Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400030265
CDS Infomation

pacid=37457669 polypeptide=PGSC0003DMP400020557 locus=PGSC0003DMG400011575 ID=PGSC0003DMT400030265.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTATCGTTTTGCAGCAAATCTTGCTTCTAAAGCCAGAGTTGCAAGAATCAGTTCCCAA
CAGATTGGTGGGAGGTTCAATTGGAGTAGAAACTATGCTGCAAAGGATATCAGATTTGGA
GTTGAAGCTAGAGCTTTGATGCTTCAAGGTGTTGAGCAGCTTGCTGATGCTGTTAAAGTC
ACTATGGGTCCAAAGGGGCGTAATGTGGTGATTGAACAAAGTTGGGGTGCACCCAAAGTA
ACAAAAGATGGCGTGACTGTTGCAAAAAGTATTGAATTCAAGGACAAGATACAAAATGTT
GGTGCTAGCCTTGTAAAACAAGTCGCCAATGCAACGAATGATGTTGCTGGTGATGGTACC
ACTTGTGCAACAGTCCTCACCCGAGCAATATTTGCTGAAGGATGCAAGTCAGTGGCAGCT
GGTATGAATGCAATGGACCTTAGACGGGGTATTACCATGGCTGTAGATTCTGTTGTGACA
AACCTGAAAAGCAGAGCACGGATGATCAGTACATCTGAGGAAATTGCACAGGTTGGGACT
ATCTCTGCAAACGGAGAAAGAGAAATTGGCGACCTAATTGCAAGGGCTATGGAGAAAGTA
GGCAAGGAGGGAGTCATCACTATTCAAGACGGGAAGACATTGCTCAATGAATTGGATGTT
GTTGAAGGGATGAAGTTGGATAGAGGTTACATATCACCATACTTCATCACAAATCAGAAG
AATCAGAAATGTGAACTGGATAACCCACTAATTCTGATTCATGAGAAAAAGATCTCAAGC
GTTAATGCTGTTGTGAAAGCATTGGAGTTAGCTCTGAAGAGACAAAGGCCCCTCTTAATT
GTGGCTGAAGATGTGGACAATGAAGCACTCGCCACTCTTATTTTGAACAAACTCCGTGCT
GGAATCAAGGTTTGTGCCATCAAAGCACCAGGCTTTGGTGAAAACAGGAAAGCTTATTTG
CAAGATCTTGCTATTTTAACTGGAGGCCAAGTCATAACAGAAGAGCTTGGACTGAACATT
GAAAATTTGGAGTTCGAGATGCTGGGAACAAGTAAAGAGGCGACTATCTCTAAGGATGAT
ACTGTCATTCTTGATGGTGCTGGTAAGAAGAAGTCCATAGAGGAACGATGTGAACTGATT
AGATCAACCATTGAACAGAGCACATCTGACTATGACAAGGAGAAGTTGCAGGAAAGACTA
GCTAAGCTTTCAGGGGGTGTTGCTGTGTTAAAGATTGGAGGTGCCAGTGAAGCTGAGGTT
GGTGAAAAGAAAGATAGAGTAACTGATGCTTTGAATGCCACAAAGGCTGCAGTGGAGGAA
GGAATTGTTCCAGGTGGTGGTGTTGCTCTTCTTTATGCAGCAAGAGAATTGGATAATTTG
ACAACAGCCAACTTTGACCAGAAGATTGGTGTACAAATTATTCAGAATGCTCTGAAGACA
CCAGTACATACAATAGCCTCTAACGCAGGAGTAGAGGGTGCTGTCGTGGTTGGTAAACTG
TTGGATCAGGACAACCTTGATCTTGGATATGATGCGGCCAAGGGTGAATATGTAGATATG
ATAAAGGCAGGGATTATCGATCCAGTGAAAGTGATTAGGACAGCTTTGGTTGATGCTGCC
AGCGTCTCGTCTCTCTTGACCACAACTGAAGCAGTTGTTGTCGAGCTTCCTAAGGATGAG
AAGGAATCTCCTGCAATGGGTGGCGGTATGGGTGGCATGGACTTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400020557
PEP Infomation

