Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400025226
CDS Infomation

pacid=37455552 polypeptide=PGSC0003DMP400017204 locus=PGSC0003DMG400009746 ID=PGSC0003DMT400025226.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTGGTTCAAATGGGTCAAGAAAATAAGGTAAACTTTCAAAACCAGAACCATTCAAAG
CCAGTGGAGTCAGTTCCAGGTGACATTAAGCCTGTTGTTATTACTAGTGCTCCTGGACCT
ATTATTCCGGCTGGGACTGGTGGAGGTGGTCATGGTGGTGGTGGGGTTGGTTTGTACACT
TCTGGGCAAGGTGAGTTTTCTCTGAAAGAAACAAGTCCACATCTTGGTGGTAAGGACAAG
ACTAGCTCAACATATGACTTGGTGGAACAAATGCAGTATTTGTATGTTAGAGTTGTAAAG
GCTAAGGATTTTTCTGTTTTTGGTGTTGGGGGTGGTGGTGAGCTTGTAGCTGAGGTGAAA
CTTGGTAACTATAGAGGAATTACTAAAAGAGTTTTTTCAAATCATGCTGAATGGGACCAA
GTTTTTGCCTTTTCAAAAGATAGTGTACAGTCCTCTGTGGTGGAGGTCTTTGTGAAGGAA
AATAACAAAGATGACTTCTTGGGTCGTGTTTGGTTTGATTTGAATGAGGTGCCTAAACGA
GTTCCGCCCGATAGTCAGTTGGCTCCACAATGGTATAGAATGGAAGACAAGAAAGGTGAT
AAGTCTAAAGGTGGTGAACTTATGGTTGCCATATGGTTTGGTACTCAAGCTGATGAAGCC
TTTGCTGAGGCTTGGCATTCTAAAGCAGCAAATGTGCATTTTGATGGTTTGTGTTCAATC
AAGTCTAAAGTGTATCTGTCACCTAAGCTTTGGTATTTACGCGTTGGGGTTATTGAAGCT
CAAGATATTGTTATGGGGGAGAAAGGGTCATCAATTATGAGATACCCTGAACTTTTTGCT
AAAGTTCAAGTTGGGAATCAGGTTCTGAGGACTAGAGTTTCTCCACCTGCTGCTACTAGA
AGCTTTACAAATCCTTTCTGGAATGAGGACTTAATGTTTGTGGTTGCTGAGCCATTTGAA
GACTTCTTGCTTGTTTCAATTGAGGATAGACTTGCTCCCAACAGAGAGGAAGTTGTGGCG
AGAGTTCTTTTGCCTGTTTCAAGCCTAGAAAGGCGACTAAACGAGAAGCCAGTTACTTCG
AGGTGGTTCAATCTTGATACTCATTTGAGCAATGCAAATGATCCCAAAGCTGTGGTTAGA
TTTGCCTCGCGGATTCACCTCCGTGCTTCACTTGATGGAGGTTACCATGTGCTTGATGAG
GCAACAATGTACAGCAGTGATGTTAGGCCGACAGCAAAGCAGTTGTGGAAGCCCCACATT
GGAGTTCTCGAGGTTGGGGTTTTGGGAGCTACCAATCTTGTGCCAATGAAAATGAAAGAA
GGCAAGGGTGGCTCTGTAGATGCGTATTGTGTTGCAAAGTATGGGCAGAAATGGGTCCGA
ACTAGGACTGTGGTGGACAGCTTATCTCCTAAATGGAATGAGCAATATACTTGGGAAGTC
TTTGACCCTTGCACTGTCATCACTATTGGGGTGTTTGATAATTCTCGTGTAGACAAGAAT
ATGGCTAACCCTGCGGCTGGAAATCGGGACTCTCGGATAGGGAAGGTTAGGATCAGGCTA
TCAACTCTTGAATCAGATAGAGTTTATACTCATGCATATCCACTTTTGATGCTGCATCCT
TCTGGGGTGAAAAAAATGGGGGAGCTTCATTTGGCTGTCCGGTTTTCATGTGCTAACATG
GTGAATATGCTTCATATGTATACAATGCCTTTGCTTCCAAAGATGCATTATGTTCAGCCC
TTGTCTGTAAGTCAGTTGGACAGCTTGAGGCACCAGGCTATGAATGTGGTGGCAACAAGA
CTTAGTCGATCTGAGCCACCTTTGGGAAGAGAAGTGGTGGAGTACATGCTCGATCATGAT
TCTCATATGTGGAGCATGAGAAAGAGCAAAGCAAATTTCTTTAGGCTAACAAATGTGGTT
