Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400028536
CDS Infomation

pacid=37480303 polypeptide=PGSC0003DMP400019413 locus=PGSC0003DMG400010990 ID=PGSC0003DMT400028536.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAATGGACCTTGCAGTGGGCTATGGCAGCAGAAACAATTTGCCCTTTCTCTGCTAAAG
TCTCCCAACAAGCTCTCCACTTTGAATCACCTAAAATCCCTCCATGTATACCTCCTCCGC
ACTGGCCTTCACCACAGCAGTTTCGCCGTTGGAAACTTCATCACCCATTGTGCTTCTCTT
GGACTCATGTCGTATGCAGCCCAACTGTTCGATCAAATGTCTGAACCAAATTCGTTTGTA
TGGAATACACTCATAAGAGGGTTCCAACAGAATCATTCTCCGAAATACACCCTTTATTAT
TTTGATCAAATGCGGGTAAACAATGCACAGCCTGATAGATTTACTTACCCTTTCACCATT
CGTGCTTGTTCAGGTTTACTGGAGTTTGCTAAAGGAGCTAGTCTTCATGGTCAGGTGGTT
AAAATTGGGGTCAATTTTGATGTCTTTGTGGGTACTAGCTTGGTTGATTTTTATACTGCT
ATGGGGGATTTGAACATGACTAAGCAAGTTTTTGAGGAATTGCCGGATAAAGATGAGGTA
ACATGGTATGCGATGTTATCGAGCTATGTTAACAAGTTTAATGACATGGGGAAAGCTCGG
GATTTGTTCGAAAAGATACCATGTAAGGATCTTGTAATTTGGCATACCTTAATCCTGGGA
TATGTCAAAGCTGGGGACTTGGAGTTAGCGAAAAAGTATTTTGATATAGCGCCTGTTAAG
GATTTACTCATGTACAATACAATTTTAGGTTGCCTTGCCAAGAATGGTGAAGTTGATCGT
CTCTTGAGATTGTTTCATGAAATGCCTTGTAGGGATTTGGTATCTTGGAATACGGTAATT
GGAGGGCTCGTACGTGATGGGAGGATTAATGAAGCTATGAGGTTCTTCTATGAAATGGAA
AGAGTGAATTTATCGCCTGATGATGTTACCCTAGCAAGCTTGCTCTCTGCTTGTGCACAA
GCTGGAGCTCTGGATATTGGGAAATGGTTGCACTCATATATTGATAGGAGGTGTTCTGAG
TTAAATGCTGTGATTGGGACAGCGCTGGTGGATATGTATTGCAAGTGTGGTGATTTGGGG
AGTGCTGCGGATGTCTTCAATAAGATGTCTGAACGTGATGTTGTAGCTTGGAGTGCTATG
ATCATGGGGTCCTCGATGAATGGACAAAGTAGAACTGCATTGAACTTCTTTTACCGTATG
AAAGATGAATCTGAAACGCCAAATGATGCGACAATTTTGGGGGTTCTGTGTGCTTGTGTG
CATGCAGGGTTGGTTGAAGAGGGAAAGAAGTGCTTTTATGGCATGTCTGAGGAGTTCGGC
TTAACACCAAAGTTGGAGCATTATGGTTGTATGGTTGATCTCCTTGGTCGAGCTGGTTTG
CTAGATGAGGCGTATTGTTTGATACAATCTATGCCATATGAGCCACACACGGGTGCCTGG
GGAGCCTTACTAGGAGCATGCAAGATACATAGAAATGTTGAGCTTGCTGAAAAGGCCATA
GAACACTTGATCCAACTTGACCTTGAGGACGGGGGATACCTCGCAATTATGTCCAACATA
TATGCTAATGCAGGAAGGTGGGAAGATGTCTCAAAAGTCCGAAAATTGATGAAGGAAAAA
GGCATTGGTAAATCACGGGGGATTAGCTCCATTGAGATTAATGGGGTAATACACGAATTT
GGTGTCCAAGAGAAAAAACACCCTCAAGCCAGAGAAATATATGATATGATAGATGAGATT
TATAGACGACTGAAGAGGGCAGGCCATGTTGCAAGCACCAGAGAGGTATTTTTCGACGTT
GAAGAGGAGGAAAAGGAAAAGGCTCTGTTCTTCCACAGTGAGAAAATGGCTGTTGCTTTC
GGACTTATTGCAACTGATAAAACAACTATCATTCGTGTGGTGAAAAACCTTCGCATTTGC
CCTGATTGTCATGCAGCTATGAAGCTGATTTCTGCTAGCTTTGAAAGAGAAATAGTCATT
AGAGACCGTCATCGTTTTCACCACTTCAAGAATGGTGTTTGCTCTTGTAGAGACTATTGG
TGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400019413
PEP Infomation

