Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400029317
CDS Infomation

pacid=37478766 polypeptide=PGSC0003DMP400019952 locus=PGSC0003DMG400011265 ID=PGSC0003DMT400029317.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAACTACTTACTTTCTAGCCTTATCCCAAAAATACAAAATCCAACTGCTGATTACCAA
ATTTTGGCAAATGTACTCAAATGTTGTGCTTCCATATCAGATGGGATGTTGGGGAAAGCT
TTACATACTTGTGTTATTAAGTTAGGTCATCATTCATGTCAATTTGTTATAAAAGCCTTG
CTTAATATGTATGCTAAATCTAAACATCTTGATGATTGTCAAAAGCTTTTCCGTACGGTT
AACTATAGTGACACAGTCATGTGGAATATTGTCTTGTCTGGATTTGCTTGTTCGCCGTTA
CATGAAATGGAGATGGAAAAGTTGTTTAATTTAATGCAAAGAGCATGTTATCCTAAGCCA
ACTTCTGTTACTCTTGCTATTGTTGTTCCTGTGATTGCTCGCTCTGGAGATTTGGGTGCT
GGAAAAAGTCTTCATTGTTACGCGGTAAAGAATGGGTTGGATTGTGAAACGTTGGTAGGA
AATGCTTTCGTATCCATGTATGCGAAATCAGGGAATATTTTAGATGCGGAAGCTACTTTT
CGTGGAATTTCTGATAAAGATGTTGTTTCATGGAATGCAATGATAGCAGGTTTGATAGAG
AATAAGCTTACAGATAGGGCGTTTGAATTGTTCAGGTTGATGGTGAGAGGTTCTGTTCTA
CCTAATTATGCAACGATTGCTAATATTATTCCTACCTGTCCTAGTTTAGGAGGGATAAAT
GGTTACCAGTTGGGAAGGCAGATGCATTGTTATGTTTTGCGACGGGTTGAGTTGTTGTCA
GAAGCTACTGTCATCAATGCTCTTTTGAGCTGCTATTTGAGGGTTGGCAATTTTGAAGGA
GCAGAGACTTTGTTCCGGAATATGAAAAGTAAAGATCTGGTATCGTGGAACTCAATAATT
GCTGGATATGCAGCAAATGGTGAATGGTTGAAGACATTGGATTTTTTCCGTGAATTCACT
AAAGAGGAGATGAGTGGACCAGACTCTGTTACTCTTATGAGCATTCTTCCAGTATGTCCA
CAGCTCAATAATGTGTTGATCGGGAAGCAGATCCATGGGTATGTAATTCGTCATAGTTTC
CTCCATCAGGATATCTCTGTGATTAATGCCCTTATAAGTTTTTATGCAAAATGTGGAAAC
ATTAAAGAGGCATGTCACCTATTTTTGTTGACTTCTAATAAAGACTTGATATCCTGGAAC
ACTATGCTTGATGCCTTAGCAGAAAACCAACTTCACGAACAATTTATTATCTTGTTAAAG
GAGATGTTAAGAGAGGGGATGAAAGCTGACTCCATCACATTATTGGCTGTGGTGCACTAT
TTTGCTAACATTTCCAGACTGGATAAGGTTAAAGAAGCACATGGTTTTTCAGTAAGATCT
GGTATCTTGTTAAGTTATACTGAACCTACTCTCGCTAATGCCTTACTTGATGCATATGCA
AAGTGTTGCAATTTAAAATATGCTAACAGAATATTTGAGAATTTACCAGGAAGCAATAAT
GTAATCACATGCAACTCAATGATCTCAGGGTTTGTGAAATATGGTCTGCATGAAGATGCA
CATGGCATATTCAAGAGGATGACCGAGAGGGATCTTACCACTTGGAATTTGATGGTGAGA
GCTTATGCTGAAAATGATTGTCCTGATCAAGCAGTGAGTCTGTTTACCGAGTTACAGCAT
CACAAAATGAGGCCTGATGCCATGTCCATTTTGAGCCTCCTTCCTGTTTGTGCTCAAATG
GCCTCAAGCAACTTGCTAAAGCAGTGCCATGCATATGTGATAAGGGCTTTTCTGGATGAT
GATGTTTATCTGATTGGGGCTTTCATAGATGTTTATTCTAAATGTGCTACTCTAAAATAT
GCATACAAGCTTTTCCAATCATCTCCAGTCAAAGATCTTGTTATGTTTACAGCAATGGTT
GGAGGGTATGCTATGCATGGAATGGGAGAAGAAGCACTTGGGATATTCTATCATATGCTT
