Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400027073
CDS Infomation

pacid=37424404 polypeptide=PGSC0003DMP400018465 locus=PGSC0003DMG400010442 ID=PGSC0003DMT400027073.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATATCAATCAGGCTTCGTCTTCAAAGACTTTATGCAACATCAAGATTTGCCTATGCT
GGATGGGGAGACTTTTTGGCTATGGAGAACAGAAGCTATCATTTAATGCAGGAATACCAT
GAATTTCCTCCAATAAACATGCTAGCGATTAATTCCCAGTTGAAGGAATTGGTTAAAAAT
GGTCAGTTAGAAGATGCACGCCAGATGTTTGACAAAATGACTCAAAGGGATGAGGTCACA
TGGACAAATATGATTTCTGGTTACGTCAATGACTCTAGTTCATTACAAGCATTGTCTTTA
TTCTTAGAAATGCGGCGTGATCCTACTATCAAAATGGACCCTTTTGCTCTTAGCCTTGCG
GTGAAGGCATGTGGGCTTGGTGTGAATTTGAAGTGTGGTGAGTTATTACATGGGTATTCG
ATGAAAGCTAATTTTGTTTGTTCTGTTTTTGTGGGTAGTTCACTTGTTGACATGTACATG
AAAGCTGGTAAAGTGTTGGAGGGTTGTGGAGTTTTTGATGAAATGCCTCTTAGGAATGTA
GTATCTTGGACCGCTGTTATAACTGGGCTTGTCCGAGCAGGTTACAATGAGGAAGGGCTG
GTGTATTTTTCTGAAATGTGGAGAGATGGTGTAGAATGTGATTCGTATGCTTATGCGATT
GTGTTAAAAGCGTGTGCTGATATTGGGTGTTTGAATTACGGGAGGGAAATGCATACTAGG
ATAGTGAAGAAAGGCTTGGATATGAGCTCTTATGTGGCTAATAGTCTTGCTACAATGTAC
AATAAATGTGGGAAAGTAAATTATGGTATGTGTTTATTTGGAAGAATGAAGTCGCGAGAT
GTTGTCTCGTGGACTACAGTAATCACGACATATGTTCAAATTGGTCAAAACCAATATGGT
ATACAAGCATTCTTGAGAATGAAAGAGTCGAATGTGACTCCTAATGAGTATACATTTGCT
GCAGTTGTTGCTGCTTGTGCAAATCTTTCGAAACTAGACTGGGGTGCACAACTGCATGCA
AATGTTTTACGTGTAGGCTTTCCTGATTCTCTGTCTGTGTCAAATTCAATTGTCACAATG
TACTCCAAATGTGGACAGTTGGATTCGGCCTCACTTGTATTTCATGAAATGAGTAGAAGA
GACATTGTTTCTTGGAGCACAATTATTGCTGGGTATGCTCAGGCTGGTTGTGGTGAGGAA
GCTTTCGAGCTGCTAACATGGATGAGAAAGGAAGGACCAAAGCCAACGGAATTTGCTCTT
GCAAGTGTACTTAGCGCATGTGGTAGTACGGCAATCCTTGACCAGGGAAAGCAACTTCAT
GCTCATGTTCTTATCATTGGATTAGATCATACGCCTTTAGTACTGAGTGCTTTGATCAAC
ATGTATTCAAAATGTGGAAGTATTGTAGAGGCCTCAAAGATATTTAATTCAGCACAAAAT
AATGACGTTGTATCATGGACAGCCATGATTCATGGGTATGCTGAACATGGATACAGCCAA
GATGCTATAAGTTTATTTGAAAGAATTCGTTATGCTGGTCTAAGACCAGATTCTGTGACC
TTCGTTGGTGTTCTAATCGCTTGTAGTCATGCTGGCCTTGTTGATCTAGCTTTTCACTAT