pacid=37480303 transcript=PGSC0003DMT400028536 locus=PGSC0003DMG400010990 ID=PGSC0003DMT400028536.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MNGPCSGLWQQKQFALSLLKSPNKLSTLNHLKSLHVYLLRTGLHHSSFAVGNFITHCASL
GLMSYAAQLFDQMSEPNSFVWNTLIRGFQQNHSPKYTLYYFDQMRVNNAQPDRFTYPFTI
RACSGLLEFAKGASLHGQVVKIGVNFDVFVGTSLVDFYTAMGDLNMTKQVFEELPDKDEV
TWYAMLSSYVNKFNDMGKARDLFEKIPCKDLVIWHTLILGYVKAGDLELAKKYFDIAPVK
DLLMYNTILGCLAKNGEVDRLLRLFHEMPCRDLVSWNTVIGGLVRDGRINEAMRFFYEME
RVNLSPDDVTLASLLSACAQAGALDIGKWLHSYIDRRCSELNAVIGTALVDMYCKCGDLG
SAADVFNKMSERDVVAWSAMIMGSSMNGQSRTALNFFYRMKDESETPNDATILGVLCACV
HAGLVEEGKKCFYGMSEEFGLTPKLEHYGCMVDLLGRAGLLDEAYCLIQSMPYEPHTGAW
GALLGACKIHRNVELAEKAIEHLIQLDLEDGGYLAIMSNIYANAGRWEDVSKVRKLMKEK
GIGKSRGISSIEINGVIHEFGVQEKKHPQAREIYDMIDEIYRRLKRAGHVASTREVFFDV
EEEEKEKALFFHSEKMAVAFGLIATDKTTIIRVVKNLRICPDCHAAMKLISASFEREIVI
RDRHRFHHFKNGVCSCRDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400028536
Transcript Infomation

pacid=37480303 locus=PGSC0003DMG400010990 ID=PGSC0003DMT400028536.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAATGGACCTTGCAGTGGGCTATGGCAGCAGAAACAATTTGCCCTTTCTCTGCTAAAG
TCTCCCAACAAGCTCTCCACTTTGAATCACCTAAAATCCCTCCATGTATACCTCCTCCGC
ACTGGCCTTCACCACAGCAGTTTCGCCGTTGGAAACTTCATCACCCATTGTGCTTCTCTT
GGACTCATGTCGTATGCAGCCCAACTGTTCGATCAAATGTCTGAACCAAATTCGTTTGTA
TGGAATACACTCATAAGAGGGTTCCAACAGAATCATTCTCCGAAATACACCCTTTATTAT
TTTGATCAAATGCGGGTAAACAATGCACAGCCTGATAGATTTACTTACCCTTTCACCATT
CGTGCTTGTTCAGGTTTACTGGAGTTTGCTAAAGGAGCTAGTCTTCATGGTCAGGTGGTT
AAAATTGGGGTCAATTTTGATGTCTTTGTGGGTACTAGCTTGGTTGATTTTTATACTGCT
ATGGGGGATTTGAACATGACTAAGCAAGTTTTTGAGGAATTGCCGGATAAAGATGAGGTA
ACATGGTATGCGATGTTATCGAGCTATGTTAACAAGTTTAATGACATGGGGAAAGCTCGG
GATTTGTTCGAAAAGATACCATGTAAGGATCTTGTAATTTGGCATACCTTAATCCTGGGA
TATGTCAAAGCTGGGGACTTGGAGTTAGCGAAAAAGTATTTTGATATAGCGCCTGTTAAG
GATTTACTCATGTACAATACAATTTTAGGTTGCCTTGCCAAGAATGGTGAAGTTGATCGT
CTCTTGAGATTGTTTCATGAAATGCCTTGTAGGGATTTGGTATCTTGGAATACGGTAATT
GGAGGGCTCGTACGTGATGGGAGGATTAATGAAGCTATGAGGTTCTTCTATGAAATGGAA
AGAGTGAATTTATCGCCTGATGATGTTACCCTAGCAAGCTTGCTCTCTGCTTGTGCACAA
GCTGGAGCTCTGGATATTGGGAAATGGTTGCACTCATATATTGATAGGAGGTGTTCTGAG
TTAAATGCTGTGATTGGGACAGCGCTGGTGGATATGTATTGCAAGTGTGGTGATTTGGGG
AGTGCTGCGGATGTCTTCAATAAGATGTCTGAACGTGATGTTGTAGCTTGGAGTGCTATG
ATCATGGGGTCCTCGATGAATGGACAAAGTAGAACTGCATTGAACTTCTTTTACCGTATG
AAAGATGAATCTGAAACGCCAAATGATGCGACAATTTTGGGGGTTCTGTGTGCTTGTGTG
CATGCAGGGTTGGTTGAAGAGGGAAAGAAGTGCTTTTATGGCATGTCTGAGGAGTTCGGC
TTAACACCAAAGTTGGAGCATTATGGTTGTATGGTTGATCTCCTTGGTCGAGCTGGTTTG
CTAGATGAGGCGTATTGTTTGATACAATCTATGCCATATGAGCCACACACGGGTGCCTGG
GGAGCCTTACTAGGAGCATGCAAGATACATAGAAATGTTGAGCTTGCTGAAAAGGCCATA
GAACACTTGATCCAACTTGACCTTGAGGACGGGGGATACCTCGCAATTATGTCCAACATA
TATGCTAATGCAGGAAGGTGGGAAGATGTCTCAAAAGTCCGAAAATTGATGAAGGAAAAA
GGCATTGGTAAATCACGGGGGATTAGCTCCATTGAGATTAATGGGGTAATACACGAATTT
GGTGTCCAAGAGAAAAAACACCCTCAAGCCAGAGAAATATATGATATGATAGATGAGATT
TATAGACGACTGAAGAGGGCAGGCCATGTTGCAAGCACCAGAGAGGTATTTTTCGACGTT
GAAGAGGAGGAAAAGGAAAAGGCTCTGTTCTTCCACAGTGAGAAAATGGCTGTTGCTTTC
GGACTTATTGCAACTGATAAAACAACTATCATTCGTGTGGTGAAAAACCTTCGCATTTGC
CCTGATTGTCATGCAGCTATGAAGCTGATTTCTGCTAGCTTTGAAAGAGAAATAGTCATT
AGAGACCGTCATCGTTTTCACCACTTCAAGAATGGTGTTTGCTCTTGTAGAGACTATTGG
TGA