Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400025528
CDS Infomation

pacid=37474117 polypeptide=PGSC0003DMP400017383 locus=PGSC0003DMG400009861 ID=PGSC0003DMT400025528.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCGGTCACCGTTAGCTCGCCGGCCGTCCGATCCTTCCATGTTTCACGATCACCTCAT
AAAACGATCTATAGGCCACGTGTCATTATGTCTGCCGTCCGATCTAGTGATAGCTTAGGA
GTAGCACCAATTTTGACTAAGTTGCAGAAAGACTGTGCTACTCCTCTCCCAGTTTTGCGC
CACGTGGCGGATGCAATGGCCGATGATATGCGGGCCGGGCTTGCCGTCGATGGCGGCAGT
GATCTGAAGATGATCCTTAGTTATGTCGACACTCTACCAACTGGGAATGAGAAAGGCTTG
TTTTATGCGTTGGACCTTGGTGGTACAAATTTCCGAGTGCTAAGGGTGCAGCTAGGTGGT
AAAGAAGAGCGTGTAGTCGCCACTGAGTTTGAGCAAGTCTCTATACCCCCAGAATTGATG
TTTGCTACCTCCGAGGAGCTGTTCGATTTCATAGCTTCTGCGCTAGGAAAATTTGCACAA
AAGGAAGGTGGTAATTTTGAGTTGCAACAGGGACGGACAAGGGAAATAGGATTCACGTTT
TCTTTTCCAGTGAAACAGACTTCAATAAGAACTGGAATCCTAATCAAATGGACAAAAGGT
TTTGCTGTCTCTGGAACTGCAGGAAAAGATGTTGTTGCTTGTTTAAATGAAGCCATGGAG
AGGCGGGGAATGGATATGCAAGTGTCTGCCCTGGTCAATGACACTGTGGGAACACTTGCC
GGAGCAAGATACTGGGATGATGATGCCATGGTTGCTGTCATTCTTGGGACTGGAACCAAT
GCTTGCTATGTAGAACGTGTGGATGCTATTCCTAAGCTGACAAAAAGGATGTCCAAGTCT
CCAATAACGATTGTGAATACTGAATGGGGAGCTTTCTCAAATGGCCTTCCTTTAACTGAG
TTTGATAGAGAAATGGATGCCGAGAGCATTAACCCTGGTGAGCAGATTTTTGAAAAGACC
ATCTCCGGTATGTACCTTGGGGAAATTGTGAGACGGGTGCTGGTCAAAATGTCCAAGGTT
GGGGGCTTATTTGGTGGCAGCTATGTTCCGGAAAAGTTAGTCACTCCATTTGTGCTGAGG
ACACCTGATATATGTGCCATGCAGCAGGATACATCAAGAGATCTTGAAGCTGTTGAATCT
GTCCTCTATGATGTAGCTGGGGTAAAATCCGATCTAAGTGCAAGGAAAACAGTCGTGGAC
ATTTGCGATACTATTGCAAAACGAGGGGGTCGTCTGGCTGGTGCAGGAATTGTTGGGATT
CTACAGAAAATGGAGGAGGATTCTAAAGGCCTCATCTTTGGTAAAAGAGCAGTTGTAGCA
ATGGATGGAGGCTTATACGAGCACTATCCTCAGTACAGAGGATACCTCCAAGAAGCTGTC
ACAGAGTTACTAGGCTCGGAAATTTCGAAAAATGTAGTGATAGAACATTCAAAAGATGGT
TCTGGAATTGGAGCTGCATTATTAGCTGCTGCAAACTCAAAGTATGAACATGATTATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400017383
PEP Infomation

