Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400025004
CDS Infomation

pacid=37449463 polypeptide=PGSC0003DMP400017060 locus=PGSC0003DMG400009659 ID=PGSC0003DMT400025004.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATTAGTGAGCAAAATGAACCTCTCTTATCCGATTCGAACGAAAAAAGATGCATCATT
TCACTTGATAATACGATTGAAGTATGCATCGGAGATTTTGGATGGTCACAATTTGTACAA
GCTATTCTAGTCTCGCTCGCTTGGGTTTTCGATGCTCAACAATCATTCATTAGTGTTTTC
ACTGATGCTCTTCCCACTTGGCATTGTATTAATAATAATAATTCCTCATGCCAAATGTAC
AAAAATATCTGCGACGTTCCAAAGGACACGTGGCAGTTTGATTTGCCAACGTACACGTCA
GTTGTCTCCGATTGGTCACTTGAATGTAGCAGCTCAGTCATCACTGGCCTCCCTGCATCA
AGTTTCTTCATAGGTTGTCTTGTTGGTGGATTTGTTCTTTGCACTTTAGCTGATTCTTCG
TTTGGTCGTAAAAACATGTTGGTTATATCATGTCTCATAATGTCTATAACGGGTTGTGTT
ACCGCGATTTCTACTAATATATGGATGTACTCTGTATTAAGGTTCGTATCTGGATTTGGC
AGGGCAAGTATAGGTACTTGTTCTCTTGTTTTATCGACGGAGTTAGTGGGAAGGAAGTGG
AGAGGGCAAGTTGGGATTATTAGCTTCGTTTGTTTTACGTTTGGATTTATATCGTTACCT
TGGATAGCGTATTTAAATAAAGGGAATTCGTGGAGAGTTTTGTATCTATTGACTTGTTTC
CCAGCAGTTGTGTATTCGATTATTGTATATTTCTTTGTTCATGAATCGCCTAGGTGGCTT
TATTTGCGAGGACATAAGGAAGAATTTGTTGAGACGTTGAAAAGAATTGCAAATCCAGCT
ACACGGGGGGAGTTGAGTTCAAGTTTCTTCGAAGCATTGTTTATTGATTTAGAAAAAAGC
ATGTCTGTGTCTGCATCACGAGATTTGGATCTGTACTCTGCTGTTAGATTGTTGATTGAG
AAAGGATGGGCTTTACGTCGATTGATGACAGTAGTGTTGATTGGTTTTGGTGTTGGAATG
GTTTATTATGGCATGCCGTTAGGGGTTGGGGATTTGGGATTTGATATCTACTTAAGTATC
ACGTTGAATGCAATTTCAGAGCTGCCATCATCATTGATAGCGTTTTTCCTTATAGGGAAA
ATGAATAGGAAGGGTTCGCTTTTAGGATTTTCCTTACTGAGTGGGATATGTAGTGTGGGT
TGCGCGTTGGTGGAGGGGAGTGAGGGATTGAAGTGGATTCAAATGGGGCTTGAAATGGTG
TCGTTTTTTAGTGCTTGTACCGCGTTTAATGTACTATTGATTTACACGTTGGAACTATTT
CCAACGTGTGTGAGGAACTGCGCGGTGTCAATGGTGAGGCAGTCATTAGTAGTTGGTGGT
GCATTGAGTCCACTGCTTGTTGCACTTGGAAGGAACAATAGCTTGTTTTCTTATGGGGTA
TTTGGAGTGTGTAGTGCCACATTTGGTTTGTTTACAGTGTGGTTGCCAGAGACTAAGGGT
AGGCTACTTTGTGACACTATGGATGAAGAGGAGAGCCTGTTGGAGCAAGCACAAGTTGTT
GACCTCAAATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400017060
PEP Infomation

