAGGCA
AGCGATCCTAATCTCCTTACTGGTGCTCTTGTTGGTGGACCTGATGCCTATGACAACTTT
GCTGATCAAAGAGATAACTATGAGCAAACTGAGCCTGCCACTTACAACAATGCTCCGTTG
ATCGGTGTGTTGGCAAGACTTCACGCTGGTCACAGCGGTTACAATCAGCTCCTTCCAGTT
GTTCCTGACCCAAAGCCAACGCCAAAGCCAGCTCCAAGAACTAAAGTAACTCCAGCTCCA
AGGCAAAGAGTACTTCCAGTCCCAGCTAATGCTCATGTTACTATTCAACAAAAGGCAACT
AGTTCATGGGCTCTGAATGGGAAGACTTACTACAGATACTCAGCAGTTGTAACCAACAAG
TCTGGAAAGACGGTTAAGAACTTGAAGCTCTCAATAGTCAAGCTCTATGGTCCTCTCTGG
GGTCTAACAAAGTATGGTAACTCGTTCATCTTCCCAGCTTGGCTCAACTCATTACCAGCT
GGTAAAAGCCTAGAGTTTGTGTACATTCACACTGCTTCACCTGCAATCGTCTCCGTTTCA
AGCTACACTCTAGTCTAA