Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400027996
CDS Infomation

pacid=37446846 polypeptide=PGSC0003DMP400019073 locus=PGSC0003DMG400010794 ID=PGSC0003DMT400027996.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATACTAAAGGGAGACTTATTGCTGGTTCACATAATAGGAATGAGTTTGTTCTCATC
AATGCTGATGAAGTTGGAAGAGTAACTTCTGTGAAAGAATTGAGTGGGCAGATTTGCCAG
ATTTGTGGAGATGAGCTCGAAATAACGGTAGATGGGGAGCCATTTGTTGCTTGCAATGAA
TGTGCATTTCCTGTTTGCAGACCTTGCTATGAGTATGAAAGGAGAGAGGGGAATCAAGCT
TGTCCTCAATGTAAAACTAGGTATAAGCGAATTAAAGGAAGTCCTCGAGTTGAAGGGGAT
GATGAAGAAGATGAATTTGATGATCTAGACAATGAGTTTGACCCTCATCAAACTGCTGAA
GCTGCCCTTTCAGCTCGCCTTAACGTTGGCCGGGGGAATCCTAATGCTTCTGGATATGCT
ACCCAATCAGAGATGGATCCTGCTGCCCTTGGCACAGAGATCCCTCTTCTTACTTATGGT
CAAGAGGAGGATGGAATTTCAGCTGACAAACATGCTCTTATAGTCCCACCATTTATGAGT
CGTGGGAAGAGAGTTCATCCAGTCTCGGATTCCTCCATGTCTTTTCCTCCTCGCCCCATG
GATCCTAAGAAAGACCTGGCAGTTTATGGGTATGGTAGTGTTGCGTGGAAGGAAAGAATG
GAAGACTGGAAGAAAAAACAGAACGATAAATTACTGATGATTAAGCACGAAGGAGGTGGT
GGTAACAATGATGGAGATGAGCTGGATCCTGACTTGCCCAAGATGGATGAAGGCAGACAA
CCGCTTTCAAGAAAGATGCCTATTGCCTCTAGCAAGCTAAGCCCATACAGATTAGTCATT
TTACTTCGACTTGTAATTCTTGGGCTCTTTTTCCACTATAGAATATTGCATCCTGTCCAT
GATGCTTATGGATTGTGGTTGACATCTGTTATATGTGAAATATGGTTTGCCGTATCCTGG
ATATTTGATCAGTTCCCAAAATGGGTTCCCATTCAGCGAGAGACATACCTAGATAGGTTA
TCATTGAGGTATGAGAAAGAAGGGAAGCCTTCTGAGTTAGCCCACATTGACGTTTTTGTT
AGTACAGTGGATCCTTTGAAAGAGCCTCCACTTATTACTGCAAATACTGTTCTCTCCATT
CTTGCTGTGGATTATCCGGTGGATAAGGTTTCATGCTATGTCTCTGACGATGGTGCTGCC
ATGCTTACTTTTGAGGCACTCTCTGAAACATCTGAGTTTGCAAGGAAATGGGTCCCATTC
TGCAAGAAATTCAGCATAGAGCCTCGAGCCCCGGAGTGGTATTTTGCTCAGAAGGTTGAT
TATTTGAAGAACACAGTAAATCCATCATTTGTGAGGGAACGCCGTGCCATGAAGAGAGAC
TATGAAGAATTTAAGGTTCGGATAAATGGATTGGTTTCCATTGCACAAAAGGTTCCTGAG
GATGGTTGGACCATGCAAGACGGAACTCCTTGGCCAGGAAACAATGTTAGGGATCATCCA
GGAATGATTCAGGTCTTTCTAGGCCATGATGGTGTCCGTGATATTGAAGGGAAGGTACTT
CCTCGCCTTATTTATGTTTCTCGTGAGAAGAGGCCAGGATTTGATCACCACAAAAAGGCT
GGTGCCATGAATGCGTTGATGCGGGTGTCAGCGGTCATCTCAAATGCTCCTTATTTACTC
AATGTGGATTGTGATCACTATATAAATAACAGTAAGGCACTGCGAGAAGCTATGTGCTTT
ATGATGGACCCCACTTCAGGAAAGAAAATATGCTACGTACAATTTCCTCAGAGATTTGAT
GGCATTGATCGACATGATAGATACTCAAATCGCAATGTGGTCTTCTTTGATATAAACATG