pacid=37449463 transcript=PGSC0003DMT400025004 locus=PGSC0003DMG400009659 ID=PGSC0003DMT400025004.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MISEQNEPLLSDSNEKRCIISLDNTIEVCIGDFGWSQFVQAILVSLAWVFDAQQSFISVF
TDALPTWHCINNNNSSCQMYKNICDVPKDTWQFDLPTYTSVVSDWSLECSSSVITGLPAS
SFFIGCLVGGFVLCTLADSSFGRKNMLVISCLIMSITGCVTAISTNIWMYSVLRFVSGFG
RASIGTCSLVLSTELVGRKWRGQVGIISFVCFTFGFISLPWIAYLNKGNSWRVLYLLTCF
PAVVYSIIVYFFVHESPRWLYLRGHKEEFVETLKRIANPATRGELSSSFFEALFIDLEKS
MSVSASRDLDLYSAVRLLIEKGWALRRLMTVVLIGFGVGMVYYGMPLGVGDLGFDIYLSI
TLNAISELPSSLIAFFLIGKMNRKGSLLGFSLLSGICSVGCALVEGSEGLKWIQMGLEMV
SFFSACTAFNVLLIYTLELFPTCVRNCAVSMVRQSLVVGGALSPLLVALGRNNSLFSYGV
FGVCSATFGLFTVWLPETKGRLLCDTMDEEESLLEQAQVVDLK*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400025004
Transcript Infomation

pacid=37449463 locus=PGSC0003DMG400009659 ID=PGSC0003DMT400025004.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATTAGTGAGCAAAATGAACCTCTCTTATCCGATTCGAACGAAAAAAGATGCATCATT
TCACTTGATAATACGATTGAAGTATGCATCGGAGATTTTGGATGGTCACAATTTGTACAA
GCTATTCTAGTCTCGCTCGCTTGGGTTTTCGATGCTCAACAATCATTCATTAGTGTTTTC
ACTGATGCTCTTCCCACTTGGCATTGTATTAATAATAATAATTCCTCATGCCAAATGTAC
AAAAATATCTGCGACGTTCCAAAGGACACGTGGCAGTTTGATTTGCCAACGTACACGTCA
GTTGTCTCCGATTGGTCACTTGAATGTAGCAGCTCAGTCATCACTGGCCTCCCTGCATCA
AGTTTCTTCATAGGTTGTCTTGTTGGTGGATTTGTTCTTTGCACTTTAGCTGATTCTTCG
TTTGGTCGTAAAAACATGTTGGTTATATCATGTCTCATAATGTCTATAACGGGTTGTGTT
ACCGCGATTTCTACTAATATATGGATGTACTCTGTATTAAGGTTCGTATCTGGATTTGGC
AGGGCAAGTATAGGTACTTGTTCTCTTGTTTTATCGACGGAGTTAGTGGGAAGGAAGTGG
AGAGGGCAAGTTGGGATTATTAGCTTCGTTTGTTTTACGTTTGGATTTATATCGTTACCT
TGGATAGCGTATTTAAATAAAGGGAATTCGTGGAGAGTTTTGTATCTATTGACTTGTTTC
CCAGCAGTTGTGTATTCGATTATTGTATATTTCTTTGTTCATGAATCGCCTAGGTGGCTT
TATTTGCGAGGACATAAGGAAGAATTTGTTGAGACGTTGAAAAGAATTGCAAATCCAGCT
ACACGGGGGGAGTTGAGTTCAAGTTTCTTCGAAGCATTGTTTATTGATTTAGAAAAAAGC
ATGTCTGTGTCTGCATCACGAGATTTGGATCTGTACTCTGCTGTTAGATTGTTGATTGAG
AAAGGATGGGCTTTACGTCGATTGATGACAGTAGTGTTGATTGGTTTTGGTGTTGGAATG
GTTTATTATGGCATGCCGTTAGGGGTTGGGGATTTGGGATTTGATATCTACTTAAGTATC
ACGTTGAATGCAATTTCAGAGCTGCCATCATCATTGATAGCGTTTTTCCTTATAGGGAAA
ATGAATAGGAAGGGTTCGCTTTTAGGATTTTCCTTACTGAGTGGGATATGTAGTGTGGGT
TGCGCGTTGGTGGAGGGGAGTGAGGGATTGAAGTGGATTCAAATGGGGCTTGAAATGGTG
TCGTTTTTTAGTGCTTGTACCGCGTTTAATGTACTATTGATTTACACGTTGGAACTATTT
CCAACGTGTGTGAGGAACTGCGCGGTGTCAATGGTGAGGCAGTCATTAGTAGTTGGTGGT
GCATTGAGTCCACTGCTTGTTGCACTTGGAAGGAACAATAGCTTGTTTTCTTATGGGGTA
TTTGGAGTGTGTAGTGCCACATTTGGTTTGTTTACAGTGTGGTTGCCAGAGACTAAGGGT
AGGCTACTTTGTGACACTATGGATGAAGAGGAGAGCCTGTTGGAGCAAGCACAAGTTGTT
GACCTCAAATAG