TCTTGGTTTGTTATTATGAGCAGGTTTCTAGAGTCTGCGCGCAATTGGCATAAGCCAGTG
CACTCTGCATTAGCTCTGATTGCCTTTACCATTCTTGTATTGGTGCCCGAGCTCATCATA
CCTTGTGTACTACTCAACTTGGCTGCAGTAGGACTATGGCGTTACAGGTCACGCCCACGC
CACCCTCCCCACATGGACACTCGACTCTCATATGCAGAGAGTGTTTATCCAGATGAACTA
GACGAGGAGTTCGATTCATTCCCTACCAGCAGAAATGCAGAAATCGTTCGAATGAGATAT
GATAGACTGAGGAGTGTGGCTGGTAGGATTCAGACTGTGGTTGGTGATATGGCAACTCAA
GGTGAGAGATTTCAGGCATTATTAAGCTGGAGGGATCCAAGAGCAACATTCTTGTTTGTA
ATATTTTGCTTCTTTGCTGCCTTTGGTTTCTACTTGGTGCCAATCAAATGGGTTGTGGCT
CTTTGGGGTTTGTATTATTTGAGACCACCAAGGTTCAGGAACAGGTTGCCATCCAGTGCT
GTATGTTTCTTGAAGAGGCTGCCTACCAGGGCAGATAGCATGTTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400017204
PEP Infomation

pacid=37455552 transcript=PGSC0003DMT400025226 locus=PGSC0003DMG400009746 ID=PGSC0003DMT400025226.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVVQMGQENKVNFQNQNHSKPVESVPGDIKPVVITSAPGPIIPAGTGGGGHGGGGVGLYT
SGQGEFSLKETSPHLGGKDKTSSTYDLVEQMQYLYVRVVKAKDFSVFGVGGGGELVAEVK
LGNYRGITKRVFSNHAEWDQVFAFSKDSVQSSVVEVFVKENNKDDFLGRVWFDLNEVPKR
VPPDSQLAPQWYRMEDKKGDKSKGGELMVAIWFGTQADEAFAEAWHSKAANVHFDGLCSI
KSKVYLSPKLWYLRVGVIEAQDIVMGEKGSSIMRYPELFAKVQVGNQVLRTRVSPPAATR
SFTNPFWNEDLMFVVAEPFEDFLLVSIEDRLAPNREEVVARVLLPVSSLERRLNEKPVTS
RWFNLDTHLSNANDPKAVVRFASRIHLRASLDGGYHVLDEATMYSSDVRPTAKQLWKPHI
GVLEVGVLGATNLVPMKMKEGKGGSVDAYCVAKYGQKWVRTRTVVDSLSPKWNEQYTWEV
FDPCTVITIGVFDNSRVDKNMANPAAGNRDSRIGKVRIRLSTLESDRVYTHAYPLLMLHP
SGVKKMGELHLAVRFSCANMVNMLHMYTMPLLPKMHYVQPLSVSQLDSLRHQAMNVVATR
LSRSEPPLGREVVEYMLDHDSHMWSMRKSKANFFRLTNVVSWFVIMSRFLESARNWHKPV
HSALALIAFTILVLVPELIIPCVLLNLAAVGLWRYRSRPRHPPHMDTRLSYAESVYPDEL
DEEFDSFPTSRNAEIVRMRYDRLRSVAGRIQTVVGDMATQGERFQALLSWRDPRATFLFV
IFCFFAAFGFYLVPIKWVVALWGLYYLRPPRFRNRLPSSAVCFLKRLPTRADSML*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400025226
Transcript Infomation

pacid=37455552 locus=PGSC0003DMG400009746 ID=PGSC0003DMT400025226.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTGGTTCAAATGGGTCAAGAAAATAAGGTAAACTTTCAAAACCAGAACCATTCAAAG
CCAGTGGAGTCAGTTCCAGGTGACATTAAGCCTGTTGTTATTACTAGTGCTCCTGGACCT
ATTATTCCGGCTGGGACTGGTGGAGGTGGTCATGGTGGTGGTGGGGTTGGTTTGTACACT
TCTGGGCAAGGTGAGTTTTCTCTGAAAGAAACAAGTCCACATCTTGGTGGTAAGGACAAG
ACTAGCTCAACATATGACTTGGTGGAACAAATGCAGTATTTGTATGTTAGAGTTGTAAAG
GCTAAGGATTTTTCTGTTTTTGGTGTTGGGGGTGGTGGTGAGCTTGTAGCTGAGGTGAAA