TTTAAATTGATGAAAGAGGAGTACAAAATAAGTTATTCAAAGGAACATTATGGTTGTATG
ATTGATCTTCTCTGTCGTGCTGGACGAATAACTGATGCTGAGAACATGATCAAGAATATG
CCATTTGAAAAGGATGATGTTGCTTGGTCAATCTTGCTTAGAGGCTGCAGGCTACATGGT
GATGTTGAATGTGGAAGCCGTGCGGCTGAGCAAATTCTTAAACTTGCTCCAAATTGTGCT
GTGACTCACACTACTTTGTCAAACATTTATGCGTCAAAGGGGAAGTGGGGTGAAGTAGCA
GAACTGAGGAAGTTGATGAGATTGAAAGGCGTCACGAAGGAGCCTGGATGGTCTTGGATT
AAGCTCAAGGATCAAGTTTCTGCATTCGTTGCTGGGGACAAAAAACATTCACAAAATGAA
GATATTTATGATATATTGGATCTGATATCCTCAAAAGCAGAATCTTCTTTTCAGAATATT
GCTTCTCTTTTGGAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400018465
PEP Infomation

pacid=37424404 transcript=PGSC0003DMT400027073 locus=PGSC0003DMG400010442 ID=PGSC0003DMT400027073.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MISIRLRLQRLYATSRFAYAGWGDFLAMENRSYHLMQEYHEFPPINMLAINSQLKELVKN
GQLEDARQMFDKMTQRDEVTWTNMISGYVNDSSSLQALSLFLEMRRDPTIKMDPFALSLA
VKACGLGVNLKCGELLHGYSMKANFVCSVFVGSSLVDMYMKAGKVLEGCGVFDEMPLRNV
VSWTAVITGLVRAGYNEEGLVYFSEMWRDGVECDSYAYAIVLKACADIGCLNYGREMHTR
IVKKGLDMSSYVANSLATMYNKCGKVNYGMCLFGRMKSRDVVSWTTVITTYVQIGQNQYG
IQAFLRMKESNVTPNEYTFAAVVAACANLSKLDWGAQLHANVLRVGFPDSLSVSNSIVTM
YSKCGQLDSASLVFHEMSRRDIVSWSTIIAGYAQAGCGEEAFELLTWMRKEGPKPTEFAL
ASVLSACGSTAILDQGKQLHAHVLIIGLDHTPLVLSALINMYSKCGSIVEASKIFNSAQN
NDVVSWTAMIHGYAEHGYSQDAISLFERIRYAGLRPDSVTFVGVLIACSHAGLVDLAFHY
FKLMKEEYKISYSKEHYGCMIDLLCRAGRITDAENMIKNMPFEKDDVAWSILLRGCRLHG
DVECGSRAAEQILKLAPNCAVTHTTLSNIYASKGKWGEVAELRKLMRLKGVTKEPGWSWI
KLKDQVSAFVAGDKKHSQNEDIYDILDLISSKAESSFQNIASLLE*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400027073
Transcript Infomation

pacid=37424404 locus=PGSC0003DMG400010442 ID=PGSC0003DMT400027073.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATATCAATCAGGCTTCGTCTTCAAAGACTTTATGCAACATCAAGATTTGCCTATGCT
GGATGGGGAGACTTTTTGGCTATGGAGAACAGAAGCTATCATTTAATGCAGGAATACCAT
GAATTTCCTCCAATAAACATGCTAGCGATTAATTCCCAGTTGAAGGAATTGGTTAAAAAT
GGTCAGTTAGAAGATGCACGCCAGATGTTTGACAAAATGACTCAAAGGGATGAGGTCACA
