Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400029994
CDS Infomation

pacid=37474258 polypeptide=PGSC0003DMP400020388 locus=PGSC0003DMG400011511 ID=PGSC0003DMT400029994.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACAAAAGACACTTCTTTATTCAAAAAACTCATCACTTGGGACCTCTTCTCCCTCCCA
AACTCAACACCCTTCGCCAAGATTCTAGATTCTTACATCAATTCCAAGTCCCAATATGTC
ATACAAACTGTCCATTGTCGAATTCTCAAGACCCATTTTAGCTCCGAAGTTTTCATAAAC
AACAAGCTAATCGACACTTATGGGAAATCTGGAATGTTAAAGTATGCCAAGAAGGTGTTT
GATAAAATGCCTGAGAGAAACACCTTTACTTGGAATTCCATGATAAATGCATATACAGCA
TCAAGATTGGTTTTTGAGGCTGAGGAACTGTTTTACTTGATGCCTGAGCCTGATCAATGC
TCGTGGAATTTGATGGTTTCGAGCTTTGCTCAATGTGAATTGTTTGATTCGTCAATAGAG
TTTCTTGTGAGAATGCACAAAGAAGATTTTGTTTTGAATGAGTATGGTTATGGAAGTGGT
TTAAGTGCTTGTGCAGGGTTGAGGGACTTGAGAATGGGAACTCAACTTCATGCCTCGGTT
GCTAAATCGAGATATTCGAGAAGTGTTTACATGGGTTCTGCGCTTATTGACATGTACTCG
AAAACTGGTAATGTGGATTGTGCAGCAAAGGTGTTTAATGGGATGTGTGAGCGTAATGTG
GTGTCGTGGAATAGTTTACTTTCTTGTTATGAGCAAAATGGGCCAGTGAAGGAGGCTCTT
GTGGTATTCGCTAGGATGATGGAGTTCGGGTTTAAACCAGATGAGAAGACCTTGGCAAGT
GTAGTAAGTGCTTGTGCGAGTTTGTGTGCGATAAGAGAAGGTAAGGAAATTCATGCCCGA
ATTTTGAAGTCGGATAAGCTTAGGGATGATCTTATCATATGCAATGCATTGGTTGATATG
TACGCAAAGTTTGGGAGAATTGCTGAAGCTAGATGGATTTTTGATAGGATGCCAGTCAGA
AGTGTGGTGTCCGACACCTGTTTGGTAAGTGGTTATGCGAGAGTTGCAAGTGTGAAGACT
GCAAGAGCCGTGTTTTTGGGGATGATTGAAAGGAATGTTGTGTCTTGGAATGCTCTTATT
GCTGGATATACACAGAATGGGAACAATGAAGAGGCACTAAATCTCTTTCTTATGCTAAAA
AGAGAACCTGTTTGGCCAACTCATTATACGTTTGGGAATCTCCTTAATGCATGTGCAAAT
TTAGCTGATCTGAAGCTTGGGAGGCAGGCTCATGCACATATTTTGAAGCATGGATTTCGT
TTCCAGAATGGACCCGAGCCTGATGTTTTTGTGGGAAATGCTCTCATAGACATGTATATG
AAATGTGGATCAGTTGAAGATGGTAGCTGTGTATTCACAAAAATGCTGGACAGAGACTGG
GTTTCATGGAATGCCATAATAGTTGGATATGCACAAAATGGGCATGCTATGGAAGCTCTT
GAAACTTTCAAGGTTATGTTAGTATCCGGAGAGAAGCCAGATCACGTGACTATGATTGGA
GTTCTATGTGCATGTAGTCATGCAGGATTGGTTGAGGAGGGGCGTCAATATTTCTATTCC
ATGGACACAGAGTATGGGTTGACACCGTTTAAGGACCACTATACATGCATGGTCGATTTA
