Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400026935
CDS Infomation

pacid=37427691 polypeptide=PGSC0003DMP400018366 locus=PGSC0003DMG400010387 ID=PGSC0003DMT400026935.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTATTAGTGAAAAAAGGATGGAGATGAAACAGCAGTTAGAGTGGAATGAAGCTCAG
AAGACTCTGATAACTGTGGACCTTGTTGCTGCAGCTAAAGAGCAGCTCAAGTTTCTTGCT
ACCGTGGATAGAAACCGTTGGCTGTATGAAGGCCGTGGCCTGGATAAAGCCATTCATAGG
TACTACTCATGTTGGCTACCACTGTTGGCAAAACACTCTGAGTCCCCCTACTTTGACGGA
CCCTTGGTTGTTCCTTTGGATTGTGAATGGATTTGGCATTGTCACAGGCTCAATCCCGTT
AGATACAAGACTGACTGTGAGAAATTATATGGGAGAATTCTTGACAACCATGATGTTGTA
TCTTCTGTGAATGCGAAATCAAAACAGGATACCGAAGAACTGTGGGAACACTTGTATACA
AATGAGCCTTATGATTTGGACTCAGCTAGAGCTCTTTCAGAAGATGTCCATGCAAAAGCT
ATACAAGCTGAAAAGTACAGTGATTATGATCTAGTCTCTGCTGTTACACGGCAAAGCCCA
TTCTTTTACCAGGTGTCTAGACCACACATAAACAACGATCTCTATCTTGAAGGTGCTGTG
GCTCGATACAAGGGTTTCTTACATCTGATCCGGAGAAACAAAGAAAGATCGATGAAGAGC
TTCACTGTTCCAACTTATGACATAGACCTTATCTGGCATACTCACCAGTTACATCCTGCT
TCTTATTGCAAAGACCTTGTTGACATTATGGGTAAGGTTTTAGAACATGATGACACTGAC
TCAGATCGAACAAAAGGGAAAAAGTTGGATACTGGCTTTTCTCGCACTACAAAGCAGTGG
GAAGAAACATATGGTTTAAGATATTGGAGGGCAGGTGCAATGTATAGAGGCAGTTCACCA
TCTCCTCTTGGGAATTCTTATTACCCCTCCAACCCTGTACGCAAGAACACAGATATTTTC
CATGAGCACCAAAAGATAATGCAGTATCCTGAGATGGAAGCAGTAGAAGTTATGTTAGAG
CTTGTAGATATCAGAAACTTACCAGAAGGACACAAGGGAAGCTTCTTTGTCTCATTTAGC
AAGACTCAGCCTGATAGAATCTTCAATGCAAAGAGAAAACTTACTATTTTGTCCGTCACT
GGGGAAAAACAGGTTGCTTATTTCCAATGTGAACCTAATGGGCATCTTCTTTTTGATCTC
ATGTCCTGCTCATCGTCTGGTTTGCCTATTCCGAAATCTGTTAAATCTGTGGGTTCTGTT
AAAGTCTCTTTAGAAGATTTGGTTTGCCCGACTTCAAAACTTACAATGGAAAAGTGGTTG
GAAGTTGTGCCAAGCTCTAAAATTGAAACACTAAAGCCAATCTGTTTACGAGTAGCTATC
TCAGTTACAACACCTACTGCAGCACCATATGTCTTTCACTTTGTCCGTCCTCGAGCATTC
TCCAAAAATTCTTGCTTATTCCCACTTCCTGGAAGGATTCAGCATGCTAAGAATTGGACT
CGTGTCATTGATGATGCTGGTGATGAGGTCATTAGCCTTCAAATGAGGGACTCGAAGAAA
TCCAAGGGGGAAACTGATTCTACATTGCACAAAGAGGTAGTTGCCGTCAGCAAGTCTAGC
GAGGTACATTCTCTTGCTGAGTTAGTAGGGAAAGAGTGGTTGCTGTTAGATGCTCAGTGG
TCTCTTCAACTTCAAACATCCAGCAGTGATGATGGCCACCTTTTTGAGTTGGCTGGTCAG
AGGAATGTGAAATTCTTCCCTGGTCAGAGGCTGGATTATGAGCACAAGCATTGTACAAAG
CAAAGGAGTCAAGATGATTTTATGACAGCGGTAGAGTTCTCTGCACAGGATCCTTATGGA
AAGGCAGTGGCGTTGGTTGACTTGAAATTTGGAGTTATCAATGTGAAAGAGGAGTGGTTT
CTTTTGCCTGGTTCTATAACAGCTTTTGTACTTTGTGATACGTTGAAGAAGGAAGGGTAT
AGTAGCCTGGTAGGCAGTGCCAAACATTCGAAAGAGAAGAATTTTTCCATTCAAGAAACT