pacid=37474117 transcript=PGSC0003DMT400025528 locus=PGSC0003DMG400009861 ID=PGSC0003DMT400025528.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSVTVSSPAVRSFHVSRSPHKTIYRPRVIMSAVRSSDSLGVAPILTKLQKDCATPLPVLR
HVADAMADDMRAGLAVDGGSDLKMILSYVDTLPTGNEKGLFYALDLGGTNFRVLRVQLGG
KEERVVATEFEQVSIPPELMFATSEELFDFIASALGKFAQKEGGNFELQQGRTREIGFTF
SFPVKQTSIRTGILIKWTKGFAVSGTAGKDVVACLNEAMERRGMDMQVSALVNDTVGTLA
GARYWDDDAMVAVILGTGTNACYVERVDAIPKLTKRMSKSPITIVNTEWGAFSNGLPLTE
FDREMDAESINPGEQIFEKTISGMYLGEIVRRVLVKMSKVGGLFGGSYVPEKLVTPFVLR
TPDICAMQQDTSRDLEAVESVLYDVAGVKSDLSARKTVVDICDTIAKRGGRLAGAGIVGI
LQKMEEDSKGLIFGKRAVVAMDGGLYEHYPQYRGYLQEAVTELLGSEISKNVVIEHSKDG
SGIGAALLAAANSKYEHDY*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400025528
Transcript Infomation

pacid=37474117 locus=PGSC0003DMG400009861 ID=PGSC0003DMT400025528.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCGGTCACCGTTAGCTCGCCGGCCGTCCGATCCTTCCATGTTTCACGATCACCTCAT
AAAACGATCTATAGGCCACGTGTCATTATGTCTGCCGTCCGATCTAGTGATAGCTTAGGA
GTAGCACCAATTTTGACTAAGTTGCAGAAAGACTGTGCTACTCCTCTCCCAGTTTTGCGC
CACGTGGCGGATGCAATGGCCGATGATATGCGGGCCGGGCTTGCCGTCGATGGCGGCAGT
GATCTGAAGATGATCCTTAGTTATGTCGACACTCTACCAACTGGGAATGAGAAAGGCTTG
TTTTATGCGTTGGACCTTGGTGGTACAAATTTCCGAGTGCTAAGGGTGCAGCTAGGTGGT
AAAGAAGAGCGTGTAGTCGCCACTGAGTTTGAGCAAGTCTCTATACCCCCAGAATTGATG
TTTGCTACCTCCGAGGAGCTGTTCGATTTCATAGCTTCTGCGCTAGGAAAATTTGCACAA
AAGGAAGGTGGTAATTTTGAGTTGCAACAGGGACGGACAAGGGAAATAGGATTCACGTTT
TCTTTTCCAGTGAAACAGACTTCAATAAGAACTGGAATCCTAATCAAATGGACAAAAGGT
TTTGCTGTCTCTGGAACTGCAGGAAAAGATGTTGTTGCTTGTTTAAATGAAGCCATGGAG
AGGCGGGGAATGGATATGCAAGTGTCTGCCCTGGTCAATGACACTGTGGGAACACTTGCC
GGAGCAAGATACTGGGATGATGATGCCATGGTTGCTGTCATTCTTGGGACTGGAACCAAT
GCTTGCTATGTAGAACGTGTGGATGCTATTCCTAAGCTGACAAAAAGGATGTCCAAGTCT
CCAATAACGATTGTGAATACTGAATGGGGAGCTTTCTCAAATGGCCTTCCTTTAACTGAG
TTTGATAGAGAAATGGATGCCGAGAGCATTAACCCTGGTGAGCAGATTTTTGAAAAGACC
ATCTCCGGTATGTACCTTGGGGAAATTGTGAGACGGGTGCTGGTCAAAATGTCCAAGGTT
GGGGGCTTATTTGGTGGCAGCTATGTTCCGGAAAAGTTAGTCACTCCATTTGTGCTGAGG
ACACCTGATATATGTGCCATGCAGCAGGATACATCAAGAGATCTTGAAGCTGTTGAATCT
GTCCTCTATGATGTAGCTGGGGTAAAATCCGATCTAAGTGCAAGGAAAACAGTCGTGGAC
ATTTGCGATACTATTGCAAAACGAGGGGGTCGTCTGGCTGGTGCAGGAATTGTTGGGATT
CTACAGAAAATGGAGGAGGATTCTAAAGGCCTCATCTTTGGTAAAAGAGCAGTTGTAGCA
ATGGATGGAGGCTTATACGAGCACTATCCTCAGTACAGAGGATACCTCCAAGAAGCTGTC
ACAGAGTTACTAGGCTCGGAAATTTCGAAAAATGTAGTGATAGAACATTCAAAAGATGGT
TCTGGAATTGGAGCTGCATTATTAGCTGCTGCAAACTCAAAGTATGAACATGATTATTAA