CTTGGCAAGGCTGGTTGCTTAGAAGAGGCAAAGGATTTGATTGAATCCATGCCGATGCCA
CCAGATAGTGTAGTATGGGGGTCTTTGCTCGCTGCATGTAAAATTCACATGGAAATTGAG
TTGGGAAAGTATGTAGCTGAGAAGCTTTTGGAGATTGATCCTACAAATTCTGGCCCTTAT
GTTCTTCTATCAAACATGTATGCTGAACAAGGAAGATGGCAAGATGTCAAAATGGTCCGA
AAACTTATGAGACAACGAGGCGTTGTTAAACAGCCTGGTTGTAGTTGGATTGAAATACAA
AGCCAGGTTCATGTTTTCATGGTAAAAGATAGGAGACACGCCCAGAAAAAAGAGATATAT
TTGATATTGAATACACTAACTAAATTGATGAAGCTTTCTGGCTATGTCCCAAATGCTGGT
CATTTGGATGGTGATGAGGAGCAAACCATGTTGGATTTTTCCTCATCTGAAGAGTTTGAA
GAACCTGTAATAGCTGCCATTGCATGCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400020388
PEP Infomation

pacid=37474258 transcript=PGSC0003DMT400029994 locus=PGSC0003DMG400011511 ID=PGSC0003DMT400029994.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MTKDTSLFKKLITWDLFSLPNSTPFAKILDSYINSKSQYVIQTVHCRILKTHFSSEVFIN
NKLIDTYGKSGMLKYAKKVFDKMPERNTFTWNSMINAYTASRLVFEAEELFYLMPEPDQC
SWNLMVSSFAQCELFDSSIEFLVRMHKEDFVLNEYGYGSGLSACAGLRDLRMGTQLHASV
AKSRYSRSVYMGSALIDMYSKTGNVDCAAKVFNGMCERNVVSWNSLLSCYEQNGPVKEAL
VVFARMMEFGFKPDEKTLASVVSACASLCAIREGKEIHARILKSDKLRDDLIICNALVDM
YAKFGRIAEARWIFDRMPVRSVVSDTCLVSGYARVASVKTARAVFLGMIERNVVSWNALI
AGYTQNGNNEEALNLFLMLKREPVWPTHYTFGNLLNACANLADLKLGRQAHAHILKHGFR
FQNGPEPDVFVGNALIDMYMKCGSVEDGSCVFTKMLDRDWVSWNAIIVGYAQNGHAMEAL
ETFKVMLVSGEKPDHVTMIGVLCACSHAGLVEEGRQYFYSMDTEYGLTPFKDHYTCMVDL
LGKAGCLEEAKDLIESMPMPPDSVVWGSLLAACKIHMEIELGKYVAEKLLEIDPTNSGPY
VLLSNMYAEQGRWQDVKMVRKLMRQRGVVKQPGCSWIEIQSQVHVFMVKDRRHAQKKEIY
LILNTLTKLMKLSGYVPNAGHLDGDEEQTMLDFSSSEEFEEPVIAAIAC*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400029994
Transcript Infomation

pacid=37474258 locus=PGSC0003DMG400011511 ID=PGSC0003DMT400029994.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACAAAAGACACTTCTTTATTCAAAAAACTCATCACTTGGGACCTCTTCTCCCTCCCA
AACTCAACACCCTTCGCCAAGATTCTAGATTCTTACATCAATTCCAAGTCCCAATATGTC
ATACAAACTGTCCATTGTCGAATTCTCAAGACCCATTTTAGCTCCGAAGTTTTCATAAAC
AACAAGCTAATCGACACTTATGGGAAATCTGGAATGTTAAAGTATGCCAAGAAGGTGTTT
