Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400025916
CDS Infomation

pacid=37476305 polypeptide=PGSC0003DMP400017685 locus=PGSC0003DMG400010006 ID=PGSC0003DMT400025916.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAAAATGCCGTCAAAACATCTTTGCAGAACCAATCAGCCACGGGTTCCATTGCTAAC
TTCTACGCAGTGCAGCTCCAACTTCTTTGCCGAGAGCATAAGCATGCCACCTCAGCGTCT
GCTCTTCTTCGATCAATCCATGCCAACATGATCACCTCCGGATTCAGCCCGCGTAGCCAC
ATCCTTAATAACTTAATCAATATCTATTGCAAAAATTCCGGTCTTGTTTATGCAAAGCAC
CTGTTTGATAGAATTCCCCAACCAGATGTAGTGGCAAGAACAACTATGATTGCTGCATAC
TCTGCTTCCGGAGAACCCAAGCTTGCAAGAGAGGTTTTTGACAAAACCCCATTAAGTATC
CGTGACACTGTTTGTTACAACGCTATGATTACAGGCTATTCACACAACAACGATGGCCAT
GCTGCTATAAAATTATTTCTTGATATGAGGTGGAAAAATTTTCAACCCGATGAGTATACC
TACACCTCCGTACTTGCAGCCTTAGCCCTTATAGCTGATCATGAAATGCACTGCCGGCAG
CTGCATTGTGCTGTTGCAAAGTCAGGCATGGCCAACTTTAAGTGTGTTGTCAATGCACTT
ATATCTGTTTATGTCAGATGTGCTTCGTCACCCCTAGCATCATCCTTGCTGTTGATGGAC
TCAGCTAGCAAGTTGTTTTATGAGATGCCAGAACGGGATGACTTATCTTGGACTACGATT
ATCACAGGGTATGTGAAGAATGATGATCTTGATGCTGCTCGGAAGGTGTTTGATGGTATG
GATGAGAAGTTGCTTGTGGCATGGAATGCCATGATCTCCGGATATGTGCATAAAGGTTTC
ATCTTTGAAGCATTAGATATGTTAAGGAAAATGTATTTAGCAGGGATGAAGCCAGATGAG
TTTACCTGCACCAGTATCCTCAGTGCTTGTGCCGATGCTGGACTGTTTCTTCTAGGAAAG
CAGGTGCATGCTTATGTTAGACGAACAGAAGAGAAAATCCATGTGTCTGTATATAATGCT
TTAATAACATTATATTGGAAATGTGGTAGAGTTGATGATGCAAGAAAAGTTTTTGATAAT
CTAGTTTTTAAGGACCTTGTTTCATGGAATGCAGTTCTATCAGCATATGTGAGTGCAGGG
CGGATTAATGAAGCTAAGTTATTTTTTGATGAGATGCCAGAGAAGAATTCCCTGGCATGG
ACGGTAATGATATCAGGATTAGCACAAAATGGACTTGGAGAAGATGGTCTCAAACTGTTC
AACCAAATGAGAGTAAAGGGGATCGAGCTGTGTGACTATGCATTTGCTGGAGCTATTACA
TCTTGTGCAGTGCTTGGAGCACTAGAAACAGGATGCCAACTCCATGCTCAACTAATCCAG
CGTGGTTATGATTCAAGCCTTTCAGCTGGAAATGCATTAGTCACATTTTATGGAAGATCT
GGGGTCATTGAAGCTGCACGTAATGTGTTCCTCACTATGCCTTGTGTAGATTTGGTGTCT
TGGAATGCATTGGTTGCTGCCTTGGGACAGCATGGATATGGTGTTCAAGCGGTTGAACTT
TTTGAACAGATGTTAGATGAAAATATAATGCCTGATAGGATAAGCTTTCTCACGGTTATA
TCTGCTTGTAGTCATGCCGGATTGATTGAAAAGGGACGACACTACTTTAATATAATGCAC
AGTGTTTATAAAATAAGCCCTGGAGAAGATCACTATGCCCGTTTAATTGATTTGTTGTCT
CGAGCTGGAAGGTTATTAGAAGCAAAAGAAGTGATCCAGAATATGCCTTATAAACCTGGA
GCACCCATTTGGGAAGCTCTTCTTGCTGGTTGCCGAACTCATAGGAACGTGGATTTGGGG