AAAGGACTTGATGGGATCCAGGGTCCAATTTATGTGGGAACTGGATGTGTCTTCAGGAGG
CAAGCACTTTATGGATATGATGCTCCAAAGAAGGCAAAACCTCCAGGAAAAACATGCAAT
TGTTGGCCGAACTGGTGTTGCTTTTTTTGTAAATCTCGAAAGAAGCATAAGAAGGGGAAA
ACGACCAAGGATAAAAAGAAGATAAAAGGAAAGGATGCTTCAACTCAGGTTCATGCTCTT
GAGAATATCGAGGAAGGAATCGAAGGAATTGATAGTGAAAAAGCATCCCTCATGCCGCAA
ATAAAACTCGAGAAGAAATTTGGACAATCACCAGTATTTGTTGCTTCAACACTACTAGAA
GATGGTGGTGTTCCTCCAGGAGCATCGTCAGCATCTCTCCTGAAAGAAGCCATCCATGTT
ATTAGTTGTGGTTATGAAGACAAAACAGAATGGGGTAAAGAGGTTGGATGGATTTATGGA
TCAGTTACTGAAGATATCTTAACTGGGTTCAAGATGCACTGCCATGGTTGGAGGTCTGTG
TATTGTATGCCCAAAAGGCCTGCATTCAAAGGGTCCGCTCCTATCAATCTTTCAGATCGT
TTGCATCAGGTTCTGCGGTGGGCCTTGGGATCTGTTGAGATTTTCTTTAGTAAACATTGT
CCCATTTGGTATGGATATGGGTGTGGTCTTAAACCATTGGAGCGGTTTTCGTACATAAAC
TCAATTGTCTATCCATTGACTGCCCTCCCTCTGATTGCATATTGTACATTGCCAGCCATC
TGTTTGCTTACTGGGAATTTCATTGTTCCAGAGCTTACCAACTATGCTAGCATTGTGTTC
ATGGCCCTTTTTATATCAATTGCTGCCACTACTATTCTGGAGATACGATGGGGAGGTGTT
GGCATCGACGACATGTGGAGAAATGAGCAATTTTGGGTTATTGGTGGTGTTTCATCCCAC
TTCTTTGCTCTTCTCCAAGGTCTTCTTAAAGTTTTGGCTGGTGTCAACACAAGTTTTACC
GTCACATCAAAAGCAGCAGATGATGGGGAGTTTTCTGAGCTTTACGTCTTCAAGTGGACA
TCCTTGTTGATCCCCCCATTGACCTTGTTGATTATGAACATCATAGGAGTTGTCGTTGGA
GTTTCAGATGCAATCAATAACGGGTATGAGTCATGGGGTCCTTTATTTGGAAAGCTTTTC
TTTGCCTTATGGGTCATTGTTCATTTGTACCCCTTCCTCAAAGGTATGATGGGGAAACAA
AGCAACGTTCCCACTATCATTATTGTGTGGTCTATCCTTCTAGCTTCTATCCTTTCGTTA
TTGTGGGTCCGAATCAACCCATTCTTGTCAAGAGGTGGACTCTCGTTAGAAGTATGTGGG
TTGGACTGCAACTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400019073
PEP Infomation

pacid=37446846 transcript=PGSC0003DMT400027996 locus=PGSC0003DMG400010794 ID=PGSC0003DMT400027996.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDTKGRLIAGSHNRNEFVLINADEVGRVTSVKELSGQICQICGDELEITVDGEPFVACNE
CAFPVCRPCYEYERREGNQACPQCKTRYKRIKGSPRVEGDDEEDEFDDLDNEFDPHQTAE
AALSARLNVGRGNPNASGYATQSEMDPAALGTEIPLLTYGQEEDGISADKHALIVPPFMS
RGKRVHPVSDSSMSFPPRPMDPKKDLAVYGYGSVAWKERMEDWKKKQNDKLLMIKHEGGG
GNNDGDELDPDLPKMDEGRQPLSRKMPIASSKLSPYRLVILLRLVILGLFFHYRILHPVH
DAYGLWLTSVICEIWFAVSWIFDQFPKWVPIQRETYLDRLSLRYEKEGKPSELAHIDVFV
STVDPLKEPPLITANTVLSILAVDYPVDKVSCYVSDDGAAMLTFEALSETSEFARKWVPF
