Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400031206
CDS Infomation

pacid=37460947 polypeptide=PGSC0003DMP400021172 locus=PGSC0003DMG400011957 ID=PGSC0003DMT400031206.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTGCATAATGGGGTAACCCCAGATGATCATATTTTCCCTTGCGCAACCAAAGCCTGT
GGGATTCTTTGTGATTATCGTATTGGCCAATCCATTCATTGCTTTTCTTTCAAAATTGGA
TTTGATTCTGATGTGTTTGTAGGGAGTTCTCTCGTTGATATGTATGCCAAATGTGGGAAC
ATTGAGATTGCTCGGAAAGTGTTCGATCAAATGCCTGAAAGAAATGTGGTTTCTTGGAGT
GGAATGATATATGGGTATGCTCAAATGGCTGAGGATGAGGAAGCTTTGAGGCTTTTCAAG
CTTGCTTTGGTTGAAGGTTTGGATGTCAATGACTTTACCTTTTCGAGTGTGATTAGAGTG
TGTGCGAATTCTACCTTGCTTGAATTAGGGAAGCAAATACACGGTTTGTGCTTGAAAACT
AGCTATGATTCGTCGAGCTTTATTGGGACTGCCTTGATATCATTGTACTCCAAGTGTGGT
CTTGTTGAAGGTGCTTATCGTGTTTTTAATGAGGTTCCAGTTAGGAATTTAGGGATGTGG
AATGCGATGTTGATTGCTTGTGCTCAGCACGGGCACACGGAAAAGGTATTTGGCTTGTTT
AAAGAAATGGAGAGTATTGGAATGAAGCCAAATTTTATTACCTTTTTATGTGTGCTATAT
GCTTGTAGCCATGCTGGGCTGGTCCCAGAAGGGAAATTTTACTTTGATTTAATGAAGAAA
CATGGAGTTGAGCCAGGGGACCAACATTATGCTTCTCTTGTGGACTGTCTCGGCCGAGCT
GGAAAATTACAAGAGGCAGTTCAAGTTATTGAGAAGATGCCAATGCAACCAACAGAATCT
GTTTGGGGAGCTTTGTTGACTGGCTGTAGAATCCACAAGAACACTGAATTGGCAGCTTAT
GTGGCTGACAGGGTCTTTGAGTTAGGTCCTGTTAGCTCAGGCGTACATGTGCTACTGTCC
AACGCATATGCTGCTGCTGGTAGATATCAAGAGGCTGCCAAAGCTAGAAAGATGCTCAGA
GACAAAGGTGTGAAAAAGGAAACTGGTTTGAGTTGGGTTGAGGAGGGAAATAAAGTACAC
ACATTTGCTGCTGGAGATAGGTCTCACTCAAAGTCTAAGGAGATATATGAAAAGTTGGAT
GAATTAGGTGATTACATGGAGCAAGCTGGGTATGTTGCAGACACAAATTATGTGTTGCAA
CAGGTTGCTGGCCAGGAAAAGAGTGAGACTATCAGGTATCACAGCGAAAGACTAGCCATT
GCTTTTGCCCTTATCACCTTTCCACCAGAAAGGCCTATTAGAGTTATGAAAAACTTGCGT
GTATGTGGCGATTGTCACAATGCAATAAAGATTATTTCAAAGTGCACCAAAAGAGTAATT
ATAGTAAGGGACAACAATCGATTTCATCGCTTTGAGGATGGGAAATGCTCCTGTGGTGAC
TATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400021172
PEP Infomation

