Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400028962
CDS Infomation

pacid=37433601 polypeptide=PGSC0003DMP400019692 locus=PGSC0003DMG400011148 ID=PGSC0003DMT400028962.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTAGCCCCGGTAGATGTCTTCGTCAGTACAGTGGATCCTATGAAGGAACCTCCTCTT
GTTACAGCTAATACAATCCTCTCAATATTAGCAATGGATTACCCTATTGACAAAATTTCA
TGCTACCTATCTGATGATGGAGCTTCAATGTGCACCTTTGAAGCACTATCAGAAACTGCA
GAATTTGCTAGAAAATGGGTTCCCTTCTGCAAGAAGTTTGCTATAGAGCCTCGAGCTCCA
GAATTTTACTTCTCCCTAAAGATTGATTATCTCAAGGACAAAGTCCAGCCAACATTTGTT
AAGGAGAGACGAGCAATGAAGAGAGAGTATGAAGAATTCAAGGTAAGAGTCAATGCACTA
GTTGCCAAAGCAACTAAAATGCCTCCAGGAGGGTGGATCATGCAAGATGGAACACCATGG
CCAGGAAATAATACCAGGGACCATCCTGGTATGATTCAAGTCTTTTTAGGCCAAAGTGGA
GGAACTGATGTGGATGGACATGAACTTCCTCGTCTTGTTTATGTTTCTCGTGAAAAAAGG
CCTGGTTTCCAGCATCACAAAAAGGCTGGTGCTATGAACGCCCTGGTTCGTGTTGCAGGA
GTTCTTACCAATGCACCATTTATGCTTAACTTGGATTGTGATCATTACCTTAACAACAGC
AAGGCTGCCAGAGAGGCCATGTGCTTCTTGATGGACCCACAAATGGGCAAAAAAGTTTGC
TTCGTCCAGTTTCCTCAAAGATTTGATGGAATAGACAAGCACGATAGATATGCCAACCGA
AACACAGTCTTCTTTGATATTAACATGAAAGGCCTAGATGGAATACAAGGTCCAGTATAT
GTTGGCACAGGATGTGTCTTCAGAAGGCAAGCATTATATGGCTACAATCCTCCTAAACGG
GCCAAGCGCCCAAGAATGGTGAGCTGCGACTGTTGTCCATGTTTTGGACGCAAAAAGAAG
CTTGACAAATATAAATCTGAAGTCAATGGAGATGCAGCCAATGCTCAAGGATTTGACGAT
GACAATGAGCTACTAATGTCCCAGATGAACTTTGAAAAGAAATTTGGTCAGTCTGCAATT
TTTGTGACTTCAACTTTAATGATTGAAGGTGGGGTTCCACCTTCGTCAAGCCCAGCAGCC
TTGTTGAAGGAAGCTATCCATGTGATCAGCTGTGGCTATGAAGATAAAACAGAATGGGGT
TTGGAGCTGGGATGGATATACGGTTCTATCACAGAGGATATCTTAACAGGTTTCAAGATG
CACTGCCGTGGTTGGAGGTCAGTCTATTGTATGCCTAAATTAGCTGCATTTAAGGGGTCT
GCTCCAATCAATCTATCAGATCGTCTCAACCAGGTGCTTCGATGGGCTCTTGGTTCCGTT
GAGATCTTTTTCAGTCATCATAGCCCAGTTTGGTATGGCCATAAGGGAGGAAATCTTAAG
TGGCTAGAACGATTATCATACATTAACACAACTATTTACCCCTTCACTTCTTTACCTCTC
CTTGCCTACTGCACTCTCCCTGCTGTCTGCTTGCTCACTGGGAAATTCATAATGCCAGAG
GTAAGCACATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400019692
PEP Infomation