GTTGAAGCAGCAGAACAACTCTTTGAGTTGACGCCACAACATGATGGAACCTATATACTT
CTAGCTAACACATTTGCTGCTGCAGGCCGATGGGATGATGCTGCTAAGGTGAGAAAACTG
ATGAGAGACCAAGGGGTGAAAAAAGAGCCTGGATGTAGTTGGATAAAGGTTGAGAATACC
GTTCATGTATTTTTGGTGGGTGATACTGCACATCCTGAAATTCAAGTAGTGTACAACTAC
CTGGAGGAATTAAGGCTGAAGATGAGGAAAATGGGATATGTTCCAGACACGCAATATGTG
TTGCATGATATGGAGACTGAGCAAAAGGAGTATGCTCTTTCAACTCATAGTGAAAAGCTG
GCGGTTGTATTTGGGCTCTTGAAGCTTCCTCGTGGAGCCACAATTAGGGTCTTCAAGAAC
CTTCGGATTTGTGGTGACTGCCACAATGCCTTCAAGTTCATGTCGAAGGTTGAGGCAAGA
GAAATCATCGTCAGAGATGGAAATAGGTTTCATCATTTCAGGGATGGTGAATGCTCATGT
GGGAATTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400017685
PEP Infomation

pacid=37476305 transcript=PGSC0003DMT400025916 locus=PGSC0003DMG400010006 ID=PGSC0003DMT400025916.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MKNAVKTSLQNQSATGSIANFYAVQLQLLCREHKHATSASALLRSIHANMITSGFSPRSH
ILNNLINIYCKNSGLVYAKHLFDRIPQPDVVARTTMIAAYSASGEPKLAREVFDKTPLSI
RDTVCYNAMITGYSHNNDGHAAIKLFLDMRWKNFQPDEYTYTSVLAALALIADHEMHCRQ
LHCAVAKSGMANFKCVVNALISVYVRCASSPLASSLLLMDSASKLFYEMPERDDLSWTTI
ITGYVKNDDLDAARKVFDGMDEKLLVAWNAMISGYVHKGFIFEALDMLRKMYLAGMKPDE
FTCTSILSACADAGLFLLGKQVHAYVRRTEEKIHVSVYNALITLYWKCGRVDDARKVFDN
LVFKDLVSWNAVLSAYVSAGRINEAKLFFDEMPEKNSLAWTVMISGLAQNGLGEDGLKLF
NQMRVKGIELCDYAFAGAITSCAVLGALETGCQLHAQLIQRGYDSSLSAGNALVTFYGRS
GVIEAARNVFLTMPCVDLVSWNALVAALGQHGYGVQAVELFEQMLDENIMPDRISFLTVI
SACSHAGLIEKGRHYFNIMHSVYKISPGEDHYARLIDLLSRAGRLLEAKEVIQNMPYKPG
APIWEALLAGCRTHRNVDLGVEAAEQLFELTPQHDGTYILLANTFAAAGRWDDAAKVRKL
MRDQGVKKEPGCSWIKVENTVHVFLVGDTAHPEIQVVYNYLEELRLKMRKMGYVPDTQYV
LHDMETEQKEYALSTHSEKLAVVFGLLKLPRGATIRVFKNLRICGDCHNAFKFMSKVEAR
EIIVRDGNRFHHFRDGECSCGNYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400025916
Transcript Infomation

pacid=37476305 locus=PGSC0003DMG400010006 ID=PGSC0003DMT400025916.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAAAATGCCGTCAAAACATCTTTGCAGAACCAATCAGCCACGGGTTCCATTGCTAAC
TTCTACGCAGTGCAGCTCCAACTTCTTTGCCGAGAGCATAAGCATGCCACCTCAGCGTCT
GCTCTTCTTCGATCAATCCATGCCAACATGATCACCTCCGGATTCAGCCCGCGTAGCCAC
ATCCTTAATAACTTAATCAATATCTATTGCAAAAATTCCGGTCTTGTTTATGCAAAGCAC
CTGTTTGATAGAATTCCCCAACCAGATGTAGTGGCAAGAACAACTATGATTGCTGCATAC