CKKFSIEPRAPEWYFAQKVDYLKNTVNPSFVRERRAMKRDYEEFKVRINGLVSIAQKVPE
DGWTMQDGTPWPGNNVRDHPGMIQVFLGHDGVRDIEGKVLPRLIYVSREKRPGFDHHKKA
GAMNALMRVSAVISNAPYLLNVDCDHYINNSKALREAMCFMMDPTSGKKICYVQFPQRFD
GIDRHDRYSNRNVVFFDINMKGLDGIQGPIYVGTGCVFRRQALYGYDAPKKAKPPGKTCN
CWPNWCCFFCKSRKKHKKGKTTKDKKKIKGKDASTQVHALENIEEGIEGIDSEKASLMPQ
IKLEKKFGQSPVFVASTLLEDGGVPPGASSASLLKEAIHVISCGYEDKTEWGKEVGWIYG
SVTEDILTGFKMHCHGWRSVYCMPKRPAFKGSAPINLSDRLHQVLRWALGSVEIFFSKHC
PIWYGYGCGLKPLERFSYINSIVYPLTALPLIAYCTLPAICLLTGNFIVPELTNYASIVF
MALFISIAATTILEIRWGGVGIDDMWRNEQFWVIGGVSSHFFALLQGLLKVLAGVNTSFT
VTSKAADDGEFSELYVFKWTSLLIPPLTLLIMNIIGVVVGVSDAINNGYESWGPLFGKLF
FALWVIVHLYPFLKGMMGKQSNVPTIIIVWSILLASILSLLWVRINPFLSRGGLSLEVCG
LDCN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400027996
Transcript Infomation

pacid=37446846 locus=PGSC0003DMG400010794 ID=PGSC0003DMT400027996.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATACTAAAGGGAGACTTATTGCTGGTTCACATAATAGGAATGAGTTTGTTCTCATC
AATGCTGATGAAGTTGGAAGAGTAACTTCTGTGAAAGAATTGAGTGGGCAGATTTGCCAG
ATTTGTGGAGATGAGCTCGAAATAACGGTAGATGGGGAGCCATTTGTTGCTTGCAATGAA
TGTGCATTTCCTGTTTGCAGACCTTGCTATGAGTATGAAAGGAGAGAGGGGAATCAAGCT
TGTCCTCAATGTAAAACTAGGTATAAGCGAATTAAAGGAAGTCCTCGAGTTGAAGGGGAT
GATGAAGAAGATGAATTTGATGATCTAGACAATGAGTTTGACCCTCATCAAACTGCTGAA
GCTGCCCTTTCAGCTCGCCTTAACGTTGGCCGGGGGAATCCTAATGCTTCTGGATATGCT
ACCCAATCAGAGATGGATCCTGCTGCCCTTGGCACAGAGATCCCTCTTCTTACTTATGGT
CAAGAGGAGGATGGAATTTCAGCTGACAAACATGCTCTTATAGTCCCACCATTTATGAGT
CGTGGGAAGAGAGTTCATCCAGTCTCGGATTCCTCCATGTCTTTTCCTCCTCGCCCCATG
GATCCTAAGAAAGACCTGGCAGTTTATGGGTATGGTAGTGTTGCGTGGAAGGAAAGAATG
GAAGACTGGAAGAAAAAACAGAACGATAAATTACTGATGATTAAGCACGAAGGAGGTGGT
GGTAACAATGATGGAGATGAGCTGGATCCTGACTTGCCCAAGATGGATGAAGGCAGACAA
CCGCTTTCAAGAAAGATGCCTATTGCCTCTAGCAAGCTAAGCCCATACAGATTAGTCATT
TTACTTCGACTTGTAATTCTTGGGCTCTTTTTCCACTATAGAATATTGCATCCTGTCCAT
GATGCTTATGGATTGTGGTTGACATCTGTTATATGTGAAATATGGTTTGCCGTATCCTGG
ATATTTGATCAGTTCCCAAAATGGGTTCCCATTCAGCGAGAGACATACCTAGATAGGTTA
TCATTGAGGTATGAGAAAGAAGGGAAGCCTTCTGAGTTAGCCCACATTGACGTTTTTGTT
AGTACAGTGGATCCTTTGAAAGAGCCTCCACTTATTACTGCAAATACTGTTCTCTCCATT
CTTGCTGTGGATTATCCGGTGGATAAGGTTTCATGCTATGTCTCTGACGATGGTGCTGCC