GAGATGGACTTTAGACCAGATCATGTTATAATAACTACAGTGCTATCTGCTTGTAGTCAT
GCTGGCCTTGTGGATGAAGGGTTAAAGATCTTTGATTCAATGGAAAAGACGCATCAAATC
AAACCTAGCATGGAGCATTATGCCTGTGTGGTGGATCTACTTGCACGTGGAGGTAGAATT
AAAGATGCGTTTTCCTTTGTGACCCAGTTGCCCTTTCAAGCTGATGCGGATGTATGGGGA
ACACTTCTGGGTGCCTGTAAAATCCATCAGGAGGTTGATGTGGGCTGTGCTGCGGCTAAT
CACCTGTTTCAAGTTAATGCTAATGATATCGGGAATTATATAGTCATGTCAAATCTGTAT
GCTGCAAATGCTAGATGGGATGGCGTCTTAGAGATAAGGAGGTCTATGAAAATGAGAGAT
CTTAAGAAGCCAGTTGGTTGCAGTTGGATTGAAGTGGAAAGGAAGAAAAGTGTATTTGCT
GCTGGTGACTATTCTCACCAACAGAGAGGACTCATATATGAAACATTAAGAGTCTTAGAT
GAACAAATCAAAGAGCTATATGAGTATGACTTATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400019952
PEP Infomation

pacid=37478766 transcript=PGSC0003DMT400029317 locus=PGSC0003DMG400011265 ID=PGSC0003DMT400029317.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MNYLLSSLIPKIQNPTADYQILANVLKCCASISDGMLGKALHTCVIKLGHHSCQFVIKAL
LNMYAKSKHLDDCQKLFRTVNYSDTVMWNIVLSGFACSPLHEMEMEKLFNLMQRACYPKP
TSVTLAIVVPVIARSGDLGAGKSLHCYAVKNGLDCETLVGNAFVSMYAKSGNILDAEATF
RGISDKDVVSWNAMIAGLIENKLTDRAFELFRLMVRGSVLPNYATIANIIPTCPSLGGIN
GYQLGRQMHCYVLRRVELLSEATVINALLSCYLRVGNFEGAETLFRNMKSKDLVSWNSII
AGYAANGEWLKTLDFFREFTKEEMSGPDSVTLMSILPVCPQLNNVLIGKQIHGYVIRHSF
LHQDISVINALISFYAKCGNIKEACHLFLLTSNKDLISWNTMLDALAENQLHEQFIILLK
EMLREGMKADSITLLAVVHYFANISRLDKVKEAHGFSVRSGILLSYTEPTLANALLDAYA
KCCNLKYANRIFENLPGSNNVITCNSMISGFVKYGLHEDAHGIFKRMTERDLTTWNLMVR
AYAENDCPDQAVSLFTELQHHKMRPDAMSILSLLPVCAQMASSNLLKQCHAYVIRAFLDD
DVYLIGAFIDVYSKCATLKYAYKLFQSSPVKDLVMFTAMVGGYAMHGMGEEALGIFYHML
EMDFRPDHVIITTVLSACSHAGLVDEGLKIFDSMEKTHQIKPSMEHYACVVDLLARGGRI
KDAFSFVTQLPFQADADVWGTLLGACKIHQEVDVGCAAANHLFQVNANDIGNYIVMSNLY
AANARWDGVLEIRRSMKMRDLKKPVGCSWIEVERKKSVFAAGDYSHQQRGLIYETLRVLD
EQIKELYEYDL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400029317
Transcript Infomation

pacid=37478766 locus=PGSC0003DMG400011265 ID=PGSC0003DMT400029317.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAACTACTTACTTTCTAGCCTTATCCCAAAAATACAAAATCCAACTGCTGATTACCAA
ATTTTGGCAAATGTACTCAAATGTTGTGCTTCCATATCAGATGGGATGTTGGGGAAAGCT
TTACATACTTGTGTTATTAAGTTAGGTCATCATTCATGTCAATTTGTTATAAAAGCCTTG
CTTAATATGTATGCTAAATCTAAACATCTTGATGATTGTCAAAAGCTTTTCCGTACGGTT
AACTATAGTGACACAGTCATGTGGAATATTGTCTTGTCTGGATTTGCTTGTTCGCCGTTA
CATGAAATGGAGATGGAAAAGTTGTTTAATTTAATGCAAAGAGCATGTTATCCTAAGCCA
