Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400026382
CDS Infomation

pacid=37462708 polypeptide=PGSC0003DMP400018017 locus=PGSC0003DMG400010177 ID=PGSC0003DMT400026382.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTTCCTTCAAAACTCAAAAAGTTCAAAGCTTTACATGAAATACTAACTGGTATTCAT
AATGAGACATCTTTTTCTAAATTTACAACAAAGAAAAACTACAGAGCATCAGTCATATGG
GACAAGAACCAAGAGGAGGAGGAGGGTGAATATTTGAATGTTCTGCGTCAATGTGTGGCG
ACATCAAGATTGGATAACGCCAAAGCCATTCACGCGAAACTGCTGAAAAACCCAGGCGGC
AGGTCTTCGCTATACTTACACAACCATCTTCTAAATGCTTATGTGAAATGTGGTGACACT
GCGAAAGGACTCAAACTGTTTGATGAAATGACTGACAGAAATGTGGTGTCTTGGACTGCC
CTCATTGCTGGATTTGTGCAAAAGGGTTTCCCTGTTGAAGCTTTCTCTCTGTTTACTCGT
ATGCACCGGAGTGGGACGAAGCCTAATGAGTTCACTTTCGTGAGTGCCCTTCACGCTTGC
TCGTTTGAGGATAGATTAAGCTTGACTAATGCATACCAAGTATATGGACTAATTACAAGA
CTTGGATTCGAGTCTAATGTTTATTTAATGAATGCTTTTTTGACGACTTTGATAAGGCAC
GGTAGATTAGATGAAGCATTAATGGTTTTTGAGTGGTGTTCCAATAAAGATATTGTTACT
TGGAATGCAATGCTAGGTGGTTGCATGCAATTTTGTTGCTCAGAGGTACCAAGGCTTTGG
TACAGGATGATCCACGAAGGAGTTGTACCAGATAACTTCAGTTTTGCTAGTGTTCTTACT
GGGTTAGCAGAGCTTTTTGTTCTTGATTTGGGTGTGCAAGTACATTCCCAGCTTGTTAAG
TCTGGTCATGGAAGTGAGATGTGTGTAGGGAACTCTTTGGTGGATATGTATTTGAAAAAT
CGAAGTTTGGGTGAGGGTTTCAAAGCATTCGAAGAGATCTGTTTTAAAGACATTTGTTCC
TGGACGCAAATGGCAGCAGGGTGTTTGAATTGTGACGAGCCAATTGAAGCTCTCAGGGTC
ATTGGAGAAATGAGGAGGGCAGGAGTAATGCCTAATAAGTTTACTCTAGCAACAGCTTTT
AGTGCATGTGCCAATACAGTTTCTTTCAAAGAAGGGGAGAAAGTTCATGGCTTGAGGATC
AAACTCGGGGATGACATTGATGTCTGTGTAGATAATGCATTGCTCGACATGTACGCCAAA
TGTGGTAGCATGGATGGGGCATTCATGGTTTTTCAGTCAATGGATGAACACACTACTGTT
TCATGGACCACTATGATTATGGGCTATGCGCAAAACGGATATCCCAAAAAAGCTCTTGAA
ATTTTCCATCAGATGAGGGAGGAAGGGGCAGAGCCTAACTACATTACCTTCATATGTGTA
CTTTATGCTTGCAGCCAAGGAGGACTTATCGACGAGGGATGGAAGTATTTCACATCAATG
AGTGATGACTATGGGATTCTCCCCGGAGAAGATCACTATGCTTGTATGGTGAATCTCCTT
GGACGTGTTGGACGTGTTAGAGAAGCTGAGGAACTAATCTTGAGTATGCCCTTTCAACCA
GGTTTGCTGGTCTGGCAAACGTTGCTTGGGGCATCCCGACTTCATGGGGATATGGAAACT
GCAGAACGAGCAGCAGAACGAGCATTACAAGTTGACAAAGTTGATCCTTCAATCTATGTG
TTATTGTCCAATACATTTGCTGGTTTGCAAAACTGGGATGGAGTTGGAACTGTGAGGGAA
TTGATGCAAAGCAGGGATGTCAAGAAAGTCCCTGGCTCCAGTTGGTTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400018017
PEP Infomation