GATGTGTGCCATGAAGAGGACAACAGAGCTAATCTGGAATCTGAGACAGAGAAGGGGGTG
AAGTTGGACCTGGAGGCTACCAAAGGAAGCATTGTAGCACCCGCAAATGAAGCAATCAGT
GGAGGCTGCGGTAATCTTATGAAGAGGGGAGCCTGTGGCAGTTGTGGTGCTGTTTGTGGA
AACAAACTAAAGAGTGGTGGTTGTGGTGGGTGCGGAAGTGGTGGTTGTGGAAGTATGTTA
GAAAGCAGTGGCTGTGGCAGTGGCTGTGGCAGCGGCTGTGGTGGTGGTGGTTGTGGAAGT
ATGTTAGAAAGCGGCGGCTGTGGTGGCAGCGGTTGTGGAGGCTGTGGTGGTGGTGGTTGT
GGAAGTATGTTAGAAAGCGGTGGCTGTGGAGGTTGTGGTGGTGGTGGCTGTGGAAATAGG
TTAGAAAGCAGCGGCTGTGGAGGTTGTGGTGGTGGTGGCTGTGGAAATAGGTTAGAAAGT
GGCGGCTGTGGAGGTTGTGGTGGTGGTGGTTGTGGAGGGAATAGTTTGAAAAGCAGTGGT
TGTGGCGGCTGTGGTGGCGGTGGATGTGGTAATGGTTTGGCATCTATCACAACTGTTGAA
GTTAATGCATAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400018366
PEP Infomation

pacid=37427691 transcript=PGSC0003DMT400026935 locus=PGSC0003DMG400010387 ID=PGSC0003DMT400026935.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGISEKRMEMKQQLEWNEAQKTLITVDLVAAAKEQLKFLATVDRNRWLYEGRGLDKAIHR
YYSCWLPLLAKHSESPYFDGPLVVPLDCEWIWHCHRLNPVRYKTDCEKLYGRILDNHDVV
SSVNAKSKQDTEELWEHLYTNEPYDLDSARALSEDVHAKAIQAEKYSDYDLVSAVTRQSP
FFYQVSRPHINNDLYLEGAVARYKGFLHLIRRNKERSMKSFTVPTYDIDLIWHTHQLHPA
SYCKDLVDIMGKVLEHDDTDSDRTKGKKLDTGFSRTTKQWEETYGLRYWRAGAMYRGSSP
SPLGNSYYPSNPVRKNTDIFHEHQKIMQYPEMEAVEVMLELVDIRNLPEGHKGSFFVSFS
KTQPDRIFNAKRKLTILSVTGEKQVAYFQCEPNGHLLFDLMSCSSSGLPIPKSVKSVGSV
KVSLEDLVCPTSKLTMEKWLEVVPSSKIETLKPICLRVAISVTTPTAAPYVFHFVRPRAF
SKNSCLFPLPGRIQHAKNWTRVIDDAGDEVISLQMRDSKKSKGETDSTLHKEVVAVSKSS
EVHSLAELVGKEWLLLDAQWSLQLQTSSSDDGHLFELAGQRNVKFFPGQRLDYEHKHCTK
QRSQDDFMTAVEFSAQDPYGKAVALVDLKFGVINVKEEWFLLPGSITAFVLCDTLKKEGY
SSLVGSAKHSKEKNFSIQETDVCHEEDNRANLESETEKGVKLDLEATKGSIVAPANEAIS
GGCGNLMKRGACGSCGAVCGNKLKSGGCGGCGSGGCGSMLESSGCGSGCGSGCGGGGCGS
MLESGGCGGSGCGGCGGGGCGSMLESGGCGGCGGGGCGNRLESSGCGGCGGGGCGNRLES
GGCGGCGGGGCGGNSLKSSGCGGCGGGGCGNGLASITTVEVNA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400026935
Transcript Infomation

pacid=37427691 locus=PGSC0003DMG400010387 ID=PGSC0003DMT400026935.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTATTAGTGAAAAAAGGATGGAGATGAAACAGCAGTTAGAGTGGAATGAAGCTCAG
AAGACTCTGATAACTGTGGACCTTGTTGCTGCAGCTAAAGAGCAGCTCAAGTTTCTTGCT
ACCGTGGATAGAAACCGTTGGCTGTATGAAGGCCGTGGCCTGGATAAAGCCATTCATAGG
TACTACTCATGTTGGCTACCACTGTTGGCAAAACACTCTGAGTCCCCCTACTTTGACGGA
CCCTTGGTTGTTCCTTTGGATTGTGAATGGATTTGGCATTGTCACAGGCTCAATCCCGTT
AGATACAAGACTGACTGTGAGAAATTATATGGGAGAATTCTTGACAACCATGATGTTGTA
