Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400029152
CDS Infomation

pacid=37434107 polypeptide=PGSC0003DMP400019833 locus=PGSC0003DMG400011207 ID=PGSC0003DMT400029152.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCCTCTTTGAAATTACCCCTTTATGTAGATAGTTCATGGGAATCCAAGAAACTAAAT
TGCACAGTAAAAGCTTTGAACTTTACTGATTCTAAGTGTTGGGTTCCCTCATTTTTGGGT
GGTGGTGCATTTGTGGTTAGCCCATTTTGTAATTTGAAGCACATTAGAGTTTCAAGATTA
GAAACTGAGGAATTAGAGACTTCTGAGTTGAGTTTAGATAATGAAGGGGTTGATGGTTTT
GAAGGTGAGTTAGGAAATGACAGTTTTGTTACTGAAAGACCAAATCTTGGGAGGGATTCT
CAGAAAGGGAAGTTTAATGTTTGGAAAAGATTTAGGAGGGTGAAGAAGGTACCGAGAGAC
TCGAATCATAGGTCTAGTTTTAGATTGAAAGATAGGAAAAATGGAATGGAAGAAAATCCC
ATGATTGCGTTTGATGTAAATAGTGATGAGAGTGTGATAGATAGCCAAAATGGGGTTGAT
TTTCCTGATGAGAATATCGGGTCTGACTCAAGTTTGGATCAGTGCAATGCAATATTGAAA
GAGCTCGAAAGGGGAAATGATGGGAAAGCGTTGAGTTTTTTCCGATGGATGAGGAAAAAT
GGGAAGTTAAAGCAAAATGTTACTGCCTATAATTTGATACTCCGCGTCTTGGGGAGAAGA
GGCGATTGGGATGGGGCGGAGGGAATGATTAAGGAAATGAGTATGGAGTCAGGTTGTAAG
CTTACATATCAAGTTTTCAATACCCTTATTTATGCTTGTCATAAAAAAGGGCTCGTGGAG
TTAGGTGCTAAGTGGTTTCACATGATGTTGGAAAATGGAGTTCAGCCAAATATAGCGACT
TTTGGGATGCTAATGGCTCTCTATCAGAAAGGATGGCATGTTGAGGAAGCAGAATTTGCA
TTTTCAATGATGAGGAATCTCAAAATTATGTGCCAGTCTGCATATTCCTCTATGTTGACG
ATATATACGCGAATGAGATTGTATGATAAAGCAGAAGAAATCATTGGCTTTTTGAGGAAA
GATGAAGTAATTCTGAATCTAGAGAATTGGTTGGTTCTGCTTAATGCTTACTGTCAACAA
GGCAAGTTACTCGAGGCTGAGCAGGTCTTAGCTTCCATGAACGAAGCTGGTTTTTCGCCA
AATATAGTTGCATACAACACATTGATCACTGGATATGGGAAGATTTCCAACATGCTTGAT
GCACAACGCTTGTTTGGTGACCTTAAAAGGGTTGGAGTGGATCCTGATGAAACAACTTAC
AGGTCTATGATAGAAGGGTGGGGTCGGACAGACAATTATGAGGAAGCAAATAGATACTAT
GTGGAACTGAAAAGACTTGGACACAAGCCAAACTCGTCTAATTTGTACACAATGCTAAAT
TTACAAGTCAAGCATGGAGACGAAGTGGATGTTGTTAGAACTATTGAGGAAATGATGCAC
ACTGGCGGCGAAAAGTCAACCATCCTTGGCATTCTTTTGCAAGCATATGAGAAGCTTGAA
CTCATTCGTGAAGTTCCTTCAATTTTGGGAGGTTCTTTATATGATCATGTTTTGAGAAAC
CAGATAGCTTGTTCAAGTCTGGTGATGGCTTATGTGAAAAACAGCATGATAGATGATGCG
TTAAAAGTCTTACGGGAAAAGCAGTGGAAGGATGCTTTATTTGAGGACAACTTGTACCAT
TTGTTAATTTGCTCATGCAAAGATTTTGGGCATCCAGAGAATGCTGTGAAAGTGTTCACT
TGTATGCCAAAATCTGATAAGCCTAACTTACATATAATATGCACTATGATAGACATTTAC
AGTACAAACAACAATTTTGCTGAAGCTGAAAAGCTTTATCTAATGTTGAAGAATTCAAAT
GTCAAATTGGACACAATAACTTTCAGTGTTGTGGTAAGGATGTATATGAAATCTGGAGCC
TTAGAAGAAGCCTGCTCTGTGTTGGATGATATGGACAAACAAAAAAACATTGTTCCAGAC
ACATATTTGCTCCGTGATATGCTCCGGATCTACCAGCGATGTGACAAGAAGGACAAATTG
GCAGATCTTTACTACAAACTTGTGAAAAGAGGAGTCATCTGGGATCAGGAAATGTACAGC
TGTGTCATAAACTGCTGTGCCCGTGCACTGCCAGTTGATGAGCTTTCGAGGCTTTTCGAT
