Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400030829
CDS Infomation

pacid=37428250 polypeptide=PGSC0003DMP400020940 locus=PGSC0003DMG400011810 ID=PGSC0003DMT400030829.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCCTTGTGTTTGCAGAGGGGAGGTGGAGGAGAAAGTGGAAGCAAAAACGATATGGAT
AATGGTAAGTATGTGAGGTATACACCAGAACAAGTTGAAGCTTTGGAGAGAGTTTATGCT
GAATGTCCAAAACCTACTTCTTTGAGAAGACAACAGCTTATTAGGGAGTGTCCTATTCTC
TCTAATATTGAACCTAAACAGATCAAAGTTTGGTTTCAGAATCGAAGATGTCGTGAAAAA
CAAAGGAAGGAAGCTTCTCGTCTCCAGACTGTTAACAGGAAGCTGAGTGCTATGAACAAG
CTGCTGATGGAAGAAAATGACCGATTACAGAAGCAAGTGTCTCAACTTGTGTATGAGAAT
GGCTACATGAAACAGCAAATCAATACTGTTAGCAGCACGACCACAGATACAAGCTGTGAA
TCTGTGGTCGTGAGTGGTCAGCAGCAAAGAAAAAACCCAACACCTCAGCATCCAGAAAGG
GATGCGAATAACCCAGCTGGTCTTCTTGCAATAGCTGAGGAGACCCTGGCAGAGTTCCTT
GGAAAGGCTACTGGAACTGCTGTCGACTGGGTGCAGATGATTGGGATGAAGCCTGGTCCG
GATTCTATTGGTATTGTTGCTGTTTCCCGCAACTGCAGTGGGGTAGCAGCACGTGCCTGC
GGCCTTGTGAGTCTAGAGCCCACGAAGGTTGCGGAGATACTCAAAGATCGTCCTTCTTGG
TATCGCGACTGCCGTTGCCTTAATGTACTGAGTGTAATCCCTACTGGCAATGGTGGGACA
ATAGAGCTTATTTACTTGCAGACTTATGCTCCAACTACATTGGCAACTGCTCGTGACTTT
TGGACATTGAGATACACTACAAGTTTGGAGGATGGCAGTCTTGTGATATGTGAACGATCT
CTGACAACAGCAACTGGTGGCCCAACAGGGCCTCCTGCTACAAGTTTTGTCAGGGCTGAA
ATGCTACCAAGTGGTTACCTCATAAGGCCTTGTGAGGGTGGGGGCTCAATGATTCACATT
GTTGATCATATTGATCTAGATGCTTGGAGTGTCCCTGAAGTTCTGAGACCACTTTATGAG
TCTTCCAAGATCCTTGCTCAGAAGATGACTATGGCTGCCTTGCGACACATACGACAAATT
GCACAAGAAACCAGCGGAGAGATCCAATACACGGGGGGTCGCCAACCTGCTGTTTTGAGG
GCACTAAGTCAGAGATTATGCAGGGGATTTAATGATGCTGTTAGTGGATTTGTTGATGAT
GGTTGGACTATTATGGATAGTGATGGTGTAGAGGATGTAACAATTGCTATAAACTCATCT
TCAAGTAAATTCCTTGGTTCACAGTACAACACCTTGTCAATACTCCCTACATTTGGAGGT
GTTTTGTGTGCCAGGGCATCAATGCTTCTTCAGAATGTTCCCCCTGCTTTACTTGTACGT
TTCCTTAGGGAGCACCGTTCCGAATGGGCAGATTATGGGGTTGATGCTTATTCTTCTGCA
TCTCTTAAAGCCAGTCCATATGCTGTCCCTTGTGCCAGACCAGGTGGTTTCCCAAGTAGC
CAGGTCATTTTACCCTTAGCTCAGACTGTGGAGCACGAGGAGTTTCTTGAGGTAGTACGT
CTAGAGGGTCCTGCTTTCTCACCAGAGGACATTGCTTTATCACGGGATATGTACTTGTTA
CAGTTATGCAGTGGAGTTGATGAGAATGCTGCAGGTGCATGTGCTCAGCTTGTTTTTGCA
CCTATTGATGAATCTTTTGGTGATGATGCTCCATTGATTCCATCTGGCTTCCGTGTCATT
CCACTGGAACCTAAATCAGATGTCCCTGCAGCAACTCGGACCTTGGATTTAGCTTCGACT
CTAGAAGCTGGAACTGGTGGGAGTGGGACACGTCCTGCTGGTGAAATTGAAGCAGGCAAT
TACAACCATCGTTCAGTTTTGACAATTGCATTCCAGTTTACTTTTGAGAGTCACTACCAG
