Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400028953
CDS Infomation	pacid=37433010 polypeptide=PGSC0003DMP400019685 locus=PGSC0003DMG400011145 ID=PGSC0003DMT400028953.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGTATGTTCATATGCATAAAGAAGGTATTTTTCCGAATAATTACACGTACCCTTTTGTT CTAAAGTCTTTATCTGACCTTAAGGAGCTGAAGTTAGGCAAATCTGTACATACCCATGTT GTGAAATGGGGTTATGTTTGTGATATTTATGTGCAGAATTCGTTGTTGAATTTGTATGCT TCTTGTGGTGAAATTGAGTTTTGTCAGCAAGTGTTCGATGAAATGCCTCAAAGAGATGTT GTTTCGTGGACGGTTTTGATTATGGGGTATAGAGATTGTGGGAAGTTTGATGATGCACTT GTTGTGTTTGAGAAAATGAGGGATTCGGGTGTGGCGCCCAATCGGGTGACGATGGTGAAT GCATTGTCTGCTTGTGCTAATTGTGGTGCTTTAGATATGGGGGTATTGATACATGATGAA ATAAGGAGGAGTGGATGGGAAATGGATGTGATTTTGGGTACTTCTTTGATAGATATGTAT GGGAAGTGTGGGAAAATCGAACACGGTTTTTGGGTATTTCAAGAGATGAAGCATAGGAAT GTGTATACTTGGAATGCTGTGATCAGGGGGTTGGCGTTGGCTAAAAGCGGGGAGGAGGCA GTGCGATGGTTCTTCATTATGGAGCGCGAAAATGTCAAACCTGATGAAGTGACTTTAGTA GCCGTGCTTTGTGCTTGTGCGTACTCCGGAATGGCTGAACAGGGCAGAGAAATCTTTTCT TGGTTAATGAATGAGAAGTATGGATTTCCACCTGGTGTGAAACACTACGCGTGTATGGTT GATCTATTAGCACGTTCAAGGCATTTAGAAGACGCGTTAAGGATGATCACAGAAATGCCA ATGGAACCGACAAAGAGCGTTTGGGGGGCATTGCTTGCTGGCTGTAGGTTACATGGAAAT CAAGAATTGAGTGAGTTTGCTGCATGGAAGCTTATAGGATTGGCACCAAGAAACTCGGCC TACTACGTCGTGTTGGCTAATTTATACGGTGAAATGGGAAGGTGGAATGACGCGGAGAAA ATTCGAGCATTGATGAAAGAGAGGGGATTATCAAAGGACTTTGGTAGTAGTTCAGTTGAA CTTGAGGATCAAAAGGATCTACTAGAGTTGTTAAGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400019685
PEP Infomation	pacid=37433010 transcript=PGSC0003DMT400028953 locus=PGSC0003DMG400011145 ID=PGSC0003DMT400028953.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MYVHMHKEGIFPNNYTYPFVLKSLSDLKELKLGKSVHTHVVKWGYVCDIYVQNSLLNLYA SCGEIEFCQQVFDEMPQRDVVSWTVLIMGYRDCGKFDDALVVFEKMRDSGVAPNRVTMVN ALSACANCGALDMGVLIHDEIRRSGWEMDVILGTSLIDMYGKCGKIEHGFWVFQEMKHRN VYTWNAVIRGLALAKSGEEAVRWFFIMERENVKPDEVTLVAVLCACAYSGMAEQGREIFS WLMNEKYGFPPGVKHYACMVDLLARSRHLEDALRMITEMPMEPTKSVWGALLAGCRLHGN QELSEFAAWKLIGLAPRNSAYYVVLANLYGEMGRWNDAEKIRALMKERGLSKDFGSSSVE LEDQKDLLELLR*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400028953
Transcript Infomation	pacid=37433010 locus=PGSC0003DMG400011145 ID=PGSC0003DMT400028953.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGTATGTTCATATGCATAAAGAAGGTATTTTTCCGAATAATTACACGTACCCTTTTGTT CTAAAGTCTTTATCTGACCTTAAGGAGCTGAAGTTAGGCAAATCTGTACATACCCATGTT GTGAAATGGGGTTATGTTTGTGATATTTATGTGCAGAATTCGTTGTTGAATTTGTATGCT TCTTGTGGTGAAATTGAGTTTTGTCAGCAAGTGTTCGATGAAATGCCTCAAAGAGATGTT GTTTCGTGGACGGTTTTGATTATGGGGTATAGAGATTGTGGGAAGTTTGATGATGCACTT GTTGTGTTTGAGAAAATGAGGGATTCGGGTGTGGCGCCCAATCGGGTGACGATGGTGAAT GCATTGTCTGCTTGTGCTAATTGTGGTGCTTTAGATATGGGGGTATTGATACATGATGAA ATAAGGAGGAGTGGATGGGAAATGGATGTGATTTTGGGTACTTCTTTGATAGATATGTAT GGGAAGTGTGGGAAAATCGAACACGGTTTTTGGGTATTTCAAGAGATGAAGCATAGGAAT GTGTATACTTGGAATGCTGTGATCAGGGGGTTGGCGTTGGCTAAAAGCGGGGAGGAGGCA GTGCGATGGTTCTTCATTATGGAGCGCGAAAATGTCAAACCTGATGAAGTGACTTTAGTA GCCGTGCTTTGTGCTTGTGCGTACTCCGGAATGGCTGAACAGGGCAGAGAAATCTTTTCT TGGTTAATGAATGAGAAGTATGGATTTCCACCTGGTGTGAAACACTACGCGTGTATGGTT GATCTATTAGCACGTTCAAGGCATTTAGAAGACGCGTTAAGGATGATCACAGAAATGCCA ATGGAACCGACAAAGAGCGTTTGGGGGGCATTGCTTGCTGGCTGTAGGTTACATGGAAAT CAAGAATTGAGTGAGTTTGCTGCATGGAAGCTTATAGGATTGGCACCAAGAAACTCGGCC TACTACGTCGTGTTGGCTAATTTATACGGTGAAATGGGAAGGTGGAATGACGCGGAGAAA ATTCGAGCATTGATGAAAGAGAGGGGATTATCAAAGGACTTTGGTAGTAGTTCAGTTGAA CTTGAGGATCAAAAGGATCTACTAGAGTTGTTAAGGTGA