Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400030516
CDS Infomation	pacid=37473414 polypeptide=PGSC0003DMP400020715 locus=PGSC0003DMG400011687 ID=PGSC0003DMT400030516.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGATTTCAGTTCTCAGTTCAACTTTATGCATCGCCGCGCATTGCTTCAAAAGCAGAGC CACGTTTCTTCCATTCTCGCAAAGCATTTATTCTTCAACAACTATGGAAAACCCGATTAC GATCCGTCTAAAAATGCAAATATGGTGTTTTCTCCACTCTCAATTCAAATTGTTCTCGGC CTTATTGCTTCTGGATCCAGTGGTGCTACATTGGATCAATTGTTGAGTTTTCTCAAATTT AACTCTGTTGAAGAACTTAACTCTGTTTATGCTCGGGTTATTGCTGATGTTTTAGCCGAT GGAAGCCCTATGGGAGGTCCTCGTTTGTCCGTTGCTAATGGAGCTTGGATTGATCAAACT CTCTCGTTTAAGCATTCTTTCAAACAGGTTATGGACAATGTTTATAAGGCTACTGCAGCT TCTGTTGATATTCGGTACAAGGCTGATGAGGTTGCTGCTGAAGTCAATAAGTGGGCAAAA GAGAAAACAAATGGTCTCATCAAACAGATTCTTCCTCCTGGTGTAGTCACTGGCGGGACT CAGCTGATCTTGGCGAATGCACTATATTTCAAAGGAGCCTGGAATGAGAAATTTGATGCT TCAGATACGAAAGACCACGAGTTCCATCTCCTCAATGGAGGATCTGTTCAAGCACCCTTA ATGACCAGCCGAAAATGGCAATATGTGAAGGTGTTTAATGGTTTCAAAGTGTTAAAACTT CCTTATAAACAGGGTGAGGACAAGCGATTTCTCAGCATGTATATGTTACTCCCAGATGCA CGTGACGGATTACCAGCTTTACTGGAGAAAATTAGTTCAGAACCTGGATGTTTAGATCAA CATATTCCGTTAACAAAAGTTAGAGTGCGCAAGTTTCTTATCCCTAAGTTCAATATATCT TTTGGACTTGAAGCTTCTAATGTTCTAAAGGGACTCGGCCTCACATTACCTTTTACTGCC GGTCTCACTGAGATGGTGGGCGAGAATTTGCCTCTGGTAGTTACACATGTTTTTCACAAG TCGTTTATTGAAGTGAACGAGGAAGGTACAGAAGCTGCAGCTGTTACTGTAGCTTTGAAT ACGTTTGGGTGCTCATTGACAATGTTTAATGAGGAGGAGATAGACTTTGTTGCTGATCAT CCCTTCTTGTTCCTTGTGAAAGATGAGACTGCTGGTGCTATTTTGTTCATGGGGACTCTG TTGAATCCTCTTGATGTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400020715
PEP Infomation	pacid=37473414 transcript=PGSC0003DMT400030516 locus=PGSC0003DMG400011687 ID=PGSC0003DMT400030516.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MDFSSQFNFMHRRALLQKQSHVSSILAKHLFFNNYGKPDYDPSKNANMVFSPLSIQIVLG LIASGSSGATLDQLLSFLKFNSVEELNSVYARVIADVLADGSPMGGPRLSVANGAWIDQT LSFKHSFKQVMDNVYKATAASVDIRYKADEVAAEVNKWAKEKTNGLIKQILPPGVVTGGT QLILANALYFKGAWNEKFDASDTKDHEFHLLNGGSVQAPLMTSRKWQYVKVFNGFKVLKL PYKQGEDKRFLSMYMLLPDARDGLPALLEKISSEPGCLDQHIPLTKVRVRKFLIPKFNIS FGLEASNVLKGLGLTLPFTAGLTEMVGENLPLVVTHVFHKSFIEVNEEGTEAAAVTVALN TFGCSLTMFNEEEIDFVADHPFLFLVKDETAGAILFMGTLLNPLDV*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400030516
Transcript Infomation	pacid=37473414 locus=PGSC0003DMG400011687 ID=PGSC0003DMT400030516.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGATTTCAGTTCTCAGTTCAACTTTATGCATCGCCGCGCATTGCTTCAAAAGCAGAGC CACGTTTCTTCCATTCTCGCAAAGCATTTATTCTTCAACAACTATGGAAAACCCGATTAC GATCCGTCTAAAAATGCAAATATGGTGTTTTCTCCACTCTCAATTCAAATTGTTCTCGGC CTTATTGCTTCTGGATCCAGTGGTGCTACATTGGATCAATTGTTGAGTTTTCTCAAATTT AACTCTGTTGAAGAACTTAACTCTGTTTATGCTCGGGTTATTGCTGATGTTTTAGCCGAT GGAAGCCCTATGGGAGGTCCTCGTTTGTCCGTTGCTAATGGAGCTTGGATTGATCAAACT CTCTCGTTTAAGCATTCTTTCAAACAGGTTATGGACAATGTTTATAAGGCTACTGCAGCT TCTGTTGATATTCGGTACAAGGCTGATGAGGTTGCTGCTGAAGTCAATAAGTGGGCAAAA GAGAAAACAAATGGTCTCATCAAACAGATTCTTCCTCCTGGTGTAGTCACTGGCGGGACT CAGCTGATCTTGGCGAATGCACTATATTTCAAAGGAGCCTGGAATGAGAAATTTGATGCT TCAGATACGAAAGACCACGAGTTCCATCTCCTCAATGGAGGATCTGTTCAAGCACCCTTA ATGACCAGCCGAAAATGGCAATATGTGAAGGTGTTTAATGGTTTCAAAGTGTTAAAACTT CCTTATAAACAGGGTGAGGACAAGCGATTTCTCAGCATGTATATGTTACTCCCAGATGCA CGTGACGGATTACCAGCTTTACTGGAGAAAATTAGTTCAGAACCTGGATGTTTAGATCAA CATATTCCGTTAACAAAAGTTAGAGTGCGCAAGTTTCTTATCCCTAAGTTCAATATATCT TTTGGACTTGAAGCTTCTAATGTTCTAAAGGGACTCGGCCTCACATTACCTTTTACTGCC GGTCTCACTGAGATGGTGGGCGAGAATTTGCCTCTGGTAGTTACACATGTTTTTCACAAG TCGTTTATTGAAGTGAACGAGGAAGGTACAGAAGCTGCAGCTGTTACTGTAGCTTTGAAT ACGTTTGGGTGCTCATTGACAATGTTTAATGAGGAGGAGATAGACTTTGTTGCTGATCAT CCCTTCTTGTTCCTTGTGAAAGATGAGACTGCTGGTGCTATTTTGTTCATGGGGACTCTG TTGAATCCTCTTGATGTTTAG