CTTGGTAACTATAGAGGAATTACTAAAAGAGTTTTTTCAAATCATGCTGAATGGGACCAA
GTTTTTGCCTTTTCAAAAGATAGTGTACAGTCCTCTGTGGTGGAGGTCTTTGTGAAGGAA
AATAACAAAGATGACTTCTTGGGTCGTGTTTGGTTTGATTTGAATGAGGTGCCTAAACGA
GTTCCGCCCGATAGTCAGTTGGCTCCACAATGGTATAGAATGGAAGACAAGAAAGGTGAT
AAGTCTAAAGGTGGTGAACTTATGGTTGCCATATGGTTTGGTACTCAAGCTGATGAAGCC
TTTGCTGAGGCTTGGCATTCTAAAGCAGCAAATGTGCATTTTGATGGTTTGTGTTCAATC
AAGTCTAAAGTGTATCTGTCACCTAAGCTTTGGTATTTACGCGTTGGGGTTATTGAAGCT
CAAGATATTGTTATGGGGGAGAAAGGGTCATCAATTATGAGATACCCTGAACTTTTTGCT
AAAGTTCAAGTTGGGAATCAGGTTCTGAGGACTAGAGTTTCTCCACCTGCTGCTACTAGA
AGCTTTACAAATCCTTTCTGGAATGAGGACTTAATGTTTGTGGTTGCTGAGCCATTTGAA
GACTTCTTGCTTGTTTCAATTGAGGATAGACTTGCTCCCAACAGAGAGGAAGTTGTGGCG
AGAGTTCTTTTGCCTGTTTCAAGCCTAGAAAGGCGACTAAACGAGAAGCCAGTTACTTCG
AGGTGGTTCAATCTTGATACTCATTTGAGCAATGCAAATGATCCCAAAGCTGTGGTTAGA
TTTGCCTCGCGGATTCACCTCCGTGCTTCACTTGATGGAGGTTACCATGTGCTTGATGAG
GCAACAATGTACAGCAGTGATGTTAGGCCGACAGCAAAGCAGTTGTGGAAGCCCCACATT
GGAGTTCTCGAGGTTGGGGTTTTGGGAGCTACCAATCTTGTGCCAATGAAAATGAAAGAA
GGCAAGGGTGGCTCTGTAGATGCGTATTGTGTTGCAAAGTATGGGCAGAAATGGGTCCGA
ACTAGGACTGTGGTGGACAGCTTATCTCCTAAATGGAATGAGCAATATACTTGGGAAGTC
TTTGACCCTTGCACTGTCATCACTATTGGGGTGTTTGATAATTCTCGTGTAGACAAGAAT
ATGGCTAACCCTGCGGCTGGAAATCGGGACTCTCGGATAGGGAAGGTTAGGATCAGGCTA
TCAACTCTTGAATCAGATAGAGTTTATACTCATGCATATCCACTTTTGATGCTGCATCCT
TCTGGGGTGAAAAAAATGGGGGAGCTTCATTTGGCTGTCCGGTTTTCATGTGCTAACATG
GTGAATATGCTTCATATGTATACAATGCCTTTGCTTCCAAAGATGCATTATGTTCAGCCC
TTGTCTGTAAGTCAGTTGGACAGCTTGAGGCACCAGGCTATGAATGTGGTGGCAACAAGA
CTTAGTCGATCTGAGCCACCTTTGGGAAGAGAAGTGGTGGAGTACATGCTCGATCATGAT
TCTCATATGTGGAGCATGAGAAAGAGCAAAGCAAATTTCTTTAGGCTAACAAATGTGGTT
TCTTGGTTTGTTATTATGAGCAGGTTTCTAGAGTCTGCGCGCAATTGGCATAAGCCAGTG
CACTCTGCATTAGCTCTGATTGCCTTTACCATTCTTGTATTGGTGCCCGAGCTCATCATA
CCTTGTGTACTACTCAACTTGGCTGCAGTAGGACTATGGCGTTACAGGTCACGCCCACGC
CACCCTCCCCACATGGACACTCGACTCTCATATGCAGAGAGTGTTTATCCAGATGAACTA
GACGAGGAGTTCGATTCATTCCCTACCAGCAGAAATGCAGAAATCGTTCGAATGAGATAT
GATAGACTGAGGAGTGTGGCTGGTAGGATTCAGACTGTGGTTGGTGATATGGCAACTCAA
GGTGAGAGATTTCAGGCATTATTAAGCTGGAGGGATCCAAGAGCAACATTCTTGTTTGTA
ATATTTTGCTTCTTTGCTGCCTTTGGTTTCTACTTGGTGCCAATCAAATGGGTTGTGGCT
CTTTGGGGTTTGTATTATTTGAGACCACCAAGGTTCAGGAACAGGTTGCCATCCAGTGCT
GTATGTTTCTTGAAGAGGCTGCCTACCAGGGCAGATAGCATGTTGTAA