GATAATGTAGCTGCAATGGCTCGCCAATATGTACGAAGTATTGTAGGCTCTGTTCAGAGA
GTTGCAATGGCCATAGCACCTTCTCGACTCAGCTCTCAGTTAACACCTAAATCCTTCCCC
GGGTCACCTGAAGCTGTCACTTTGGCAAGGTGGATTTCCCGGAGCTATAGGGTGCATACA
GGAGGAGACCTGTTCCAGGTTGATTCTCAAGCTGGTGATGCTGTTCTGAAACAACTGTGG
CACCATAGTGATGCAATAATGTGTTGCTCTGTAAAAATGAATGCATCTGCAGTTTTTACA
TTTGCAAACCAGGCTGGTCTTGACATGCTTGAAACCACTTTGTTAGCTCTTCAGGATATA
ATGCTTGATAAGATTCTAGATGAAGCTGGTCGTAAGGTCCTCCTATCGGAGTTCTCCAAG
ATCATGCAGCAGGGATTTGCCTATCTGCCAGCAGGAATATGTGTATCTAGCATGGGTAGG
CCAATATCATATGAGCAAGCCATAGCATGGAAGGTTCTCAACGACGATGATTCCAATCAC
TGTCTAGCTTTCATGTTCATAAACTGGTCTTTTGTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400020940
PEP Infomation

pacid=37428250 transcript=PGSC0003DMT400030829 locus=PGSC0003DMG400011810 ID=PGSC0003DMT400030829.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MALCLQRGGGGESGSKNDMDNGKYVRYTPEQVEALERVYAECPKPTSLRRQQLIRECPIL
SNIEPKQIKVWFQNRRCREKQRKEASRLQTVNRKLSAMNKLLMEENDRLQKQVSQLVYEN
GYMKQQINTVSSTTTDTSCESVVVSGQQQRKNPTPQHPERDANNPAGLLAIAEETLAEFL
GKATGTAVDWVQMIGMKPGPDSIGIVAVSRNCSGVAARACGLVSLEPTKVAEILKDRPSW
YRDCRCLNVLSVIPTGNGGTIELIYLQTYAPTTLATARDFWTLRYTTSLEDGSLVICERS
LTTATGGPTGPPATSFVRAEMLPSGYLIRPCEGGGSMIHIVDHIDLDAWSVPEVLRPLYE
SSKILAQKMTMAALRHIRQIAQETSGEIQYTGGRQPAVLRALSQRLCRGFNDAVSGFVDD
GWTIMDSDGVEDVTIAINSSSSKFLGSQYNTLSILPTFGGVLCARASMLLQNVPPALLVR
FLREHRSEWADYGVDAYSSASLKASPYAVPCARPGGFPSSQVILPLAQTVEHEEFLEVVR
LEGPAFSPEDIALSRDMYLLQLCSGVDENAAGACAQLVFAPIDESFGDDAPLIPSGFRVI
PLEPKSDVPAATRTLDLASTLEAGTGGSGTRPAGEIEAGNYNHRSVLTIAFQFTFESHYQ
DNVAAMARQYVRSIVGSVQRVAMAIAPSRLSSQLTPKSFPGSPEAVTLARWISRSYRVHT
GGDLFQVDSQAGDAVLKQLWHHSDAIMCCSVKMNASAVFTFANQAGLDMLETTLLALQDI
MLDKILDEAGRKVLLSEFSKIMQQGFAYLPAGICVSSMGRPISYEQAIAWKVLNDDDSNH
CLAFMFINWSFV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400030829
Transcript Infomation

pacid=37428250 locus=PGSC0003DMG400011810 ID=PGSC0003DMT400030829.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCCTTGTGTTTGCAGAGGGGAGGTGGAGGAGAAAGTGGAAGCAAAAACGATATGGAT
AATGGTAAGTATGTGAGGTATACACCAGAACAAGTTGAAGCTTTGGAGAGAGTTTATGCT
GAATGTCCAAAACCTACTTCTTTGAGAAGACAACAGCTTATTAGGGAGTGTCCTATTCTC
TCTAATATTGAACCTAAACAGATCAAAGTTTGGTTTCAGAATCGAAGATGTCGTGAAAAA
CAAAGGAAGGAAGCTTCTCGTCTCCAGACTGTTAACAGGAAGCTGAGTGCTATGAACAAG
CTGCTGATGGAAGAAAATGACCGATTACAGAAGCAAGTGTCTCAACTTGTGTATGAGAAT
