Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400028505
CDS Infomation

pacid=37444585 polypeptide=PGSC0003DMP400019396 locus=PGSC0003DMG400010976 ID=PGSC0003DMT400028505.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTACGCGTAGGGCTTTTTCTGAAGAATCATTAAGAGAGATTCTATTGAGTTTGCTT
GTGAAATCGTTGTTAAGATTCAAATGTGTATGCAAAAATTGGGGCAATCTTATCAATAAC
CCTAGCTTCACTATAGACCACTTGAATTTAAGTAAGAAGAAGAAGCCTCCACAACACTTG
ATTTATGATTATGGTGCAGCCAATGATGCTCCTACGGTCACTTTGGTTTCCGATAAGGGT
ATAGATGAACAAAATTTTCAAAGGCTTGGAGATAATATTACCAACTTGTTAGGTTCTATT
GATGGCGTGTTTTTCTTAGAAAGACAAATTGGTAATGACATTTTGTGTGCATTATGGAAT
CCAGCTAACAGAGAGGTGAGACACCTTCCTGCCGCCGCAATTAGCTTTGAATCTTTTGCA
GTTGGTCGTCATTTAGTGTTCGGATTAGAGCCTATGACTAAGGATTATAAAGTGCTTTAC
TATAATCAAATTGAAGAATATGCAGCGATTTACTCATGTTCTAGGGATTCATGGAAAATA
TTTGAACATAACACAGACGTACATCAAAATTCTATGATGTGTAAAAAAAGCTTTTATAAC
ACTGCTGATTATCTGAATGGATCTTATTATTGGTTGTTAAAGGAGAAGACTGATAAATGT
AGAATTCTTTCATTTGATTTTGGGAATGAGTTGTTTGTAAAGATGGAAGGGCCACCACGT
GGTCATGAGGATTATAGTTGGTCGACAGATCTAATCCTGCTTGGTGACTCCGTTGGCATC
TTGAACTTTGTCGAGGGATTTGTTAAAGATGTATGGGTAATGATACAGCCAGGTGTTTGG
AACAAACTTCTTACCATTCATCTCACTACGCCTACTAAGTCATTTTATGACAACTCTTTT
ATTTTGGTAACTAAAAGTTCCCGGCTGGTCTCATATAATGTTAGGACAAACAAGACGAAG
CTTTTTGAATTTCGTCATCCGGGCCTGAAGTCATTTCCAGAGTGTGGTGGTTGTGGGGTT
TACTATTATAAAGAGAGCTTAGTAACAATTAAACGAAAAGGGAATAGTGAGCTCCATCTT
AGTCGTTGTTTGACAAAAATGGTGAACAAATATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400019396
PEP Infomation

pacid=37444585 transcript=PGSC0003DMT400028505 locus=PGSC0003DMG400010976 ID=PGSC0003DMT400028505.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MATRRAFSEESLREILLSLLVKSLLRFKCVCKNWGNLINNPSFTIDHLNLSKKKKPPQHL
IYDYGAANDAPTVTLVSDKGIDEQNFQRLGDNITNLLGSIDGVFFLERQIGNDILCALWN
PANREVRHLPAAAISFESFAVGRHLVFGLEPMTKDYKVLYYNQIEEYAAIYSCSRDSWKI
FEHNTDVHQNSMMCKKSFYNTADYLNGSYYWLLKEKTDKCRILSFDFGNELFVKMEGPPR
GHEDYSWSTDLILLGDSVGILNFVEGFVKDVWVMIQPGVWNKLLTIHLTTPTKSFYDNSF
ILVTKSSRLVSYNVRTNKTKLFEFRHPGLKSFPECGGCGVYYYKESLVTIKRKGNSELHL
SRCLTKMVNKY*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400028505
Transcript Infomation

pacid=37444585 locus=PGSC0003DMG400010976 ID=PGSC0003DMT400028505.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTACGCGTAGGGCTTTTTCTGAAGAATCATTAAGAGAGATTCTATTGAGTTTGCTT
GTGAAATCGTTGTTAAGATTCAAATGTGTATGCAAAAATTGGGGCAATCTTATCAATAAC
CCTAGCTTCACTATAGACCACTTGAATTTAAGTAAGAAGAAGAAGCCTCCACAACACTTG
ATTTATGATTATGGTGCAGCCAATGATGCTCCTACGGTCACTTTGGTTTCCGATAAGGGT
ATAGATGAACAAAATTTTCAAAGGCTTGGAGATAATATTACCAACTTGTTAGGTTCTATT
GATGGCGTGTTTTTCTTAGAAAGACAAATTGGTAATGACATTTTGTGTGCATTATGGAAT
CCAGCTAACAGAGAGGTGAGACACCTTCCTGCCGCCGCAATTAGCTTTGAATCTTTTGCA
GTTGGTCGTCATTTAGTGTTCGGATTAGAGCCTATGACTAAGGATTATAAAGTGCTTTAC
TATAATCAAATTGAAGAATATGCAGCGATTTACTCATGTTCTAGGGATTCATGGAAAATA
TTTGAACATAACACAGACGTACATCAAAATTCTATGATGTGTAAAAAAAGCTTTTATAAC
ACTGCTGATTATCTGAATGGATCTTATTATTGGTTGTTAAAGGAGAAGACTGATAAATGT
AGAATTCTTTCATTTGATTTTGGGAATGAGTTGTTTGTAAAGATGGAAGGGCCACCACGT
GGTCATGAGGATTATAGTTGGTCGACAGATCTAATCCTGCTTGGTGACTCCGTTGGCATC
TTGAACTTTGTCGAGGGATTTGTTAAAGATGTATGGGTAATGATACAGCCAGGTGTTTGG
AACAAACTTCTTACCATTCATCTCACTACGCCTACTAAGTCATTTTATGACAACTCTTTT
ATTTTGGTAACTAAAAGTTCCCGGCTGGTCTCATATAATGTTAGGACAAACAAGACGAAG
CTTTTTGAATTTCGTCATCCGGGCCTGAAGTCATTTCCAGAGTGTGGTGGTTGTGGGGTT
TACTATTATAAAGAGAGCTTAGTAACAATTAAACGAAAAGGGAATAGTGAGCTCCATCTT
AGTCGTTGTTTGACAAAAATGGTGAACAAATATTAA