Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400029590
CDS Infomation	pacid=37456073 polypeptide=PGSC0003DMP400020148 locus=PGSC0003DMG402011377 ID=PGSC0003DMT400029590.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCTTCTGAATTGATCTACCGCGGACCGGAATCACTTCCGGTTCCCGACAGTTACACT CCCAAACCACACAAACCATGGTTTACTGTTATTCGTCCCCTTCGTTACTTGCTACGAGAA CAGAGAATCGTTTTTCTATTCGCAGGCATTGCTATCGCTTCTCTAATTTTTGCCTTTTTA CCTTCTTCTCGTTCCGGAGGATCGAACTACGCAAACACCGGGATCTACGATTCGTACTTA CCGTCGGAGTCGACTCAGTCTCAGGTGGCTCACCGGATTATCTATCAGAATCGGGTCGGG TTCGGGTCGTTTAATTCCGGTGGGAAGATCCCGTTGGGATTGCAGCGGAAGAGTTTGAGG ATCGTGGTGACTGGTGGTGCTGGTTTTGTAGGTAGTCATCTTGTGGACCGTTTGATTGCG AGAGGTGATAGCGTGATCGTCGTTGATAATTTCTTCACCGGACGGAAAGAAAATGTTATG CATCATTTTGGTAACCCTAGGTTTGAGCTTATTAGACACGATGTTGTTGAGCCACTTTTG CTTGAAGTTGACCAGATCTATCATCTCGCTTGCCCTGCTTCTCCCGTTCATTACAAGCAT AATCCCGTCAAGACTATTAAGACTAATGTGGTGGGGACTTTGAACATGCTGGGATTGGCT AAAAGAGTCGGTGCGAGGTTTTTGCTAACGAGCACCAGCGAGGTGTACGGTGATCCTTTA GAACATCCACAGAAGGAGACATACTGGGGCAATGTTAATCCTATTGGTGTCCGAAGTTGC TACGATGAGGGAAAACGTACAGCTGAAACATTGACCATGGATTATCACAGAGGTGCTGAA GTTGAGGTGAGAATTGCTAGGATCTTTAACACTTATGGACCTCGTATGTGCATTGATGAT GGTCGCGTTGTCAGCAACTTTGTCGCTCAGGCTTTAAGGAAGGAGCCTTTGACAGTTTAT GGTGATGGGAAACAAACAAGAAGTTTCCAATTTGTTTCAGATCTGGTTGAAGGCCTAATG CGGTTGATGGAAGGAGAACATGTCGGACCCTTCAACCTCGGAAACCCTGGTGAATTCACA ATGCTTGAACTTGCTAAGGTGGTCCAGGAAACCATTGACCCAAATGCACAGATTGTACAC AAACCAAACACAGAAGATGACCCACACAAGAGGAAACCTGATATCTCAAAGGCTAAAGAG TTACTTGGTTGGGAACCAAAAGTGGCTCTTAGAAATGGTCTACCTATGATGGTTCAAGAC TTTAGGCAACGTATTTTCGGTGATCACAAAGAAGACAGTGGAAAGATCACCACAGCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400020148
PEP Infomation	pacid=37456073 transcript=PGSC0003DMT400029590 locus=PGSC0003DMG402011377 ID=PGSC0003DMT400029590.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MASELIYRGPESLPVPDSYTPKPHKPWFTVIRPLRYLLREQRIVFLFAGIAIASLIFAFL PSSRSGGSNYANTGIYDSYLPSESTQSQVAHRIIYQNRVGFGSFNSGGKIPLGLQRKSLR IVVTGGAGFVGSHLVDRLIARGDSVIVVDNFFTGRKENVMHHFGNPRFELIRHDVVEPLL LEVDQIYHLACPASPVHYKHNPVKTIKTNVVGTLNMLGLAKRVGARFLLTSTSEVYGDPL EHPQKETYWGNVNPIGVRSCYDEGKRTAETLTMDYHRGAEVEVRIARIFNTYGPRMCIDD GRVVSNFVAQALRKEPLTVYGDGKQTRSFQFVSDLVEGLMRLMEGEHVGPFNLGNPGEFT MLELAKVVQETIDPNAQIVHKPNTEDDPHKRKPDISKAKELLGWEPKVALRNGLPMMVQD FRQRIFGDHKEDSGKITTA*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400029590
Transcript Infomation	pacid=37456073 locus=PGSC0003DMG402011377 ID=PGSC0003DMT400029590.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCTTCTGAATTGATCTACCGCGGACCGGAATCACTTCCGGTTCCCGACAGTTACACT CCCAAACCACACAAACCATGGTTTACTGTTATTCGTCCCCTTCGTTACTTGCTACGAGAA CAGAGAATCGTTTTTCTATTCGCAGGCATTGCTATCGCTTCTCTAATTTTTGCCTTTTTA CCTTCTTCTCGTTCCGGAGGATCGAACTACGCAAACACCGGGATCTACGATTCGTACTTA CCGTCGGAGTCGACTCAGTCTCAGGTGGCTCACCGGATTATCTATCAGAATCGGGTCGGG TTCGGGTCGTTTAATTCCGGTGGGAAGATCCCGTTGGGATTGCAGCGGAAGAGTTTGAGG ATCGTGGTGACTGGTGGTGCTGGTTTTGTAGGTAGTCATCTTGTGGACCGTTTGATTGCG AGAGGTGATAGCGTGATCGTCGTTGATAATTTCTTCACCGGACGGAAAGAAAATGTTATG CATCATTTTGGTAACCCTAGGTTTGAGCTTATTAGACACGATGTTGTTGAGCCACTTTTG CTTGAAGTTGACCAGATCTATCATCTCGCTTGCCCTGCTTCTCCCGTTCATTACAAGCAT AATCCCGTCAAGACTATTAAGACTAATGTGGTGGGGACTTTGAACATGCTGGGATTGGCT AAAAGAGTCGGTGCGAGGTTTTTGCTAACGAGCACCAGCGAGGTGTACGGTGATCCTTTA GAACATCCACAGAAGGAGACATACTGGGGCAATGTTAATCCTATTGGTGTCCGAAGTTGC TACGATGAGGGAAAACGTACAGCTGAAACATTGACCATGGATTATCACAGAGGTGCTGAA GTTGAGGTGAGAATTGCTAGGATCTTTAACACTTATGGACCTCGTATGTGCATTGATGAT GGTCGCGTTGTCAGCAACTTTGTCGCTCAGGCTTTAAGGAAGGAGCCTTTGACAGTTTAT GGTGATGGGAAACAAACAAGAAGTTTCCAATTTGTTTCAGATCTGGTTGAAGGCCTAATG CGGTTGATGGAAGGAGAACATGTCGGACCCTTCAACCTCGGAAACCCTGGTGAATTCACA ATGCTTGAACTTGCTAAGGTGGTCCAGGAAACCATTGACCCAAATGCACAGATTGTACAC AAACCAAACACAGAAGATGACCCACACAAGAGGAAACCTGATATCTCAAAGGCTAAAGAG TTACTTGGTTGGGAACCAAAAGTGGCTCTTAGAAATGGTCTACCTATGATGGTTCAAGAC TTTAGGCAACGTATTTTCGGTGATCACAAAGAAGACAGTGGAAAGATCACCACAGCTTAA