pacid=37457669 transcript=PGSC0003DMT400030265 locus=PGSC0003DMG400011575 ID=PGSC0003DMT400030265.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MYRFAANLASKARVARISSQQIGGRFNWSRNYAAKDIRFGVEARALMLQGVEQLADAVKV
TMGPKGRNVVIEQSWGAPKVTKDGVTVAKSIEFKDKIQNVGASLVKQVANATNDVAGDGT
TCATVLTRAIFAEGCKSVAAGMNAMDLRRGITMAVDSVVTNLKSRARMISTSEEIAQVGT
ISANGEREIGDLIARAMEKVGKEGVITIQDGKTLLNELDVVEGMKLDRGYISPYFITNQK
NQKCELDNPLILIHEKKISSVNAVVKALELALKRQRPLLIVAEDVDNEALATLILNKLRA
GIKVCAIKAPGFGENRKAYLQDLAILTGGQVITEELGLNIENLEFEMLGTSKEATISKDD
TVILDGAGKKKSIEERCELIRSTIEQSTSDYDKEKLQERLAKLSGGVAVLKIGGASEAEV
GEKKDRVTDALNATKAAVEEGIVPGGGVALLYAARELDNLTTANFDQKIGVQIIQNALKT
PVHTIASNAGVEGAVVVGKLLDQDNLDLGYDAAKGEYVDMIKAGIIDPVKVIRTALVDAA
SVSSLLTTTEAVVVELPKDEKESPAMGGGMGGMDF*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400030265
Transcript Infomation

pacid=37457669 locus=PGSC0003DMG400011575 ID=PGSC0003DMT400030265.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTATCGTTTTGCAGCAAATCTTGCTTCTAAAGCCAGAGTTGCAAGAATCAGTTCCCAA
CAGATTGGTGGGAGGTTCAATTGGAGTAGAAACTATGCTGCAAAGGATATCAGATTTGGA
GTTGAAGCTAGAGCTTTGATGCTTCAAGGTGTTGAGCAGCTTGCTGATGCTGTTAAAGTC
ACTATGGGTCCAAAGGGGCGTAATGTGGTGATTGAACAAAGTTGGGGTGCACCCAAAGTA
ACAAAAGATGGCGTGACTGTTGCAAAAAGTATTGAATTCAAGGACAAGATACAAAATGTT
GGTGCTAGCCTTGTAAAACAAGTCGCCAATGCAACGAATGATGTTGCTGGTGATGGTACC
ACTTGTGCAACAGTCCTCACCCGAGCAATATTTGCTGAAGGATGCAAGTCAGTGGCAGCT
GGTATGAATGCAATGGACCTTAGACGGGGTATTACCATGGCTGTAGATTCTGTTGTGACA
AACCTGAAAAGCAGAGCACGGATGATCAGTACATCTGAGGAAATTGCACAGGTTGGGACT
ATCTCTGCAAACGGAGAAAGAGAAATTGGCGACCTAATTGCAAGGGCTATGGAGAAAGTA
GGCAAGGAGGGAGTCATCACTATTCAAGACGGGAAGACATTGCTCAATGAATTGGATGTT
GTTGAAGGGATGAAGTTGGATAGAGGTTACATATCACCATACTTCATCACAAATCAGAAG
AATCAGAAATGTGAACTGGATAACCCACTAATTCTGATTCATGAGAAAAAGATCTCAAGC
GTTAATGCTGTTGTGAAAGCATTGGAGTTAGCTCTGAAGAGACAAAGGCCCCTCTTAATT
GTGGCTGAAGATGTGGACAATGAAGCACTCGCCACTCTTATTTTGAACAAACTCCGTGCT
GGAATCAAGGTTTGTGCCATCAAAGCACCAGGCTTTGGTGAAAACAGGAAAGCTTATTTG
CAAGATCTTGCTATTTTAACTGGAGGCCAAGTCATAACAGAAGAGCTTGGACTGAACATT
GAAAATTTGGAGTTCGAGATGCTGGGAACAAGTAAAGAGGCGACTATCTCTAAGGATGAT
ACTGTCATTCTTGATGGTGCTGGTAAGAAGAAGTCCATAGAGGAACGATGTGAACTGATT
AGATCAACCATTGAACAGAGCACATCTGACTATGACAAGGAGAAGTTGCAGGAAAGACTA
GCTAAGCTTTCAGGGGGTGTTGCTGTGTTAAAGATTGGAGGTGCCAGTGAAGCTGAGGTT
GGTGAAAAGAAAGATAGAGTAACTGATGCTTTGAATGCCACAAAGGCTGCAGTGGAGGAA
GGAATTGTTCCAGGTGGTGGTGTTGCTCTTCTTTATGCAGCAAGAGAATTGGATAATTTG
ACAACAGCCAACTTTGACCAGAAGATTGGTGTACAAATTATTCAGAATGCTCTGAAGACA
CCAGTACATACAATAGCCTCTAACGCAGGAGTAGAGGGTGCTGTCGTGGTTGGTAAACTG
TTGGATCAGGACAACCTTGATCTTGGATATGATGCGGCCAAGGGTGAATATGTAGATATG
ATAAAGGCAGGGATTATCGATCCAGTGAAAGTGATTAGGACAGCTTTGGTTGATGCTGCC
AGCGTCTCGTCTCTCTTGACCACAACTGAAGCAGTTGTTGTCGAGCTTCCTAAGGATGAG
AAGGAATCTCCTGCAATGGGTGGCGGTATGGGTGGCATGGACTTCTAA