pacid=37433601 transcript=PGSC0003DMT400028962 locus=PGSC0003DMG400011148 ID=PGSC0003DMT400028962.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLAPVDVFVSTVDPMKEPPLVTANTILSILAMDYPIDKISCYLSDDGASMCTFEALSETA
EFARKWVPFCKKFAIEPRAPEFYFSLKIDYLKDKVQPTFVKERRAMKREYEEFKVRVNAL
VAKATKMPPGGWIMQDGTPWPGNNTRDHPGMIQVFLGQSGGTDVDGHELPRLVYVSREKR
PGFQHHKKAGAMNALVRVAGVLTNAPFMLNLDCDHYLNNSKAAREAMCFLMDPQMGKKVC
FVQFPQRFDGIDKHDRYANRNTVFFDINMKGLDGIQGPVYVGTGCVFRRQALYGYNPPKR
AKRPRMVSCDCCPCFGRKKKLDKYKSEVNGDAANAQGFDDDNELLMSQMNFEKKFGQSAI
FVTSTLMIEGGVPPSSSPAALLKEAIHVISCGYEDKTEWGLELGWIYGSITEDILTGFKM
HCRGWRSVYCMPKLAAFKGSAPINLSDRLNQVLRWALGSVEIFFSHHSPVWYGHKGGNLK
WLERLSYINTTIYPFTSLPLLAYCTLPAVCLLTGKFIMPEVST*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400028962
Transcript Infomation

pacid=37433601 locus=PGSC0003DMG400011148 ID=PGSC0003DMT400028962.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTAGCCCCGGTAGATGTCTTCGTCAGTACAGTGGATCCTATGAAGGAACCTCCTCTT
GTTACAGCTAATACAATCCTCTCAATATTAGCAATGGATTACCCTATTGACAAAATTTCA
TGCTACCTATCTGATGATGGAGCTTCAATGTGCACCTTTGAAGCACTATCAGAAACTGCA
GAATTTGCTAGAAAATGGGTTCCCTTCTGCAAGAAGTTTGCTATAGAGCCTCGAGCTCCA
GAATTTTACTTCTCCCTAAAGATTGATTATCTCAAGGACAAAGTCCAGCCAACATTTGTT
AAGGAGAGACGAGCAATGAAGAGAGAGTATGAAGAATTCAAGGTAAGAGTCAATGCACTA
GTTGCCAAAGCAACTAAAATGCCTCCAGGAGGGTGGATCATGCAAGATGGAACACCATGG
CCAGGAAATAATACCAGGGACCATCCTGGTATGATTCAAGTCTTTTTAGGCCAAAGTGGA
GGAACTGATGTGGATGGACATGAACTTCCTCGTCTTGTTTATGTTTCTCGTGAAAAAAGG
CCTGGTTTCCAGCATCACAAAAAGGCTGGTGCTATGAACGCCCTGGTTCGTGTTGCAGGA
GTTCTTACCAATGCACCATTTATGCTTAACTTGGATTGTGATCATTACCTTAACAACAGC
AAGGCTGCCAGAGAGGCCATGTGCTTCTTGATGGACCCACAAATGGGCAAAAAAGTTTGC
TTCGTCCAGTTTCCTCAAAGATTTGATGGAATAGACAAGCACGATAGATATGCCAACCGA
AACACAGTCTTCTTTGATATTAACATGAAAGGCCTAGATGGAATACAAGGTCCAGTATAT
GTTGGCACAGGATGTGTCTTCAGAAGGCAAGCATTATATGGCTACAATCCTCCTAAACGG
GCCAAGCGCCCAAGAATGGTGAGCTGCGACTGTTGTCCATGTTTTGGACGCAAAAAGAAG
CTTGACAAATATAAATCTGAAGTCAATGGAGATGCAGCCAATGCTCAAGGATTTGACGAT
GACAATGAGCTACTAATGTCCCAGATGAACTTTGAAAAGAAATTTGGTCAGTCTGCAATT
TTTGTGACTTCAACTTTAATGATTGAAGGTGGGGTTCCACCTTCGTCAAGCCCAGCAGCC
TTGTTGAAGGAAGCTATCCATGTGATCAGCTGTGGCTATGAAGATAAAACAGAATGGGGT
TTGGAGCTGGGATGGATATACGGTTCTATCACAGAGGATATCTTAACAGGTTTCAAGATG
CACTGCCGTGGTTGGAGGTCAGTCTATTGTATGCCTAAATTAGCTGCATTTAAGGGGTCT
GCTCCAATCAATCTATCAGATCGTCTCAACCAGGTGCTTCGATGGGCTCTTGGTTCCGTT
GAGATCTTTTTCAGTCATCATAGCCCAGTTTGGTATGGCCATAAGGGAGGAAATCTTAAG
TGGCTAGAACGATTATCATACATTAACACAACTATTTACCCCTTCACTTCTTTACCTCTC
CTTGCCTACTGCACTCTCCCTGCTGTCTGCTTGCTCACTGGGAAATTCATAATGCCAGAG
GTAAGCACATGA