Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400028047
CDS Infomation

pacid=37476777 polypeptide=PGSC0003DMP400019116 locus=PGSC0003DMG400010819 ID=PGSC0003DMT400028047.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAAATGAAAGTATAGACATGGAAAAAGAGAGACTAACAGCTGAGATGAATTTCAAA
GATTCATCTTCAGTTGTTATTAAAATCCGGCAAAAATTGCCGGATTTTTTACAATCTGTT
AAGCTCAAATATGTCAAACTTGGTTATGGTTATTCTTGTAACCCTCTCACACTTCTTCTT
TTTGCTACAATTTTTCCTATAGTTACCTTCACTCTTATTCAACTATTAACCGGTCTAAAA
TTAGACCGGTTTTATGATACATTGACAAGTGATCCAACTTTACTTATAATTAACACTTCA
ACCGGTCTAACCGGTTTGATAGTGCTATTTTTTGTACTAGGGGTGTATTATGTAAAAAAA
CCTAGACCGGTTTATTTGGTTGATTTTGCATGTTACAAACCCGAAGATGAACGAAAAATA
TCTGTCGATTCGTTCTTGAATATGACAGAAGGAAATGGTGCGTTTGAAGACGAAACTATA
GTATTTCAAAAAAAGATATCTCATCGTTCTGGTTTAGGTGACGAGACATATTTGCCTAAA
GGAATCACATCCATCCCACCAAACCTCAACATGAAAGAGGCACGTGCTGAGGCGGAGGCG
GTTATGTTTGGTGCATTGGATTCATTATTTAGTAAAACACAAATCAAGCCAGAGGAAATT
GGAATTCTTATAGTGAATTGTAGTTTGTTTAATCCAACGCCATCGCTTTCGTCAATGATT
GTCAATCACTACAAGCTCAAAACTGACATCAAAAGTTATAATTTAGGTGGAATGGGATGT
AGTGCTGGCTTAATTTCAATTGATTTAGCCAAACAACTATTAAAAGCAAATCAAAATTCA
TATGCTGTGGTAGTTAGCATGGAAAACATTACATTAAATTGGTATTTTGGAAATGATAGA
TCAATGTTGCTATGCAATTGTATATTTCGTATGGGAGGAGCAGCCATGCTTTTGTCTAAC
AAGTCGAAAGATCGAACCCGGTCTAAATATGAGTTGGTTCACACGGTTCGAACCCATAAA
GGAGCAGATGACAATAGCTACAATTGTGTGTACCAAAGAGAAGATGATAAGGGTGTCGTA
GGGGTGTCACTAGCTCGTGAACTTATGGCCGTAGCTGGTGATGCTCTCAAAACAAACATC
ACCACCCTTGGGCCATCCGTGTTACCTCTTACTGAGCAATTCAGGTTTTTCATGACATTG
GTGAAGAGGAAACTCTTGAAAGCTAAAGTGAAACCCTACATACCGGATTTCAAGCTAGCA
TTCGAGCATTTCTGCATACACGCGGGAGGAAGGGCAGTGTTAGATGAAATACAAAACAAC
TTAAGCCTAAGTGATTGGCATATGGAGCCATCAAGAATGACACTCCACAGGTTTGGTAAC
ACGTCGAGTAGTTCGTTATGGTACGAATTAGCTTACACAGAATCAAAAGGAAGGGTGAAG
AAAGGAGATAGAGTGTGGCAAATTGCGTTTGGTTCAGGTTTCAAATGTAATAGTGCAGTT
TGGAAATCACTAAAGGTTATTGATAGTAATGAAGTGAATGCAAATGGAAACCCTTGGGCT
GATTGCATTCAACGTTACCCTGTGAAAGTTGCCCTTGCCAAACAATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400019116
PEP Infomation