ACTTCTGTTACTCTTGCTATTGTTGTTCCTGTGATTGCTCGCTCTGGAGATTTGGGTGCT
GGAAAAAGTCTTCATTGTTACGCGGTAAAGAATGGGTTGGATTGTGAAACGTTGGTAGGA
AATGCTTTCGTATCCATGTATGCGAAATCAGGGAATATTTTAGATGCGGAAGCTACTTTT
CGTGGAATTTCTGATAAAGATGTTGTTTCATGGAATGCAATGATAGCAGGTTTGATAGAG
AATAAGCTTACAGATAGGGCGTTTGAATTGTTCAGGTTGATGGTGAGAGGTTCTGTTCTA
CCTAATTATGCAACGATTGCTAATATTATTCCTACCTGTCCTAGTTTAGGAGGGATAAAT
GGTTACCAGTTGGGAAGGCAGATGCATTGTTATGTTTTGCGACGGGTTGAGTTGTTGTCA
GAAGCTACTGTCATCAATGCTCTTTTGAGCTGCTATTTGAGGGTTGGCAATTTTGAAGGA
GCAGAGACTTTGTTCCGGAATATGAAAAGTAAAGATCTGGTATCGTGGAACTCAATAATT
GCTGGATATGCAGCAAATGGTGAATGGTTGAAGACATTGGATTTTTTCCGTGAATTCACT
AAAGAGGAGATGAGTGGACCAGACTCTGTTACTCTTATGAGCATTCTTCCAGTATGTCCA
CAGCTCAATAATGTGTTGATCGGGAAGCAGATCCATGGGTATGTAATTCGTCATAGTTTC
CTCCATCAGGATATCTCTGTGATTAATGCCCTTATAAGTTTTTATGCAAAATGTGGAAAC
ATTAAAGAGGCATGTCACCTATTTTTGTTGACTTCTAATAAAGACTTGATATCCTGGAAC
ACTATGCTTGATGCCTTAGCAGAAAACCAACTTCACGAACAATTTATTATCTTGTTAAAG
GAGATGTTAAGAGAGGGGATGAAAGCTGACTCCATCACATTATTGGCTGTGGTGCACTAT
TTTGCTAACATTTCCAGACTGGATAAGGTTAAAGAAGCACATGGTTTTTCAGTAAGATCT
GGTATCTTGTTAAGTTATACTGAACCTACTCTCGCTAATGCCTTACTTGATGCATATGCA
AAGTGTTGCAATTTAAAATATGCTAACAGAATATTTGAGAATTTACCAGGAAGCAATAAT
GTAATCACATGCAACTCAATGATCTCAGGGTTTGTGAAATATGGTCTGCATGAAGATGCA
CATGGCATATTCAAGAGGATGACCGAGAGGGATCTTACCACTTGGAATTTGATGGTGAGA
GCTTATGCTGAAAATGATTGTCCTGATCAAGCAGTGAGTCTGTTTACCGAGTTACAGCAT
CACAAAATGAGGCCTGATGCCATGTCCATTTTGAGCCTCCTTCCTGTTTGTGCTCAAATG
GCCTCAAGCAACTTGCTAAAGCAGTGCCATGCATATGTGATAAGGGCTTTTCTGGATGAT
GATGTTTATCTGATTGGGGCTTTCATAGATGTTTATTCTAAATGTGCTACTCTAAAATAT
GCATACAAGCTTTTCCAATCATCTCCAGTCAAAGATCTTGTTATGTTTACAGCAATGGTT
GGAGGGTATGCTATGCATGGAATGGGAGAAGAAGCACTTGGGATATTCTATCATATGCTT
GAGATGGACTTTAGACCAGATCATGTTATAATAACTACAGTGCTATCTGCTTGTAGTCAT
GCTGGCCTTGTGGATGAAGGGTTAAAGATCTTTGATTCAATGGAAAAGACGCATCAAATC
AAACCTAGCATGGAGCATTATGCCTGTGTGGTGGATCTACTTGCACGTGGAGGTAGAATT
AAAGATGCGTTTTCCTTTGTGACCCAGTTGCCCTTTCAAGCTGATGCGGATGTATGGGGA
ACACTTCTGGGTGCCTGTAAAATCCATCAGGAGGTTGATGTGGGCTGTGCTGCGGCTAAT
CACCTGTTTCAAGTTAATGCTAATGATATCGGGAATTATATAGTCATGTCAAATCTGTAT
GCTGCAAATGCTAGATGGGATGGCGTCTTAGAGATAAGGAGGTCTATGAAAATGAGAGAT
CTTAAGAAGCCAGTTGGTTGCAGTTGGATTGAAGTGGAAAGGAAGAAAAGTGTATTTGCT
GCTGGTGACTATTCTCACCAACAGAGAGGACTCATATATGAAACATTAAGAGTCTTAGAT
GAACAAATCAAAGAGCTATATGAGTATGACTTATAG