Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400027972
CDS Infomation

pacid=37444311 polypeptide=PGSC0003DMP400019058 locus=PGSC0003DMG400010778 ID=PGSC0003DMT400027972.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATCCAACAGCAGATGAGCAGTTGGACTATGGTGATGAGGAATATGGAGGAAGCCAC
AAGATGCAGTACCATGGAAGTGGGACAATTCCTGCTCTAGCAGAGGATGAAATGATGGGT
GAAGATGATGAATATGATGATCTTTACAATGATGTTAACATTGGGGAAGGTTTCCTACAG
CTGCAGCGGTCAGAGGTTCCAGTTCCTTCTGTTGATGCGGGAAATGGGAATTTTCAAGCC
CAGAAAGATAGTTTTCCTGCCTCAAGGGCTGGTGGTTTAGGATCAGAGGAGGCGAAAATC
CCTGGTATTGCAACAGAAGGGAAGTATGCTGGCACTGAAGTCCAATTTCCCCAGCAAAAG
GGTGAGCCTGTAGTTGAAAGGGAAACTGAACGACCTGCTGATGCTGCACAAAAAGCAAGG
CCTTCAGCAATTACAATGACTCTCAATTCTCAAGCGGGGAACTCTGGTTACCAAGGATCC
ATGCCAATGCCCCAGAAAATTGGTGCTGATCCTATGGCTATGCCAGAAAAAAATGCCAGT
GAAGCTACACCATTGATGAATTCTGTTGTGCCTGGACCAAGAGTTGTTCCGCACATGCCA
ACTAATCAATTGAACTCAAGTGGGAATGTTAACATGAATAATCCAGTTATTAGTGAGACT
CCTTTTAGGCCATCTCTGGAGAATGGCAACACCATGCTCTTTGTTGGAGAATTGCACTGG
TGGACTACTGATGCTGAGCTTGAGAGTGTGCTAACTCAATATGGGAATGTAAAGGAGATC
AAATTCTTTGATGAGAGAGCTAGTGGCAAGTCTAAAGGCTATTGTCAAGTTGAGTTTTTT
GACCCAGCTTCTGCAGCTGCTTGCAAAGAAGGAATGAATGGTTATAATTTCAATGGGCGA
GCCTGTGTTGTCGCATTTGCAACTCCACAAACTATAAAACAGATGGGTTCCTCATATGCG
AACAAAACTCAAAACCAGGTGCAGTCTCAACCACAGGGGCGGAGACCCATGAATGAGGGA
GTTGGTAGAGGTGGGCCAAATTACACCCCTGGAGATGCTGGGAGGAATTTCGGAAGAGGT
AGTTGGGGGCGTGGAGGGCCGGGTATGCCTAACAGAGGACCTGGGGGTGGACCAGTGAGG
GGAAGAGGAGCCATGGGATCAAAGAATATGATGGTGAATCCTGGAGCTGGCAATGGTGCT
GGTGGAGCTTTTGGGCAAGGACTTGCAGGTCCAGCATTTGGTGGTCCTCCTGCAGGTCTA
ATGCATCCCCAGGGCATGATGGGTCCTGGTTTTGATCCCAGTTTTATGGGTCGAGGAGCT
GGTTATGGAGGATTTTCAGGTCCTGCATTTCCCGGGATGATGCCTCCATTTCAAGCTGTT
AATCCTATGGGTCTTCCTGGAGTGGCTCCTCATGTCAACCCTGCATTCTTTGGTCGAGGA
ATGGCTGCAAATGGAATGGGAATGATGAGTGCTGCTGGGATGGATGGGCCTCATCCAGGA
ATGTGGACTGACACAAGCGGGGGAGGATGGGGAGGAGAAGAACATGGCAGGAGAACTAGA
GAGTCCAGTTATGGGGGTGAAGATAATGCATCAGAGTATGGCTATGGAGAGGTTAGCCAT
GATAAAGGAGCCAGGTCAAGTGCTGTGTCCAGGGAAAAGGAACGGGGTTCTGAGCGTGAC
TGGTCAGGCAACTCTGACAAGCGGCATCGTGATGAAAGAGAACATGACAGAGATAGGCAT
GATAAGGAGCACAGATACAGGGAAGAAAGGGATGGTTACCGGGACTATCGTCAAAAGGAG
CGTGAATCAGAGTATGAGGAAGACTATGACCGTGGACAGTCTTCTTCAAGATCCCGTAGC
AAATCCCGAGCAGCTCAGGAGGAGGATCATAGGTCTAGATCAAGAGACACAAATTATGGG
AAACGTAGACGCGCACCTTCTGAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400019058
PEP Infomation

