Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400031619
CDS Infomation

pacid=37470004 polypeptide=PGSC0003DMP400021439 locus=PGSC0003DMG400012128 ID=PGSC0003DMT400031619.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGGCTATTGAAGGTAGCTACGTGTAATTTGAACCAATGGGCTATGGATTTCGACTGC
AATTTGAGCAACATTAAGCAATCTGTTGCGGAGGCTAAAGCTGCTGGAGCTATGATCAGG
CTTGGACCAGAGCTTGAAATCACTGGATATGGTTGTGAAGATCATTTTTTAGAACTAGAT
ACTGTTGCTCATGCGTGGGAATGCTTAAAAGAATTACTGTTAGGAGATTGGACTGATGGG
ATATTATGTAGCTTCGGTATGCCTGTTATCAAAGATTCAGAACGATACAACTGTCAAGTG
TTGTGCCTAAACAGAAAAATAATCATGATAAGGCCAAAGATGTGGCTAGCAAATGATGGC
AACTATCGAGAACTTCGATGGTTTACAGCATGGAAATCAAAAGATCACCTTGAGGACTTC
CATCTCCCAAGTGAAGTTTCAGATGCTTTGTCTCAGACAACAGTACCTTTTGGTTATGGC
TATGTCCAGTTTCTAGACACAGCTGTTGCAGCTGAAGTTTGTGAAGAACTTTTTACTCCT
CAACCTCCTCATGCTGAGCTTGCATTGAATGGTGTTGAAGTGTTTATGAATGCAAGTGGA
AGTCATCATCAATTACGAAAGCTTGATCTTCGCAATCGTGCTTTTATAAGTGCCACACAT
ACTCGAGGGGGAGTTTACATGTACAGTAATCACCAAGGATGCGATGGTGGTCGTCTCTAT
TATGATGGATGTTCTTGTGTTGTTGTAAATGGAGATATGGTAGCACAAGGTTCACAATTT
TCTTTGAAGGATGTTGAAATGGTTTTTGCTCAAATTGATCTAGATGCGGTTGCAAGTCTC
AGATCATCTATCAGTAGCTTTCAAGAGCAAGCAAGTTGTAAAACTAAAGTTTCCAAAGTA
TTTGTGCCTTACAAGCTTTGCCAACCTTTTAACCTCCTAATGTCACTTTCAAGTCCACTC
AAGATTAGATACCACTCTCCTGAGGAGGAAATAGCACTTGGACCTGCTTGCTGGCTGTGG
GATTATCTAAGAAGAAGTGGTGCATCTGGTTTTCTGCTTCCCCTTTCTGGTGGTGCTGAT
AGTTCCTCCGTTGCTGCTATAGTTGGTTCAATGTGCCAGCTTGTAGTAAAAGAAATTGCA
AACGGTGACAAGCAGATAAAAGCAGATGCTATTCGAATTGGCCATTACACTGATGGTCAG
TTTCCAACAGATAGCCAAGAATTTGCTAAGCGCATTTTTTACACTGTTTTTATGGGATCT
GAAAATAGTTCAGAAGCCACAACAACTCGGGCAAAGGTGTTGGCTGATGAGGTAGGATCA
TGGCATCTTAACGTGAGCATCGATGGAGTGGTCTCTTCACTAATCTGTTTGTTTCAAACA
CTCACTGGAAAGCGTCCACGCTATAAGGTAGATGGGGGATCAAACATTGAAAATTTAGGG
TTGCAAAACATTCAAGCTCGGGTCCGAATGGTCCTGGCATTCATGTTAGCATCTCTGCTG
CCATGGGTCCATAACAAACCTGGGTTTTATCTGGTTTTGGGTAGCTCCAATGTGGATGAA
GGATTACGTGGTTACTTAACAAAGTATGATTGTAGTTCAGCAGATATAAATCCAATTGGA
AGTATCAGTAAGATGGATCTTCGAACATTTCTGAAATGGGCTGCCGTTCATCTTGGCTAC
TCATCCCTGGCAGAGATTGAAGCTGCACCGCCCACTGCTGAATTGGAGCCTATACGTGCG
AATTACAGTCAGTTGGATGAAGTGGATATGGGTATGACCTATGAAGAACTTTCAGTGTAC
GGAAGGTTGCGCAAGATTTTCCGCTGTGGACCTCTATCAATGTTTAAGAATTTGTGTTAC
AAATGGGGTACAAAGTTGACGCCTGCAGAGGTGGCTGACAAAGTGAAATACTTCTTTAAA
TACTATTCCATCAATAGACACAAGATGACTGTCATGACGCCTTCATATCATGCTGAGGTA
CTTCACTTCTATGTTGCATGGATCCATTACTTGCATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400021439
PEP Infomation