pacid=37460947 transcript=PGSC0003DMT400031206 locus=PGSC0003DMG400011957 ID=PGSC0003DMT400031206.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLHNGVTPDDHIFPCATKACGILCDYRIGQSIHCFSFKIGFDSDVFVGSSLVDMYAKCGN
IEIARKVFDQMPERNVVSWSGMIYGYAQMAEDEEALRLFKLALVEGLDVNDFTFSSVIRV
CANSTLLELGKQIHGLCLKTSYDSSSFIGTALISLYSKCGLVEGAYRVFNEVPVRNLGMW
NAMLIACAQHGHTEKVFGLFKEMESIGMKPNFITFLCVLYACSHAGLVPEGKFYFDLMKK
HGVEPGDQHYASLVDCLGRAGKLQEAVQVIEKMPMQPTESVWGALLTGCRIHKNTELAAY
VADRVFELGPVSSGVHVLLSNAYAAAGRYQEAAKARKMLRDKGVKKETGLSWVEEGNKVH
TFAAGDRSHSKSKEIYEKLDELGDYMEQAGYVADTNYVLQQVAGQEKSETIRYHSERLAI
AFALITFPPERPIRVMKNLRVCGDCHNAIKIISKCTKRVIIVRDNNRFHRFEDGKCSCGD
YW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400031206
Transcript Infomation

pacid=37460947 locus=PGSC0003DMG400011957 ID=PGSC0003DMT400031206.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTGCATAATGGGGTAACCCCAGATGATCATATTTTCCCTTGCGCAACCAAAGCCTGT
GGGATTCTTTGTGATTATCGTATTGGCCAATCCATTCATTGCTTTTCTTTCAAAATTGGA
TTTGATTCTGATGTGTTTGTAGGGAGTTCTCTCGTTGATATGTATGCCAAATGTGGGAAC
ATTGAGATTGCTCGGAAAGTGTTCGATCAAATGCCTGAAAGAAATGTGGTTTCTTGGAGT
GGAATGATATATGGGTATGCTCAAATGGCTGAGGATGAGGAAGCTTTGAGGCTTTTCAAG
CTTGCTTTGGTTGAAGGTTTGGATGTCAATGACTTTACCTTTTCGAGTGTGATTAGAGTG
TGTGCGAATTCTACCTTGCTTGAATTAGGGAAGCAAATACACGGTTTGTGCTTGAAAACT
AGCTATGATTCGTCGAGCTTTATTGGGACTGCCTTGATATCATTGTACTCCAAGTGTGGT
CTTGTTGAAGGTGCTTATCGTGTTTTTAATGAGGTTCCAGTTAGGAATTTAGGGATGTGG
AATGCGATGTTGATTGCTTGTGCTCAGCACGGGCACACGGAAAAGGTATTTGGCTTGTTT
AAAGAAATGGAGAGTATTGGAATGAAGCCAAATTTTATTACCTTTTTATGTGTGCTATAT
GCTTGTAGCCATGCTGGGCTGGTCCCAGAAGGGAAATTTTACTTTGATTTAATGAAGAAA
CATGGAGTTGAGCCAGGGGACCAACATTATGCTTCTCTTGTGGACTGTCTCGGCCGAGCT
GGAAAATTACAAGAGGCAGTTCAAGTTATTGAGAAGATGCCAATGCAACCAACAGAATCT
GTTTGGGGAGCTTTGTTGACTGGCTGTAGAATCCACAAGAACACTGAATTGGCAGCTTAT
GTGGCTGACAGGGTCTTTGAGTTAGGTCCTGTTAGCTCAGGCGTACATGTGCTACTGTCC
AACGCATATGCTGCTGCTGGTAGATATCAAGAGGCTGCCAAAGCTAGAAAGATGCTCAGA
GACAAAGGTGTGAAAAAGGAAACTGGTTTGAGTTGGGTTGAGGAGGGAAATAAAGTACAC
ACATTTGCTGCTGGAGATAGGTCTCACTCAAAGTCTAAGGAGATATATGAAAAGTTGGAT
GAATTAGGTGATTACATGGAGCAAGCTGGGTATGTTGCAGACACAAATTATGTGTTGCAA
CAGGTTGCTGGCCAGGAAAAGAGTGAGACTATCAGGTATCACAGCGAAAGACTAGCCATT
GCTTTTGCCCTTATCACCTTTCCACCAGAAAGGCCTATTAGAGTTATGAAAAACTTGCGT
GTATGTGGCGATTGTCACAATGCAATAAAGATTATTTCAAAGTGCACCAAAAGAGTAATT
ATAGTAAGGGACAACAATCGATTTCATCGCTTTGAGGATGGGAAATGCTCCTGTGGTGAC
TATTGGTGA