GATAAAATGCCTGAGAGAAACACCTTTACTTGGAATTCCATGATAAATGCATATACAGCA
TCAAGATTGGTTTTTGAGGCTGAGGAACTGTTTTACTTGATGCCTGAGCCTGATCAATGC
TCGTGGAATTTGATGGTTTCGAGCTTTGCTCAATGTGAATTGTTTGATTCGTCAATAGAG
TTTCTTGTGAGAATGCACAAAGAAGATTTTGTTTTGAATGAGTATGGTTATGGAAGTGGT
TTAAGTGCTTGTGCAGGGTTGAGGGACTTGAGAATGGGAACTCAACTTCATGCCTCGGTT
GCTAAATCGAGATATTCGAGAAGTGTTTACATGGGTTCTGCGCTTATTGACATGTACTCG
AAAACTGGTAATGTGGATTGTGCAGCAAAGGTGTTTAATGGGATGTGTGAGCGTAATGTG
GTGTCGTGGAATAGTTTACTTTCTTGTTATGAGCAAAATGGGCCAGTGAAGGAGGCTCTT
GTGGTATTCGCTAGGATGATGGAGTTCGGGTTTAAACCAGATGAGAAGACCTTGGCAAGT
GTAGTAAGTGCTTGTGCGAGTTTGTGTGCGATAAGAGAAGGTAAGGAAATTCATGCCCGA
ATTTTGAAGTCGGATAAGCTTAGGGATGATCTTATCATATGCAATGCATTGGTTGATATG
TACGCAAAGTTTGGGAGAATTGCTGAAGCTAGATGGATTTTTGATAGGATGCCAGTCAGA
AGTGTGGTGTCCGACACCTGTTTGGTAAGTGGTTATGCGAGAGTTGCAAGTGTGAAGACT
GCAAGAGCCGTGTTTTTGGGGATGATTGAAAGGAATGTTGTGTCTTGGAATGCTCTTATT
GCTGGATATACACAGAATGGGAACAATGAAGAGGCACTAAATCTCTTTCTTATGCTAAAA
AGAGAACCTGTTTGGCCAACTCATTATACGTTTGGGAATCTCCTTAATGCATGTGCAAAT
TTAGCTGATCTGAAGCTTGGGAGGCAGGCTCATGCACATATTTTGAAGCATGGATTTCGT
TTCCAGAATGGACCCGAGCCTGATGTTTTTGTGGGAAATGCTCTCATAGACATGTATATG
AAATGTGGATCAGTTGAAGATGGTAGCTGTGTATTCACAAAAATGCTGGACAGAGACTGG
GTTTCATGGAATGCCATAATAGTTGGATATGCACAAAATGGGCATGCTATGGAAGCTCTT
GAAACTTTCAAGGTTATGTTAGTATCCGGAGAGAAGCCAGATCACGTGACTATGATTGGA
GTTCTATGTGCATGTAGTCATGCAGGATTGGTTGAGGAGGGGCGTCAATATTTCTATTCC
ATGGACACAGAGTATGGGTTGACACCGTTTAAGGACCACTATACATGCATGGTCGATTTA
CTTGGCAAGGCTGGTTGCTTAGAAGAGGCAAAGGATTTGATTGAATCCATGCCGATGCCA
CCAGATAGTGTAGTATGGGGGTCTTTGCTCGCTGCATGTAAAATTCACATGGAAATTGAG
TTGGGAAAGTATGTAGCTGAGAAGCTTTTGGAGATTGATCCTACAAATTCTGGCCCTTAT
GTTCTTCTATCAAACATGTATGCTGAACAAGGAAGATGGCAAGATGTCAAAATGGTCCGA
AAACTTATGAGACAACGAGGCGTTGTTAAACAGCCTGGTTGTAGTTGGATTGAAATACAA
AGCCAGGTTCATGTTTTCATGGTAAAAGATAGGAGACACGCCCAGAAAAAAGAGATATAT
TTGATATTGAATACACTAACTAAATTGATGAAGCTTTCTGGCTATGTCCCAAATGCTGGT
CATTTGGATGGTGATGAGGAGCAAACCATGTTGGATTTTTCCTCATCTGAAGAGTTTGAA
GAACCTGTAATAGCTGCCATTGCATGCTAA