ATGCTTACTTTTGAGGCACTCTCTGAAACATCTGAGTTTGCAAGGAAATGGGTCCCATTC
TGCAAGAAATTCAGCATAGAGCCTCGAGCCCCGGAGTGGTATTTTGCTCAGAAGGTTGAT
TATTTGAAGAACACAGTAAATCCATCATTTGTGAGGGAACGCCGTGCCATGAAGAGAGAC
TATGAAGAATTTAAGGTTCGGATAAATGGATTGGTTTCCATTGCACAAAAGGTTCCTGAG
GATGGTTGGACCATGCAAGACGGAACTCCTTGGCCAGGAAACAATGTTAGGGATCATCCA
GGAATGATTCAGGTCTTTCTAGGCCATGATGGTGTCCGTGATATTGAAGGGAAGGTACTT
CCTCGCCTTATTTATGTTTCTCGTGAGAAGAGGCCAGGATTTGATCACCACAAAAAGGCT
GGTGCCATGAATGCGTTGATGCGGGTGTCAGCGGTCATCTCAAATGCTCCTTATTTACTC
AATGTGGATTGTGATCACTATATAAATAACAGTAAGGCACTGCGAGAAGCTATGTGCTTT
ATGATGGACCCCACTTCAGGAAAGAAAATATGCTACGTACAATTTCCTCAGAGATTTGAT
GGCATTGATCGACATGATAGATACTCAAATCGCAATGTGGTCTTCTTTGATATAAACATG
AAAGGACTTGATGGGATCCAGGGTCCAATTTATGTGGGAACTGGATGTGTCTTCAGGAGG
CAAGCACTTTATGGATATGATGCTCCAAAGAAGGCAAAACCTCCAGGAAAAACATGCAAT
TGTTGGCCGAACTGGTGTTGCTTTTTTTGTAAATCTCGAAAGAAGCATAAGAAGGGGAAA
ACGACCAAGGATAAAAAGAAGATAAAAGGAAAGGATGCTTCAACTCAGGTTCATGCTCTT
GAGAATATCGAGGAAGGAATCGAAGGAATTGATAGTGAAAAAGCATCCCTCATGCCGCAA
ATAAAACTCGAGAAGAAATTTGGACAATCACCAGTATTTGTTGCTTCAACACTACTAGAA
GATGGTGGTGTTCCTCCAGGAGCATCGTCAGCATCTCTCCTGAAAGAAGCCATCCATGTT
ATTAGTTGTGGTTATGAAGACAAAACAGAATGGGGTAAAGAGGTTGGATGGATTTATGGA
TCAGTTACTGAAGATATCTTAACTGGGTTCAAGATGCACTGCCATGGTTGGAGGTCTGTG
TATTGTATGCCCAAAAGGCCTGCATTCAAAGGGTCCGCTCCTATCAATCTTTCAGATCGT
TTGCATCAGGTTCTGCGGTGGGCCTTGGGATCTGTTGAGATTTTCTTTAGTAAACATTGT
CCCATTTGGTATGGATATGGGTGTGGTCTTAAACCATTGGAGCGGTTTTCGTACATAAAC
TCAATTGTCTATCCATTGACTGCCCTCCCTCTGATTGCATATTGTACATTGCCAGCCATC
TGTTTGCTTACTGGGAATTTCATTGTTCCAGAGCTTACCAACTATGCTAGCATTGTGTTC
ATGGCCCTTTTTATATCAATTGCTGCCACTACTATTCTGGAGATACGATGGGGAGGTGTT
GGCATCGACGACATGTGGAGAAATGAGCAATTTTGGGTTATTGGTGGTGTTTCATCCCAC
TTCTTTGCTCTTCTCCAAGGTCTTCTTAAAGTTTTGGCTGGTGTCAACACAAGTTTTACC
GTCACATCAAAAGCAGCAGATGATGGGGAGTTTTCTGAGCTTTACGTCTTCAAGTGGACA
TCCTTGTTGATCCCCCCATTGACCTTGTTGATTATGAACATCATAGGAGTTGTCGTTGGA
GTTTCAGATGCAATCAATAACGGGTATGAGTCATGGGGTCCTTTATTTGGAAAGCTTTTC
TTTGCCTTATGGGTCATTGTTCATTTGTACCCCTTCCTCAAAGGTATGATGGGGAAACAA
AGCAACGTTCCCACTATCATTATTGTGTGGTCTATCCTTCTAGCTTCTATCCTTTCGTTA
TTGTGGGTCCGAATCAACCCATTCTTGTCAAGAGGTGGACTCTCGTTAGAAGTATGTGGG
TTGGACTGCAACTAA