pacid=37444311 transcript=PGSC0003DMT400027972 locus=PGSC0003DMG400010778 ID=PGSC0003DMT400027972.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDPTADEQLDYGDEEYGGSHKMQYHGSGTIPALAEDEMMGEDDEYDDLYNDVNIGEGFLQ
LQRSEVPVPSVDAGNGNFQAQKDSFPASRAGGLGSEEAKIPGIATEGKYAGTEVQFPQQK
GEPVVERETERPADAAQKARPSAITMTLNSQAGNSGYQGSMPMPQKIGADPMAMPEKNAS
EATPLMNSVVPGPRVVPHMPTNQLNSSGNVNMNNPVISETPFRPSLENGNTMLFVGELHW
WTTDAELESVLTQYGNVKEIKFFDERASGKSKGYCQVEFFDPASAAACKEGMNGYNFNGR
ACVVAFATPQTIKQMGSSYANKTQNQVQSQPQGRRPMNEGVGRGGPNYTPGDAGRNFGRG
SWGRGGPGMPNRGPGGGPVRGRGAMGSKNMMVNPGAGNGAGGAFGQGLAGPAFGGPPAGL
MHPQGMMGPGFDPSFMGRGAGYGGFSGPAFPGMMPPFQAVNPMGLPGVAPHVNPAFFGRG
MAANGMGMMSAAGMDGPHPGMWTDTSGGGWGGEEHGRRTRESSYGGEDNASEYGYGEVSH
DKGARSSAVSREKERGSERDWSGNSDKRHRDEREHDRDRHDKEHRYREERDGYRDYRQKE
RESEYEEDYDRGQSSSRSRSKSRAAQEEDHRSRSRDTNYGKRRRAPSE*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400027972
Transcript Infomation

pacid=37444311 locus=PGSC0003DMG400010778 ID=PGSC0003DMT400027972.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATCCAACAGCAGATGAGCAGTTGGACTATGGTGATGAGGAATATGGAGGAAGCCAC
AAGATGCAGTACCATGGAAGTGGGACAATTCCTGCTCTAGCAGAGGATGAAATGATGGGT
GAAGATGATGAATATGATGATCTTTACAATGATGTTAACATTGGGGAAGGTTTCCTACAG
CTGCAGCGGTCAGAGGTTCCAGTTCCTTCTGTTGATGCGGGAAATGGGAATTTTCAAGCC
CAGAAAGATAGTTTTCCTGCCTCAAGGGCTGGTGGTTTAGGATCAGAGGAGGCGAAAATC
CCTGGTATTGCAACAGAAGGGAAGTATGCTGGCACTGAAGTCCAATTTCCCCAGCAAAAG
GGTGAGCCTGTAGTTGAAAGGGAAACTGAACGACCTGCTGATGCTGCACAAAAAGCAAGG
CCTTCAGCAATTACAATGACTCTCAATTCTCAAGCGGGGAACTCTGGTTACCAAGGATCC
ATGCCAATGCCCCAGAAAATTGGTGCTGATCCTATGGCTATGCCAGAAAAAAATGCCAGT
GAAGCTACACCATTGATGAATTCTGTTGTGCCTGGACCAAGAGTTGTTCCGCACATGCCA
ACTAATCAATTGAACTCAAGTGGGAATGTTAACATGAATAATCCAGTTATTAGTGAGACT
CCTTTTAGGCCATCTCTGGAGAATGGCAACACCATGCTCTTTGTTGGAGAATTGCACTGG
TGGACTACTGATGCTGAGCTTGAGAGTGTGCTAACTCAATATGGGAATGTAAAGGAGATC
AAATTCTTTGATGAGAGAGCTAGTGGCAAGTCTAAAGGCTATTGTCAAGTTGAGTTTTTT
GACCCAGCTTCTGCAGCTGCTTGCAAAGAAGGAATGAATGGTTATAATTTCAATGGGCGA
GCCTGTGTTGTCGCATTTGCAACTCCACAAACTATAAAACAGATGGGTTCCTCATATGCG
AACAAAACTCAAAACCAGGTGCAGTCTCAACCACAGGGGCGGAGACCCATGAATGAGGGA
GTTGGTAGAGGTGGGCCAAATTACACCCCTGGAGATGCTGGGAGGAATTTCGGAAGAGGT
AGTTGGGGGCGTGGAGGGCCGGGTATGCCTAACAGAGGACCTGGGGGTGGACCAGTGAGG
GGAAGAGGAGCCATGGGATCAAAGAATATGATGGTGAATCCTGGAGCTGGCAATGGTGCT
GGTGGAGCTTTTGGGCAAGGACTTGCAGGTCCAGCATTTGGTGGTCCTCCTGCAGGTCTA
ATGCATCCCCAGGGCATGATGGGTCCTGGTTTTGATCCCAGTTTTATGGGTCGAGGAGCT
GGTTATGGAGGATTTTCAGGTCCTGCATTTCCCGGGATGATGCCTCCATTTCAAGCTGTT
AATCCTATGGGTCTTCCTGGAGTGGCTCCTCATGTCAACCCTGCATTCTTTGGTCGAGGA
ATGGCTGCAAATGGAATGGGAATGATGAGTGCTGCTGGGATGGATGGGCCTCATCCAGGA
ATGTGGACTGACACAAGCGGGGGAGGATGGGGAGGAGAAGAACATGGCAGGAGAACTAGA
GAGTCCAGTTATGGGGGTGAAGATAATGCATCAGAGTATGGCTATGGAGAGGTTAGCCAT
GATAAAGGAGCCAGGTCAAGTGCTGTGTCCAGGGAAAAGGAACGGGGTTCTGAGCGTGAC
TGGTCAGGCAACTCTGACAAGCGGCATCGTGATGAAAGAGAACATGACAGAGATAGGCAT
GATAAGGAGCACAGATACAGGGAAGAAAGGGATGGTTACCGGGACTATCGTCAAAAGGAG
CGTGAATCAGAGTATGAGGAAGACTATGACCGTGGACAGTCTTCTTCAAGATCCCGTAGC
AAATCCCGAGCAGCTCAGGAGGAGGATCATAGGTCTAGATCAAGAGACACAAATTATGGG
AAACGTAGACGCGCACCTTCTGAATGA