Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400030316
CDS Infomation

pacid=37447929 polypeptide=PGSC0003DMP400020594 locus=PGSC0003DMG400011602 ID=PGSC0003DMT400030316.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGCCATGGAAAGACCTTAGCGGAAAAGTAGTGATGGTGACCGGTGCATCGTCAGGA
ATCGGGTTAGAGTTCTGTCTCGACTTGGCCAAAGCCGGTTGCAAAATCATTGCTGCTGCT
CGTCGTGTTGAGAGACTGAAATCTCTATGTGACCAAATTAATAGTAATTCAGAGGGACTC
CAACGGGCAATCGTGGTCCAACTTGATGTTACCGCTGATGGTGCTACTATTGAGTCCGCG
GTACAAATAGCTTGGGACACCTTTGGACGTATCGATGTCTTGGTTAACAATGCCGGAGTT
ACAGGTAAGCACTCTTCATTGGAATTGTCAGAGGAGGAGTGGGACAATATGTTTAACACG
AACCTAAAAGGGGCATGGTTGGTGTCCAAATATGTATGTAGACGTATGCGCGATGCTAAA
CAGGGCGGAGGGTCTGTTATTAATATATCTTCCATGGCTGGTTTAAATAGGGTAGTATAC
ATAGGGACATTTGGTTACGCTTCTTCAAAGATGGCTCTTGACATGGTTACTAAGAATATG
GCGATGGAATTGGGAGTAGACAAGATCAGAGTGAACTCAATAGCACCAGGATATTTCAAA
TCAGAGATAACAGAGGGGCTTATGCAAAATAAATGGTTCAATAATGTTACTAGGAGAACT
ATTCCTCTAAGAACATCGGGAACGATTAATCCGGCTTTAACATCAGTGGTGAGGTATTTA
ATCCACGATTCTTCAGAATATATTTCGGGAAATGTCTTCATCGTTGATGCTGGAACTACC
TTACCAGGTGTCCCCATTTTCTCATCACTCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400020594
PEP Infomation

pacid=37447929 transcript=PGSC0003DMT400030316 locus=PGSC0003DMG400011602 ID=PGSC0003DMT400030316.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEPWKDLSGKVVMVTGASSGIGLEFCLDLAKAGCKIIAAARRVERLKSLCDQINSNSEGL
QRAIVVQLDVTADGATIESAVQIAWDTFGRIDVLVNNAGVTGKHSSLELSEEEWDNMFNT
NLKGAWLVSKYVCRRMRDAKQGGGSVINISSMAGLNRVVYIGTFGYASSKMALDMVTKNM
AMELGVDKIRVNSIAPGYFKSEITEGLMQNKWFNNVTRRTIPLRTSGTINPALTSVVRYL
IHDSSEYISGNVFIVDAGTTLPGVPIFSSL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400030316
Transcript Infomation

pacid=37447929 locus=PGSC0003DMG400011602 ID=PGSC0003DMT400030316.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGCCATGGAAAGACCTTAGCGGAAAAGTAGTGATGGTGACCGGTGCATCGTCAGGA
ATCGGGTTAGAGTTCTGTCTCGACTTGGCCAAAGCCGGTTGCAAAATCATTGCTGCTGCT
CGTCGTGTTGAGAGACTGAAATCTCTATGTGACCAAATTAATAGTAATTCAGAGGGACTC
CAACGGGCAATCGTGGTCCAACTTGATGTTACCGCTGATGGTGCTACTATTGAGTCCGCG
GTACAAATAGCTTGGGACACCTTTGGACGTATCGATGTCTTGGTTAACAATGCCGGAGTT
ACAGGTAAGCACTCTTCATTGGAATTGTCAGAGGAGGAGTGGGACAATATGTTTAACACG
AACCTAAAAGGGGCATGGTTGGTGTCCAAATATGTATGTAGACGTATGCGCGATGCTAAA
CAGGGCGGAGGGTCTGTTATTAATATATCTTCCATGGCTGGTTTAAATAGGGTAGTATAC
ATAGGGACATTTGGTTACGCTTCTTCAAAGATGGCTCTTGACATGGTTACTAAGAATATG
GCGATGGAATTGGGAGTAGACAAGATCAGAGTGAACTCAATAGCACCAGGATATTTCAAA
TCAGAGATAACAGAGGGGCTTATGCAAAATAAATGGTTCAATAATGTTACTAGGAGAACT
ATTCCTCTAAGAACATCGGGAACGATTAATCCGGCTTTAACATCAGTGGTGAGGTATTTA
ATCCACGATTCTTCAGAATATATTTCGGGAAATGTCTTCATCGTTGATGCTGGAACTACC
TTACCAGGTGTCCCCATTTTCTCATCACTCTAG