TCTGCTTCCGGAGAACCCAAGCTTGCAAGAGAGGTTTTTGACAAAACCCCATTAAGTATC
CGTGACACTGTTTGTTACAACGCTATGATTACAGGCTATTCACACAACAACGATGGCCAT
GCTGCTATAAAATTATTTCTTGATATGAGGTGGAAAAATTTTCAACCCGATGAGTATACC
TACACCTCCGTACTTGCAGCCTTAGCCCTTATAGCTGATCATGAAATGCACTGCCGGCAG
CTGCATTGTGCTGTTGCAAAGTCAGGCATGGCCAACTTTAAGTGTGTTGTCAATGCACTT
ATATCTGTTTATGTCAGATGTGCTTCGTCACCCCTAGCATCATCCTTGCTGTTGATGGAC
TCAGCTAGCAAGTTGTTTTATGAGATGCCAGAACGGGATGACTTATCTTGGACTACGATT
ATCACAGGGTATGTGAAGAATGATGATCTTGATGCTGCTCGGAAGGTGTTTGATGGTATG
GATGAGAAGTTGCTTGTGGCATGGAATGCCATGATCTCCGGATATGTGCATAAAGGTTTC
ATCTTTGAAGCATTAGATATGTTAAGGAAAATGTATTTAGCAGGGATGAAGCCAGATGAG
TTTACCTGCACCAGTATCCTCAGTGCTTGTGCCGATGCTGGACTGTTTCTTCTAGGAAAG
CAGGTGCATGCTTATGTTAGACGAACAGAAGAGAAAATCCATGTGTCTGTATATAATGCT
TTAATAACATTATATTGGAAATGTGGTAGAGTTGATGATGCAAGAAAAGTTTTTGATAAT
CTAGTTTTTAAGGACCTTGTTTCATGGAATGCAGTTCTATCAGCATATGTGAGTGCAGGG
CGGATTAATGAAGCTAAGTTATTTTTTGATGAGATGCCAGAGAAGAATTCCCTGGCATGG
ACGGTAATGATATCAGGATTAGCACAAAATGGACTTGGAGAAGATGGTCTCAAACTGTTC
AACCAAATGAGAGTAAAGGGGATCGAGCTGTGTGACTATGCATTTGCTGGAGCTATTACA
TCTTGTGCAGTGCTTGGAGCACTAGAAACAGGATGCCAACTCCATGCTCAACTAATCCAG
CGTGGTTATGATTCAAGCCTTTCAGCTGGAAATGCATTAGTCACATTTTATGGAAGATCT
GGGGTCATTGAAGCTGCACGTAATGTGTTCCTCACTATGCCTTGTGTAGATTTGGTGTCT
TGGAATGCATTGGTTGCTGCCTTGGGACAGCATGGATATGGTGTTCAAGCGGTTGAACTT
TTTGAACAGATGTTAGATGAAAATATAATGCCTGATAGGATAAGCTTTCTCACGGTTATA
TCTGCTTGTAGTCATGCCGGATTGATTGAAAAGGGACGACACTACTTTAATATAATGCAC
AGTGTTTATAAAATAAGCCCTGGAGAAGATCACTATGCCCGTTTAATTGATTTGTTGTCT
CGAGCTGGAAGGTTATTAGAAGCAAAAGAAGTGATCCAGAATATGCCTTATAAACCTGGA
GCACCCATTTGGGAAGCTCTTCTTGCTGGTTGCCGAACTCATAGGAACGTGGATTTGGGG
GTTGAAGCAGCAGAACAACTCTTTGAGTTGACGCCACAACATGATGGAACCTATATACTT
CTAGCTAACACATTTGCTGCTGCAGGCCGATGGGATGATGCTGCTAAGGTGAGAAAACTG
ATGAGAGACCAAGGGGTGAAAAAAGAGCCTGGATGTAGTTGGATAAAGGTTGAGAATACC
GTTCATGTATTTTTGGTGGGTGATACTGCACATCCTGAAATTCAAGTAGTGTACAACTAC
CTGGAGGAATTAAGGCTGAAGATGAGGAAAATGGGATATGTTCCAGACACGCAATATGTG
TTGCATGATATGGAGACTGAGCAAAAGGAGTATGCTCTTTCAACTCATAGTGAAAAGCTG
GCGGTTGTATTTGGGCTCTTGAAGCTTCCTCGTGGAGCCACAATTAGGGTCTTCAAGAAC
CTTCGGATTTGTGGTGACTGCCACAATGCCTTCAAGTTCATGTCGAAGGTTGAGGCAAGA
GAAATCATCGTCAGAGATGGAAATAGGTTTCATCATTTCAGGGATGGTGAATGCTCATGT
GGGAATTACTGGTGA