GAGATGCTTAAACGTGGATTCTTACCTAATACAGTCACCTTTAATGTCATGCTTGACGTA
TATGGGAAATCCAGACTCTTCAAAAGAGCAAGAGAGGTTTTTTCAATGGCTAAAAAGTGT
GGTTTGGCTGATGTTATCTCTTACAACACTCTCATAGCTGCATATGGGAGAAGCAAAGAC
TTCAAGAATATGTCATCAACTGTCAAGAAAATGCACTTCAATGGCTTTTCAGTTTCTCTT
GAAGCCTACAATTGTATGTTAGATGCCTATGGGAAAGAAGGACAAATGGAGAAATTCCGT
AATGTCTTGGAAAGACTGAAGGAATCTGGTCACTCTTCTGATCATTACACTTACAACATT
ATGATAAACATTTATGGCGAGCTAGGTTGGATTGAAGAAGTTTCGAATGTACTGGCAGAA
TTAAAGGAATCAGGATCAATTGGACCTGATTTGTGCAGCTATAACACATTGATAAAGGCT
TATGGAATTGCTGGAATGGTTGAACGTGCAGTAGATTTGGTCAAGGAAATGCGCAAAAAT
GGAATTGAACCTGATCGAATAACCTACACTAACCTAATCAATGCATTACGGAAAAATGAT
AAGTTTCTTGAGGCTGTTAAGTGGTCTTTATGGATGAAGCAGATTGGATTATAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400019833
PEP Infomation

pacid=37434107 transcript=PGSC0003DMT400029152 locus=PGSC0003DMG400011207 ID=PGSC0003DMT400029152.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MASLKLPLYVDSSWESKKLNCTVKALNFTDSKCWVPSFLGGGAFVVSPFCNLKHIRVSRL
ETEELETSELSLDNEGVDGFEGELGNDSFVTERPNLGRDSQKGKFNVWKRFRRVKKVPRD
SNHRSSFRLKDRKNGMEENPMIAFDVNSDESVIDSQNGVDFPDENIGSDSSLDQCNAILK
ELERGNDGKALSFFRWMRKNGKLKQNVTAYNLILRVLGRRGDWDGAEGMIKEMSMESGCK
LTYQVFNTLIYACHKKGLVELGAKWFHMMLENGVQPNIATFGMLMALYQKGWHVEEAEFA
FSMMRNLKIMCQSAYSSMLTIYTRMRLYDKAEEIIGFLRKDEVILNLENWLVLLNAYCQQ
GKLLEAEQVLASMNEAGFSPNIVAYNTLITGYGKISNMLDAQRLFGDLKRVGVDPDETTY
RSMIEGWGRTDNYEEANRYYVELKRLGHKPNSSNLYTMLNLQVKHGDEVDVVRTIEEMMH
TGGEKSTILGILLQAYEKLELIREVPSILGGSLYDHVLRNQIACSSLVMAYVKNSMIDDA
LKVLREKQWKDALFEDNLYHLLICSCKDFGHPENAVKVFTCMPKSDKPNLHIICTMIDIY
STNNNFAEAEKLYLMLKNSNVKLDTITFSVVVRMYMKSGALEEACSVLDDMDKQKNIVPD
TYLLRDMLRIYQRCDKKDKLADLYYKLVKRGVIWDQEMYSCVINCCARALPVDELSRLFD
EMLKRGFLPNTVTFNVMLDVYGKSRLFKRAREVFSMAKKCGLADVISYNTLIAAYGRSKD
FKNMSSTVKKMHFNGFSVSLEAYNCMLDAYGKEGQMEKFRNVLERLKESGHSSDHYTYNI
MINIYGELGWIEEVSNVLAELKESGSIGPDLCSYNTLIKAYGIAGMVERAVDLVKEMRKN
GIEPDRITYTNLINALRKNDKFLEAVKWSLWMKQIGL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400029152
Transcript Infomation

pacid=37434107 locus=PGSC0003DMG400011207 ID=PGSC0003DMT400029152.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCCTCTTTGAAATTACCCCTTTATGTAGATAGTTCATGGGAATCCAAGAAACTAAAT
TGCACAGTAAAAGCTTTGAACTTTACTGATTCTAAGTGTTGGGTTCCCTCATTTTTGGGT
GGTGGTGCATTTGTGGTTAGCCCATTTTGTAATTTGAAGCACATTAGAGTTTCAAGATTA
GAAACTGAGGAATTAGAGACTTCTGAGTTGAGTTTAGATAATGAAGGGGTTGATGGTTTT
GAAGGTGAGTTAGGAAATGACAGTTTTGTTACTGAAAGACCAAATCTTGGGAGGGATTCT
CAGAAAGGGAAGTTTAATGTTTGGAAAAGATTTAGGAGGGTGAAGAAGGTACCGAGAGAC
TCGAATCATAGGTCTAGTTTTAGATTGAAAGATAGGAAAAATGGAATGGAAGAAAATCCC