GGCTACATGAAACAGCAAATCAATACTGTTAGCAGCACGACCACAGATACAAGCTGTGAA
TCTGTGGTCGTGAGTGGTCAGCAGCAAAGAAAAAACCCAACACCTCAGCATCCAGAAAGG
GATGCGAATAACCCAGCTGGTCTTCTTGCAATAGCTGAGGAGACCCTGGCAGAGTTCCTT
GGAAAGGCTACTGGAACTGCTGTCGACTGGGTGCAGATGATTGGGATGAAGCCTGGTCCG
GATTCTATTGGTATTGTTGCTGTTTCCCGCAACTGCAGTGGGGTAGCAGCACGTGCCTGC
GGCCTTGTGAGTCTAGAGCCCACGAAGGTTGCGGAGATACTCAAAGATCGTCCTTCTTGG
TATCGCGACTGCCGTTGCCTTAATGTACTGAGTGTAATCCCTACTGGCAATGGTGGGACA
ATAGAGCTTATTTACTTGCAGACTTATGCTCCAACTACATTGGCAACTGCTCGTGACTTT
TGGACATTGAGATACACTACAAGTTTGGAGGATGGCAGTCTTGTGATATGTGAACGATCT
CTGACAACAGCAACTGGTGGCCCAACAGGGCCTCCTGCTACAAGTTTTGTCAGGGCTGAA
ATGCTACCAAGTGGTTACCTCATAAGGCCTTGTGAGGGTGGGGGCTCAATGATTCACATT
GTTGATCATATTGATCTAGATGCTTGGAGTGTCCCTGAAGTTCTGAGACCACTTTATGAG
TCTTCCAAGATCCTTGCTCAGAAGATGACTATGGCTGCCTTGCGACACATACGACAAATT
GCACAAGAAACCAGCGGAGAGATCCAATACACGGGGGGTCGCCAACCTGCTGTTTTGAGG
GCACTAAGTCAGAGATTATGCAGGGGATTTAATGATGCTGTTAGTGGATTTGTTGATGAT
GGTTGGACTATTATGGATAGTGATGGTGTAGAGGATGTAACAATTGCTATAAACTCATCT
TCAAGTAAATTCCTTGGTTCACAGTACAACACCTTGTCAATACTCCCTACATTTGGAGGT
GTTTTGTGTGCCAGGGCATCAATGCTTCTTCAGAATGTTCCCCCTGCTTTACTTGTACGT
TTCCTTAGGGAGCACCGTTCCGAATGGGCAGATTATGGGGTTGATGCTTATTCTTCTGCA
TCTCTTAAAGCCAGTCCATATGCTGTCCCTTGTGCCAGACCAGGTGGTTTCCCAAGTAGC
CAGGTCATTTTACCCTTAGCTCAGACTGTGGAGCACGAGGAGTTTCTTGAGGTAGTACGT
CTAGAGGGTCCTGCTTTCTCACCAGAGGACATTGCTTTATCACGGGATATGTACTTGTTA
CAGTTATGCAGTGGAGTTGATGAGAATGCTGCAGGTGCATGTGCTCAGCTTGTTTTTGCA
CCTATTGATGAATCTTTTGGTGATGATGCTCCATTGATTCCATCTGGCTTCCGTGTCATT
CCACTGGAACCTAAATCAGATGTCCCTGCAGCAACTCGGACCTTGGATTTAGCTTCGACT
CTAGAAGCTGGAACTGGTGGGAGTGGGACACGTCCTGCTGGTGAAATTGAAGCAGGCAAT
TACAACCATCGTTCAGTTTTGACAATTGCATTCCAGTTTACTTTTGAGAGTCACTACCAG
GATAATGTAGCTGCAATGGCTCGCCAATATGTACGAAGTATTGTAGGCTCTGTTCAGAGA
GTTGCAATGGCCATAGCACCTTCTCGACTCAGCTCTCAGTTAACACCTAAATCCTTCCCC
GGGTCACCTGAAGCTGTCACTTTGGCAAGGTGGATTTCCCGGAGCTATAGGGTGCATACA
GGAGGAGACCTGTTCCAGGTTGATTCTCAAGCTGGTGATGCTGTTCTGAAACAACTGTGG
CACCATAGTGATGCAATAATGTGTTGCTCTGTAAAAATGAATGCATCTGCAGTTTTTACA
TTTGCAAACCAGGCTGGTCTTGACATGCTTGAAACCACTTTGTTAGCTCTTCAGGATATA
ATGCTTGATAAGATTCTAGATGAAGCTGGTCGTAAGGTCCTCCTATCGGAGTTCTCCAAG
ATCATGCAGCAGGGATTTGCCTATCTGCCAGCAGGAATATGTGTATCTAGCATGGGTAGG
CCAATATCATATGAGCAAGCCATAGCATGGAAGGTTCTCAACGACGATGATTCCAATCAC
TGTCTAGCTTTCATGTTCATAAACTGGTCTTTTGTTTAA