Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400029644
CDS Infomation

pacid=37455217 polypeptide=PGSC0003DMP400020190 locus=PGSC0003DMG400011398 ID=PGSC0003DMT400029644.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGCCTCCATCCAGAAGTCAAGTGGGCACAAAGGCCTGATGTGGTGTATCTCACTGTG
ATGCTACCAGATGCTAAAGATCCAAAAGTAAACTTGGATCCAGAAGGAGTGTTTAACTTC
TCTGCTAGTGCTGGGGCAGGTGACCGTCACTATGAGTTGAAGCTTGAGCTTCAGGATAAA
GTTAATGTTGAGGAGAGCAAAATTAGTACCGGCGTGAGAAGCATATTCTGCATTTTGCAA
AAAGCAGAGCCAAAATGGTGGACTAAATTATTGCGTGGAGACGGTAAAGCACCACACTAT
GTGAAGGTAGATTGGGACAAGTGGGTGGATGAAGATGATGAACCTGATGCTGGTCCTGGG
GATATGGATATGAATTCAATGGATTTCTCAAAATTCGGTGATATGGGTGGAATGGGAGGT
GATATGGCTTCAATGATGGGCGGAATGGGCGGAATGGGTGGAATGGGCGGAATGATGGGT
GGAATGGGCGGAATGGGTGGGATGATGGGAGGAATGGGTGGCATGATGGGTGGAATGGGA
GGTGATATGGCTGGAATGATGGGTGGAATGGGAGGTGATATGGGGGATGACCTTGATGAG
AGTGACGATGAAGAGCAAGAAGTGATAAAGCCTTCTGCTAAAGCTGCTGAGGTGGTAGAT
GCGAAACCTAAGGCAGAAGGTGAAGCTGCATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400020190
PEP Infomation

pacid=37455217 transcript=PGSC0003DMT400029644 locus=PGSC0003DMG400011398 ID=PGSC0003DMT400029644.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSLHPEVKWAQRPDVVYLTVMLPDAKDPKVNLDPEGVFNFSASAGAGDRHYELKLELQDK
VNVEESKISTGVRSIFCILQKAEPKWWTKLLRGDGKAPHYVKVDWDKWVDEDDEPDAGPG
DMDMNSMDFSKFGDMGGMGGDMASMMGGMGGMGGMGGMMGGMGGMGGMMGGMGGMMGGMG
GDMAGMMGGMGGDMGDDLDESDDEEQEVIKPSAKAAEVVDAKPKAEGEAA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400029644
Transcript Infomation

pacid=37455217 locus=PGSC0003DMG400011398 ID=PGSC0003DMT400029644.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGCCTCCATCCAGAAGTCAAGTGGGCACAAAGGCCTGATGTGGTGTATCTCACTGTG
ATGCTACCAGATGCTAAAGATCCAAAAGTAAACTTGGATCCAGAAGGAGTGTTTAACTTC
TCTGCTAGTGCTGGGGCAGGTGACCGTCACTATGAGTTGAAGCTTGAGCTTCAGGATAAA
GTTAATGTTGAGGAGAGCAAAATTAGTACCGGCGTGAGAAGCATATTCTGCATTTTGCAA
AAAGCAGAGCCAAAATGGTGGACTAAATTATTGCGTGGAGACGGTAAAGCACCACACTAT
GTGAAGGTAGATTGGGACAAGTGGGTGGATGAAGATGATGAACCTGATGCTGGTCCTGGG
GATATGGATATGAATTCAATGGATTTCTCAAAATTCGGTGATATGGGTGGAATGGGAGGT
GATATGGCTTCAATGATGGGCGGAATGGGCGGAATGGGTGGAATGGGCGGAATGATGGGT
GGAATGGGCGGAATGGGTGGGATGATGGGAGGAATGGGTGGCATGATGGGTGGAATGGGA
GGTGATATGGCTGGAATGATGGGTGGAATGGGAGGTGATATGGGGGATGACCTTGATGAG
AGTGACGATGAAGAGCAAGAAGTGATAAAGCCTTCTGCTAAAGCTGCTGAGGTGGTAGAT
GCGAAACCTAAGGCAGAAGGTGAAGCTGCATAG