pacid=37462708 transcript=PGSC0003DMT400026382 locus=PGSC0003DMG400010177 ID=PGSC0003DMT400026382.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLPSKLKKFKALHEILTGIHNETSFSKFTTKKNYRASVIWDKNQEEEEGEYLNVLRQCVA
TSRLDNAKAIHAKLLKNPGGRSSLYLHNHLLNAYVKCGDTAKGLKLFDEMTDRNVVSWTA
LIAGFVQKGFPVEAFSLFTRMHRSGTKPNEFTFVSALHACSFEDRLSLTNAYQVYGLITR
LGFESNVYLMNAFLTTLIRHGRLDEALMVFEWCSNKDIVTWNAMLGGCMQFCCSEVPRLW
YRMIHEGVVPDNFSFASVLTGLAELFVLDLGVQVHSQLVKSGHGSEMCVGNSLVDMYLKN
RSLGEGFKAFEEICFKDICSWTQMAAGCLNCDEPIEALRVIGEMRRAGVMPNKFTLATAF
SACANTVSFKEGEKVHGLRIKLGDDIDVCVDNALLDMYAKCGSMDGAFMVFQSMDEHTTV
SWTTMIMGYAQNGYPKKALEIFHQMREEGAEPNYITFICVLYACSQGGLIDEGWKYFTSM
SDDYGILPGEDHYACMVNLLGRVGRVREAEELILSMPFQPGLLVWQTLLGASRLHGDMET
AERAAERALQVDKVDPSIYVLLSNTFAGLQNWDGVGTVRELMQSRDVKKVPGSSWF*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400026382
Transcript Infomation

pacid=37462708 locus=PGSC0003DMG400010177 ID=PGSC0003DMT400026382.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTTCCTTCAAAACTCAAAAAGTTCAAAGCTTTACATGAAATACTAACTGGTATTCAT
AATGAGACATCTTTTTCTAAATTTACAACAAAGAAAAACTACAGAGCATCAGTCATATGG
GACAAGAACCAAGAGGAGGAGGAGGGTGAATATTTGAATGTTCTGCGTCAATGTGTGGCG
ACATCAAGATTGGATAACGCCAAAGCCATTCACGCGAAACTGCTGAAAAACCCAGGCGGC
AGGTCTTCGCTATACTTACACAACCATCTTCTAAATGCTTATGTGAAATGTGGTGACACT
GCGAAAGGACTCAAACTGTTTGATGAAATGACTGACAGAAATGTGGTGTCTTGGACTGCC
CTCATTGCTGGATTTGTGCAAAAGGGTTTCCCTGTTGAAGCTTTCTCTCTGTTTACTCGT
ATGCACCGGAGTGGGACGAAGCCTAATGAGTTCACTTTCGTGAGTGCCCTTCACGCTTGC
TCGTTTGAGGATAGATTAAGCTTGACTAATGCATACCAAGTATATGGACTAATTACAAGA
CTTGGATTCGAGTCTAATGTTTATTTAATGAATGCTTTTTTGACGACTTTGATAAGGCAC
GGTAGATTAGATGAAGCATTAATGGTTTTTGAGTGGTGTTCCAATAAAGATATTGTTACT
TGGAATGCAATGCTAGGTGGTTGCATGCAATTTTGTTGCTCAGAGGTACCAAGGCTTTGG
TACAGGATGATCCACGAAGGAGTTGTACCAGATAACTTCAGTTTTGCTAGTGTTCTTACT
GGGTTAGCAGAGCTTTTTGTTCTTGATTTGGGTGTGCAAGTACATTCCCAGCTTGTTAAG
TCTGGTCATGGAAGTGAGATGTGTGTAGGGAACTCTTTGGTGGATATGTATTTGAAAAAT
CGAAGTTTGGGTGAGGGTTTCAAAGCATTCGAAGAGATCTGTTTTAAAGACATTTGTTCC
TGGACGCAAATGGCAGCAGGGTGTTTGAATTGTGACGAGCCAATTGAAGCTCTCAGGGTC
ATTGGAGAAATGAGGAGGGCAGGAGTAATGCCTAATAAGTTTACTCTAGCAACAGCTTTT
AGTGCATGTGCCAATACAGTTTCTTTCAAAGAAGGGGAGAAAGTTCATGGCTTGAGGATC
AAACTCGGGGATGACATTGATGTCTGTGTAGATAATGCATTGCTCGACATGTACGCCAAA
TGTGGTAGCATGGATGGGGCATTCATGGTTTTTCAGTCAATGGATGAACACACTACTGTT
TCATGGACCACTATGATTATGGGCTATGCGCAAAACGGATATCCCAAAAAAGCTCTTGAA
ATTTTCCATCAGATGAGGGAGGAAGGGGCAGAGCCTAACTACATTACCTTCATATGTGTA
CTTTATGCTTGCAGCCAAGGAGGACTTATCGACGAGGGATGGAAGTATTTCACATCAATG
AGTGATGACTATGGGATTCTCCCCGGAGAAGATCACTATGCTTGTATGGTGAATCTCCTT
GGACGTGTTGGACGTGTTAGAGAAGCTGAGGAACTAATCTTGAGTATGCCCTTTCAACCA
GGTTTGCTGGTCTGGCAAACGTTGCTTGGGGCATCCCGACTTCATGGGGATATGGAAACT
GCAGAACGAGCAGCAGAACGAGCATTACAAGTTGACAAAGTTGATCCTTCAATCTATGTG
TTATTGTCCAATACATTTGCTGGTTTGCAAAACTGGGATGGAGTTGGAACTGTGAGGGAA
TTGATGCAAAGCAGGGATGTCAAGAAAGTCCCTGGCTCCAGTTGGTTTTAA