Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400030121
CDS Infomation	pacid=37447846 polypeptide=PGSC0003DMP400020478 locus=PGSC0003DMG402011540 ID=PGSC0003DMT400030121.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGATCATCCAAAGGGCTTCATGCTTTCACAGAGCTCTACTTACTTCTTTAGAGAAGGTA GGACCAAGGTACTTTACTGCCCCTGCTCAAACTTCTGCACAACCTTCTACTTATAGGGAT TATGAATCAAGGGATATTTTTGATTGGGATAATCTTGGATTCAAATTAATTCAAACTGAT TATATGTTTATGACAAGAAGTTCTCAAAATGGGAATTTTGAAAAAGGCAAGCTTAATCCC TATGGAAATATTGAATTAAGTCCCTCTGCTGGTGTCTTGAACTATGGACAGGGTTTAATT GAAGGTACAAAAGCTTATAGAGTGGATGATGGAAGAATATTTCTTTTTCGTCCACAAGAA AGTGGAATTAGAATGCAAATTGGTGCTAAAAGAATGTGTATGCCTTCTCCTTCTATTCAA CAATTTGTTGATGCTGTCAAGTTAACAACTATAGCTAATAGACGTTGGATCCCTCCTGCT GGAAAAGGGTCACTTTATATTAGGCCTTTGCTTATTGGAAATGGACCTATACTTGGAATT GCTCCAGCACCAGAGTACACATTTATTGTCTATGCTTGTCCTGTTGGAAATTATTTAAGG AATGGGACACAACCATTAACTTTATATGTTGAGGAAGAACATCATCGTGCCTCACAAGGG GGAGCTGGTGGAGTCAAAGCAATTACTAATTATGCCCCGGTGATAAAAGCAATACAGAAA GCAAAAGAGAGAGGATACTCAGATGTATTGTATCTTGATTCAGTAAATAAAAAATATATT GAAGAGGTCTCTGCCTCTAACATTTTCCTTGTAAAGGGAAAAAACATTTCAACACCAGTT GCTAGTGGAACCATTCTTGAAGGTGTCACAAGGAAAAGCATTATAGACATTGCACATGAT CTTGGATACCAGGTTGAAGAACGTTTGATTGAAGCAGATGAATTGTTTAGTGCTGATGAA GTATTTTGTACTGGAACTGCACTTGGTGTTGCTCCTGTAGGAAGTATTACCTACAAAAAC AAAAGGATTAACTACAAGGTAAGCTCAGACTTAATAAGTGCGCAATTGAACTCAAGATTA GTAGCAATTCAAAAAGGAATTATTGAGGACAAGAGGGGTTGGATTATTGAGATTAAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400020478
PEP Infomation	pacid=37447846 transcript=PGSC0003DMT400030121 locus=PGSC0003DMG402011540 ID=PGSC0003DMT400030121.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MIIQRASCFHRALLTSLEKVGPRYFTAPAQTSAQPSTYRDYESRDIFDWDNLGFKLIQTD YMFMTRSSQNGNFEKGKLNPYGNIELSPSAGVLNYGQGLIEGTKAYRVDDGRIFLFRPQE SGIRMQIGAKRMCMPSPSIQQFVDAVKLTTIANRRWIPPAGKGSLYIRPLLIGNGPILGI APAPEYTFIVYACPVGNYLRNGTQPLTLYVEEEHHRASQGGAGGVKAITNYAPVIKAIQK AKERGYSDVLYLDSVNKKYIEEVSASNIFLVKGKNISTPVASGTILEGVTRKSIIDIAHD LGYQVEERLIEADELFSADEVFCTGTALGVAPVGSITYKNKRINYKVSSDLISAQLNSRL VAIQKGIIEDKRGWIIEIK*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400030121
Transcript Infomation	pacid=37447846 locus=PGSC0003DMG402011540 ID=PGSC0003DMT400030121.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGATCATCCAAAGGGCTTCATGCTTTCACAGAGCTCTACTTACTTCTTTAGAGAAGGTA GGACCAAGGTACTTTACTGCCCCTGCTCAAACTTCTGCACAACCTTCTACTTATAGGGAT TATGAATCAAGGGATATTTTTGATTGGGATAATCTTGGATTCAAATTAATTCAAACTGAT TATATGTTTATGACAAGAAGTTCTCAAAATGGGAATTTTGAAAAAGGCAAGCTTAATCCC TATGGAAATATTGAATTAAGTCCCTCTGCTGGTGTCTTGAACTATGGACAGGGTTTAATT GAAGGTACAAAAGCTTATAGAGTGGATGATGGAAGAATATTTCTTTTTCGTCCACAAGAA AGTGGAATTAGAATGCAAATTGGTGCTAAAAGAATGTGTATGCCTTCTCCTTCTATTCAA CAATTTGTTGATGCTGTCAAGTTAACAACTATAGCTAATAGACGTTGGATCCCTCCTGCT GGAAAAGGGTCACTTTATATTAGGCCTTTGCTTATTGGAAATGGACCTATACTTGGAATT GCTCCAGCACCAGAGTACACATTTATTGTCTATGCTTGTCCTGTTGGAAATTATTTAAGG AATGGGACACAACCATTAACTTTATATGTTGAGGAAGAACATCATCGTGCCTCACAAGGG GGAGCTGGTGGAGTCAAAGCAATTACTAATTATGCCCCGGTGATAAAAGCAATACAGAAA GCAAAAGAGAGAGGATACTCAGATGTATTGTATCTTGATTCAGTAAATAAAAAATATATT GAAGAGGTCTCTGCCTCTAACATTTTCCTTGTAAAGGGAAAAAACATTTCAACACCAGTT GCTAGTGGAACCATTCTTGAAGGTGTCACAAGGAAAAGCATTATAGACATTGCACATGAT CTTGGATACCAGGTTGAAGAACGTTTGATTGAAGCAGATGAATTGTTTAGTGCTGATGAA GTATTTTGTACTGGAACTGCACTTGGTGTTGCTCCTGTAGGAAGTATTACCTACAAAAAC AAAAGGATTAACTACAAGGTAAGCTCAGACTTAATAAGTGCGCAATTGAACTCAAGATTA GTAGCAATTCAAAAAGGAATTATTGAGGACAAGAGGGGTTGGATTATTGAGATTAAGTGA