pacid=37476777 transcript=PGSC0003DMT400028047 locus=PGSC0003DMG400010819 ID=PGSC0003DMT400028047.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MANESIDMEKERLTAEMNFKDSSSVVIKIRQKLPDFLQSVKLKYVKLGYGYSCNPLTLLL
FATIFPIVTFTLIQLLTGLKLDRFYDTLTSDPTLLIINTSTGLTGLIVLFFVLGVYYVKK
PRPVYLVDFACYKPEDERKISVDSFLNMTEGNGAFEDETIVFQKKISHRSGLGDETYLPK
GITSIPPNLNMKEARAEAEAVMFGALDSLFSKTQIKPEEIGILIVNCSLFNPTPSLSSMI
VNHYKLKTDIKSYNLGGMGCSAGLISIDLAKQLLKANQNSYAVVVSMENITLNWYFGNDR
SMLLCNCIFRMGGAAMLLSNKSKDRTRSKYELVHTVRTHKGADDNSYNCVYQREDDKGVV
GVSLARELMAVAGDALKTNITTLGPSVLPLTEQFRFFMTLVKRKLLKAKVKPYIPDFKLA
FEHFCIHAGGRAVLDEIQNNLSLSDWHMEPSRMTLHRFGNTSSSSLWYELAYTESKGRVK
KGDRVWQIAFGSGFKCNSAVWKSLKVIDSNEVNANGNPWADCIQRYPVKVALAKQ*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400028047
Transcript Infomation

pacid=37476777 locus=PGSC0003DMG400010819 ID=PGSC0003DMT400028047.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAAATGAAAGTATAGACATGGAAAAAGAGAGACTAACAGCTGAGATGAATTTCAAA
GATTCATCTTCAGTTGTTATTAAAATCCGGCAAAAATTGCCGGATTTTTTACAATCTGTT
AAGCTCAAATATGTCAAACTTGGTTATGGTTATTCTTGTAACCCTCTCACACTTCTTCTT
TTTGCTACAATTTTTCCTATAGTTACCTTCACTCTTATTCAACTATTAACCGGTCTAAAA
TTAGACCGGTTTTATGATACATTGACAAGTGATCCAACTTTACTTATAATTAACACTTCA
ACCGGTCTAACCGGTTTGATAGTGCTATTTTTTGTACTAGGGGTGTATTATGTAAAAAAA
CCTAGACCGGTTTATTTGGTTGATTTTGCATGTTACAAACCCGAAGATGAACGAAAAATA
TCTGTCGATTCGTTCTTGAATATGACAGAAGGAAATGGTGCGTTTGAAGACGAAACTATA
GTATTTCAAAAAAAGATATCTCATCGTTCTGGTTTAGGTGACGAGACATATTTGCCTAAA
GGAATCACATCCATCCCACCAAACCTCAACATGAAAGAGGCACGTGCTGAGGCGGAGGCG
GTTATGTTTGGTGCATTGGATTCATTATTTAGTAAAACACAAATCAAGCCAGAGGAAATT
GGAATTCTTATAGTGAATTGTAGTTTGTTTAATCCAACGCCATCGCTTTCGTCAATGATT
GTCAATCACTACAAGCTCAAAACTGACATCAAAAGTTATAATTTAGGTGGAATGGGATGT
AGTGCTGGCTTAATTTCAATTGATTTAGCCAAACAACTATTAAAAGCAAATCAAAATTCA
TATGCTGTGGTAGTTAGCATGGAAAACATTACATTAAATTGGTATTTTGGAAATGATAGA
TCAATGTTGCTATGCAATTGTATATTTCGTATGGGAGGAGCAGCCATGCTTTTGTCTAAC
AAGTCGAAAGATCGAACCCGGTCTAAATATGAGTTGGTTCACACGGTTCGAACCCATAAA
GGAGCAGATGACAATAGCTACAATTGTGTGTACCAAAGAGAAGATGATAAGGGTGTCGTA
GGGGTGTCACTAGCTCGTGAACTTATGGCCGTAGCTGGTGATGCTCTCAAAACAAACATC
ACCACCCTTGGGCCATCCGTGTTACCTCTTACTGAGCAATTCAGGTTTTTCATGACATTG
GTGAAGAGGAAACTCTTGAAAGCTAAAGTGAAACCCTACATACCGGATTTCAAGCTAGCA
TTCGAGCATTTCTGCATACACGCGGGAGGAAGGGCAGTGTTAGATGAAATACAAAACAAC
TTAAGCCTAAGTGATTGGCATATGGAGCCATCAAGAATGACACTCCACAGGTTTGGTAAC
ACGTCGAGTAGTTCGTTATGGTACGAATTAGCTTACACAGAATCAAAAGGAAGGGTGAAG
AAAGGAGATAGAGTGTGGCAAATTGCGTTTGGTTCAGGTTTCAAATGTAATAGTGCAGTT
TGGAAATCACTAAAGGTTATTGATAGTAATGAAGTGAATGCAAATGGAAACCCTTGGGCT
GATTGCATTCAACGTTACCCTGTGAAAGTTGCCCTTGCCAAACAATAG