pacid=37470004 transcript=PGSC0003DMT400031619 locus=PGSC0003DMG400012128 ID=PGSC0003DMT400031619.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MRLLKVATCNLNQWAMDFDCNLSNIKQSVAEAKAAGAMIRLGPELEITGYGCEDHFLELD
TVAHAWECLKELLLGDWTDGILCSFGMPVIKDSERYNCQVLCLNRKIIMIRPKMWLANDG
NYRELRWFTAWKSKDHLEDFHLPSEVSDALSQTTVPFGYGYVQFLDTAVAAEVCEELFTP
QPPHAELALNGVEVFMNASGSHHQLRKLDLRNRAFISATHTRGGVYMYSNHQGCDGGRLY
YDGCSCVVVNGDMVAQGSQFSLKDVEMVFAQIDLDAVASLRSSISSFQEQASCKTKVSKV
FVPYKLCQPFNLLMSLSSPLKIRYHSPEEEIALGPACWLWDYLRRSGASGFLLPLSGGAD
SSSVAAIVGSMCQLVVKEIANGDKQIKADAIRIGHYTDGQFPTDSQEFAKRIFYTVFMGS
ENSSEATTTRAKVLADEVGSWHLNVSIDGVVSSLICLFQTLTGKRPRYKVDGGSNIENLG
LQNIQARVRMVLAFMLASLLPWVHNKPGFYLVLGSSNVDEGLRGYLTKYDCSSADINPIG
SISKMDLRTFLKWAAVHLGYSSLAEIEAAPPTAELEPIRANYSQLDEVDMGMTYEELSVY
GRLRKIFRCGPLSMFKNLCYKWGTKLTPAEVADKVKYFFKYYSINRHKMTVMTPSYHAEV
LHFYVAWIHYLH*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400031619
Transcript Infomation

pacid=37470004 locus=PGSC0003DMG400012128 ID=PGSC0003DMT400031619.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGGCTATTGAAGGTAGCTACGTGTAATTTGAACCAATGGGCTATGGATTTCGACTGC
AATTTGAGCAACATTAAGCAATCTGTTGCGGAGGCTAAAGCTGCTGGAGCTATGATCAGG
CTTGGACCAGAGCTTGAAATCACTGGATATGGTTGTGAAGATCATTTTTTAGAACTAGAT
ACTGTTGCTCATGCGTGGGAATGCTTAAAAGAATTACTGTTAGGAGATTGGACTGATGGG
ATATTATGTAGCTTCGGTATGCCTGTTATCAAAGATTCAGAACGATACAACTGTCAAGTG
TTGTGCCTAAACAGAAAAATAATCATGATAAGGCCAAAGATGTGGCTAGCAAATGATGGC
AACTATCGAGAACTTCGATGGTTTACAGCATGGAAATCAAAAGATCACCTTGAGGACTTC
CATCTCCCAAGTGAAGTTTCAGATGCTTTGTCTCAGACAACAGTACCTTTTGGTTATGGC
TATGTCCAGTTTCTAGACACAGCTGTTGCAGCTGAAGTTTGTGAAGAACTTTTTACTCCT
CAACCTCCTCATGCTGAGCTTGCATTGAATGGTGTTGAAGTGTTTATGAATGCAAGTGGA
AGTCATCATCAATTACGAAAGCTTGATCTTCGCAATCGTGCTTTTATAAGTGCCACACAT
ACTCGAGGGGGAGTTTACATGTACAGTAATCACCAAGGATGCGATGGTGGTCGTCTCTAT
TATGATGGATGTTCTTGTGTTGTTGTAAATGGAGATATGGTAGCACAAGGTTCACAATTT
TCTTTGAAGGATGTTGAAATGGTTTTTGCTCAAATTGATCTAGATGCGGTTGCAAGTCTC
AGATCATCTATCAGTAGCTTTCAAGAGCAAGCAAGTTGTAAAACTAAAGTTTCCAAAGTA
TTTGTGCCTTACAAGCTTTGCCAACCTTTTAACCTCCTAATGTCACTTTCAAGTCCACTC
AAGATTAGATACCACTCTCCTGAGGAGGAAATAGCACTTGGACCTGCTTGCTGGCTGTGG
GATTATCTAAGAAGAAGTGGTGCATCTGGTTTTCTGCTTCCCCTTTCTGGTGGTGCTGAT
AGTTCCTCCGTTGCTGCTATAGTTGGTTCAATGTGCCAGCTTGTAGTAAAAGAAATTGCA
AACGGTGACAAGCAGATAAAAGCAGATGCTATTCGAATTGGCCATTACACTGATGGTCAG
TTTCCAACAGATAGCCAAGAATTTGCTAAGCGCATTTTTTACACTGTTTTTATGGGATCT
GAAAATAGTTCAGAAGCCACAACAACTCGGGCAAAGGTGTTGGCTGATGAGGTAGGATCA
TGGCATCTTAACGTGAGCATCGATGGAGTGGTCTCTTCACTAATCTGTTTGTTTCAAACA
CTCACTGGAAAGCGTCCACGCTATAAGGTAGATGGGGGATCAAACATTGAAAATTTAGGG
TTGCAAAACATTCAAGCTCGGGTCCGAATGGTCCTGGCATTCATGTTAGCATCTCTGCTG
CCATGGGTCCATAACAAACCTGGGTTTTATCTGGTTTTGGGTAGCTCCAATGTGGATGAA
GGATTACGTGGTTACTTAACAAAGTATGATTGTAGTTCAGCAGATATAAATCCAATTGGA
AGTATCAGTAAGATGGATCTTCGAACATTTCTGAAATGGGCTGCCGTTCATCTTGGCTAC
TCATCCCTGGCAGAGATTGAAGCTGCACCGCCCACTGCTGAATTGGAGCCTATACGTGCG
AATTACAGTCAGTTGGATGAAGTGGATATGGGTATGACCTATGAAGAACTTTCAGTGTAC
GGAAGGTTGCGCAAGATTTTCCGCTGTGGACCTCTATCAATGTTTAAGAATTTGTGTTAC
AAATGGGGTACAAAGTTGACGCCTGCAGAGGTGGCTGACAAAGTGAAATACTTCTTTAAA
TACTATTCCATCAATAGACACAAGATGACTGTCATGACGCCTTCATATCATGCTGAGGTA
CTTCACTTCTATGTTGCATGGATCCATTACTTGCATTGA