ATGATTGCGTTTGATGTAAATAGTGATGAGAGTGTGATAGATAGCCAAAATGGGGTTGAT
TTTCCTGATGAGAATATCGGGTCTGACTCAAGTTTGGATCAGTGCAATGCAATATTGAAA
GAGCTCGAAAGGGGAAATGATGGGAAAGCGTTGAGTTTTTTCCGATGGATGAGGAAAAAT
GGGAAGTTAAAGCAAAATGTTACTGCCTATAATTTGATACTCCGCGTCTTGGGGAGAAGA
GGCGATTGGGATGGGGCGGAGGGAATGATTAAGGAAATGAGTATGGAGTCAGGTTGTAAG
CTTACATATCAAGTTTTCAATACCCTTATTTATGCTTGTCATAAAAAAGGGCTCGTGGAG
TTAGGTGCTAAGTGGTTTCACATGATGTTGGAAAATGGAGTTCAGCCAAATATAGCGACT
TTTGGGATGCTAATGGCTCTCTATCAGAAAGGATGGCATGTTGAGGAAGCAGAATTTGCA
TTTTCAATGATGAGGAATCTCAAAATTATGTGCCAGTCTGCATATTCCTCTATGTTGACG
ATATATACGCGAATGAGATTGTATGATAAAGCAGAAGAAATCATTGGCTTTTTGAGGAAA
GATGAAGTAATTCTGAATCTAGAGAATTGGTTGGTTCTGCTTAATGCTTACTGTCAACAA
GGCAAGTTACTCGAGGCTGAGCAGGTCTTAGCTTCCATGAACGAAGCTGGTTTTTCGCCA
AATATAGTTGCATACAACACATTGATCACTGGATATGGGAAGATTTCCAACATGCTTGAT
GCACAACGCTTGTTTGGTGACCTTAAAAGGGTTGGAGTGGATCCTGATGAAACAACTTAC
AGGTCTATGATAGAAGGGTGGGGTCGGACAGACAATTATGAGGAAGCAAATAGATACTAT
GTGGAACTGAAAAGACTTGGACACAAGCCAAACTCGTCTAATTTGTACACAATGCTAAAT
TTACAAGTCAAGCATGGAGACGAAGTGGATGTTGTTAGAACTATTGAGGAAATGATGCAC
ACTGGCGGCGAAAAGTCAACCATCCTTGGCATTCTTTTGCAAGCATATGAGAAGCTTGAA
CTCATTCGTGAAGTTCCTTCAATTTTGGGAGGTTCTTTATATGATCATGTTTTGAGAAAC
CAGATAGCTTGTTCAAGTCTGGTGATGGCTTATGTGAAAAACAGCATGATAGATGATGCG
TTAAAAGTCTTACGGGAAAAGCAGTGGAAGGATGCTTTATTTGAGGACAACTTGTACCAT
TTGTTAATTTGCTCATGCAAAGATTTTGGGCATCCAGAGAATGCTGTGAAAGTGTTCACT
TGTATGCCAAAATCTGATAAGCCTAACTTACATATAATATGCACTATGATAGACATTTAC
AGTACAAACAACAATTTTGCTGAAGCTGAAAAGCTTTATCTAATGTTGAAGAATTCAAAT
GTCAAATTGGACACAATAACTTTCAGTGTTGTGGTAAGGATGTATATGAAATCTGGAGCC
TTAGAAGAAGCCTGCTCTGTGTTGGATGATATGGACAAACAAAAAAACATTGTTCCAGAC
ACATATTTGCTCCGTGATATGCTCCGGATCTACCAGCGATGTGACAAGAAGGACAAATTG
GCAGATCTTTACTACAAACTTGTGAAAAGAGGAGTCATCTGGGATCAGGAAATGTACAGC
TGTGTCATAAACTGCTGTGCCCGTGCACTGCCAGTTGATGAGCTTTCGAGGCTTTTCGAT
GAGATGCTTAAACGTGGATTCTTACCTAATACAGTCACCTTTAATGTCATGCTTGACGTA
TATGGGAAATCCAGACTCTTCAAAAGAGCAAGAGAGGTTTTTTCAATGGCTAAAAAGTGT
GGTTTGGCTGATGTTATCTCTTACAACACTCTCATAGCTGCATATGGGAGAAGCAAAGAC
TTCAAGAATATGTCATCAACTGTCAAGAAAATGCACTTCAATGGCTTTTCAGTTTCTCTT
GAAGCCTACAATTGTATGTTAGATGCCTATGGGAAAGAAGGACAAATGGAGAAATTCCGT
AATGTCTTGGAAAGACTGAAGGAATCTGGTCACTCTTCTGATCATTACACTTACAACATT
ATGATAAACATTTATGGCGAGCTAGGTTGGATTGAAGAAGTTTCGAATGTACTGGCAGAA
TTAAAGGAATCAGGATCAATTGGACCTGATTTGTGCAGCTATAACACATTGATAAAGGCT
TATGGAATTGCTGGAATGGTTGAACGTGCAGTAGATTTGGTCAAGGAAATGCGCAAAAAT
GGAATTGAACCTGATCGAATAACCTACACTAACCTAATCAATGCATTACGGAAAAATGAT
AAGTTTCTTGAGGCTGTTAAGTGGTCTTTATGGATGAAGCAGATTGGATTATAA