TCTTCTGTGAATGCGAAATCAAAACAGGATACCGAAGAACTGTGGGAACACTTGTATACA
AATGAGCCTTATGATTTGGACTCAGCTAGAGCTCTTTCAGAAGATGTCCATGCAAAAGCT
ATACAAGCTGAAAAGTACAGTGATTATGATCTAGTCTCTGCTGTTACACGGCAAAGCCCA
TTCTTTTACCAGGTGTCTAGACCACACATAAACAACGATCTCTATCTTGAAGGTGCTGTG
GCTCGATACAAGGGTTTCTTACATCTGATCCGGAGAAACAAAGAAAGATCGATGAAGAGC
TTCACTGTTCCAACTTATGACATAGACCTTATCTGGCATACTCACCAGTTACATCCTGCT
TCTTATTGCAAAGACCTTGTTGACATTATGGGTAAGGTTTTAGAACATGATGACACTGAC
TCAGATCGAACAAAAGGGAAAAAGTTGGATACTGGCTTTTCTCGCACTACAAAGCAGTGG
GAAGAAACATATGGTTTAAGATATTGGAGGGCAGGTGCAATGTATAGAGGCAGTTCACCA
TCTCCTCTTGGGAATTCTTATTACCCCTCCAACCCTGTACGCAAGAACACAGATATTTTC
CATGAGCACCAAAAGATAATGCAGTATCCTGAGATGGAAGCAGTAGAAGTTATGTTAGAG
CTTGTAGATATCAGAAACTTACCAGAAGGACACAAGGGAAGCTTCTTTGTCTCATTTAGC
AAGACTCAGCCTGATAGAATCTTCAATGCAAAGAGAAAACTTACTATTTTGTCCGTCACT
GGGGAAAAACAGGTTGCTTATTTCCAATGTGAACCTAATGGGCATCTTCTTTTTGATCTC
ATGTCCTGCTCATCGTCTGGTTTGCCTATTCCGAAATCTGTTAAATCTGTGGGTTCTGTT
AAAGTCTCTTTAGAAGATTTGGTTTGCCCGACTTCAAAACTTACAATGGAAAAGTGGTTG
GAAGTTGTGCCAAGCTCTAAAATTGAAACACTAAAGCCAATCTGTTTACGAGTAGCTATC
TCAGTTACAACACCTACTGCAGCACCATATGTCTTTCACTTTGTCCGTCCTCGAGCATTC
TCCAAAAATTCTTGCTTATTCCCACTTCCTGGAAGGATTCAGCATGCTAAGAATTGGACT
CGTGTCATTGATGATGCTGGTGATGAGGTCATTAGCCTTCAAATGAGGGACTCGAAGAAA
TCCAAGGGGGAAACTGATTCTACATTGCACAAAGAGGTAGTTGCCGTCAGCAAGTCTAGC
GAGGTACATTCTCTTGCTGAGTTAGTAGGGAAAGAGTGGTTGCTGTTAGATGCTCAGTGG
TCTCTTCAACTTCAAACATCCAGCAGTGATGATGGCCACCTTTTTGAGTTGGCTGGTCAG
AGGAATGTGAAATTCTTCCCTGGTCAGAGGCTGGATTATGAGCACAAGCATTGTACAAAG
CAAAGGAGTCAAGATGATTTTATGACAGCGGTAGAGTTCTCTGCACAGGATCCTTATGGA
AAGGCAGTGGCGTTGGTTGACTTGAAATTTGGAGTTATCAATGTGAAAGAGGAGTGGTTT
CTTTTGCCTGGTTCTATAACAGCTTTTGTACTTTGTGATACGTTGAAGAAGGAAGGGTAT
AGTAGCCTGGTAGGCAGTGCCAAACATTCGAAAGAGAAGAATTTTTCCATTCAAGAAACT
GATGTGTGCCATGAAGAGGACAACAGAGCTAATCTGGAATCTGAGACAGAGAAGGGGGTG
AAGTTGGACCTGGAGGCTACCAAAGGAAGCATTGTAGCACCCGCAAATGAAGCAATCAGT
GGAGGCTGCGGTAATCTTATGAAGAGGGGAGCCTGTGGCAGTTGTGGTGCTGTTTGTGGA
AACAAACTAAAGAGTGGTGGTTGTGGTGGGTGCGGAAGTGGTGGTTGTGGAAGTATGTTA
GAAAGCAGTGGCTGTGGCAGTGGCTGTGGCAGCGGCTGTGGTGGTGGTGGTTGTGGAAGT
ATGTTAGAAAGCGGCGGCTGTGGTGGCAGCGGTTGTGGAGGCTGTGGTGGTGGTGGTTGT
GGAAGTATGTTAGAAAGCGGTGGCTGTGGAGGTTGTGGTGGTGGTGGCTGTGGAAATAGG
TTAGAAAGCAGCGGCTGTGGAGGTTGTGGTGGTGGTGGCTGTGGAAATAGGTTAGAAAGT
GGCGGCTGTGGAGGTTGTGGTGGTGGTGGTTGTGGAGGGAATAGTTTGAAAAGCAGTGGT
TGTGGCGGCTGTGGTGGCGGTGGATGTGGTAATGGTTTGGCATCTATCACAACTGTTGAA
GTTAATGCATAA