TGGACAAATATGATTTCTGGTTACGTCAATGACTCTAGTTCATTACAAGCATTGTCTTTA
TTCTTAGAAATGCGGCGTGATCCTACTATCAAAATGGACCCTTTTGCTCTTAGCCTTGCG
GTGAAGGCATGTGGGCTTGGTGTGAATTTGAAGTGTGGTGAGTTATTACATGGGTATTCG
ATGAAAGCTAATTTTGTTTGTTCTGTTTTTGTGGGTAGTTCACTTGTTGACATGTACATG
AAAGCTGGTAAAGTGTTGGAGGGTTGTGGAGTTTTTGATGAAATGCCTCTTAGGAATGTA
GTATCTTGGACCGCTGTTATAACTGGGCTTGTCCGAGCAGGTTACAATGAGGAAGGGCTG
GTGTATTTTTCTGAAATGTGGAGAGATGGTGTAGAATGTGATTCGTATGCTTATGCGATT
GTGTTAAAAGCGTGTGCTGATATTGGGTGTTTGAATTACGGGAGGGAAATGCATACTAGG
ATAGTGAAGAAAGGCTTGGATATGAGCTCTTATGTGGCTAATAGTCTTGCTACAATGTAC
AATAAATGTGGGAAAGTAAATTATGGTATGTGTTTATTTGGAAGAATGAAGTCGCGAGAT
GTTGTCTCGTGGACTACAGTAATCACGACATATGTTCAAATTGGTCAAAACCAATATGGT
ATACAAGCATTCTTGAGAATGAAAGAGTCGAATGTGACTCCTAATGAGTATACATTTGCT
GCAGTTGTTGCTGCTTGTGCAAATCTTTCGAAACTAGACTGGGGTGCACAACTGCATGCA
AATGTTTTACGTGTAGGCTTTCCTGATTCTCTGTCTGTGTCAAATTCAATTGTCACAATG
TACTCCAAATGTGGACAGTTGGATTCGGCCTCACTTGTATTTCATGAAATGAGTAGAAGA
GACATTGTTTCTTGGAGCACAATTATTGCTGGGTATGCTCAGGCTGGTTGTGGTGAGGAA
GCTTTCGAGCTGCTAACATGGATGAGAAAGGAAGGACCAAAGCCAACGGAATTTGCTCTT
GCAAGTGTACTTAGCGCATGTGGTAGTACGGCAATCCTTGACCAGGGAAAGCAACTTCAT
GCTCATGTTCTTATCATTGGATTAGATCATACGCCTTTAGTACTGAGTGCTTTGATCAAC
ATGTATTCAAAATGTGGAAGTATTGTAGAGGCCTCAAAGATATTTAATTCAGCACAAAAT
AATGACGTTGTATCATGGACAGCCATGATTCATGGGTATGCTGAACATGGATACAGCCAA
GATGCTATAAGTTTATTTGAAAGAATTCGTTATGCTGGTCTAAGACCAGATTCTGTGACC
TTCGTTGGTGTTCTAATCGCTTGTAGTCATGCTGGCCTTGTTGATCTAGCTTTTCACTAT
TTTAAATTGATGAAAGAGGAGTACAAAATAAGTTATTCAAAGGAACATTATGGTTGTATG
ATTGATCTTCTCTGTCGTGCTGGACGAATAACTGATGCTGAGAACATGATCAAGAATATG
CCATTTGAAAAGGATGATGTTGCTTGGTCAATCTTGCTTAGAGGCTGCAGGCTACATGGT
GATGTTGAATGTGGAAGCCGTGCGGCTGAGCAAATTCTTAAACTTGCTCCAAATTGTGCT
GTGACTCACACTACTTTGTCAAACATTTATGCGTCAAAGGGGAAGTGGGGTGAAGTAGCA
GAACTGAGGAAGTTGATGAGATTGAAAGGCGTCACGAAGGAGCCTGGATGGTCTTGGATT
AAGCTCAAGGATCAAGTTTCTGCATTCGTTGCTGGGGACAAAAAACATTCACAAAATGAA
GATATTTATGATATATTGGATCTGATATCCTCAAAAGCAGAATCTTCTTTTCAGAATATT
GCTTCTCTTTTGGAGTAG