Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400026605
CDS Infomation	pacid=37479335 polypeptide=PGSC0003DMP400018156 locus=PGSC0003DMG400010277 ID=PGSC0003DMT400026605.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGATCGGTCAAGCAAAAAAGGGTCGAAAATGGCCTGTTGTTTCCCTGTTATCCTTGAC CGATCCATGAGAAGCAGCTTCAAGCTATCTAAGAGCTCTTCTTCTAATAAACTCAATAAA AGCAAGAGCTCTATATGTTCACCAACATCTCTATCGATGAAGAAAAAGTCTGTCCAGGAA AATGATCACCTGGTTGTATGTTTTGGGGAGCTGTTGATAGATTTTGTGCCTACAGTATCT GGAGTTTCACTTGCAGAAGCACCTGGTTTTAAAAAGGCTCCTGGTGGGGCACCAGCTAAT GTTGCAGTTGGTATTGCAAGATTAGGAGGTTCTTCCGCCTTTATTGGCAAGGTGGGTGCA GATGAATTTGGTTACATGTTAGCTGATATATTAAAACAGAACAATGTTGACAATTCTGGT ATGCGTTTTGATACTCATGCTAGAACAGCATTGGCGTTTGTTACATTGAAAGCAGATGGT GAGAGAGAATTCATGTTTTTCCGCAATCCAAGTGCTGATATGCTTCTAACTGAGGCAGAG CTCGACAAAAATCTCATTCAAAAGGCAAGAATCTTTCACTATGGTTCAATCTCTTTGATT GCTGAACCATGTAGGTCAGCTCATCTTGCTGCCATGGAGACTGCTAAAAATGCAGGCTGC ATTCTTTCTTATGACCCAAATCTAAGGTTGCCCTTATGGCCATCCGCTGAGGCTGCTCGT GAAGGAATTTTAAGCATTTGGGACCAAGCTGACATTATTAAGGTAAGTGAAGATGAAATC ACATTTTTAACAAATGGTGAAGATGCTTATGATGACAATGTGGTCATGACTAAGCTTTTC CACTCCAACCTTAAACTTTTGCTCGTAACTGAAGGCGGAGACGGTTGCAGATACTATACT AAGAATTTTCATGGAAGAGTGAATGGCGTTAAAGTTACAGCAGTTGACACCACAGGAGCA GGTGATGCATTTGTTGGTGGACTTCTCAACAGTATGGCCTCAGATCCAGATATTTACATG GATGAGAAGAAATTGAGGGATGCACTCCTATTTGCAAATGGATGTGGAGCAATAACTGTA ACAGAAAAAGGAGCAATTCCTGCATTGCCTACAAAAGAAGCAGTACTTAAAATCTTGGAT GGTGCCACTGCTAATTGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400018156
PEP Infomation	pacid=37479335 transcript=PGSC0003DMT400026605 locus=PGSC0003DMG400010277 ID=PGSC0003DMT400026605.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MDRSSKKGSKMACCFPVILDRSMRSSFKLSKSSSSNKLNKSKSSICSPTSLSMKKKSVQE NDHLVVCFGELLIDFVPTVSGVSLAEAPGFKKAPGGAPANVAVGIARLGGSSAFIGKVGA DEFGYMLADILKQNNVDNSGMRFDTHARTALAFVTLKADGEREFMFFRNPSADMLLTEAE LDKNLIQKARIFHYGSISLIAEPCRSAHLAAMETAKNAGCILSYDPNLRLPLWPSAEAAR EGILSIWDQADIIKVSEDEITFLTNGEDAYDDNVVMTKLFHSNLKLLLVTEGGDGCRYYT KNFHGRVNGVKVTAVDTTGAGDAFVGGLLNSMASDPDIYMDEKKLRDALLFANGCGAITV TEKGAIPALPTKEAVLKILDGATAN*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400026605
Transcript Infomation	pacid=37479335 locus=PGSC0003DMG400010277 ID=PGSC0003DMT400026605.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGATCGGTCAAGCAAAAAAGGGTCGAAAATGGCCTGTTGTTTCCCTGTTATCCTTGAC CGATCCATGAGAAGCAGCTTCAAGCTATCTAAGAGCTCTTCTTCTAATAAACTCAATAAA AGCAAGAGCTCTATATGTTCACCAACATCTCTATCGATGAAGAAAAAGTCTGTCCAGGAA AATGATCACCTGGTTGTATGTTTTGGGGAGCTGTTGATAGATTTTGTGCCTACAGTATCT GGAGTTTCACTTGCAGAAGCACCTGGTTTTAAAAAGGCTCCTGGTGGGGCACCAGCTAAT GTTGCAGTTGGTATTGCAAGATTAGGAGGTTCTTCCGCCTTTATTGGCAAGGTGGGTGCA GATGAATTTGGTTACATGTTAGCTGATATATTAAAACAGAACAATGTTGACAATTCTGGT ATGCGTTTTGATACTCATGCTAGAACAGCATTGGCGTTTGTTACATTGAAAGCAGATGGT GAGAGAGAATTCATGTTTTTCCGCAATCCAAGTGCTGATATGCTTCTAACTGAGGCAGAG CTCGACAAAAATCTCATTCAAAAGGCAAGAATCTTTCACTATGGTTCAATCTCTTTGATT GCTGAACCATGTAGGTCAGCTCATCTTGCTGCCATGGAGACTGCTAAAAATGCAGGCTGC ATTCTTTCTTATGACCCAAATCTAAGGTTGCCCTTATGGCCATCCGCTGAGGCTGCTCGT GAAGGAATTTTAAGCATTTGGGACCAAGCTGACATTATTAAGGTAAGTGAAGATGAAATC ACATTTTTAACAAATGGTGAAGATGCTTATGATGACAATGTGGTCATGACTAAGCTTTTC CACTCCAACCTTAAACTTTTGCTCGTAACTGAAGGCGGAGACGGTTGCAGATACTATACT AAGAATTTTCATGGAAGAGTGAATGGCGTTAAAGTTACAGCAGTTGACACCACAGGAGCA GGTGATGCATTTGTTGGTGGACTTCTCAACAGTATGGCCTCAGATCCAGATATTTACATG GATGAGAAGAAATTGAGGGATGCACTCCTATTTGCAAATGGATGTGGAGCAATAACTGTA ACAGAAAAAGGAGCAATTCCTGCATTGCCTACAAAAGAAGCAGTACTTAAAATCTTGGAT GGTGCCACTGCTAATTGA